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文档简介

1、2003年一1. 萜:分子骨架可以看做是由两个或多个异戊二烯单位连接而成,根据异戊二烯的数目,萜可分为单萜、双萜、三萜和多萜等。一般不含脂肪酸,属于不可皂化脂质。2. 启动子:启动子是RNA聚合酶能够识别并与之结合,从而起始基因转录的一段DNA序列,通常位于基因上游,控制基因表达(转录)的起始时间和表达的程度。3. 循环式光合磷酸化:在循环式电子传递中,光驱动的电子从PS传递给铁氧化还原蛋白后不是进一步传递给NADP+,而是传递给细胞色素b6/f复合物,再经由质体蓝素(PC)而流回到PS。在此过程中, 电子循环流动, 促进质子梯度的建立,并与磷酸化相偶联,产生ATP,故称为循环式光合磷酸化。循

2、环式光合磷酸化的最终产物只有ATP。4. 抗体酶:具酶活性的抗体,或名催化性单克隆抗体,用过渡态类似物作为免疫原制取)5. 简并性:几个密码子编码同一个氨基酸的现象或同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象。二1. cGMP:3,5-环鸟苷酸。是细胞中的重要的第二信使。2. EDTA:乙二胺四乙酸 是一种金属螯合剂,可以螯合酶中的金属离子从而抑制酶的活性。如:提取DNA时,可以螯合Mg2+。防止DNA降解3. GSH:还原型谷胱甘肽即-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸,还原型谷胱甘肽在红细胞中作为巯基缓冲剂存在,维持血红蛋白和红细胞其它蛋白的半胱氨酸巯基处于还原态,结构式见第一册P1684. HbCO:结

3、合有一氧化碳的血红蛋白。CO因为HB的结合能力远高于氧气和二氧化碳,CO与铁卟啉紧密结合后,Fe、C和O三个原子直线排列,CO的直线结合受到远端组氨酸的位阻作用,从而结合力下降。降低CO的毒害作用。5. HMG-CoA: -羟基-甲基戊二酰CoA。是胆固醇合成过程中重要的中间产物,由一分子乙酰乙酰-CoA和一分子乙酰-CoA在HMG-CoA合酶的作用下生成,HMG-CoA还原酶作用下生成甲羟戊酸,HMG-CoA还原酶是重要的限速酶。三.1. (-)二硫键也参与高级结构2. (-)特异作用于甲硫氨酸羧基侧肽键3. (+)四1. VL 和VH;负责抗体与抗原的识别与结合2. 谷氨酸 第六位突变为缬

4、氨酸3. 苯丙氨酸和色氨酸(酪氨酸)P134. 受体酪氨酸磷脂酶5. 5%6.-氨基酸指氨基结合在位碳原子上如-丙氨酸是遍多酸的一个成分P1297. 赖氨酸和天冬氨酸8. 对氨基苯甲酸(四氢叶酸是一碳单位转移的重要辅酶,参与细菌分裂增殖所必须的嘌呤、嘧啶及氨基酸等物质的合成。由于叶酸不能透过细菌细胞壁,所以不能利用现成的叶酸,必须依赖自身二氢叶酸合成酶催化蝶啶和对氨基苯甲酸合成二氢蝶啶,再与谷氨酸生成二氢叶酸,并在二氢叶酸还原酶的作用下转变成四氢叶酸,磺胺药物的化学结构与对氨基苯甲酸相似(PABA),能竞争性地争夺二氢叶酸合成酶,使细菌的二氢叶酸合成受阻,不能合成四氢叶酸,最终影响核蛋白的合成

5、而抑菌。)9. 携带初H+外的一价阳离子穿过膜,离子载体抑制剂10. Vmax变小;Km变小11. DNA聚合酶不能从头起始合成,必须有一段RNA酶合成的引物12. 转移酶 连接酶13. 磷酸果糖激酶;反应式见P71下册14. ?经水解后的产物是氨基酸15. 终止密码子 色氨酸 通用密码子16. 腺苷琥珀酸 黄嘌呤核苷酸17. 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,辅酶起电子载体的作用18. P481,tRNA和rRNA中19. 3-polyA尾巴,修饰20. 活性和纯度五1. 又称RNA指导的DNA聚合酶。是以RNA为模板合成DNA的酶。前病毒学说,Temin发现致癌RNA病毒的复制行为与一般RNA病毒

6、不同,用特异的抑制物如放线菌素D(专门抑制DNA为模板的反应)可以抑制致癌RNA病毒的复制,但不能抑制一般RNA病毒的复制。说明致癌RNA复制过程中必然经过一个DNA中间体,并于1864年提出前病毒学说.Bader用嘌呤霉素来抑制静止细胞蛋白质的合成,发现这种细胞仍然可以感染劳氏肉瘤病毒,说明有关的酶不是感染后在细胞中合成的,而是由病毒携带进细胞的1970年美国科学家特明(H.M.Temin)和巴尔的摩(D.Baltimore)分别于动物致癌RNA病毒中发现的,他们并因此获得1975年度诺贝尔生理学或医学奖。逆转录病毒具有三种酶的活性:RNA指导的DNA聚合酶活性;DNA指导的DAN聚合酶活性

