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文档简介
1、关于催化水解反应的金属酶第一张,PPT共四十页,创作于2022年6月根据酶催化反应的类型,把酶分为六类 :氧化还原酶类 催化氧化还原反应转移酶类 催化功能基团转移反应裂解酶类 催化从底物移去一个基团而留下双键的反应或其逆反应异构酶类 催化异构体互相转变合成酶类 催化双分子合成一种新物质同时使ATP分解的反应水解酶类 催化水解反应第一节 概述第二张,PPT共四十页,创作于2022年6月一、水解酶 六大酶类之中研究的最多并应用最广泛的一类,其中有不少水解酶的活性与金属离子有关。 后页表中列出若干水解金属酶和金属离子激活酶。 金属离子激活酶是指必须加入金属离子才具有活性的酶。第三张,PPT共四十页,
2、创作于2022年6月第四张,PPT共四十页,创作于2022年6月水解酶根据水解键的类型不同分为六个亚类。酯酶 作用于酯键,使其水解为酸和醇糖苷酶 作用于糖基化合物,使糖键水解醚酶 作用于醚键,使其水解肽酶 作用于肽键,使其水解C-N酶 作用于其它C-N键酸酐酶 作用于酸酐本章仅对肽酶及酯酶作一些介绍 第五张,PPT共四十页,创作于2022年6月肽酶催化蛋白质的肽键水解蛋白质为高分子物质,不能透过细胞膜,必须水解成小分子才能被肠吸收。蛋白质由各种肽酶催化,水解成小分子,被肠吸收。第六张,PPT共四十页,创作于2022年6月肽酶肽链端解酶肽链内切酶(蛋白酶)氨肽酶羧肽酶嗜热菌蛋白酶根据作用方式,肽
3、酶又分为肽链端解酶和肽链内切酶。肽链端解酶从肽链羧基末端和氨基末端切下氨基酸,前者称羧肽酶,后者称氨肽酶。内切酶是另一类肽酶,用于切断蛋白质分子内部肽键使之变成小分子多肽,如嗜热菌蛋白酶。 第七张,PPT共四十页,创作于2022年6月酯酶催化酯键水解,其中羧酸酯酶催化羧酸酯水解RCOOR + H2O RCOOH + ROH磷酸酯酶催化磷酸酯键水解 O O ROPOR + H2O RO POH +ROH | | OH OHR=H时,磷酸单酯酶(如:碱性磷酸酯酶)磷酸二酯酶(如:磷脂酶C)第八张,PPT共四十页,创作于2022年6月水解金属酶之中很多都与Zn2+有关。其次:Ca2+、Mg2+,还有
4、少数酶含Mn2+ 由于水解过程不发生电子转移,所以金属离子的氧化态在催化过程中不变化。第九张,PPT共四十页,创作于2022年6月二、水解金属酶研究中的过渡金属离子EPR、Mssbauer、d-d电子光谱金属酶存在某种过渡金属。Zn2+,Ca2+,Mg2+等离子不具有未充满的d轨道,因此含有Zn2+,Ca2+,Mg2+等离子的金属酶就难以应用上述检测技术获得有用信息。为了深入研究金属酶的性质,通常采用探针。一般采用Co2+代替Zn2+,用Mn2+代替Mg2+。非过渡金属Tl+作为K+的NMR探针。第十张,PPT共四十页,创作于2022年6月使用探针离子遵循的原则:同晶置换,即探针离子在酶分子中
5、占据原有金属离子所在的同一位置。电子构型、离子半径、配位几何构型。很关键问题:是否能继续保持酶分子的生物活性。金属配位键的强弱对于决定反应的途径也很重要,而这种配位键的强度可随金属不同而变化。第十一张,PPT共四十页,创作于2022年6月第十二张,PPT共四十页,创作于2022年6月Zn2+的电子结构:d10,在可见区没有吸收。在羧肽酶研究中采用Mn2+,Fe2+,Co2+,Ni2+,Cu2+,Rh3+,Cd2+,Pd2+等离子取代。Co2+取代的羧肽酶A对肽键的水解具有很强的活性。Co2+羧肽酶A的吸收光谱与经典的四面体配位的钴配合物很不同,而且摩尔消光系数很大,这是由于金属处在畸变四面体配
