猪12号染色体几个微卫星标记与部分生产性状的关系研究

1、研究简报猪12号染色体几个微卫星标记与部分生产性状的关系研究3赵书红1杨晓鹏1刘榜1李奎1彭中镇1张建生2孙仕铨2顾建平2(1华中农业大学牧医学院动物分子生物学与育种实验室,武汉430070;2国营常熟畜禽良种场,常熟421550A Study on R elation Betw een Some Production Traits and a Fe w Microsatellites on Porcine Chromosome 12Zhao Shuhong 1Y ang X iaopeng 1Liu Bang 1Li K ui 1Peng Zhongzhen 1Zhang Jiansheng

2、 2Sun Shiquan 2G u Jianping 2(1Huazhong Agricultural Univer sity ,Wuhan 430070,China ;2Changshu Animal Breeding Farm ,Changshu 421550,China 关键词猪;12号染色体;微卫星;生产性状K ey w ords pig ,chrom os ome 12,microsatellite ,production traits中图法分类号S 828.2众多的微卫星位点及其丰富的多态性是微卫星在各领域广泛应用的基础。在定位QT L 方面,现在通过建立猪资源家系,人们已把一些

3、与繁殖、生长、胴体和肉质等方面有关的数量性状位点定位在某些微卫星附近。例如,3号染色体上微卫星SW2427-SW251区域与猪的日增重、4号染色体上S0101-S0107区域与背膘、腹脂、7号染色体上S0064-S0066区域与胴体组成和初生重有着很大的关联1。12号染色体为最短的中部着丝粒染色体,因与猪生产性状紧密相关的生长激素(GH 基因位于其上而倍受重视2,3。虽然目前对GH 基因研究得比较详细,但对此染色体上其它位置的微卫星位点与生产性状相关的研究报道却很少。本研究就是利用一参考家系的回交后代个体对猪12号染色体上的4个微卫星位点的多态性和某些性状资料,分析该4个位点与性状的关联,为进

4、一步寻找影响这些性状的QT L 提供新资料。1材料与方法1头大白公猪配3头二花脸母猪,从F 1中选出11头母猪与其父亲进行回交,头2胎共得到154头回交后代(14窝。记录每头猪的乳头数,测定初生重、20日龄重、45日龄重、初生至45日龄日增重等性状。位点:SW1350、SW1553、SW874、SW957。引物序列参照Alexander 等4,R ohrer 等5。引物合成由上海生物工程公司完成。采取每头猪个体血样,提取DNA 进行PCR 扩增,应用非变性聚丙烯凝胶电泳及收稿日期:19991019;修回日期:200006053国家自然科学基金(批准号:39770539、湖北省自然科学基金(97

5、J 0598、留学回国人员启动基金、高校博士点基金和国家杰出青年科学基金(39925027资助项目赵书红,女,1967年生,博士,副教授.工作单位:华中农业大学畜牧兽医学院,武汉430070第19卷第4期2000年8月华中农业大学学报Journal of Huazhong Agricultural University V ol.19N o.4Aug.2000,360362银染检测每头猪12号染色体上4个微卫星位点的基因型,具体参照赵书红等2资料。用S AS软件进行每类样本含量不等的单向分组方差分析6,判断各类标记基因型之间数量性状的差异。2结果不同位点上扩增成功的样本含量及不同基因型猪2,7

6、各性状的差异显著性检验结果见表1。方差分析表明:性状乳头数在位点SW957的不同基因型间差异显著;初生重、20日龄重、45日龄重及初生至45日龄平均日增重在位点SW1350的不同基因型间差异显著;初生重、45日龄重及初生至45日龄平均日增重在位点SW874的不同基因型间差异显著;各性状在SW1553各基因型间差异均不显著。表1不同基因型猪的生产性能差异显著性检验结果T able1Productivity testing of different genotypes pigs位点Locus 基因型G enotype样品数Sam pleN o.乳头数Nipple N o.初生重/kgBirth w

7、eight20日龄重/kg20day weight45日龄重/kg45day weight初生至45日龄平均日增重/gAverage daily gainfrom birth to45daySW957AA4715.90.19a 1.140.03 4.540.1013.050.38264.998.11 AB5415.20.13b 1.170.03 4.450.0912.540.34250.247.23AC214.50.50c 1.350.05 4.450.0512.250.75233.334.45 SW1350BB5215.70.1712.00.03ab 4.490.08a13.320.28a2

8、70.155.94a AB3215.20.19 1.210.03ab 4.560.11a13.340.30a269.586.49aAA1115.70.380.740.10b 3.730.31b8.441.32c171.1127.39aBC715.10.26 1.180.09ab 4.570.18a12.440.72a248.0015.99bAC414.80.48 1.250.10a 4.850.27a10.500.90b205.5519.80bCC114.00.00 1.200.00ab 6.500.00c9.400.00bc182.220.00c SW1553AB5515.50.16 1.1

9、10.04 4.310.0912.240.39247.627.97 BB1215.30.33 1.190.08 4.220.1812.250.87241.6618.11AA3015.50.20 1.170.03 4.480.1112.670.33255.047.50 SW874BC5515.50.14 1.190.03a 4.530.1013.150.31a264.546.51a BB3415.30.20 1.170.03a 4.320.1013.050.33a265.697.18aAB2215.60.25 1.020.07b 4.260.209.940.74b203.5415.27b3讨论目

10、前在猪中已定位了大量的微卫星标记,应用这些标记通过基因组扫描寻找与数量性状连锁的标记也在进行3,但猪中已定位的QT L数尚较少,还需进行大量的标记基因型与数量性状连锁分析鉴别以定位更多的QT L。检测不同基因型的性状值是否存在显著差异是QT L定位的第一步。本研究即基于此。所用微卫星标记位于猪12号染色体上,该染色体由于一些具有重要生理功能的基因位于其上,对其遗传图及已定位的标记与性状的关联研究也受到了重视。本研究通过方差分析达到极显著水平的标记/性状组合有:SW1350/初生重、SW1350/20日龄重、SW1350/45日龄重、SW1350/初生至45日龄平均日龄重、SW874/45日龄重

11、、SW874/初生至45日龄平均日龄重;达显著水平的组合有SW874/初生重、SW957/乳头数,这些达显著水平的关联可能是由于标记QT L连锁的结果。163第4期赵书红等:猪12号染色体几个微卫星标记与部分生产性状的关系研究参考文献1彭中镇,赵书红,李奎等.猪数量性状基因及其标记研究进展.国外畜牧科技,1999,26(1:28322赵书红,张建生,孙仕铨等.应用参考家系信息构建猪12号染色体部分微卫星位点遗传图的研究.华中农业大学学报,1998,17(5:4694733Niels on V H,Larsen N J.S tudy of the ass ociation of production traits with haplotypes of the growth horm one gene in pigs.Anim G enet,1992,(Suppl.1:1054Alexander L J,R ohrer G A,Beattie C W.Cloning and characterization of414polym orphic porcine microsatellites.Anim G enet.1996,27:137 1485R ohrer G A,Alexander J W,K eele T P,et al.A mic