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文档简介
1、南京信息工程大学 滨江学院 实验(实习)报告实验(实习)名称 基于划分方法的聚类分析 实验(实习)日期 2011.6.10 指导教师 闫雷鸣 专业 软工(动画) 年级 2008 班次 (1)班 姓名 王圆媛 学号 20082358002 得分 一、 实验目的(1)学习聚类分析的基本概念、各种数据类型、聚类方法的分类。(2)学会典型的划分方法K均值和K中心点算法的基本原理、特点、优缺点。(3)应用Weka软件,学会导入数据文件,并对数据文件进行预处理。(4)学会并应用划分方法中K均值和K中心点算法对数据集进行聚类分析。二、实验准备:Bank-data三、实验要求:用划分方法中K均值和K中心点算法
2、对数据集进行聚类分析四、实验内容:4.1相关知识聚类分析中的“类”(cluster)和前面分类的“类”(class)是不同的,对cluster更加准确的翻译应该是“簇”。聚类的任务是把所有的实例分配到若干的簇,使得同一个簇的实例聚集在一个簇中心的周围,它们之间距离的比较近;而不同簇实例之间的距离比较远。对于由数值型属性刻画的实例来说,这个距离通常指欧氏距离。聚类分析中使用最常见的K均值(K-means)算法。K均值聚类方法的步骤如下。 (1)K均值算法首先随机的指定K个簇中心。(2)将每个实例分配到距它最近的簇中心,得到K个簇;(3)计分别计算各簇中所有实例的均值,把它们作为各簇新的簇中心。重
3、复(2)和(3),直到K个簇中心的位置都固定,簇的分配也固定。上述K均值算法只能处理数值型的属性,遇到分类型的属性时要把它变为若干个取值0和1的属性。WEKA将自动实施这个分类型到数值型的变换,而且Weka会自动对数值型的数据作标准化。Weka中列出了很多聚类算法。对于EM实现,用户可指定需要产生多少聚类,否则所用的算法可通过交叉验证来决定,在这种情况下,折的数量固定为10(除非训练实例小于10个)。用户可指定循环次数的最大值,并且为正常的密度计算设定可允许的最小标准差。SimpleKMeans使用k均值来聚类数据;聚类的数量通过一个参数设定。Cobweb实现了用于名词属性的Cobweb算法和
4、用于数值性属性的Classit算法。FarthestFirst实现Hochbaum和Shmoys远端优先遍历算法。MakeDensityBaseCluster是一个元聚类器,它包装一个聚类算法,使其返回一个概率分布和密度。它为每个聚类拟合一个离散分布,或一个对称的正态分布。4.2实验操作(1)在开始程序(或者桌面图标)中找到WEKA,单击即可启动WEKA,启动WEKA时会发现首先出现的一个命令提示符。接着将出现如下Weka GUI Chooser界面。(2)选择GUI Chooser中的探索者(Explorer)用户界面。点击预处理(Preprocess)功能按钮的,Open file,选择其
5、中的“bank-data”数据作关联规则的分析。打开“bank-data.csv”,可以看到“Current relation”、“Attributes”“Selected attribute”三个区域。(3)对于原始数据“bank-data.csv”的预处,删去属性“id”,保存为ARFF格式后,修改属性“children”为分类型。这样得到的数据文件为“bank.arff”,含600条实例。(4)用“Explorer”打开刚才得到的“bank.arff”,并切换到“Cluster”选项卡。点击“Choose” 在随后打开的层级式菜单中的选择“SimpleKMeans”,这是WEKA中实现K
6、均值的算法。点击旁边的文本框,修改“numClusters”为6,说明我们希望把这600条实例聚成6类,即K=6。下面的“seed”参数是要设置一个随机种子,依此产生一个随机数,用来得到K均值算法中第一次给出的K个簇中心的位置,先设定为10。(7)选中“Cluster Mode”的“Use training set”,点击“Start”按钮,观察右边“Clusterer output”给出的聚类结果。也可以在左下角“Result list”中这次产生的结果上点右键,“View in separate window”在新窗口中浏览结果。(8)实验结果:结果中有这么一行字样: 这是评价聚类好坏的标
7、准,数值越小说明同一簇实例之间的距离越小。 “seed”参数的变化,导致得到的这个数值也发生变化。通过多尝试变化seed值,并取使得数值最小的seed值。 接下来“Cluster centroids:”之后列出了各个簇中心的位置。对于数值型的属性,簇中心就是它的均值(Mean);分类型的就是它的众数(Mode), 也就是说这个属性上取值为众数值的实例最多。对于数值型的属性,还给出了它在各个簇里的标准差(Std Devs)。 最后的“Clustered Instances”是各个簇中实例的数目及百分比。为了观察可视化的聚类结果,在左下方“Result list”列出的结果上右击,点“Visualize cluster assignments”。弹出的窗口给出了各实例的散点图。最上方的两个框是选择横坐标和纵坐标,第二行的“color”是散点图着色的依据,默认是根据不同的簇“Cluster”给实例标上不同的颜色。可以在这里点“Save”把聚类结果保存成ARFF文件。在这个新的ARFF文件中,“instance_number”属性表示某实例的编号,“Cluster”属性表示聚类算法给出的该实例所在的簇。4.3扩展学习(1)选择其他数据集来对其进行k-means聚类分析,并对其聚类结果进行分析研究。(2)通过对其参数的修正完善加深理解k-means聚
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