英文医学数据库检索下-中南大学

1、1英文医学数据库检索英文医学数据库检索(下）下）中南大学中南大学 刘雁书刘雁书 2 教 学 内 容一、重要外文检索系统及其获取二、Pubmed文献检索系统三、EMBase四、Scifinder Scholar五、Biosis Previews六、中南大学馆订电子期刊导航七、如何查到满意文献3 三、EMBASE（一）概述（二）检索功能4（一）EMBase概述荷兰荷兰Elsevier Science Elsevier Science 出版社建立的生物出版社建立的生物医学与药学方面的文摘型数据库，收医学与药学方面的文摘型数据库，收录来自录来自7070个国家的个国家的4,5504,550多种期刊，其多

2、种期刊，其中欧洲期刊占中欧洲期刊占54%54%。51. EMBase沿革印刷型检索工具：Excerpta Medica（EM），按分册出版，最早1947年数据库全部内容：全部内容：EMBase部分内容：专题数据库（部分内容：专题数据库（Drugs & Pharmacology 、Evidence Based Medicine ）62. EMTREEEMTREE：EMBASE支持主题词检索，拥有一支持主题词检索，拥有一套自有词表体系：套自有词表体系：EMTREE7EMTREE：EMBase词表 主题词：主题词：descriptordescriptor, preferred termpre

3、ferred term检索：检索：5 5个叙词字段（个叙词字段（DEMDEM与与DER DER 、DRMDRM与与DRR DRR 、SUSU）8主题词特点自然语序: acute lymphocytic leukemia 单数形式:stomach tumor 美式拼法美式拼法 :fetus(:fetus(不用不用 foetus) foetus) 多用全称：多用全称：nuclear magnetic resonance 希腊字母用罗马字拼读希腊字母用罗马字拼读: alpha(不用）9副主题词（link term） v疾病（14个）v药物（17个）v投药方式（47个）10EMTREE疾病连接词（P9

4、5） Disease Link Terms ComplicationCongenital disorderDiagnosisDisease ManagementDrug resistance (began 1996)Drug therapyEtiology1414个疾病关联词个疾病关联词 Epidemiology PreventionRadiotherapyRehabilitationSide effectSurgeryTherapy11EMTREE药物连接词药物连接词 Drug Link Terms17个药物连接词个药物连接词 Adverse drug reaction Clinical t

5、rialDrug administrationDrug analysisDrug combinationDrug comparisonDrug concentrationDrug developmentDrug doseDrug interaction Drug therapy Drug toxicityEndogenous compoundPharmaceuticsPharmacoeconomicsPharmacokineticsPharmacology 47个给药途径连接词个给药途径连接词 Oral drug administrationEpidural drug administrati

6、onInhalational drug administration 12（一）EMBASE概述MEDLINE1,800 种特有期种特有期刊刊EMBASE5,400 种期刊，其中种期刊，其中包括包括1,800 种特有期种特有期刊刊3. 同时检索同时检索EMBASE和和 MEDLINE，并自动去重并自动去重134. 4. 部分文献提供全文链接部分文献提供全文链接 ScienceDirect from Elsevier Science () IDEAL from Academic Press () LINK from Springer-Verlag (www.link.springer.de) T

7、hieme () Cell Press () Catchword ()145. 有可供再检索的主题词、著者链接及相关文献链接检索相关文献作者、主题词链接156. E-mail Alerts服务16（二）EMBASE检索功能17w 1. 快速检索快速检索(quick search)w 2. 高级检索高级检索(advanced search) w 3. 药物检索药物检索(drug search)w 4. 疾病检索疾病检索(disease search)w 5. 文章检索文章检索(article search)w 6. 词表检索词表检索 (EMTREE Tools)w 7. 期刊检索期刊检索(Jou

8、rnals)w 8. 作者检索作者检索 (Authors)18EMBASE Quick Search界面19Advanced Search：限制条件并进行组配检索：限制条件并进行组配检索20Drug Search：从药物入手进行检索：从药物入手进行检索21Disease Search：从疾病入手进行检索：从疾病入手进行检索22Journals：浏览期刊检索23Article Search：指定获取某篇文献24EMBASE检索结果界面检索结果界面25“Preview Abstract”格式26“Preview Index Terms”格式27“View Full Text”格式28利用Sciru

