克氏原螯虾两种模式识别受体基因的克隆、重组表达及功能分析

1、生物化学与分子生物学专业毕业论文 精品论文 克氏原螯虾两种模式识别受体基因的克隆、重组表达及功能分析关键词：模式识别受体 重组表达 基因克隆 甲壳动物 细菌侵染摘要：模式识别受体(Pattern recognition receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分子模式(Pathogen associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系统。本研究首先在甲壳动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对克氏原螯虾(Procambar

2、us clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标基因的表达。而且，这种RNA干扰介导的基因沉默效应能够系统性的发生，至少持续96小时，能够满足本研究中对模式识别受体基因功能鉴定的要求。 随后，利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术从克氏原螯虾(Procambarus clarkii)中克隆、鉴定了两个模式识别受

3、体基因：脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因(命名为PcLGBP)和C-型凝集素基因(命名为PcLEC)。 PcLGBP基因cDNA全序列包含一个1107bp的开放阅读框(Open reading frame，ORF)，编码369个氨基酸。在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，表明PcLGBP是一个分泌的胞外蛋白。PcLGBP蛋白的氨基酸序列中包含一个糖基水解酶结构域和一个-1，3-糖苷键识别序列(Phe235-Asp253)以及两个细胞粘附位点(RGD106-108，157-159)和一个N糖基化位点(NRSI66-69)。在其类葡聚糖酶结构域还包含决定葡聚糖酶活性的保守氨基酸。同源性分析发现

4、PcLGBP与甲壳类动物的脂多糖和-1，3葡聚糖结合蛋白LGBP(Lipopolysaccharide and p-1，3-glucan binding protein，LGBP)或-1，3葡聚糖结合蛋白(-1，3-glucan binding protein，BGBP)同源，与一些昆虫的革兰氏阴性细菌结合蛋白(Gram-negative bacteria protein，GNBP)及葡聚糖酶的一致性高于40。为分析PcLGBP基因的功能，通过半定量RT-PCR方法研究了其在组织中的分布，并用荧光定量PCR技术分析了其对细菌刺激的响应，结果表明PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，能响应热致

5、死鳗弧菌刺激而增强表达，说明PcLGBP基因可能参与螯虾的细菌防御反应。 利用酶联免疫法对重组PcLGBP蛋白与细菌和真菌表面多糖的结合活性进行了鉴定，表明重组PcLGBP蛋白能与来源于革兰氏阴性细菌的脂多糖和来源于真菌的-1，3-葡聚糖结合，而对来源于革兰氏阳性细菌的肽聚糖则没有结合活性。为进一步了解PcLGBP基因在细菌防御中的作用，利用RNA干扰技术沉默PcLGBP基因的表达，并用三种不同的病原菌进行了细菌侵染实验。PcLGBP基因沉默显著降低了克氏原螯虾对革兰氏阴性细菌的防御能力，而对革兰氏阳性细菌侵染没有显著的影响。 PcLEC基因的cDNA全序列包含一个813bp的ORF，编码27

6、1个氨基酸，在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，以及一段富含甘基酸的序列，在C末端有一个糖识别结构域(CarbohLydrate recognition domain，CRD)。另外还有四个半胱氨酸残基，可能参与形成两对链内二硫键。PcLEC同甲壳动物、昆虫等物种的C型凝集素都有明显的序列相似性。空间结构预测表明，PcLEC与经典的半乳糖结合C-型凝集素具有相似的空间结构，有七个折叠，2个螺旋共九个二级结构元件，有两对二硫键和一个长环状结构，是一个经典的短型凝集素。利用实时定量PCR技术对PcLEC基因的组织表达和细菌刺激后的时序表达变化进行了检测。在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞等六个组

7、织中均检测到PcLEC基因的表达，其中在血细胞和肝胰腺中的表达量最高，而在肌肉、鳃和性腺中的表达量相对较低。同时，热致死的细菌注射能显著增强PcLEC基因的表达。对重组PcLEC蛋白进行凝菌实验表明重组PcLEC对大肠杆菌、鳗弧菌和藤黄微球菌都表现出依赖Ca2+的凝集效应，这种凝集效应能够被半乳糖和N-乙酰半乳糖胺抑制。酶联免疫实验进一步证实了PcLEC对半乳糖和N-乙酰半乳糖胺具有较强的结合活性。 本研究的结果表明PcLGBP和PcLEC分别为革兰氏阴性细菌结合蛋白和C型凝集素家族的两个模式识别受体。PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，PcLEC基因在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞中

8、均能表达，在血细胞和肝胰腺中表达量最高。二者均能够被热致死的鳗弧菌刺激表达上调。PcLGBP蛋白能够与革兰氏阴性细菌和真菌的表面多糖脂多糖以及-1，3-葡聚糖结合，介导克氏原螯虾革兰氏阴性细菌侵染的防御。PcLEC蛋白能够与半乳糖及其衍生物N-乙酰半乳糖胺结合，以钙离子依赖的方式凝集细菌。正文内容 模式识别受体(Pattern recognition receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分子模式(Pathogen associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系统。本研究首先在甲壳

