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文档简介

1、第5章 常用分析软件 一、基因结构一、基因结构基因基因原核生物基因结构：真核生物基因结构： CpG岛岛是指是指DNA序列上的一个区域，此区域含有大序列上的一个区域，此区域含有大量相联的胞嘧啶（量相联的胞嘧啶（C）、鸟嘌呤（）、鸟嘌呤（G），以及使两者相连），以及使两者相连的磷酸酯键（的磷酸酯键（p）。）。CpG岛的概念是岛的概念是Gardiner-garden和和Fromner于于1987年提出的，基因中平均每年提出的，基因中平均每100 Kb即可出现。即可出现。CpG岛位于基因的启动子和第一个外显子区，约有岛位于基因的启动子和第一个外显子区，约有60%80%的人类基因的启动子和起始外显子含有

2、的人类基因的启动子和起始外显子含有CpG岛，岛，其中其中GC含量大于含量大于50%，长度超过，长度超过200bp。因此搜索。因此搜索CpG岛可以为基因及其启动子预测提供重要线索。岛可以为基因及其启动子预测提供重要线索。 CpGPlot是预测是预测CpG岛的在线工具，它是由欧洲岛的在线工具，它是由欧洲分子生物学实验室分子生物学实验室EMBL European Molecular Biology Laboratory提供的。提供的。其网址为：其网址为：http:/www.ebi.ac.uk/Tools/emboss/cpgplot/index.html序序号号Genebank登陆号登陆号物物 种种

3、基因功能基因功能1234567AY094405AF486514X03935X62134X88789U23945X57233Arabidopsis halianaHordeum vulgareZea maysO.sativaP.sativumSorghum bicolorWheatgranule bound starch synthase I mRNAgranule bound starch synthase I mRNAglucosyl transferasegranule bound starch synthase I mRNAmRNA for starch synthasegranule-bound starch synthase precursor (W

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