9、s查找网络信息29四、Scifinder Scholar （一）简介 （二）检索功能 30出版商： Chemical Abstract Service 化学文摘服务社化学文摘服务社发展沿革： 印刷版：Chemical Abstract, CA 光盘数据库：CA on CDCA on CD 网络数据库：SciFinder 联机数据库：STN、DIALOG ( (一一)Scifinder Scholar)Scifinder Scholar简介简介31SciFinder Scholar数据库背景数据库背景跨世纪跨世纪工程工程SciFinderScholar光盘光盘纸本纸本1907年年1977年年19

10、97年年2002年年32SciFinder Scholar包含的六大数据库最最全全ScifinderCAplusCAplusMedlineMedlineRegistryRegistryCASReactCASReactChemcatsChemcatsChemlistChemlist物质数据库物质数据库化学反应数据库化学反应数据库管制品物质数据库管制品物质数据库商品来源数据库商品来源数据库文摘数据库文摘数据库文摘数据库文摘数据库33两个主要数据库- - 33003300多万物质和多万物质和59005900多万序列多万序列- 通过名称、分子式、结构式检通过名称、分子式、结构式检索物质或者用索物质或者

11、用 BLAST BLAST检索序列检索序列 - 通过实验或者计算得到的物质通过实验或者计算得到的物质性质数据性质数据- CAS RN CAS RN-每日新增每日新增40004000多个物质或序列多个物质或序列- - 摘自摘自95009500多种期刊、多种期刊、5050多个多个专利组织以及其他学术题录信专利组织以及其他学术题录信息（息（28002800多万条信息）多万条信息） - 通过作者通过作者/ /公司公司/ /全文全文/ /期刊期刊/ /专专利号利号/ /文件类型和出版年检索文件类型和出版年检索- CAS RN CAS RN-每日新增每日新增30003000篇期刊和专利篇期刊和专利-2 2

12、天内收录天内收录9 9大专利局公开的大专利局公开的专利专利CAS RegistryCAplus最全的最全的物质数据物质数据库库时效性最时效性最高高文摘数据文摘数据库库34四个独特数据库- 世界世界900900家厂商家厂商10001000类目录类目录 17001700多万种化学品商业来源多万种化学品商业来源物质物质-CAS RNCAS RN-14001400多万条单步或多步反多万条单步或多步反应（尤其专利中的反应）应（尤其专利中的反应）- 结构和亚结构检索结构和亚结构检索-CAS RNCAS RN-每周新增每周新增60013006001300新反应新反应- 2424万多备案或管控物质万多备案或管

13、控物质- CAS RN CAS RN-每周新增约每周新增约5050种物质种物质-7070多个国家多个国家47804780多种医学多种医学类期刊类期刊16001600多万条文摘记录多万条文摘记录-美国国家医学图书馆出品美国国家医学图书馆出品-每周更新每周更新4 4次次ChemlistCASReactMedlineChemCats时效性时效性高高实用性实用性强强35SciFinder Scholar：学科范围：学科范围生物化学、遗传学、免疫学、药理学、毒理学、生物化学、遗传学、免疫学、药理学、毒理学、发酵发酵 有机化学有机化学材料化学（高分子）材料化学（高分子）聚合物、塑料、纺织、橡聚合物、塑料、

14、纺织、橡胶粘合剂等胶粘合剂等应用化学和化学工程应用化学和化学工程加工、工业化学、金属加工、工业化学、金属/合金、陶瓷、环境科学等合金、陶瓷、环境科学等物理化学、无机化学和分析化学物理化学、无机化学和分析化学36（二）Scifinder Scholar检索功能37Scifinder检索主界面检索主界面开始新任务开始新任务参数设定参数设定检索历史检索历史检索分类检索分类38Scifinder Scholar主检索界面主检索界面Explore:适于适于检索不确定信检索不确定信息息Locate:适于检适于检索确定信息索确定信息Browser:浏览核心期刊的内容浏览核心期刊的内容39(二)Scifind

15、er Scholar检索功能 1. Explore检索功能介绍Literature：获取文献 Research Topic Author name Company Name/organization Substances：获取化学物质相关信息 Chemical Structure Molecular Formula Reactions 获取化学反应相关信息40Explore-不确定信息的检索不确定信息的检索文献检索文献检索物质检索物质检索反应检索反应检索41提出问题提出问题中国在纳米材料的应用方面的研究报道中国在纳米材料的应用方面的研究报道SciFinder Scholar查询举例查询举例-主