9、动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标基因的表达。而且，这种RNA干扰介导的基因沉默效应能够系统性的发生，至少持续96小时，能够满足本研究中对模式识别受体基因功能鉴定的要求。 随后，利用RACE(Rapid Amp

10、lification of cDNA Ends)技术从克氏原螯虾(Procambarus clarkii)中克隆、鉴定了两个模式识别受体基因：脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因(命名为PcLGBP)和C-型凝集素基因(命名为PcLEC)。 PcLGBP基因cDNA全序列包含一个1107bp的开放阅读框(Open reading frame，ORF)，编码369个氨基酸。在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，表明PcLGBP是一个分泌的胞外蛋白。PcLGBP蛋白的氨基酸序列中包含一个糖基水解酶结构域和一个-1，3-糖苷键识别序列(Phe235-Asp253)以及两个细胞粘附位点(RGD106-1

11、08，157-159)和一个N糖基化位点(NRSI66-69)。在其类葡聚糖酶结构域还包含决定葡聚糖酶活性的保守氨基酸。同源性分析发现PcLGBP与甲壳类动物的脂多糖和-1，3葡聚糖结合蛋白LGBP(Lipopolysaccharide and p-1，3-glucan binding protein，LGBP)或-1，3葡聚糖结合蛋白(-1，3-glucan binding protein，BGBP)同源，与一些昆虫的革兰氏阴性细菌结合蛋白(Gram-negative bacteria protein，GNBP)及葡聚糖酶的一致性高于40。为分析PcLGBP基因的功能，通过半定量RT-PCR

12、方法研究了其在组织中的分布，并用荧光定量PCR技术分析了其对细菌刺激的响应，结果表明PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，能响应热致死鳗弧菌刺激而增强表达，说明PcLGBP基因可能参与螯虾的细菌防御反应。 利用酶联免疫法对重组PcLGBP蛋白与细菌和真菌表面多糖的结合活性进行了鉴定，表明重组PcLGBP蛋白能与来源于革兰氏阴性细菌的脂多糖和来源于真菌的-1，3-葡聚糖结合，而对来源于革兰氏阳性细菌的肽聚糖则没有结合活性。为进一步了解PcLGBP基因在细菌防御中的作用，利用RNA干扰技术沉默PcLGBP基因的表达，并用三种不同的病原菌进行了细菌侵染实验。PcLGBP基因沉默显著降低了克氏原螯虾

13、对革兰氏阴性细菌的防御能力，而对革兰氏阳性细菌侵染没有显著的影响。 PcLEC基因的cDNA全序列包含一个813bp的ORF，编码271个氨基酸，在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，以及一段富含甘基酸的序列，在C末端有一个糖识别结构域(CarbohLydrate recognition domain，CRD)。另外还有四个半胱氨酸残基，可能参与形成两对链内二硫键。PcLEC同甲壳动物、昆虫等物种的C型凝集素都有明显的序列相似性。空间结构预测表明，PcLEC与经典的半乳糖结合C-型凝集素具有相似的空间结构，有七个折叠，2个螺旋共九个二级结构元件，有两对二硫键和一个长环状结构，是一个经典的短型凝集

14、素。利用实时定量PCR技术对PcLEC基因的组织表达和细菌刺激后的时序表达变化进行了检测。在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞等六个组织中均检测到PcLEC基因的表达，其中在血细胞和肝胰腺中的表达量最高，而在肌肉、鳃和性腺中的表达量相对较低。同时，热致死的细菌注射能显著增强PcLEC基因的表达。对重组PcLEC蛋白进行凝菌实验表明重组PcLEC对大肠杆菌、鳗弧菌和藤黄微球菌都表现出依赖Ca2+的凝集效应，这种凝集效应能够被半乳糖和N-乙酰半乳糖胺抑制。酶联免疫实验进一步证实了PcLEC对半乳糖和N-乙酰半乳糖胺具有较强的结合活性。 本研究的结果表明PcLGBP和PcLEC分别为革兰氏阴性细菌结

15、合蛋白和C型凝集素家族的两个模式识别受体。PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，PcLEC基因在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞中均能表达，在血细胞和肝胰腺中表达量最高。二者均能够被热致死的鳗弧菌刺激表达上调。PcLGBP蛋白能够与革兰氏阴性细菌和真菌的表面多糖脂多糖以及-1，3-葡聚糖结合，介导克氏原螯虾革兰氏阴性细菌侵染的防御。PcLEC蛋白能够与半乳糖及其衍生物N-乙酰半乳糖胺结合，以钙离子依赖的方式凝集细菌。模式识别受体(Pattern recognition receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分子模式(Pathog

