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文档简介
1、(推荐)winbugs基础操作及使用-李艳丽李艳丽winbugs介绍贝叶斯模型介绍winbugs 操作流程案例介绍winbugs (bayesian inference using gibbs sampling)就是一款通过mcmc方法来分析复杂统计模型的软件。其基本原理就是通过gibbs sampling和metropolis算法,从完全条件概率分布中抽样,从而生成马尔科夫链,通过迭代,最终估计出模型参数。经典统计贝叶斯统计样本信息总体信息先验信息( , )( ) ( | )pypp y( , )( ) ( | )( | )( )( )pypp ypyp yp y联合密度与先验分布,样本分布
2、间的关系y=0+ 1*x1+ n*xny d()= 0+ 1*x1+ n*xni di()经典统计模型bayesian模型1- 确定模型2- 输入数据 3- 运行模型4- 模型初始化5- generate burn-in values6- 确定被模拟的参数7- 运行8- 检查收敛性及列出结果模型基本结构 (model)数据 (list)模型初始化参数 (list)选中model,然后点击check model,检查模型是否有错。一,check model后左下方如果显示 model is syntactically correct,则表明模型运行通过,没有语法错误。二,选中list(即原始da
3、ta),点击load data,导入数据。左下方显示 data loaded,则数据导入成功。三,点击compile,编译模型四,选中list(初始化的参数),点击load inits,初始化模型,初始化成功左下方显示model is initialized。单击inferrencesample,出现sample monitor tools对话框。在node对话框输入感兴趣的需要模拟的参数。每输入一个参数,点击set设定。单击modelupdate,出现update tool对话框,设定采样规则,开始采样模拟。 updates:模拟生成的样本数 refresh:update进度显示的步长 th
4、in:每x步收集一笔资料 iteration:显示模拟进程inferrencesample,在node窗口输入感兴趣参数,输入*则显示所有的所有参数的结果trace:显示样本的轨迹history:同tracedensity:参数核密度stats:显示参数的统计结果(均值,方差等)coda:显示参数每步的取值quantiles:显示百分位数auto cor:参数自相关性tracehistorydensitystatisticsauto cor通过迭代轨迹(trace),迭代历史(history),自相关函数(auto corr)等来进行判断。当迭代轨迹,迭代历史基本趋于稳定,自相关函数很快接近于0,可认为迭代过程已经收敛。通过dic的值来比较不同模型的优劣性。dic值越小,模型越好。设定dic之后,再次update模型。单击dic,则显示此模型的dic值。dic主要用来比较模型的优劣,其绝对值没有太大意义。点击任务栏help,下拉菜单点击examples vol 1或者examples vol 2,
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