7、;核糖核酸酶H活性。病毒逆转录酶含Zn2+,以脱氧核苷三磷酸为底物,从5到3合成DNA,反应需要引物。这个酶在许多方面与DNA聚合酶相似。目前已发现不少动物反转录病毒,近年来也发现了几种人类反转录病毒。艾滋病毒也是一种反转录病毒。有的逆转录酶已提纯,可作为合成某些特定RNA的互补DNA的工具酶,也可用于DNA的序列分析和克隆重组DNA。当RNA致癌病毒,如鸟类劳氏肉瘤病毒(Rous sar-coma virus)进入宿主细胞后,其逆转录酶先催化合成与病毒RNA互补的DNA单链,继而复制出双螺旋DNA,并经另一种病毒酶的作用整合到宿主的染色体DNA中,此整合的DNA可能潜伏(不表达)数代,待遇适

8、合的条件时被激活,利用宿主的酶系统转录成相应的RNA,其中一部分作为病毒的遗传物质,另一部分则作为mRNA翻译成病毒特有的蛋白质。最后,RNA和蛋白质被组装成新的病毒粒子。在一定的条件下,整合的DNA也可使细胞转化成癌细胞。2. 测试透析过的水中的离子种类和浓度,加入原有酶中测试酶的活性,同时用EDTA螯合酶做对照,就可以判断是否是由于辅助因子问题3代谢调节是生物界普遍存在的环境的一种适应能力。不同的生物代谢调节方式的不同的,越高级的生物代谢调节越复杂,越低级的生物代谢调节越简单。归纳起来,生物的代谢调节可在细胞水平、激素水平、神经水平3个不同水平上进行。细胞水平调节是最基本、最原始的调节方式

9、,是通过调节某些酶的活性和酶的含量达到调节物质代谢的速率,以满足集体的需要。激素水平调节和神经水平调节都是高级的调节方式,但仍以细胞水平调节作为基础。一、 细胞水平的代谢调节细胞水平调节主要是通过细胞内代谢物质浓度的改变来调节某些酶促反应的速率,以满足机体的需要,所以细胞水平调节也称为酶水平调节或分子水平调节。细胞水平的调节主要包括酶的定位调节、酶含量的调节和酶活性的调节3种方式,其中以酶活性的调节最为重要。(一) 酶的定位调节在动物机体内,各种代谢途径都是由一系列酶催化的连续反应,每种酶在细胞内都有一定的位置。真核生物细胞内由于细胞被膜系统分隔成不同的细胞器,使酶形成区域划分布,保证了不同代

10、谢过程在细胞内的不同部位进行,使细胞代谢能顺利进行,而不致造成混乱。此外,酶的这种分隔分布使酶、辅助因子和底物在细胞器内高度浓缩,从而加快代谢反应的速率。(二)酶的活性调节在生物体内,酶活性的大小受到调节和控制,只有这样才不会引起某些代谢产物的不足或积累,也不会造成某些底物的缺乏或过剩,使得各种代谢产物的含量保持着动态平衡。酶活性的调节是细胞中最快速,最经济的调节方式。酶活性调节不是由于代谢途径中全部酶活性的改变,而常常只取决于某些甚至某一个关键酶活性的变化。这些酶又称调节酶、关键酶或限速酶(表12-2)。表12-2 主要代谢途径的限速酶代谢途径限速酶糖酵解途径己塘激酶、1 - 磷酸果糖激酶、

11、丙酮酸激酶磷酸戊糖途径葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶三羧酸循环柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶、-酮戊二酸脱氢酶复合体糖异生丙酮酸羧化酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、果糖-1,6- 二磷酸酶、葡萄糖-6-磷酸酶(三)酶的含量调节 生物体除通过改变酶分子的结构来调节细胞内原有酶的活性快速适应需要外,还可通过改变酶的合成或降解速率以控制酶的绝对含量来调节代谢。但酶蛋白的合成与降解调节需要消耗能量,所需时间和持续时间都较长,故酶的含量的调节属迟缓调节。如:酶蛋白合成的诱导与阻遏 、酶蛋白降解的调控 二、激素对物质代谢的调节激素是一类由特定的细胞合成并分泌的化学物质,它随血液循环至全身,作用于特定的靶组织或靶细胞,

12、引起细胞物质代谢沿着一定的方向进行而产生特定的生物学效应。激素对特定的组织或细胞发挥作用,是由于该组织或细胞具有能特异识别和结合相应激素的受体。激素作为第一信使与受体结合后,受体分子的构象发生改变而引起一系列生物学效应。按激素受体在细胞的不同部位,可将激素分为细胞膜受体激素和细胞内受体激素两类。(一)、激素通过细胞膜受体的调节激素通过细胞膜受体的调节作用通常通过靶细胞膜上的特异性 G蛋白受体起作用,即激素到达靶细胞后,先与细胞膜上的特异受体结合,激活G蛋白,G蛋白在激活细胞内膜的腺苷酸环化酶,活化后的腺苷酸环化酶可催化ATP转化为cAMP,cAMP作为激素的第二信使,再激活胞内的蛋白激酶A(P

13、KA),产生一系列的生理效应。这样,激素的信号通过一个酶促的酶活性的级联发大系统逐级放大,使细胞在短时间没作出快速应答反应。例如,肾上腺素作用与肌细胞受体导致肌糖原分解的过程,肾上腺素的信息经cAMP传达到细胞内,同时抑制糖原合酶b(无活性)脱磷酸化转变为糖原合酶a ( 有活性)。从而在瞬间内使糖原分解,以适应动物在应激状态下能量的要求此外,胰高血糖素,促肾上腺皮质激素,甲状旁腺素,促甲状腺素,促卵泡素和黄体素等都属于胞外激素,都是cAMP为第二信使产生生理效应。(二)、激素通过细胞内受体的调节有一些脂溶性的激素,如固醇类激素,甲状腺素,前列腺素等,易于透过细胞膜进入细胞内,直接与胞质内或核内

