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文档简介
1、2纲要纲要3 3对照样品实验样品基片点样针探针4生物芯片技术简介生物芯片技术简介5生物芯片技术优点生物芯片技术优点619961997199819992000200120022003200420050100020003000400050006000700080009000100001100012000130001400015000160001700018000200620077889自主研发的微型芯片实验室系统自主研发的微型芯片实验室系统1010LuxScan 10K-BLuxScan 10K-ASlideWasher 8AutoVortex 3Extractor 36GeneChip Pers
2、onal SystemBioMixer IIChemLite 88RT-CyclerSmartMixer 24PersonalArrayer 16EcoSamplerSmartArrayer 48SmartArrayer 136自主研发的生物芯片配套仪器设备自主研发的生物芯片配套仪器设备1111 Array-based HLA Genotyping & SNP Detection Array-based CGH DNA DNA Methylation Microarray ChIP-chip Transcription Factor ProfilingProtein Rheumatic
3、 Autoimmune Antibody Profiling Gene Expression Profiling MicroarrayRNA MicroRNA Microarray Neuronal Network Electrophysiological Monitoring Electrorotation Chip Cell Tissue Array Tissue四位一体的生物芯片应用研究平台四位一体的生物芯片应用研究平台12荣获荣获2007年度国家技术发明奖二等奖年度国家技术发明奖二等奖 1313杂交扫描图像分析生物信息学1、作为亚洲唯一被邀请的单位,博奥生物的系统化微阵列生物芯片和相关
4、仪器设备平台技术在2006年美国FDA组织实施的微阵列芯片质控项目中取得了令人满意的结果,两篇相关文章发表在2006年9月 的 N a t u r e B i o -technology 上。点样2、Nature全球推荐,入选国际主流技术平台,已成功为国际制药企业等数百家公司和大学提供高质量服务。2006年成功参加国际年成功参加国际MAQC质控项目质控项目14生物芯片技术在健康管理领域的应用生物芯片技术在健康管理领域的应用15生物芯片在个体遗传检测中的应用生物芯片在个体遗传检测中的应用16n 高通量:5小时内同时检测GJB2, GJB3, SLC 26A4 和 12S rRNA 等4个基因中的
5、10个基因突变位点n 高精确度:解放军301医院对515例临床样本作双盲对照实验表明芯片检测与测序法检测符合率为100n 操作简便:操作步骤少、软件自动分析杂交结果激光共焦扫描仪自动判读软件芯片试剂盒芯片杂交仪医疗器械证书Human Mutation, 29:306-314, 2008235delC/299delAT heterozygote235delC homozygote235delC heterozygote芯片洗干仪17点样仪芯片杂交仪 激光共焦扫描仪2500人份芯片专用分型软件医疗器械证n 高精度:分型精度国际最高(99 )n 高通量:分析通量国际最高(一次10,000个样品)n
6、低成本:分析每份样品节省1/3开销(近¥150)n 可靠性:已连续两年为中华骨髓库使用(分析样品近30,000份)n 辐射性:已签署向西班牙出口 9 套系统的协议Molecular Immunology, 40: 501-507, 2003.18复杂疾病相关复杂疾病相关SNP检测芯片检测芯片19个体遗传标记健康风险预测技术个体遗传标记健康风险预测技术20生物芯片在健康状态监控中的应用生物芯片在健康状态监控中的应用21314K313K315K341K317K321K316K319K323K338K344K313N315N323N318N341N317N319N321N318K314N338N31
7、6N344NNL5NL7NL6NL9NL8downupnon149 mRNAs聚类分析FDR 挑选芯片 数据预处理International Journal of Cancer, 2008, in press癌癌旁正常2222酵母转录因子活性谱芯片(含 96 个转录因子 )Journal of Proteome Research, 2007, accepted. 高通量:一次可分析若干个专录因子的结合活性 可靠性:已通过大量标品和实际样品的确认和验证辐射性:为药物研发和疾病机理研究所需的系统信号 通路共筑图提供了很好的技术平台,已为若 干研究单位提供了相关技术服务人转录因子活性谱芯片(含 24
8、8 个转录因子 )Journal of Proteome Research, 2008, accepted. 小鼠转录因子活性谱芯片(含 200 个转录因子 )Journal of Proteome Research, 4:1451-1456, 2005. 23adjacent normal samplescancer samples包含有人、大鼠、小鼠 743 条miRNA 探针的 miRNAs 表达谱芯片,是目前国内构建的涉及miRNA数目最多 、 质 量 最 好 的miRNA表达谱芯片。Cancer Research, 68(1):26-33, 20082424系统性硬皮病系统性红斑狼疮
9、自动判读软件激光共焦扫描仪n高通量:同时检测 8 种抗核抗体(SSA52, SSA60, SSB, Sm, RNP68, Scl-70, Jo-1和 centromere)n快速分析:全部检测时间仅为 2 小时n半定量:该产品可以通过与特定参照比较得出半定量结果n高特异性和高灵敏度:只需要提供 0.2 L 患者血清即可进行检测,而采用传统ELISA 法0.2 L 患者血清只能检测 1 种抗核抗体医疗器械证25生物芯片技术在个性化诊疗中的应用生物芯片技术在个性化诊疗中的应用26Breast Cancer Research and Treatment, 68(1):26-33, 200727敏感不
10、敏感285个差异表达基因28实时荧光PCR检测共分析病人样品78份Cancer Research, 68(1):26-33, 200829扫描仪判读软件基因芯片试剂盒样品制备仪杂交仪n 通 量:两个一线抗结核药;n 速 度: 6 小时 versus 传统 6 周;n 灵敏度:125 CFU/反应;n 特异性:严谨的各步骤对照;自动判读; 防PCR污染。能够快速检测结核杆菌多药耐药(利福平、异烟肼),基于rpoB/katG/inhA的基因突变。分离株或者痰样本均可检测。 芯片洗干仪30采用不对称多重PCR扩增技术和基因芯片平台,可快速区分鉴定葡萄球菌属中的金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌和肠球
11、菌中的属粪肠球菌、屎肠球菌 ,还可同时检测ermA、ermC、mecA、 msrA、aac(6)-aph(2) 等5个耐药基因。n 高通量: 可以同时进行G细菌鉴定和耐药检测n 高效率:获取最终结果由传统的 2-3 天缩短至 5 个小时n 高精度:基于基因型检测原理,较传统的表型检测方法更为准确细菌样品分离株DNA 提取靶基因扩增图像扫描结果分析杂交反应Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 59:149-156, 2007.Journal of Clinical Microbiolology, 45(11): 3514-3521, 20
12、07.Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 51(10): 37073713, 2007.31能够同时鉴定拉米夫定和阿德福韦两种药物 4 个位点11 种基因型的耐药情况。 n 通 量:能够同时鉴定 2 种药物,11种基因型;n 速 度: 6 小时;n 灵敏度:1104 copy/ml;n 特异性:高。QCQCBCBC 204M 204M 204I204IQCQCBCBC204V204VQCQCQCQCECECECECBCBCBCBCECECECEC 204M 204M204V204V204I204I204S204S204S204SBC BC181A181A181T181T BC BC181T181T181A181A181V181V181V181VBCBCBCBCBCBCBCBC 180L 180L180M 180M 236N 236N 180L 180L236N 236N180M 180M236T236T236T236T 204I,180M 204V,180M 204S,180M点阵排布敏感株32下一代生物芯片技术发展展望下一代生物芯片技术发展展
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