16、题检索主题检索存在问题存在问题中国有那些机构在研究中国有那些机构在研究? 常见的应用领域在哪里常见的应用领域在哪里?在这方面发表的专在这方面发表的专利有那些利有那些? 42Explore主题检索“Closely associated with one another”表示在同一个句子当中出表示在同一个句子当中出现现43SciFinder能自动识别同义词、近义词、缩写、单复数，并有截词，断词等功能获取文摘获取文摘链接全文链接全文44SFS2007新功能新功能系统分类系统分类对于大量的文献结果对于大量的文献结果,SFS提供强大的二次检索和分析功能提供强大的二次检索和分析功能45来源期刊：来源期刊：

17、发现相关的学术期刊发现相关的学术期刊学科领域：学科领域：了解在不同学科的分布情况了解在不同学科的分布情况 出版年：出版年：了解该领域的研究历史和发了解该领域的研究历史和发展展文献语种文献语种 ：了解有关文献的语种分布情了解有关文献的语种分布情况况 文献类型文献类型 ：了解文献的种类了解文献的种类作者作者：发现某一领域中发文章最多发现某一领域中发文章最多的研究者的研究者机构机构 发现某一领域研究最多的研发现某一领域研究最多的研究机构究机构CAS No：了解文献出现的物质及应用了解文献出现的物质及应用索引词：索引词：帮助分析该领域中文献的内帮助分析该领域中文献的内容容辅助索引词：辅助索引词：帮助分

18、析该领域中文献的内帮助分析该领域中文献的内容容数据库数据库分析是来自分析是来自CAPLUS还是还是MEDLINE排序：排序：可以选择按照字母顺序也可可以选择按照字母顺序也可以按照出现频率顺序以按照出现频率顺序一共一共11种分析手段种分析手段46一共一共7种限定手段种限定手段主题主题：对初次结果用其它对初次结果用其它的主题再作的主题再作2次检次检索索机构机构：直接获得自己关心直接获得自己关心的机构的参考的机构的参考作者作者：直接获得自己关心直接获得自己关心的作者的参考的作者的参考出版年出版年：直接获得自己关心直接获得自己关心的年份的参考的年份的参考文献类型文献类型：直接获得关心的文献直接获得关心

19、的文献类型类型文献语种文献语种：直接获得关心的语种直接获得关心的语种的参考的参考来自数据库来自数据库：可以限定文献的出处可以限定文献的出处47用China再次限定主题得到来自中国的纳米材料得到来自中国的纳米材料应用方面的研究报道应用方面的研究报道1283篇篇48用组织机构名分析中国哪些研究机构在研究这个主题中国从事这个主题研究的机构很多49Categorize功能帮您提供系统分功能帮您提供系统分类方法类方法SciFinder Scholar 2007 新功能之一新功能之一: 系统分类系统分类系统分类帮助你系统分类帮助你寻找新的科研方向寻找新的科研方向50分析来自中国的报道中有多少是专利,根据需

20、要查看51Explore-物质物质结构结构检索检索52结构检索的界面结构检索的界面铅笔元素周期表可变基团重复基团工具结构模版橡皮正电子选择工具原子锁定工具碳链工具常用基团R基团定义工具可变位置连接工具多元环工具旋转工具负电子环锁定工具索套选择工具53(1)精确结构检索精确结构检索5455(2)亚结构检索亚结构检索5633246种修饰信息57我们做科研我们做科研往往是希望得到我们不知道的信息往往是希望得到我们不知道的信息那么对于这那么对于这33246种物质，我们如何去分析来获得种物质，我们如何去分析来获得我们需要的信息呢？我们需要的信息呢？强大的物质结构后处理功能强大的物质结构后处理功能5859