16、en associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系统。本研究首先在甲壳动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标基因的表达。而且，这种RNA干扰介导的基因沉默效应能

17、够系统性的发生，至少持续96小时，能够满足本研究中对模式识别受体基因功能鉴定的要求。 随后，利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术从克氏原螯虾(Procambarus clarkii)中克隆、鉴定了两个模式识别受体基因：脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因(命名为PcLGBP)和C-型凝集素基因(命名为PcLEC)。 PcLGBP基因cDNA全序列包含一个1107bp的开放阅读框(Open reading frame，ORF)，编码369个氨基酸。在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，表明PcLGBP是一个分泌的胞外蛋白。PcLGBP蛋白的氨基酸序列

18、中包含一个糖基水解酶结构域和一个-1，3-糖苷键识别序列(Phe235-Asp253)以及两个细胞粘附位点(RGD106-108，157-159)和一个N糖基化位点(NRSI66-69)。在其类葡聚糖酶结构域还包含决定葡聚糖酶活性的保守氨基酸。同源性分析发现PcLGBP与甲壳类动物的脂多糖和-1，3葡聚糖结合蛋白LGBP(Lipopolysaccharide and p-1，3-glucan binding protein，LGBP)或-1，3葡聚糖结合蛋白(-1，3-glucan binding protein，BGBP)同源，与一些昆虫的革兰氏阴性细菌结合蛋白(Gram-negative

19、bacteria protein，GNBP)及葡聚糖酶的一致性高于40。为分析PcLGBP基因的功能，通过半定量RT-PCR方法研究了其在组织中的分布，并用荧光定量PCR技术分析了其对细菌刺激的响应，结果表明PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，能响应热致死鳗弧菌刺激而增强表达，说明PcLGBP基因可能参与螯虾的细菌防御反应。 利用酶联免疫法对重组PcLGBP蛋白与细菌和真菌表面多糖的结合活性进行了鉴定，表明重组PcLGBP蛋白能与来源于革兰氏阴性细菌的脂多糖和来源于真菌的-1，3-葡聚糖结合，而对来源于革兰氏阳性细菌的肽聚糖则没有结合活性。为进一步了解PcLGBP基因在细菌防御中的作用，利

20、用RNA干扰技术沉默PcLGBP基因的表达，并用三种不同的病原菌进行了细菌侵染实验。PcLGBP基因沉默显著降低了克氏原螯虾对革兰氏阴性细菌的防御能力，而对革兰氏阳性细菌侵染没有显著的影响。 PcLEC基因的cDNA全序列包含一个813bp的ORF，编码271个氨基酸，在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，以及一段富含甘基酸的序列，在C末端有一个糖识别结构域(CarbohLydrate recognition domain，CRD)。另外还有四个半胱氨酸残基，可能参与形成两对链内二硫键。PcLEC同甲壳动物、昆虫等物种的C型凝集素都有明显的序列相似性。空间结构预测表明，PcLEC与经典的半乳糖结

21、合C-型凝集素具有相似的空间结构，有七个折叠，2个螺旋共九个二级结构元件，有两对二硫键和一个长环状结构，是一个经典的短型凝集素。利用实时定量PCR技术对PcLEC基因的组织表达和细菌刺激后的时序表达变化进行了检测。在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞等六个组织中均检测到PcLEC基因的表达，其中在血细胞和肝胰腺中的表达量最高，而在肌肉、鳃和性腺中的表达量相对较低。同时，热致死的细菌注射能显著增强PcLEC基因的表达。对重组PcLEC蛋白进行凝菌实验表明重组PcLEC对大肠杆菌、鳗弧菌和藤黄微球菌都表现出依赖Ca2+的凝集效应，这种凝集效应能够被半乳糖和N-乙酰半乳糖胺抑制。酶联免疫实验进一步证

22、实了PcLEC对半乳糖和N-乙酰半乳糖胺具有较强的结合活性。 本研究的结果表明PcLGBP和PcLEC分别为革兰氏阴性细菌结合蛋白和C型凝集素家族的两个模式识别受体。PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，PcLEC基因在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞中均能表达，在血细胞和肝胰腺中表达量最高。二者均能够被热致死的鳗弧菌刺激表达上调。PcLGBP蛋白能够与革兰氏阴性细菌和真菌的表面多糖脂多糖以及-1，3-葡聚糖结合，介导克氏原螯虾革兰氏阴性细菌侵染的防御。PcLEC蛋白能够与半乳糖及其衍生物N-乙酰半乳糖胺结合，以钙离子依赖的方式凝集细菌。模式识别受体(Pattern recognition

23、 receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分子模式(Pathogen associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系统。本研究首先在甲壳动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenae

24、us vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标基因的表达。而且，这种RNA干扰介导的基因沉默效应能够系统性的发生，至少持续96小时，能够满足本研究中对模式识别受体基因功能鉴定的要求。 随后，利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术从克氏原螯虾(Procambarus clarkii)中克隆、鉴定了两个模式识别受体基因：脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因(命名为PcLGBP)和C-型凝集素基因(命名为PcLEC)。 PcLGBP基因cDNA全序列包含一个1107bp的开放阅读框(Open reading frame，ORF)

25、，编码369个氨基酸。在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，表明PcLGBP是一个分泌的胞外蛋白。PcLGBP蛋白的氨基酸序列中包含一个糖基水解酶结构域和一个-1，3-糖苷键识别序列(Phe235-Asp253)以及两个细胞粘附位点(RGD106-108，157-159)和一个N糖基化位点(NRSI66-69)。在其类葡聚糖酶结构域还包含决定葡聚糖酶活性的保守氨基酸。同源性分析发现PcLGBP与甲壳类动物的脂多糖和-1，3葡聚糖结合蛋白LGBP(Lipopolysaccharide and p-1，3-glucan binding protein，LGBP)或-1，3葡聚糖结合蛋白(-1，3-g

26、lucan binding protein，BGBP)同源，与一些昆虫的革兰氏阴性细菌结合蛋白(Gram-negative bacteria protein，GNBP)及葡聚糖酶的一致性高于40。为分析PcLGBP基因的功能，通过半定量RT-PCR方法研究了其在组织中的分布，并用荧光定量PCR技术分析了其对细菌刺激的响应，结果表明PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，能响应热致死鳗弧菌刺激而增强表达，说明PcLGBP基因可能参与螯虾的细菌防御反应。 利用酶联免疫法对重组PcLGBP蛋白与细菌和真菌表面多糖的结合活性进行了鉴定，表明重组PcLGBP蛋白能与来源于革兰氏阴性细菌的脂多糖和来源于真

27、菌的-1，3-葡聚糖结合，而对来源于革兰氏阳性细菌的肽聚糖则没有结合活性。为进一步了解PcLGBP基因在细菌防御中的作用，利用RNA干扰技术沉默PcLGBP基因的表达，并用三种不同的病原菌进行了细菌侵染实验。PcLGBP基因沉默显著降低了克氏原螯虾对革兰氏阴性细菌的防御能力，而对革兰氏阳性细菌侵染没有显著的影响。 PcLEC基因的cDNA全序列包含一个813bp的ORF，编码271个氨基酸，在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，以及一段富含甘基酸的序列，在C末端有一个糖识别结构域(CarbohLydrate recognition domain，CRD)。另外还有四个半胱氨酸残基，可能参与形成两

28、对链内二硫键。PcLEC同甲壳动物、昆虫等物种的C型凝集素都有明显的序列相似性。空间结构预测表明，PcLEC与经典的半乳糖结合C-型凝集素具有相似的空间结构，有七个折叠，2个螺旋共九个二级结构元件，有两对二硫键和一个长环状结构，是一个经典的短型凝集素。利用实时定量PCR技术对PcLEC基因的组织表达和细菌刺激后的时序表达变化进行了检测。在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞等六个组织中均检测到PcLEC基因的表达，其中在血细胞和肝胰腺中的表达量最高，而在肌肉、鳃和性腺中的表达量相对较低。同时，热致死的细菌注射能显著增强PcLEC基因的表达。对重组PcLEC蛋白进行凝菌实验表明重组PcLEC对大肠

29、杆菌、鳗弧菌和藤黄微球菌都表现出依赖Ca2+的凝集效应，这种凝集效应能够被半乳糖和N-乙酰半乳糖胺抑制。酶联免疫实验进一步证实了PcLEC对半乳糖和N-乙酰半乳糖胺具有较强的结合活性。 本研究的结果表明PcLGBP和PcLEC分别为革兰氏阴性细菌结合蛋白和C型凝集素家族的两个模式识别受体。PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，PcLEC基因在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞中均能表达，在血细胞和肝胰腺中表达量最高。二者均能够被热致死的鳗弧菌刺激表达上调。PcLGBP蛋白能够与革兰氏阴性细菌和真菌的表面多糖脂多糖以及-1，3-葡聚糖结合，介导克氏原螯虾革兰氏阴性细菌侵染的防御。PcLEC蛋白

30、能够与半乳糖及其衍生物N-乙酰半乳糖胺结合，以钙离子依赖的方式凝集细菌。模式识别受体(Pattern recognition receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分子模式(Pathogen associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系统。本研究首先在甲壳动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集

31、素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标基因的表达。而且，这种RNA干扰介导的基因沉默效应能够系统性的发生，至少持续96小时，能够满足本研究中对模式识别受体基因功能鉴定的要求。 随后，利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术从克氏原螯虾(Procambarus clarkii)中克隆、鉴定了两个模式识别受体基因：脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因(命名为PcLGBP)和C-型凝集素基因(命名为P