14、的特异受体以非共价键进行可逆结合,形成激素-受体复合物使受体活化,活化后的受体型再结合与DNA片段中特定的核苷酸序列,促进或阻止基因的表达,调节蛋白质(酶)的生物合成,产生一系列的生物学效应(图12-10)图12-10激素通过细胞内受体的调节途径三、神经水平的代谢调节 机体主要通过神经体液途径对各组织的物质代谢进行调节,以适应不断变化的内外环境,力求在动态中维持相对的稳定,以维持正常生命活动。现以应激为例简要说明整体水平的代谢调节。应激是动物体受到一些诸如创伤,剧痛,冻伤,缺氧,中毒,感染,以及剧烈情绪激动等异乎寻常的刺激所作出的一系列反应“紧张状态”。应激伴有一系列神经-体液的改变,包括交感

15、神经兴奋,肾上腺髓质和皮质激素分泌增加,血浆胰高血糖素和生长激素水平升高,胰岛素水平降低等,引起糖,脂肪和蛋白质等物质代谢发生相应变化。2004(一)一1. ubiquitin泛素一种76个氨基酸残基的高度保守的热稳定的小分子蛋白质,最初从牛胸腺分离,随后发现存在于所研究的所有组织的细胞中,包括动物、酵母、细菌和高等植物。核内和胞质中均存在,因其极为广泛的分布而得此名。它与蛋白质发生依赖于ATP的反应,结果是其末端与蛋白质的赖氨酸氨基缩合。被其标记的蛋白质会被降解.2. avidin 抗生物素蛋白 在新鲜的鸡蛋清中,含有的一种蛋白质,可以与生物素结合成无活性又不易消化吸收的物质,鸡蛋加热后这种

16、物质就会失活,目前在生物工程中该蛋白质也有较广应用。3. carbanion of TPP TPP的碳负离子:tpp噻唑环中的N原子和S原子之间的C原子形成负离子状态被称为C负离子,从而与丙酮酸的羰基发生加合作用。噻唑环中带正电荷的氮原子起电子穴作用,稳定负电荷的形成。4. dideoxy sequencing method 双脱氧测序法:又称Sanger测序法,通常DNA的复制需要:DNA聚合酶,单链DNA模板,带有3'-OH末端的单链寡核苷酸引物,4种dNTP(dATP、dGTP、dTTP和dCTP)。聚合酶用模板作指导,不断地将dNTP加到引物的3'-OH末端,使引物延伸

17、,合成出新的互补DNA链。如果加入一种特殊核苷酸,双脱氧核苷三磷酸(ddNTP),因为它与普通dNTP不同,在脱氧核糖的3位置缺少一个羟基,故不能同后续的dNTP形成磷酸二酯键。例如,存在ddCTP、dCTP和三种其他的dNTP(其中一种为-32P标记)的情况下,将引物、模板和DNA聚合酶一起保温,即可形成一种全部具有相同的5'-引物端和以ddC残基为3端结尾的一系列长短不一片段的混合物。经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离制得的放射性自显影区带图谱将为新合成的不同长度的DNA链中C的分布提供准确信息,从而将全部C的位置确定下来。采用类似的方法,在ddATP、ddGTP和ddTTP存在的条件下

18、,可同时制得分别以ddA、ddG和ddT残基为3'端结尾的三组长短不一的片段。将制得的四组混合物全部平行地点加在变性聚丙烯酸受凝胶电泳板上进行电泳,每组制品中的各个组分将按其链长的不同得到分离,从而制得相应的放射性自显影图谱。从所得图谱即可直接读得DNA的碱基序列。5. DNA fingerprinting DNA指纹:1984年英国莱斯特大学的遗传学家Jefferys及其合作者首次将分离的人源小卫星DNA用作基因探针,同人体核DNA的酶切片段杂交,获得了由多个位点上的等位基因组成的长度不等的杂交带图纹,这种图纹极少有两个人完全相同,故称为"DNA指纹",意思是它同

19、人的指纹一样是每个人所特有的。6. hyperuricemia高尿酸血:血液中存在异常高含量的尿酸,可能由嘌呤合成增加引起。 高尿酸血与痛风症相关。7. LDL receptor低密度脂蛋白受体 一种与载脂蛋白B相结合的细胞表面受体。可使LDL从血浆(发生细胞)内化,以调节胆固醇和LDL的合成从而调节血浆胆固醇的浓度。8. pyruvate dehydrogenase complex 丙酮酸脱氢酶复合体 催化丙酮酸、NAD+和辅酶A之间反应形成乙酰辅酶A、NADH和CO2(整个反应)的酶复合体。包含三个活性酶和五个辅酶。9. glucokinase (in liver) 葡萄糖激酶 哺乳动物肝

20、赃中特有的一种己糖激酶的同工酶,它与底物葡萄糖的亲和力很底,故只有当血液中葡萄糖浓度很高时它才能与之反应;同时,它不受高水平G-6-P的抑制,故可大量地吸纳血液中(过多)的葡萄糖。10. induced fit 诱导契合:酶和底物相互作用原理的一种学说。P38911. iron-sulfur cluster:铁硫簇 氧化磷酸化过程中,电子的转移需要由三个电子泵(NADH-Q还原酶、细胞色素还原酶、细胞色素氧化酶)完成,其中铁硫簇是NADH-Q的第二个辅基,起传递电子的作用。12. NADH-Q还原酶 氧化磷酸化过程中,电子的转移需要由三个电子泵(NADH-Q还原酶、细胞色素还原酶、细胞色素氧化