21、6大分析功能大分析功能真实原子附属性真实原子附属性：帮助分析某一特定帮助分析某一特定原子上的修饰原子上的修饰可变基团分析：可变基团分析：帮助分析结构定义帮助分析结构定义中的定义的某一类中的定义的某一类基团基团R基团分析：基团分析：帮助分析结构定义帮助分析结构定义中的中的R基团基团精确结构：精确结构：帮助分析结构中存在的帮助分析结构中存在的互变异构或者兼性离子互变异构或者兼性离子环骨架分析：环骨架分析：帮助分析结构中存在所帮助分析结构中存在所有环骨架有环骨架构象分析：构象分析：帮助分析结构中存在构帮助分析结构中存在构象问题象问题 物质结构的分析方法物质结构的分析方法607大限定功能大限定功能结构

22、再次限定结构再次限定：帮助对结构再次帮助对结构再次限定限定同位素限定同位素限定：帮助获得结构中帮助获得结构中含有同位素的物含有同位素的物质质金属包含限定金属包含限定：帮助获得结构中帮助获得结构中含有金属的物质含有金属的物质商业化限定：商业化限定：帮助获得可购买帮助获得可购买的物质的物质性质限定性质限定：通过物质的理化通过物质的理化性质对物质进行性质对物质进行限定限定提供性质限定：提供性质限定：对可提供的物性对可提供的物性数据分析数据分析提供参考分析提供参考分析：帮助获得至少含帮助获得至少含有有1篇参考的物篇参考的物质质对于上面的对于上面的3万多种物质，如果我只万多种物质，如果我只想获得具有红外

23、光谱数据的物质，那想获得具有红外光谱数据的物质，那么，我应该选择什么呢？么，我应该选择什么呢？物质结构的二次检索方法物质结构的二次检索方法61或得具有红外光谱信息的物质或得具有红外光谱信息的物质62(3)相似结构检索相似结构检索63得到相似结构信息得到相似结构信息64相似结构相似结构需要查询什么样的结构需要查询什么样的结构聚合物，混合物聚合物，混合物修饰结构修饰结构设计的结构设计的结构SciFinder Scholar结构检索小结结构检索小结精确结构检索精确结构检索亚结构检索亚结构检索相似结构检索相似结构检索65Explore-反应检索反应检索66反应检索工具条反应检索工具条反应位置标记工具反

24、应箭头反应官能团列表反应原子标记工具反应角色工具67(1)精确结构反应检索精确结构反应检索6869分析及二次检索功能分析及二次检索功能70产率：产率：了解产物的产率了解产物的产率作者：作者：了解在不同学科的分布情况了解在不同学科的分布情况 语种：语种：了解有关文献的语种分布了解有关文献的语种分布情况情况期刊名称期刊名称 ：可以帮助发现相关期刊可以帮助发现相关期刊文献类型文献类型 ：了解文献的种类了解文献的种类催化剂催化剂：了解反应中出现的催化剂了解反应中出现的催化剂机构机构 发现某一领域研究最多的研发现某一领域研究最多的研究机构究机构溶剂：溶剂：了解反应中可能出现的溶剂了解反应中可能出现的溶剂

25、反应步数：反应步数：了解反应步数的情况了解反应步数的情况发表年限：发表年限：了解该领域的研究历史和了解该领域的研究历史和发展发展排序：排序：可以选择按照字母顺序也可可以选择按照字母顺序也可以按照出现频率顺序以按照出现频率顺序一共一共10种分析手段种分析手段71一共一共4种限定手段种限定手段结构限定：结构限定：可以进一步限定可以进一步限定反应物，产物，反应物，产物，催化剂等催化剂等产率限定：产率限定：可以对反应的产可以对反应的产率事先进行限定率事先进行限定反应步数限定：反应步数限定：可以对反应的步可以对反应的步数事先进行限定数事先进行限定反应类型限定：反应类型限定：可以限定反应的可以限定反应的类

26、型是什么类型是什么72反应步数分析反应步数分析溶剂分析溶剂分析73SciFinder 反应检索小结反应检索小结多用多用Analyze/Refine，来获得催化剂，溶剂，产率，来获得催化剂，溶剂，产率等信息等信息如果反应只涉及基团之间的变化，用官能团反应可如果反应只涉及基团之间的变化，用官能团反应可以获得更多的参考信息以获得更多的参考信息当无法找到具体反应，或者检索结果并不满意，尝当无法找到具体反应，或者检索结果并不满意，尝试用亚结构反应查询，可以获得更多的参考信息试用亚结构反应查询，可以获得更多的参考信息更多关于物质和反应检索培训请查看更多关于物质和反应检索培训请查看http:/ 资料下载中心