32、cLEC)。 PcLGBP基因cDNA全序列包含一个1107bp的开放阅读框(Open reading frame，ORF)，编码369个氨基酸。在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，表明PcLGBP是一个分泌的胞外蛋白。PcLGBP蛋白的氨基酸序列中包含一个糖基水解酶结构域和一个-1，3-糖苷键识别序列(Phe235-Asp253)以及两个细胞粘附位点(RGD106-108，157-159)和一个N糖基化位点(NRSI66-69)。在其类葡聚糖酶结构域还包含决定葡聚糖酶活性的保守氨基酸。同源性分析发现PcLGBP与甲壳类动物的脂多糖和-1，3葡聚糖结合蛋白LGBP(Lipopolysaccha

33、ride and p-1，3-glucan binding protein，LGBP)或-1，3葡聚糖结合蛋白(-1，3-glucan binding protein，BGBP)同源，与一些昆虫的革兰氏阴性细菌结合蛋白(Gram-negative bacteria protein，GNBP)及葡聚糖酶的一致性高于40。为分析PcLGBP基因的功能，通过半定量RT-PCR方法研究了其在组织中的分布，并用荧光定量PCR技术分析了其对细菌刺激的响应，结果表明PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，能响应热致死鳗弧菌刺激而增强表达，说明PcLGBP基因可能参与螯虾的细菌防御反应。 利用酶联免疫法对重组

34、PcLGBP蛋白与细菌和真菌表面多糖的结合活性进行了鉴定，表明重组PcLGBP蛋白能与来源于革兰氏阴性细菌的脂多糖和来源于真菌的-1，3-葡聚糖结合，而对来源于革兰氏阳性细菌的肽聚糖则没有结合活性。为进一步了解PcLGBP基因在细菌防御中的作用，利用RNA干扰技术沉默PcLGBP基因的表达，并用三种不同的病原菌进行了细菌侵染实验。PcLGBP基因沉默显著降低了克氏原螯虾对革兰氏阴性细菌的防御能力，而对革兰氏阳性细菌侵染没有显著的影响。 PcLEC基因的cDNA全序列包含一个813bp的ORF，编码271个氨基酸，在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，以及一段富含甘基酸的序列，在C末端有一个糖识别

35、结构域(CarbohLydrate recognition domain，CRD)。另外还有四个半胱氨酸残基，可能参与形成两对链内二硫键。PcLEC同甲壳动物、昆虫等物种的C型凝集素都有明显的序列相似性。空间结构预测表明，PcLEC与经典的半乳糖结合C-型凝集素具有相似的空间结构，有七个折叠，2个螺旋共九个二级结构元件，有两对二硫键和一个长环状结构，是一个经典的短型凝集素。利用实时定量PCR技术对PcLEC基因的组织表达和细菌刺激后的时序表达变化进行了检测。在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞等六个组织中均检测到PcLEC基因的表达，其中在血细胞和肝胰腺中的表达量最高，而在肌肉、鳃和性腺中的表

36、达量相对较低。同时，热致死的细菌注射能显著增强PcLEC基因的表达。对重组PcLEC蛋白进行凝菌实验表明重组PcLEC对大肠杆菌、鳗弧菌和藤黄微球菌都表现出依赖Ca2+的凝集效应，这种凝集效应能够被半乳糖和N-乙酰半乳糖胺抑制。酶联免疫实验进一步证实了PcLEC对半乳糖和N-乙酰半乳糖胺具有较强的结合活性。 本研究的结果表明PcLGBP和PcLEC分别为革兰氏阴性细菌结合蛋白和C型凝集素家族的两个模式识别受体。PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，PcLEC基因在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞中均能表达，在血细胞和肝胰腺中表达量最高。二者均能够被热致死的鳗弧菌刺激表达上调。PcLGBP蛋

37、白能够与革兰氏阴性细菌和真菌的表面多糖脂多糖以及-1，3-葡聚糖结合，介导克氏原螯虾革兰氏阴性细菌侵染的防御。PcLEC蛋白能够与半乳糖及其衍生物N-乙酰半乳糖胺结合，以钙离子依赖的方式凝集细菌。模式识别受体(Pattern recognition receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分子模式(Pathogen associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系统。本研究首先在甲壳动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对

38、克氏原螯虾(Procambarus clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标基因的表达。而且，这种RNA干扰介导的基因沉默效应能够系统性的发生，至少持续96小时，能够满足本研究中对模式识别受体基因功能鉴定的要求。 随后，利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术从克氏原螯虾(Procambarus clarkii

