分子标记及其在植物遗传育种中的应用

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3、料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！酶切酶切电泳电泳印印迹迹管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！l 共显性，可以区别纯合和杂合基因型共显性，可以区别纯合和杂合基因型l 稳定、重复性强稳定、重复性强l 某些植物中开发探针已遍及整个基因组某些植物中开发探针已遍及整个基因组l 缺点：缺点：DNADNA需要量较大，技术复杂；需要量较大，技术复杂； 用于做图较费时，难以分析

4、大量样品用于做图较费时，难以分析大量样品； 在基因组较大、严格自花授粉作物上多在基因组较大、严格自花授粉作物上多态性很低，使遗传图饱和度低。态性很低，使遗传图饱和度低。管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！3553Target DNA sequenceGCTCGCAGTACTTCATGACGAGCGdenature 95 C5335GCTCGCAGTACTTCATGACGAGCGTCATGAGCTCGCanneal primers 60 CTaq polymerase binds 3 and extendsGCTCGC5335AGTACTTCATG

5、ACGAGCGTCATGAGCTCGCDNA is doubled with each cycleRepeat 25-40 times管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！PCR扩扩增：增：管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！SSR的分布特点的分布特点管

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7、，提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！AFLP操作步骤：操作步骤：管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载

8、！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！AFLP SCAR管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！PIC/SimpsonPIC/Simpson遗传多样性系数遗传多样性系数 = 1 - = 1 - P Pi i 2 2等位基因数目等位基因数目 A A PrimerPrimer0.47800.47800.30400.30400.17400.17400.04300.0430A = 4A = 4PIC = 1 PIC = 1 SUM (0.47)SUM (0.47)2 2 + (0.30) + (0.30)2 2 + (0.17) + (0.17)2 2

9、 + (0.04) + (0.04)2 2 = 0.64 = 0.64SSR资料：资料：管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！遗传相似系数遗传相似系数 Gower (1985):Gower (1985): a + da + da + b + c + da + b + c + d简单匹配系数（简单匹配系数（SM）(Simple matching coefficient) a a a + b + ca + b + cJaccard 相似系数相似系数(Jaccard 1908). 2 2a a2a + b + c2a + b + cDice (1945)相似系数相似系数，即即 Nei &

10、 Li (1979)相似系数相似系数.管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！其中其中 :abcd+ -+-kj管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！遗传距离的计算：遗传距离的计算：Rogers（1972）Rogers-W（Rogers distance as modified by Wright （1978）kkjkilociijxxnd2)(21 kkjkiijxxd2)(21管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！两个两个 随机群体随机群体 j 、k间的遗传距离（间的遗传距离（Nei 1972）: X Xij 为为X X群体第群体第i i个位点第个位点第j j个等位基因频率个等位

11、基因频率 Yij为为Y群体第群体第i个位点第个位点第j个位点基因频率个位点基因频率 管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！EST (Expressed Sequence Tags)管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下

12、载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！DNA微阵列（微阵列（Microarray）管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！微型化高通量高通量提高信息量提高信息量平行化平行化提高信息的可比性提高信息的可比性微量化微量化降低待检样品用量降低待检样品用量自动化自动化提高工作效率提高工作效率低成本低成本可迅速普及推广可迅速普及推广生物芯片的特征与优点生物芯片的特征与优点管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！构建遗传图谱构建

13、遗传图谱 （molecular marker linkage mapmolecular marker linkage map）以具有遗传多型性的分子标记为以具有遗传多型性的分子标记为“路标路标”Polymorphic molecular marker as “route sign”以减数分裂中发生的遗传重组交换值为图距以减数分裂中发生的遗传重组交换值为图距Recombination frequency (%) in meiosis as “map distance (cM)”绘制高密度的分子标记连锁图绘制高密度的分子标记连锁图Genetic linkage map with high dens

14、ity管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！遗传标记数据遗传标记数据数量性状数据数量性状数据 作作图图群群体体( (F2,BC,DH,RIL等等) )管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！分子标记连锁图谱的构建分子标记连锁图谱的构建 定位群体亲本间多态性分子标记的筛选定位群体亲本间多态性分子标记的筛选 定位群体的组建定位群体的组建 定位群体分子标记分析定位群体分子标记分析 分子标记连锁图谱的绘制分子标记连锁图谱的绘制管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理资源吧（），提供海量管理资料免费下载！管理

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