27、资料下载中心74SciFinder Scholar检索检索TipsExplore by Research TopicExplore by Document IdentifierExplore by Substance IdentifierExplore by Molecular Formula75Explore by Research Topic -Tips一般最佳在一般最佳在23个个Concepts（关键词），最多不超过（关键词），最多不超过5个个最好使用介词而不用最好使用介词而不用Boolean运算符，如运算符，如AND 、OR、NOT；介词能被识别；介词能被识别；识别常用缩写、单复数、过

28、去式等；识别常用缩写、单复数、过去式等；支持同义词，近义词检索；支持同义词，近义词检索；不能用！或不能用！或*（删减字符或通配符）（删减字符或通配符）可用括号，括号内为前词的同义词；可用括号，括号内为前词的同义词；76Explore by Document Identifier-Tips77Explore by Substance Identifier-Tips 最多输入最多输入25条；条； Read File必须是必须是 .txt文件；文件； 每个条目输入每个条目输入200字符；字符； 可以有空格，不区分大小写；可以有空格，不区分大小写； 如果检索结果不理想，也可在主题检索中再检；如果检索结

29、果不理想，也可在主题检索中再检；支持俗名，商品名检索支持俗名，商品名检索78Explore by Molecular Formula-Tips 区分大小写；区分大小写； 输入必须规范，否则会自动要求重输；输入必须规范，否则会自动要求重输； 输入时不同元素之间可用空格隔开，系统也会自动输入时不同元素之间可用空格隔开，系统也会自动分割；分割； 输入盐类，可分为酸碱组分以输入盐类，可分为酸碱组分以 . 相连；相连； 如：如：H3 O4 P . 3 Na；H3 O4 P . 2 Na；H3 O4 P . Na 分别代表不同的物质分别代表不同的物质 聚合物则输入单体组成以括号加聚合物则输入单体组成以括号

30、加X，如，如(C4H6)X； 对于复杂的有机物质，可以通过分子式查询，并通对于复杂的有机物质，可以通过分子式查询，并通过亚结构限定获得过亚结构限定获得79 分子式检索中分子式排列依hill分子式排列顺序若化合物不含C元素：各元素依其英文字母顺序来排列检索，如：H2SO4 以H2O4S排列来检索。若化合物含C元素：先排C元素、再排H元素、其它元素则再依其英文字母顺序来排列检索，如：C9H8CL4N8O。 分子式检索不能区分同分异构体，同分异构体必须配合命名来检索，或者用结构检索 80（二）Scifinder Scholar检索功能 2. Locate检索功能 2.1. 查找特定参考文献（Loca

31、te Literature） 2.1.1. 根据书目信息查找文献（Bibliographic Information） 通过输入所需的书目信息，SciFinder 可帮助您查找特定的期刊或专利参考文献。 查找期刊文献时，选择Journal Reference，输入相关的期刊参考文献信息。单击确定。 81 2.1.1. 根据文献标识符查找文献（Document Identifier） 键入专利号或CAS物质登记号进行查找。每行输入一个标识符，一次可搜索25个标识符。或者单击从文件中读取可以导入标识符列表。 82 2.2. 查找物质（Locate Substances） 使用“物质标识符”及化学名

32、称或CAS登记号查找特定物质或物质组。 (1)查找和验证化学名称、CAS 登记号、分子式和其它物质信息 (2)获取计算和实验属性数据 (3)识别商业来源 (4)检索法规遵循信息 (5)获取讨论物质的文章和专利 83 2.2. 查找物质（Locate Substances）键入化学名称、商标名称或 CAS 登记号进行查找。每行输入一个标识符，一次可搜索25个标识符。或者单击从文件中读取可以导入标识符列表。单击确定。 要查看答案中的属性数据，请单击显微镜图标以显示物质详情。如果属性信息可用，则提供链接。属性值来源显示于右侧列和脚注区域中。84Locate检索检索输入苯的名称输入苯的名称benzen

33、e858687Browse检索检索88Scifinder检索小结 Explore:适于检索不确定信息Literature：获取文献信息Substances：获取化学物质相关信息Reactions：获取化学反应相关信息 Locate:适于检索确定信息Locate Literature：查找指定文献Locate Substances: 查找指定化学物质 Browser:浏览期刊信息89Scifinder Scholar检索小结 向向SciFinder Scholar提一个最为广泛的问题提一个最为广泛的问题 通过通过Analyze/Refine功能不断修正检索思路功能不断修正检索思路 通过通过Ana