39、)中克隆、鉴定了两个模式识别受体基因：脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因(命名为PcLGBP)和C-型凝集素基因(命名为PcLEC)。 PcLGBP基因cDNA全序列包含一个1107bp的开放阅读框(Open reading frame，ORF)，编码369个氨基酸。在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，表明PcLGBP是一个分泌的胞外蛋白。PcLGBP蛋白的氨基酸序列中包含一个糖基水解酶结构域和一个-1，3-糖苷键识别序列(Phe235-Asp253)以及两个细胞粘附位点(RGD106-108，157-159)和一个N糖基化位点(NRSI66-69)。在其类葡聚糖酶结构域还包含决定葡聚糖酶活

40、性的保守氨基酸。同源性分析发现PcLGBP与甲壳类动物的脂多糖和-1，3葡聚糖结合蛋白LGBP(Lipopolysaccharide and p-1，3-glucan binding protein，LGBP)或-1，3葡聚糖结合蛋白(-1，3-glucan binding protein，BGBP)同源，与一些昆虫的革兰氏阴性细菌结合蛋白(Gram-negative bacteria protein，GNBP)及葡聚糖酶的一致性高于40。为分析PcLGBP基因的功能，通过半定量RT-PCR方法研究了其在组织中的分布，并用荧光定量PCR技术分析了其对细菌刺激的响应，结果表明PcLGBP基因是肝

41、胰腺特异表达的基因，能响应热致死鳗弧菌刺激而增强表达，说明PcLGBP基因可能参与螯虾的细菌防御反应。 利用酶联免疫法对重组PcLGBP蛋白与细菌和真菌表面多糖的结合活性进行了鉴定，表明重组PcLGBP蛋白能与来源于革兰氏阴性细菌的脂多糖和来源于真菌的-1，3-葡聚糖结合，而对来源于革兰氏阳性细菌的肽聚糖则没有结合活性。为进一步了解PcLGBP基因在细菌防御中的作用，利用RNA干扰技术沉默PcLGBP基因的表达，并用三种不同的病原菌进行了细菌侵染实验。PcLGBP基因沉默显著降低了克氏原螯虾对革兰氏阴性细菌的防御能力，而对革兰氏阳性细菌侵染没有显著的影响。 PcLEC基因的cDNA全序列包含一

42、个813bp的ORF，编码271个氨基酸，在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，以及一段富含甘基酸的序列，在C末端有一个糖识别结构域(CarbohLydrate recognition domain，CRD)。另外还有四个半胱氨酸残基，可能参与形成两对链内二硫键。PcLEC同甲壳动物、昆虫等物种的C型凝集素都有明显的序列相似性。空间结构预测表明，PcLEC与经典的半乳糖结合C-型凝集素具有相似的空间结构，有七个折叠，2个螺旋共九个二级结构元件，有两对二硫键和一个长环状结构，是一个经典的短型凝集素。利用实时定量PCR技术对PcLEC基因的组织表达和细菌刺激后的时序表达变化进行了检测。在肌肉、心、肝

43、胰腺、鳃、性腺和血细胞等六个组织中均检测到PcLEC基因的表达，其中在血细胞和肝胰腺中的表达量最高，而在肌肉、鳃和性腺中的表达量相对较低。同时，热致死的细菌注射能显著增强PcLEC基因的表达。对重组PcLEC蛋白进行凝菌实验表明重组PcLEC对大肠杆菌、鳗弧菌和藤黄微球菌都表现出依赖Ca2+的凝集效应，这种凝集效应能够被半乳糖和N-乙酰半乳糖胺抑制。酶联免疫实验进一步证实了PcLEC对半乳糖和N-乙酰半乳糖胺具有较强的结合活性。 本研究的结果表明PcLGBP和PcLEC分别为革兰氏阴性细菌结合蛋白和C型凝集素家族的两个模式识别受体。PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，PcLEC基因在肌肉、

44、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞中均能表达，在血细胞和肝胰腺中表达量最高。二者均能够被热致死的鳗弧菌刺激表达上调。PcLGBP蛋白能够与革兰氏阴性细菌和真菌的表面多糖脂多糖以及-1，3-葡聚糖结合，介导克氏原螯虾革兰氏阴性细菌侵染的防御。PcLEC蛋白能够与半乳糖及其衍生物N-乙酰半乳糖胺结合，以钙离子依赖的方式凝集细菌。模式识别受体(Pattern recognition receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分子模式(Pathogen associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系

45、统。本研究首先在甲壳动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标基因的表达。而且，这种RNA干扰介导的基因沉默效应能够系统性的发生，至少持续96小时，能够满足本研究中对模式识别受体基因功能鉴定的要求。 随后，利用RACE