21、酶)完成。其中NADH-Q还原酶是第一个质子泵,又称为NADH脱氢酶,或复合体,相对分子量高达88000,至少含有34条多肽链,分别由核和线粒体基因编码,含有两个辅基:FMN和铁硫簇。13. proenzyme 酶原 某些酶在细胞内合成或初分泌时没有活性,这些没有活性的酶的前身称为酶原(zymogen),使酶原转变为有活性酶的作用称为酶原激活(zymogen activation)。比较著名的例子是消化酶的酶原(胃蛋白酶原,胰蛋白酶原,胰凝乳蛋白酶原)和血液凝固酶的酶原(凝血酶原,纤溶酶原)。酶原可以贮存在其合成部位而没有引起细胞或组织自我消化(水解)的危险,待细胞需要时再被激活。是酶活性调节

22、的一种方式。14. thermogenin 产热素 褐色脂肪线粒体内含有的一种激素,是一种含有两个亚基形成的二聚体蛋白质,其相对分子量为64000,该激素可被游离脂肪酸激活,也可被嘌呤核苷酸抑制,它刺激质子流,使其通过该激素蛋白并使氧化磷酸化解偶联从而产生热量p13915. substrate cycle底物循环 反应物和产物在两个酶的作用下的互变,如:F-6-P与F-1,6-P的互变。它的存在提高了调控的敏感性.二1. 增色效应 紫外 吸光度增加 双螺旋结构 2. 嘧啶 尿素 胞液 线粒体 谷氨酰胺 天冬氨酸3. 磷酰基 二氧化碳 电子 活化的葡萄糖 一碳单位 醛基4. 6-P-葡萄糖脱氢酶

23、 转醛酶 转酮酶 NADPH 6-磷酸-葡萄糖 还原力 糖酵解5. 谷胱甘肽还原酶 NADPH FAD Fe-S 6. Asp蛋白酶 含Zn蛋白酶 丝氨酸蛋白酶 巯基蛋白酶 天冬氨酸蛋白酶类7. DNA聚合酶 DNA聚合酶8. 4-羟脯氨酸 -羧基谷氨酸9. 完全伸展 链间氢键10. 杂交瘤细胞 B淋巴 肿瘤11. 编码序列 间插序列 中央外显子 12. 13. 强 2,3-二磷酸甘油酸 弱14. 叶酸 二氢叶酸还原酶 尿嘧啶 胸苷酸合酶 胸腺嘧啶 15, D L 脱羧三1. BE 2. AB 3. ABCE 4. A 5. C 6. CE 7. A 8. B 9. D 10. CD 11.

24、B 12. A 13. ADE 14. BCE 15. AB 16. AC 17. ADE 18. E 19. A 20. A四1.2. 移位2, 3, 4个质子获得的自由能(G = nFE=46E)分别为9.23, .13.8, 18.5 (kcal/mol), 合成1 mol ATP消耗7.3 kcal, 分别剩余1.93, 6.5, 11.2 kcal。这些能量驱动合成ATP (根据G = G0 +1.364 log k)直到k(ATP/ADPPi)值达101.4, 104.8, 108.2; 分离的合成ATP的线粒体悬浮液中此(实际)比值大于104., 故每合成1个ATP移位的质子数至

25、少为3。3(1)丙酮酸羧化酶 和生物素(见第一册P455页)(2)-酮戊二酸脱氢酶复合体中的二氢硫辛酰胺转乙酰基酶和流线酰胺之间(见第二册P95页最后一段3-5行)(3)脂肪酸合酶 :生物素和羧基载体蛋白中Lys的-氨基。羧化酶都以生物素为辅基, 都在酶的Lys 残基的-氨基与生物素的羧基之间形成酰胺键, 从而形成“长长的,可伸缩的分子线。2004(二)一1. Western blotting:蛋白质印记:但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以

26、非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。2. -chymotrypsin:-糜蛋白:酶原被胰蛋白酶水解(切断15-16键) -酶(已具活性)再切去两个二肽 -酶(稳定型酶)3. abzyme:抗体酶具酶活性的抗体,或名催化性单克隆抗体,用过渡态类似物作为免疫原制取4. carbanion of TPP:的碳负离子:tpp噻唑环中的N原子和S原子之间的C原子形成负离

27、子状态被称为C负离子,从而与丙酮酸的羰基发生加合作用。噻唑环中带正电荷的氮原子起电子穴作用,稳定负电荷的形成。5. charge-relay system:电荷中继系统(P387)胰凝乳蛋白酶活性部位由Ser195 His57 Asp102组成,这三个氨基酸残基连在一起形成一个电荷中继系统,从而使Ser195的羟基具有很高的亲核性。6. dideoxy sequence method:双脱氧测序法通常DNA的复制需要:DNA聚合酶,单链DNA模板,带有3'-OH末端的单链寡核苷酸引物,4种dNTP(dATP、dGTP、dTTP和dCTP)。聚合酶用模板作指导,不断地将dNTP加到引物的

28、3'-OH末端,使引物延伸,合成出新的互补DNA链。如果加入一种特殊核苷酸,双脱氧核苷三磷酸(ddNTP),因为它与普通dNTP不同,在脱氧核糖的3位置缺少一个羟基,故不能同后续的dNTP形成磷酸二酯键。例如,存在ddCTP、dCTP和三种其他的dNTP(其中一种为-32P标记)的情况下,将引物、模板和DNA聚合酶一起保温,即可形成一种全部具有相同的5'-引物端和以ddC残基为3端结尾的一系列长短不一片段的混合物。经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离制得的放射性自显影区带图谱将为新合成的不同长度的DNA链中C的分布提供准确信息,从而将全部C的位置确定下来。采用类似的方法,在ddATP、

