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文档简介

1、甾体17 a羟化酶/ C17 , 20-裂解酶(P45017 Q抑制剂的摘 要 目的:建立P45017(抑制剂的三维定量构效关系,为设计新的更有效的抑制剂提供理论依据。方法和结果:利用比较分子力场方法,建立了 P45017(抑制剂的三维定量构效关系模型。 交叉 验证回归系数 R2CV、非交叉验证回归系数和标准偏差SEE分别为0 . 533 , 0 .776 , 0 . 271。说明系列化合物分子周围立体场和静电 场的分布与生物活性间有良好的相关性。 利用该模型对本室合成的三 个化合物进行活性预测,结果与实测值相符。结论:所得模型支持了 假设的抑制剂作用机理和作用模型。所得勘MFA模型具有一定的

2、预测能力,可用来设计新的P45017 a抑制剂。关键词 P45017 a抑制剂比较分子场分析法(CoMFA) 三维定量 构效关系模型17 a羟化酶/CI7, 20裂解酶是位于睾丸和肾上腺的细胞色素 酶。它是雄激素生物合成途径中的关键酶。功能是将2l碳的生物前体孕烯醇酮和孕酮分别在两步中去 C20 乙酰侧链和17位羟化,转 化成19碳的去氢表雄酮和雄烯二酮。最后由位于前列腺中的5 a 还原酶将睾酮转化成二氢睾酮。已经证明体内的一些疾病是由体内过 高的雄激素导致的,如前列腺良性增生,前列肠癌等。临床上已证明 降低体内的雄激素水平是治疗这些疾病的有效方法。选择性高、作用 强的P45017 a酶抑制剂

3、可以通过抑制雄激素生物合成中较初始环 节,降低体内雄激素水平,在临床上用于治疗前列腺疾病。已报道的P45017 a。抑制剂主要包括国体类和非甾体类,而非团体类抑制剂 大都不具有好的选择性。为了进一步阐明P45017 a抑制剂的定量构效关系,建立具有提示高活性化合物信息及预测能力的构效关系模 型,本文利用比较分子力场方法(CoMFA),对甾体类抑制剂进行了三 维定量构效关系研究。实验方法所有工作都是在Tripos公司SiliconGraphics O 2工作站上完成 的。所用计算程序为Tripos公司的Sybyl6 . 4分子设计软件包。计 算过程所涉及的参数除非特别指明,均为缺省值。1化合物的

4、选择P450l7 a(CYPI7)是一种结构尚未知的细胞色素酶。其抑制剂的 筛选有多种方法。因此对化合物的活性数据进行了严格考察。本文选择了 31个团体抑制剂进行CoMFA研究。它们的活性数据源于同一 个实验室。每次测试中,对照样品活性值相同,认为有可比性。所选 取样品是以酮康唑为标准品,其IC50值为78nM。比较分子力场分 析采用IC50的负对数形式一10glC50。所选用的化合物结构及活性 见表 I。Tabl The structures and activities of 31 compounds used in CoMFA .2活性构象确定由于酶结构未知,所以采用分子的最低能量构象作

5、为最可能的效 构象。以活性最好的化合物31作为模板分子。其起始构象是在Sybyl6 . 4的“ Build /Edit ”模块下建立,用分子力学程序 Minimize进行能量优化。优化过程中采用Powell能量梯度法,用Tripos力场, 能量收敛限定为0. 001kcal / mol-l,优化次数为1000。分子载荷 为Gasteiger Huchel型电荷。其它化合物以3l为模板,变换成相 应结构,也以Minimize程序以同样条件能量优化后,作为最低能量 构象。3分子叠合由于抑制剂同属甾体类,它们与酶结合时部位应一致。而它们之 间除17位取代不同外,仅是A环和D环有差别。因此以活性最好的

6、 化合物31为模板,以B环和C环上的C8, C9, C10 , C11 , C12 , C13,为叠合点进行叠合。叠合图见图1Fig 1:Stereoview of superimpositi on of 31 P45017ainhin bitorsused in CoMFA.4 CoMFA分析CoMFA分析由Sybyl6 . 4中的QSAR模块来完成。分析力场包 括立体场和静电场。在 0-50kal/mol-1范围内,经多次摸索,将立体场和静电场的能量域值分别设为15kcal /mol-1 和15kcal /mol-1。先以交叉验证(cross-validation)确定最佳主成分数,再用非

7、 交叉验证(non-validation) 建立最终的比较分子力场模型。在最小二 乘法(Partial Least Square , PLS)分析中,column filtering 设为4kcal / mol-1结果与讨论1 CoMPA模型比较分子力场分析所得勘 MFA模型的学参数为:交叉验证相关 系数R2cv=0.533,最佳主成分数为3,由最佳主成分数建立的CoMFA模型的传统相关系数 R2 = 0. 799 , F= 31 . 201,标准方差 SEE(standard error of estimate) = 0. 271。该模型对 31 个化合物 的活性预测值与实测值的相关性如图2

8、。Fig 2:Predicted vs actual biological activities of 31 in hibitiorsfrom CoMFA model2.CoMFA系数等势图CoMFA模型系数等势图见图3 (a)和3 (b).其中参照分子 化合物31。图3 (a)中绿色和黄色区域代表立体场对化合物活性的 影响,绿色区域表示在该区域附近存在体积大的基团将由于增加的立 体场面有利于活性的提高,黄色区域则表示该区域不宜于引入位阴大 的基团,否则会降低化合物的活性。图3( b)中红色和兰色区域代表静电场对活性的影响:红色区 域表示引入负电性基团有利于提高活生,兰色区域则表明引入正电性

9、基团有利于活性提咼。Fig 3(a):View of the CoMFA steric field graphFig 3(b):View of the CoMFA electrostatic field graph3关于模型的讨论在立体场等势图中可以看到,在甾体骨架的(面有一块黄色区域, 说明在此处存在有位阻大的基团将不利于抑酶作用;从静电场等势图 中可以看出在化合物31的杂环附近有多处红色区域,说明在这些区 域引入富电荷的基团将有利于活性的提高。这与文献中假设的竞争性P450I7 a抑制剂的作用机理和作用模型相符。该假设认为在距离甾体 D环适当位置引入具有孤对的原子,如N等,将可能与P450l7 a的血红素辅基中的Fe原子结合,而抑制酶的活性。假设的作用模式中 是血红素位于甾环的a面(如图4),我们得到的3DCoMFA模型更进 一步说明了,在甾环 D环存在富电荷的原子有利于抑酶活性,这支 持了上述作用机理。a面位阻大基团不利于抑酶活性,这是与假设的 作用模型一致,因为在此处有位阻大的基团,会阻碍杂原子与Fe作用,而不利于抑酶活性。Fig 4:Stereoplot of the substrateheme-complex for the P45017 a利用该模型对本室合成的3个化合物进行了活性预测。预测结果 是以3 羟基一17 (2 '噻唑)雄甾

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