46、(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术从克氏原螯虾(Procambarus clarkii)中克隆、鉴定了两个模式识别受体基因：脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因(命名为PcLGBP)和C-型凝集素基因(命名为PcLEC)。 PcLGBP基因cDNA全序列包含一个1107bp的开放阅读框(Open reading frame，ORF)，编码369个氨基酸。在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，表明PcLGBP是一个分泌的胞外蛋白。PcLGBP蛋白的氨基酸序列中包含一个糖基水解酶结构域和一个-1，3-糖苷键识别序列(Phe235-Asp253)以及两个细胞粘附位

47、点(RGD106-108，157-159)和一个N糖基化位点(NRSI66-69)。在其类葡聚糖酶结构域还包含决定葡聚糖酶活性的保守氨基酸。同源性分析发现PcLGBP与甲壳类动物的脂多糖和-1，3葡聚糖结合蛋白LGBP(Lipopolysaccharide and p-1，3-glucan binding protein，LGBP)或-1，3葡聚糖结合蛋白(-1，3-glucan binding protein，BGBP)同源，与一些昆虫的革兰氏阴性细菌结合蛋白(Gram-negative bacteria protein，GNBP)及葡聚糖酶的一致性高于40。为分析PcLGBP基因的功能，通

48、过半定量RT-PCR方法研究了其在组织中的分布，并用荧光定量PCR技术分析了其对细菌刺激的响应，结果表明PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，能响应热致死鳗弧菌刺激而增强表达，说明PcLGBP基因可能参与螯虾的细菌防御反应。 利用酶联免疫法对重组PcLGBP蛋白与细菌和真菌表面多糖的结合活性进行了鉴定，表明重组PcLGBP蛋白能与来源于革兰氏阴性细菌的脂多糖和来源于真菌的-1，3-葡聚糖结合，而对来源于革兰氏阳性细菌的肽聚糖则没有结合活性。为进一步了解PcLGBP基因在细菌防御中的作用，利用RNA干扰技术沉默PcLGBP基因的表达，并用三种不同的病原菌进行了细菌侵染实验。PcLGBP基因沉默

49、显著降低了克氏原螯虾对革兰氏阴性细菌的防御能力，而对革兰氏阳性细菌侵染没有显著的影响。 PcLEC基因的cDNA全序列包含一个813bp的ORF，编码271个氨基酸，在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，以及一段富含甘基酸的序列，在C末端有一个糖识别结构域(CarbohLydrate recognition domain，CRD)。另外还有四个半胱氨酸残基，可能参与形成两对链内二硫键。PcLEC同甲壳动物、昆虫等物种的C型凝集素都有明显的序列相似性。空间结构预测表明，PcLEC与经典的半乳糖结合C-型凝集素具有相似的空间结构，有七个折叠，2个螺旋共九个二级结构元件，有两对二硫键和一个长环状结构，

50、是一个经典的短型凝集素。利用实时定量PCR技术对PcLEC基因的组织表达和细菌刺激后的时序表达变化进行了检测。在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞等六个组织中均检测到PcLEC基因的表达，其中在血细胞和肝胰腺中的表达量最高，而在肌肉、鳃和性腺中的表达量相对较低。同时，热致死的细菌注射能显著增强PcLEC基因的表达。对重组PcLEC蛋白进行凝菌实验表明重组PcLEC对大肠杆菌、鳗弧菌和藤黄微球菌都表现出依赖Ca2+的凝集效应，这种凝集效应能够被半乳糖和N-乙酰半乳糖胺抑制。酶联免疫实验进一步证实了PcLEC对半乳糖和N-乙酰半乳糖胺具有较强的结合活性。 本研究的结果表明PcLGBP和PcLEC分

51、别为革兰氏阴性细菌结合蛋白和C型凝集素家族的两个模式识别受体。PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，PcLEC基因在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞中均能表达，在血细胞和肝胰腺中表达量最高。二者均能够被热致死的鳗弧菌刺激表达上调。PcLGBP蛋白能够与革兰氏阴性细菌和真菌的表面多糖脂多糖以及-1，3-葡聚糖结合，介导克氏原螯虾革兰氏阴性细菌侵染的防御。PcLEC蛋白能够与半乳糖及其衍生物N-乙酰半乳糖胺结合，以钙离子依赖的方式凝集细菌。模式识别受体(Pattern recognition receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分

52、子模式(Pathogen associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系统。本研究首先在甲壳动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标基因的表达。而且，这种RNA干扰

53、介导的基因沉默效应能够系统性的发生，至少持续96小时，能够满足本研究中对模式识别受体基因功能鉴定的要求。 随后，利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术从克氏原螯虾(Procambarus clarkii)中克隆、鉴定了两个模式识别受体基因：脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因(命名为PcLGBP)和C-型凝集素基因(命名为PcLEC)。 PcLGBP基因cDNA全序列包含一个1107bp的开放阅读框(Open reading frame，ORF)，编码369个氨基酸。在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，表明PcLGBP是一个分泌的胞外蛋白。PcLG