29、ddGTP和ddTTP存在的条件下,可同时制得分别以ddA、ddG和ddT残基为3'端结尾的三组长短不一的片段。将制得的四组混合物全部平行地点加在变性聚丙烯酸受凝胶电泳板上进行电泳,每组制品中的各个组分将按其链长的不同得到分离,从而制得相应的放射性自显影图谱。从所得图谱即可直接读得DNA的碱基序列。7. hyperuricemia:高尿酸血症血液中存在异常高含量的尿酸,可能由嘌呤合成增加引起。 高尿酸血与痛风症相关。8. ELISA:酶联免疫吸附测定 是一种基于抗原-抗体相互作用的分离蛋白质的方法。原理都是以待测抗原(或抗体)和酶标抗体(或抗原)的特异结合反应为基础,然后通过酶活力测定

30、来确定抗原(抗体)含量。基本步骤参见课本P2789. helix-to-coil transition:螺旋线团转变DNA变性过程中由双螺旋状态转变为线性状态的过程。10. glucokinase(in liver)肝脏中的葡萄糖激酶:哺乳动物肝赃中特有的一种己糖激酶的同工酶,它与底物葡萄糖的亲和力很底,故只有当血液中葡萄糖浓度很高时它才能与之反应;同时,它不受高水平G-6-P的抑制,故可大量地吸纳血液中(过多)的葡萄糖。11. lectin:一类非抗体的蛋白质或糖蛋白,能够与糖类专一的非共价结合,并具有凝集细胞和沉淀聚糖和复合糖的作用。12. malate-aspartate shuttle

31、:苹果酸-天冬氨酸穿梭途径 是在心脏和肝脏的细胞溶胶内NADH的电子进入线粒体的途径 此系统以苹果酸和天冬氨酸为载体,在苹果酸脱氢酶和谷草转氨酶的催化下。将胞液中NADH的氢原子带入线粒体交给NAD+,再沿NADH氧化呼吸链进行氧化磷酸化。因此,经此穿梭系统带入一对氢原子可生成3分子ATP 13. PRPP:磷酸核糖焦磷:生物合成多种含氮环状化合物极其衍生物中必不可少的反应物,特别在合成组氨酸、核苷酸中的嘌呤和嘧啶时。14. substrate cycle:底物循环 反应物和产物在两个酶的作用下的互变,如:F-6-P与F-1,6-P的互变。它的存在提高了调控的敏感性.15. pyruvate

32、dehydrogenase complex:丙酮酸脱氢酶复合体 催化丙酮酸、NAD+和辅酶A之间反应形成乙酰辅酶A、NADH和CO2(整个反应)的酶复合体。包含三个活性酶和五个辅酶。二1. ATP NAD FAD NADPH PPP 含腺嘌呤 2. 丙酮酸脱氢酶 二氢硫辛酰转乙酰基酶 二氢硫辛酸脱氢酶 -酮戊二酸脱氢酶复合体 E33. 谷胱甘肽还原酶 NADPH FAD Fe-S4. Asp蛋白酶 含Zn蛋白酶 丝氨酸蛋白酶 巯基蛋白酶 天冬氨酸蛋白酶类5. DNA聚合酶 DNA聚合酶6. 嘧啶 尿素 胞液 线粒体 谷氨酰胺 天冬氨酸7. 变性 退火 延伸8. 核酸内切酶 载体 质粒 噬菌体9

33、. 高度伸展 链间氢键10. 杂交瘤细胞 B淋巴 肿瘤11. 三级 不同 一级结构 三级结构12. 强 2,3-二磷酸甘油酸 弱13. 别嘌呤醇 尿酸 IMP 黄嘌呤氧化酶14. HMG-CoA 甲羟戊酸 HMG-CoA还原酶15. 4-羟脯氨酸 -羧基谷氨酸三1.BE 2 AB 3 ABCE 4 AD 5 C 6 CE, 7 A, 8 B, 9 CD, 10 CD, 11 B, 12 A, 13 ADE, 14 BCDE, 15 AB 16 AC, 17 ADE 18 E 19 A, 20ª四1.2. 脂代谢Fatty acid: 8(acetyl CoA) +7(FADH2) +

34、7(NADH) =8 x (3 NADH + FADH2 ) +7(FADH2) +7(NADH) =31 NADH+ 15 FADH2 In oxidative phosphorylation: 4H+ + 4e + O2 =2H2O (每一个还原型电子载体传递一对电子,46个电子载体(92个电子)共需23个氧分子作为电子受体。每个软脂酸(即8个acetyl CoA)完全氧化生成16个CO2, CO2 :O2 =16:230.7糖代谢: Glucose: C6H12O6 +6O2 =6CO2+6H2O 糖酵解:2NADH;丙酮酸脱氢:2NADH (呼出2个CO2 );TCA循环(呼出4个CO

35、2 ) :6个NADH 和2个FADH2 ;共产生12个还原型电子载体(24个电子),即需6个氧分子作为电子受体; 共呼出6个CO2 CO2 :O2 =1 以及其它(如蛋白等)有机物质的氧化(量较小)综上所述: CO2 :O2 0.83. (1)丙酮酸羧化酶 和生物素(见第一册P455页)(2)-酮戊二酸脱氢酶复合体中的二氢硫辛酰胺转乙酰基酶和流线酰胺之间(见第二册P95页最后一段3-5行、第一册P459)(3)脂肪酸合酶 :生物素和羧基载体蛋白中Lys的-氨基。羧化酶都以生物素为辅基, 都在酶的Lys 残基的-氨基与生物素的羧基之间形成酰胺键, 从而形成“长长的,可伸缩的分子线。作用:实现二