6、位引起的;圆二色谱、磁圆二色谱和低温EPR谱的结果证实这一点。证明锌酶中的Zn2+处于畸变四面体配位状态。第十三张,PPT共四十页,创作于2022年6月第十四张,PPT共四十页,创作于2022年6月碳酸酐酶研究中,钴酶活性是锌酶活性的50%,而Ni2+,Mn2+,Fe2+酶仅稍具活性,其它惰性。Co2+取代酶大都能在不同程度上保持酶的催化活性。电子结构、离子半径、配位几何构型。Co2+配合物有多种几何构型,高自旋Co(II)配合物优先采取四面体结构。四面体场中,高自旋Co2+的电子组态为e4t23,相当于Zn2+的d10组态的球对称结构。采用Co2+作为探针,就能提供锌酶的金属结合部位结构的有
7、用信息。第十五张,PPT共四十页,创作于2022年6月第二节 羧肽酶羧肽酶是催化肽链的C-末端氨基酸残基水解的酶。 第一个被发现的锌酶 第一个被发现的金属酶 动力学、结构、光谱最清楚的水解酶 羧肽酶分类: 金属酶,存在于胰液中,细胞外酶,帮助蛋白质消化,中性或弱碱性显示极大的活性 非金属酶(酵母羧肽酶C),细胞内酶,在酸性条件下具有很大活性。第十六张,PPT共四十页,创作于2022年6月一、羧肽酶A1.组成、结构与功能(1)组成:存在哺乳动物胰脏中,相对分子质量34600, Zn2+作为辅基,单一多肽链,约300个氨基酸残基。研究比较多的是牛的羧肽酶A。 羧肽酶原A在胰蛋白酶作用下,一个肽键断
8、裂,释放出大约60个氨基酸残基的N-末端裂解物。在不同条件下,可以产生4种不同羧肽酶A:307; 305; 300;300第十七张,PPT共四十页,创作于2022年6月动物体内羧肽酶原A二聚体或三聚体,无活性胰蛋白酶激活60个氨基酸残基-N末端裂解物肽键断裂不同条件下,四种不同的羧肽酶307,305,300,300通常说的羧肽酶A就是羧肽酶A 第十八张,PPT共四十页,创作于2022年6月(2)结构:椭球形,羧肽酶A() 大约一半的氨基酸形成-螺旋结构或-折叠结构。第十九张,PPT共四十页,创作于2022年6月其余氨基酸无确定模式,相对容易变形,与底物结合相联系的构象变化主要在这些容易变形的部
9、分发生。酶分子中部一狭长的空腔,底物结合位置。底物的C末端沿这条沟槽伸入到酶分子内的活性部位,空腔中还有一定数量的水分子, Zn2+就处于这条空腔的内表面,它是维持羧肽酶A活性所必须的组分。 第二十张,PPT共四十页,创作于2022年6月第二十一张,PPT共四十页,创作于2022年6月Zn2+与多肽链的两个组氨酸(69,196)的咪唑基氮原子,以及谷氨酸(72)的羧基氧原子以配位键结合,第二十二张,PPT共四十页,创作于2022年6月Zn2+第配位为水。Zn2+处于畸变四面体配位状态中。第二十三张,PPT共四十页,创作于2022年6月3功能:催化蛋白质或多肽的羧基末端肽键的水解反应。除了脯氨酸
10、之外,羧肽酶能不同程度的催化具有各种C-末端氨基酸的肽链水解。底物的C-末端侧链为芳基或分支较大的脂基羧肽酶显示出很强的活性。 NHCHCONHCHCOO- + H2O | | R2 R1 NHCHCOOH + NH2CHCOO- | | R2 R1第二十四张,PPT共四十页,创作于2022年6月2.肽水解的催化机理(1)活性部位早期的蛋白链化学修饰法已经确定羧肽酶的活性部位。Zn2+除与组氨酸(His-69)、-196,以及Glu-72形成直接参与催化作用的活性部位外,还包括Arg-145,Tyr-248和Glu-270,它们的侧联基团也是直接与底物结合的部位。当上述氨基酸与其他物质作用而被