54、BP蛋白的氨基酸序列中包含一个糖基水解酶结构域和一个-1，3-糖苷键识别序列(Phe235-Asp253)以及两个细胞粘附位点(RGD106-108，157-159)和一个N糖基化位点(NRSI66-69)。在其类葡聚糖酶结构域还包含决定葡聚糖酶活性的保守氨基酸。同源性分析发现PcLGBP与甲壳类动物的脂多糖和-1，3葡聚糖结合蛋白LGBP(Lipopolysaccharide and p-1，3-glucan binding protein，LGBP)或-1，3葡聚糖结合蛋白(-1，3-glucan binding protein，BGBP)同源，与一些昆虫的革兰氏阴性细菌结合蛋白(Gram

55、-negative bacteria protein，GNBP)及葡聚糖酶的一致性高于40。为分析PcLGBP基因的功能，通过半定量RT-PCR方法研究了其在组织中的分布，并用荧光定量PCR技术分析了其对细菌刺激的响应，结果表明PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，能响应热致死鳗弧菌刺激而增强表达，说明PcLGBP基因可能参与螯虾的细菌防御反应。 利用酶联免疫法对重组PcLGBP蛋白与细菌和真菌表面多糖的结合活性进行了鉴定，表明重组PcLGBP蛋白能与来源于革兰氏阴性细菌的脂多糖和来源于真菌的-1，3-葡聚糖结合，而对来源于革兰氏阳性细菌的肽聚糖则没有结合活性。为进一步了解PcLGBP基因在

56、细菌防御中的作用，利用RNA干扰技术沉默PcLGBP基因的表达，并用三种不同的病原菌进行了细菌侵染实验。PcLGBP基因沉默显著降低了克氏原螯虾对革兰氏阴性细菌的防御能力，而对革兰氏阳性细菌侵染没有显著的影响。 PcLEC基因的cDNA全序列包含一个813bp的ORF，编码271个氨基酸，在N末端有一个17个氨基酸的信号肽，以及一段富含甘基酸的序列，在C末端有一个糖识别结构域(CarbohLydrate recognition domain，CRD)。另外还有四个半胱氨酸残基，可能参与形成两对链内二硫键。PcLEC同甲壳动物、昆虫等物种的C型凝集素都有明显的序列相似性。空间结构预测表明，PcL

57、EC与经典的半乳糖结合C-型凝集素具有相似的空间结构，有七个折叠，2个螺旋共九个二级结构元件，有两对二硫键和一个长环状结构，是一个经典的短型凝集素。利用实时定量PCR技术对PcLEC基因的组织表达和细菌刺激后的时序表达变化进行了检测。在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞等六个组织中均检测到PcLEC基因的表达，其中在血细胞和肝胰腺中的表达量最高，而在肌肉、鳃和性腺中的表达量相对较低。同时，热致死的细菌注射能显著增强PcLEC基因的表达。对重组PcLEC蛋白进行凝菌实验表明重组PcLEC对大肠杆菌、鳗弧菌和藤黄微球菌都表现出依赖Ca2+的凝集效应，这种凝集效应能够被半乳糖和N-乙酰半乳糖胺抑制。

58、酶联免疫实验进一步证实了PcLEC对半乳糖和N-乙酰半乳糖胺具有较强的结合活性。 本研究的结果表明PcLGBP和PcLEC分别为革兰氏阴性细菌结合蛋白和C型凝集素家族的两个模式识别受体。PcLGBP基因是肝胰腺特异表达的基因，PcLEC基因在肌肉、心、肝胰腺、鳃、性腺和血细胞中均能表达，在血细胞和肝胰腺中表达量最高。二者均能够被热致死的鳗弧菌刺激表达上调。PcLGBP蛋白能够与革兰氏阴性细菌和真菌的表面多糖脂多糖以及-1，3-葡聚糖结合，介导克氏原螯虾革兰氏阴性细菌侵染的防御。PcLEC蛋白能够与半乳糖及其衍生物N-乙酰半乳糖胺结合，以钙离子依赖的方式凝集细菌。模式识别受体(Pattern r

59、ecognition receptor，PRR)是由胚系基因编码的一类参与病原识别的蛋白质，它们能够与微生物表面病原相关的分子模式(Pathogen associatedmolecular pattern，PAMP)相互作用而激活宿主的先天性免疫系统。本研究首先在甲壳动物中建立了RNA干扰技术，并利用新建立RNA干扰技术结合基因原核重组、荧光定量PCR等分子生物学技术对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)的两个模式识别受体基因脂多糖和-1，3-葡聚糖结合蛋白基因以及C-型凝集素基因进行了研究。 首先，通过体外转录合成目标基因的双链RaNA，将双链RNA注射克氏原螯虾或凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)个体，建立了稳定RNA干扰技术，能够有效沉默目标