36、氧化碳或硫辛酰胺的定向转运。2005年(一)一1.melting temperature of DNA DNA的熔解温度:DNA的双螺旋结构解旋到一半时的温度,又称解链温度。2.-carboxyglutamate -羧基谷氨酸:- 碳原子上有两个羧基,依赖于VK的酶系催化凝血酶原氨基端(区域的)十个谷氨酸成为- 羧基谷氨酸(正常的凝血酶原)ca2+的强螯合剂具凝血活性的凝血酶(VK缺乏或其拮抗物的存在,无法合成有效的凝血酶原进而生成凝血酶,使出血不止)3. hairpin bend:发夹转角即-转角是多肽链中常见的二级结构,连接蛋白质分子中的二级结构(-螺旋和-折叠),使肽链走向改变的一种非重

37、复多肽区,一般含有216个氨基酸残基。常见的转角含有4个氨基酸残基,有两种类型。转角I的特点是:第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氮之间形成氢键;转角II的第3个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。4. protein domain:蛋白质结构域。通常由一个外显子编码。是多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成的三级结构的局部折叠区,它们是相对独立的紧密球状实体。5. phosphodiester bond:磷酸二脂键:一种化学基团,指一分子磷酸与两个醇(羟基)酯化形成的两个酯键。该酯键成了两个醇之间的桥梁。例如一个核苷的3羟基与另一个核苷的5羟基与同一分子磷酸酯化,

38、就形成了一个磷酸二酯键。6. splite gene:断裂基因 真核生物的基因通常编码序列被不编码序列间隔开来,即外显子被内含子间隔,称为断裂基因。7. chromosome walking:染色体步移 在克隆基因组基因时,已知该基因在染色体上的位置但没有该基因的序列信息,无法制备相应的探针,因此无法直接筛查文库去克隆基因。此时,如果知道离开该基因一定距离上的DNA序列,则可用这个DNA序列作探针,通过染色体步移来逐步接近并最后达到待克隆的基因。其基本原理是用探针筛查文库,得到阳性克隆后,将这个重组载体中的插入片段分离出来,然后用这个片段的末端部分(注意不能包含重复序列)作为新一轮筛查文库的探

39、针;得到新的重组载体中的插入片段,同上一个插入片段的末端部分(即探针序列)是重叠的,共有的。也就是这两个片段是在同一条染色体上相互邻接的。于是,再用新得的插入片段的末端部分作为探针,再去筛查文库。通过一系列的操作,得到的插入片段逐渐连接延伸,最后可以步移到待克隆的基因。8. proximal histidine:近端组氨酸即F8组氨酸 是血红蛋白中十分保守的氨基酸残基,在氧结合过程中与血红素铁离子直接结合,参与氧的运输。9. concerted model:协同模型 一个分子中所有亚单位一致地进行T,R态转换,对称性得以保持。比如一种变构酶是由两个相同亚基组成的寡聚体,存在两种状态:RR和TT

40、。R状态表示松驰状态,具有高活性,对底物的亲和力大;而T状态表示紧张状态,具有很低的活性或不具有活性,与底物的亲和力很小。R状态与T状态可以互变。分子的构象或是RR或是TT,而不是RT.10. apoprotein:脱辅蛋白. 脱辅蛋白+辅基=全蛋白。例如:脱血红素辅基的血红蛋白就是脱辅蛋白。11. macro CoA:巨辅酶A:; 指ACP(酰基载体蛋白),它含有与辅酶A相同的磷酸泛酰巯基乙胺头部(与脂肪酸合成过程中各中间物连接);与此部分相连接的是”巨大”的由77个氨基酸残基构成的一条多肽链。12. hyperammonemia高血氨症:尿素循环缺陷导致血液中氨类含量过高而导致的智力迟钝、

41、新生儿死亡等症状。如:缺乏精氨酸酶等。13. urea cycle 尿素循环:一组循环反应, 其中由氨基酸代谢产物两个氨基和一个二氧化碳生成一个尿素排出体外。14. UDP-glucose尿苷二磷酸葡萄糖; 一种核苷二磷酸糖,作为糖原合成(和其它许多合成)反应中葡萄糖基的供体。15. retroviruses反转录病毒:为RNA病毒。Viral RNA(+) DNA()-RNA (+) hybrid DNA transcript of viral RNA即DNA()单链 double-helical viral DNA(±) 随后整合进宿主细胞的染色体中。并随之复制,繁殖。二1. 乙

42、酰辅酶A;乙醛;草酰乙酸(P110)2. 磷酸甘油醛脱氢酶;异柠檬酸脱氢酶;a-酮戊二酸脱氢酶复合体;苹果酸脱氢酶; L-3-羟脂酰-CoA3. 氧化脱羧生成-酮戊二酸进入TCA途径;裂解为琥珀酸和乙醛酸。4. 2,4-二硝基苯酚;抑制ATP形成而不抑制电子传递过程;寡霉素;抑制氧又一直ATP形成;短杆菌肽;可携带初H+外的一架阳离子,从而破坏质子梯度。5. 磷酸戊糖途径;三羧酸转运途径。6. 3-磷酸甘油醛;6-磷酸果糖;糖酵解;ppp。延胡索酸;糖类;氨基酸7. 二氢硫辛酰胺脱氢酶 硫辛酰胺8. 甲酸;甲醛;甲醇;二氧化碳;生物素9. Asp蛋白酶 含Zn蛋白酶 丝氨酸蛋白酶 巯基蛋白酶1