34、lyze/Refine功能来缩小检索的范围功能来缩小检索的范围 通过通过Analyze/Refine功能来获取新的知识点和灵功能来获取新的知识点和灵感感 尝试将不同的尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，功能组合起来用，会有更多的收益会有更多的收益 通过通过Get Related来获得更多的信息来获得更多的信息 90五、BioSIS Previewsv书目数据库：书目数据库： BIOSIS 提供提供v内容：内容： 110110多个国家的多个国家的50005000多种期多种期刊刊( (会议、专利、科技报告和图书会议、专利、科技报告和图书) )v学科学科: :生物生物( (最权威

35、最权威), ),基础医学基础医学91获取获取印刷：BABA（ Biological Abstracts ）和）和BA/RRMBA/RRM光盘和网络： BIOSIS Preview（ BP）(OVID，SPIRSSPIRS，DIALOGDIALOG，WOK)WOK)我校：我校：（OVID和WOK）92Biosis Previews（WOK检索界面）93六、中南大学医学图书馆馆订外文刊导航 此导航汇集了12个外文全文数据库所包含的期刊：ovid(343)、proquest health and medicine complete(phmc)(910)、elsevier(1535)、springer

36、(1581)、kluwer(860)、nstl(210)、ebsco-asp(4408)、lexisnexis(20种医学刊)、wiley(33种医学刊)、worldscinet(88)、Karger（75）、MDCOSULT(刊88种、书51本)。每本期刊都做了链接，点击该期刊可以直接链接到该期刊的卷期列表。此导航全部囊括了至今我馆购买的生物医学类的外文刊。网址：中南大学医学图书馆() 访问路径：主页馆订外文刊导航94中南大学医学图书馆主页95中南大学馆订外文期刊导航浏览界面96查找Nature Genetics杂志我馆订购情况点击期刊名获取点击期刊名获取本馆订购情况本馆订购情况收录数据库收

37、录数据库97Nature Genetics我馆全文订购情况98获取论文全文99七、如何查找满意文献 选择最准确的提问词 检索结果不理想时的调整方法文献量过多时调整方法文献量过少时调整方法100（一）选择最准确的提问词 课题举例:阴道超声诊断早、中期胎儿畸形 胎儿Fetus(受精9周后） 胚胎embryo(受精至8周末）101选择最准确的提问词 用全称,少用缩写 HCC代表什么? HCC 7378 hepatocellular carcinoma 33291 HCC OR hepatocellular carcinoma 33834 102希腊字母的输入 PPAR 过氧化物酶体增生物激活受体 p

38、eroxisome proliferator activated receptor ppar-r 105 ppar gamma 1520 alpha beta gamma delta103（二）检索策略调整方法 检出文献量过多提高查准率 检出文献量过少提高查全率104检索策略调整方法 提高查准率的方法使用更专指的词（下位词）增加用“AND”联结的检索词作进一步的限定用文献外表特征限定检出文献量利用“MESH DATABASE”检索服务105提高查准率的方法 1. 使用更专指的词（下位词） 课题：内毒素对神经系统（神经元）的损伤 Search Most Recent queries Result

39、 #1 endotoxins 68029 #2 nervous system 1423937 #3 injur* 650528 #4 #1 AND #3 AND #2 490 #5 neurons 469562 #6 #1 AND #3 AND #5 175 1062. 增加用“AND”联结的检索词作进一步的限定课题：膀胱癌与P53基因突变（细胞凋亡）Search Most Recent queries Result#1 bladder neoplasms 47973#2 genes p53 24560#3 mutation 538622#4 #1 AND #2 AND #3 350#5 ap

40、optosis 174618#6 #4 AND #5 341073. 用文献外表特征限定检出文献量课题：了解细胞凋亡研究进展apoptosis 174618 publication types=review: 26647 freefulltext: 59531 publication data from 2007-present: 50901Apoptosisti 54838 publication data from 2008-present 86231084. 利用“MESH DATABASE”检索服务asthma 111964asthmamesh 88644asthmamajr 72109asth