11、化学修饰时,酶失去活性第二十五张,PPT共四十页,创作于2022年6月(2)锌-羰基机理 主要特征:底物的C-末端肽键的羰基通过锌的配位作用而极化,极化羰基的碳原子由于亲核反应发生水解作用。第一步:Arg-145的胍基和底物的带负电荷的C-末端羧基相互吸引。第二步:底物酪氨酸残基的芳基侧链进入酶的非极性口袋形空腔中挤走4H2O。第三步:底物敏感肽键的-NH-基上的氮原子与酶的Tyr-248的-OH以氢键连结。第二十六张,PPT共四十页,创作于2022年6月第四步:底物肽键上的羰基挤走了水分子而与锌配位,锌使羰基极化以致碳原子容易接受亲核进攻。第五步:底物末端的羰基碳原子通过一个插入的水分子与酶
12、的谷氨酸Glu-270的侧链以氢键连结。但最后这一步不一定发生。羧肽酶与甘氨酰胺结合的过程,必须通过活性中心的重排,特别是酶分子的构象的重大改变才能实现。Arg-145 和 Glu-270移动0.2nm,Arg的位移带动了肽链的扭转,使Tyr-248移动了1.2nm。第二十七张,PPT共四十页,创作于2022年6月诱导喫合状态:酶分子构象改变,配位键、范德华力、静电吸引力和氢键等作用力,使酶分子与底物在空间和电荷上都很匹配,因而处于喫合状态。羧肽酶与甘氨酰胺结合正是酶的诱导喫合状态的范例。酶分子构象改变和各种相互作用力使底物肽键处于张力状体下,因此,反应活化能大大降低。第二十八张,PPT共四十
13、页,创作于2022年6月第二十九张,PPT共四十页,创作于2022年6月酶与底物结合后进一步反应的步骤有两种不同的观点。第一种:Glu-270激活了水分子,提高了水分子的氧的亲核能力,向底物肽健羰基的碳原子进攻,Glu-270羰基质子化,Tyr-248也提供一个质子,肽键断裂,底物分解。第三十张,PPT共四十页,创作于2022年6月第二种:第三十一张,PPT共四十页,创作于2022年6月锌的作用: 在锌-羰基机理中起了使肽键产生张力的作 用,从而促进了底物的水解。由于Zn2+的作用,底物肽键的羰基碳原子的电子云密度降低而呈正电性,因此羰基碳原子更容易接受亲核进攻。底物末端羧基与Arg-145带
14、正电的胍基连结,触发了Tyr-248大幅度位移,酶显示活性。由此可见:酶与底物的诱导喫合是一个互相识别的动态过程。这个过程发生活性中心重排,使底物有可能被酶的功能基包围而发生催化。第三十二张,PPT共四十页,创作于2022年6月第三节:碳酸酐酶广泛存在动物、植物和某些微生物体内。可逆催化二氧化碳的水合作用,还能催化醛类水合作用和某些脂的水解。碳酸酐酶分含Zn2+酶和不含Zn2+酶。锌酶,红细胞中仅次于血红蛋白。第三十三张,PPT共四十页,创作于2022年6月一、组成、结构、功能相对分子量约30000,单一肽链,每个分子含一个Zn2+,260个氨基酸残基,脯氨酸含量较高,没有二硫键。通常碳酸酐酶
15、指碳酸酐酶B。椭球形,分子中有一个袋形空腔, Zn2+结合在空腔底部。 Zn2+与His-93,95,117的N原字配位,第四配位可能有水分子或羟基占据畸形四面体结构。第三十四张,PPT共四十页,创作于2022年6月第三十五张,PPT共四十页,创作于2022年6月天然碳酸酐酶和脱锌的酶蛋白有相同的三级结构。因此, Zn2+在碳酸酐酶中不是起稳定空间结构的作用,而是活性中心组分。Co2+取代锌,50%活性。大量实验表明, Co2+占据了Zn2+原来结合部位。第三十六张,PPT共四十页,创作于2022年6月可推测:金属离子的配位环境是畸变四面体构型。第三十七张,PPT共四十页,创作于2022年6月第三十八张,PPT共四十页,创作于2022年6月碳酸
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