43、0. D -Ala- D Ala;糖肽转肽酶11. 延胡索酸;氨基12. D型;L型;型13. 磷酸烯醇式丙酮酸;乙酰乙酰ACP14. Gly;脯氨酸;组氨酸;咪唑基15. 小;大三1 BCE 2 ABC 3 A 4 BC, 5 ACDE 6 A 7 AC, 8 ABCDE 9, ACE 10 ABCE 11 B CDE 12 BCD 13 ABDE 14 DE 15 A四.(所给试卷不全,网上没搜到。)2005年()一1. glycerol phosphate shuttle磷酸甘油穿梭:这一系统以3-磷酸甘油和磷酸二羟丙酮为载体,在两种不同的-磷酸甘油脱氢酶的催化下,将胞液中NADH的氢原

44、子带入线粒体中,交给FAD,再沿琥珀酸氧化呼吸链进行氧化磷酸化。因此,如NADH通过此穿梭系统带一对氢原子进入线粒体,则只得到2分子ATP。2. one-carbon group一碳单位:指某些氨基酸分解代谢过程中产生含有一个碳原子的基团,包括甲基、亚甲基、甲烯基、甲炔基、甲酚基及亚氨甲基等,一碳单位的载体一般为四氢叶酸。3. melting temperature of DNA熔解温度:DNA的双螺旋结构解旋到一半时的温度,又称解链温度。4. isoenzyme同工酶:生物体内催化相同反应而分子结构不同的酶。如乳酸脱氢酶LDH就具有五种同工酶。5. isoelectric focusing

45、等电聚焦:分离两性分子,特别是分离蛋白质的一种技术。它是根据在一个电场的影响下这些两性分子在PH梯度上的分布情况进行分离。6. hairpin bend发夹转角:即-转角是多肽链中常见的二级结构,连接蛋白质分子中的二级结构(-螺旋和-折叠),使肽链走向改变的一种非重复多肽区,一般含有216个氨基酸残基。常见的转角含有4个氨基酸残基,有两种类型。转角I的特点是:第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氮之间形成氢键;转角II的第3个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。7. protein domain蛋白质结构域:通常由一个外显子编码。是多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形

46、成的三级结构的局部折叠区,它们是相对独立的紧密球状实体。8. split gene断裂基因:真核生物的基因通常编码序列被不编码序列间隔开来,即外显子被内含子间隔,称为断裂基因。9. chromosome walking染色体步移:在克隆基因组基因时,已知该基因在染色体上的位置但没有该基因的序列信息,无法制备相应的探针,因此无法直接筛查文库去克隆基因。此时,如果知道离开该基因一定距离上的DNA序列,则可用这个DNA序列作探针,通过染色体步移来逐步接近并最后达到待克隆的基因。其基本原理是用探针筛查文库,得到阳性克隆后,将这个重组载体中的插入片段分离出来,然后用这个片段的末端部分(注意不能包含重复序

47、列)作为新一轮筛查文库的探针;得到新的重组载体中的插入片段,同上一个插入片段的末端部分(即探针序列)是重叠的,共有的。也就是这两个片段是在同一条染色体上相互邻接的。于是,再用新得的插入片段的末端部分作为探针,再去筛查文库。通过一系列的操作,得到的插入片段逐渐连接延伸,最后可以步移到待克隆的基因。10. SDS PAGE SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳:SDS是阴离子去污剂,作为变性剂和助溶试剂,它能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋白分子的二、三级结构。而在样品和凝胶中加入还原剂和SDS后,分子被解聚成多肽链,解聚后的氨基酸侧链和SDS结合成蛋白- SDS胶束,所带的负电荷大大超过了蛋

48、白原有的电荷量,这样就消除了不同分子间的电荷差异和结构差异。蛋白质亚基的电泳迁移率主要取决于亚基分子量的大小,电荷因素可以忽视。从而只根据蛋白质的亚基分离之。11. Bohr effect波尔效应:PH值降低或CO2增加促进氧气释放的现象12. glutathione reductase谷胱甘肽还原酶:催化使还原力NADPH中的电子通过FAD传递到氧化型谷胱甘肽上使其还原为还原型谷胱甘肽NADPH+GSSG-GSH+GSH+NADP+,是体内重要的抗氧化剂13. HGPRT次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶:Hypoxanthine (or guanine)+ PRPPIMP (or GMP)+

49、PPi.14. hydroxyproline羟脯氨酸:在新形成的胶原蛋白中许多脯氨酸残基羟基化形成羟脯氨酸,从而使三股螺旋的胶原蛋白更加稳定,羟化过程有维生素C参与。若缺乏维生素C则可能导致败血病。15. F-1、6-Bpase果糖-1、6-二磷酸酶:催化1、6-二磷酸果糖形成6-磷酸果糖,克服糖异生途径中不可逆的反应。在体内具有重要的调节作用。二1. 胶原蛋白 氢 Pro Hyp2. 一级结构3. 2,3-双脱氧腺嘌呤核苷酸4. 硫辛酰胺 丙酮酸脱氢酶复合体 NAD+ 苹果酸脱氢酶 FAD 琥珀酸脱氢酶5. Lys -氨基 醛基 希夫碱 6. 乙酰-CoA 乙醛 草酰乙酸7. 氧化脱羧进入T

50、CA循环 裂解为琥珀酸和乙醛酸8. PPP途径 三羧酸转运体系9. 二氢硫辛酰胺脱氢酶 硫辛酰胺10. Asp蛋白酶 含Zn蛋白酶 丝氨酸蛋白酶 巯基蛋白酶11. D -Ala- D Ala 糖肽转肽酶12. 延胡索酸 氨基13. D L 14. PEP 乙酰乙酰ACP15. Gly Pro 亚氨基 组氨酸 咪唑基三1 BCE 2,ABC 3,A, 4 BC, 5 ACDE, 6 A, 7 AC, 8 ABCDE 9, ACE 10 ABCE 11, BCDE, 12 BCD, 13 ABDE, 14 DE 15, A四1.设计引物将基因扩增出来,用Mus进行酶切,与正常基因一起进行电泳,若产

51、生两条条带则说明突变。原理:PCR、琼脂糖凝胶电泳。第二条链的Glu被Val代替。2electron sink 电子穴: electrophilic亲电子 atom or group of atoms that can capture an electron from another part of a molecular system.(1)A key feature of TPP: C atom between the N and S atoms in the thiazole噻唑 ring ionizes to form a carbanion碳负离子, which readily ad

52、ds to the carbonyl group of Pyr. The positively charged ring nitrogen of TPP then acts as an electron sink to stabilize the formation of a negative charge.噻唑环中带正电荷的氮原子起电子穴作用,稳定负电荷的形成(从而促成与底物的结合).(2)Aldolase醛缩酶forms a Schiff base希夫碱 with DHAPThe condensation process of DHAP and GAl-3-P to form F-1,6-

53、BP (the reverse of the glycolytic reaction)质子化 希夫碱(作为电子穴)形成促进烯醇化阴离子形成与带正电的甘油醛缩合enolate anion + aldehyde group of GAl-3-Pprotonated Schiff base of F-1,6-BPits deprotonation and hydrolyzation 去质子化和水解3. 活化消耗两个ATP 每一轮氧化生成一个乙酰-CoA,一个FADH2和一个NADH 每一个乙酰-CoA进入三羧酸循环生成3个NADH和一个FADH2,再水平磷酸化得到一个ATP 油酸一共18个C,经过8

54、轮氧化得到9个乙酰CoA。因为存在一个双键,所以少生成一分子FADH2 总计7个ATP(扣除最初2个消耗),16个FADH2和35个NADH 按新的算法,一个FADH2生成1.5个ATP,一个NADH生成2.5个ATP,则共计:7+16*1.5+35*2.5=118.5个ATP2006年()一1. ELISA:酶联免疫吸附测定:酶联免疫吸附测定 是一种基于抗原-抗体相互作用的分离蛋白质的方法。原理都是以待测抗原(或抗体)和酶标抗体(或抗原)的特异结合反应为基础,然后通过酶活力测定来确定抗原(抗体)含量。基本步骤参见课本P2782. hydroxyproline:羟脯氨酸:在新形成的胶原蛋白中许

55、多脯氨酸残基羟基化形成羟脯氨酸,从而使三股螺旋的胶原蛋白更加稳定,羟化过程有维生素C参与。若缺乏维生素C则可能导致败血病。3. bifunctional enzyme:双功能酶:具有两种功能的酶如:F-6-PF-2,6-BP, by PFK2 磷酸果糖激酶2(F-6-PF-1,6-BP, by PFK); the reversal reaction: F-2,6-BPF-6-P, by FBPase2果糖二磷酸酶2(F-1,6-BPF-6-P, by FBPase) 而这两种作用的酶其实是一个蛋白质4. PALA: N-(phosphoacetyl瞵乙酰基)-L-aspartate:N-瞵乙酰

56、基-L-天冬氨酸:一种双底物(天冬氨酸和氨甲酰磷酸)类似物,可被氨甲酰磷酸合成酶识别,但不是它的底物,从而研究该酶的活性部位。5. charge-relay system:电荷中继系统:胰凝乳蛋白酶活性部位由Ser、His、Asp组成,这三个氨基酸残基联在一起形成一个电荷中继网,使Ser的羟基具有非常高的亲核性。6. abzyme:酶原:某些酶在细胞内合成或初分泌时没有活性,这些没有活性的酶的前身称为酶原(zymogen),使酶原转变为有活性酶的作用称为酶原激活(zymogen activation)。比较著名的例子是消化酶的酶原(胃蛋白酶原,胰蛋白酶原,胰凝乳蛋白酶原)和血液凝固酶的酶原(凝

57、血酶原,纤溶酶原)7. lectin:凝集素:一类非抗体的蛋白质或糖蛋白,能够与糖类专一性非共价结合,并具有凝集细胞核沉淀聚糖和复合糖的作用。8. diagonal electrophoresis:对角线电泳:是将样品先电泳一段时间再旋转90°后继续电泳一段时间,这样样品就出现在一条对角线上。常见于蛋白质中鉴定二硫键的位置。9. cyanocobalamin:氰钴胺维生素B12:参与S-腺苷甲硫氨酸的形成,介导SAM形成中甲基的转移,并参与分子重排和某些细菌中核苷酸还原为脱氧核苷酸的过程。10. avidin:抗生物素蛋白 在新鲜的鸡蛋清中,含有的一种蛋白质,可以与生物素结合成无活性又不易消化吸收的物质,鸡蛋加热后这种物质就会失活,目前在生物工程中该蛋白质也有较广应用11. cohesive end:粘性末端:限制性内切酶切割后形成的互补的

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