系统进化树制作步骤MEGA10_第1页
系统进化树制作步骤MEGA10_第2页
系统进化树制作步骤MEGA10_第3页
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文档简介

1、IsEHampCtkxi1RepoiiaEIMEGAida*se:«5121fl19系统进化树制作步骤 MEGA5.1先要把格式弄成该软件识别的meg格式,fasta格式也行,只要能够导入1导入,点击左上角Align,选择创建新的比对 Alignment,点击 OK,D* Modeh DirtaruceFhger2提示创建DNA分析文件,进入如下右边界面皿口晋W钮 1 11Rtb Seoneac-H- Dirplir H,Scecif a ' Abbr-.-,L _elI Z-332 4E-EE . 113- =s-xl GEV 1 mlT,ih*c5rlJi qeriA m

2、zliciu2S T5ri_£¥'«-r 1 i-slyhTFii. g«n«-3.ffllHM3<SE.= 2.13- H!:zi CF/ 1 ElVb*iSrlll13.14alIK1)113.119J=Qri CFV 二 玷匚1专-苔_口 F7-VCW49X in»5 -ffllA30033ei.113- =rl CF-P =JJ7k :£or pDlviiedrlx 工1乒口£EID37770-1|H.uri CUV* i SKA far pil b-adrln t ±«&

3、#163;n7ULIR-P3. 1 13.3icrl CF7 二 KKApqLtcJx二口 亏<z工口S.«! . 10 3 - x±± i CFJ£fir ±lv4idrLR.9.WL0L1L. 1 13.nori ZF7 二 KKa iar3?10flI3377CE . 1 |3 .CFir L 二KM. tax«l±Ji*.r土 4UilAY20l=3j.11 Z'ssDirzlxiT.ui nHicTaT-us1 llun.izi sub|k¥5 04E7E .1 i2ar»

4、7;l£eDi nn芒t益巳口由 CFL1- 1 flLQ H'-inan811睥心”.11 sndir-slxrruff Fuictat-us CFV 1 rlljOK,会3打开fasta格式的序列文件,如下*16: &lig;nBcnt Erplorcr tcpv-l B f ast a)DNA-Se-quances | Translaled Protein Sequences |4选择Alignment中的比对选项,使用 Clastaw比对,会有比对参数,默认即可,点 自行完成比对。Q(Wig PtrUfe15G峭 E«i*r4i Rtntly汹 gw

5、yPenaftp5SEHmbfiRenJy|&6fi口 NAWugM 虹|UBTKfnpfaFiWoiltd 5-U « Hegiive MintDM* Dwoert tUofl 阁I" Keto Fledetawd Gdpi;而二15pk" GfiiCh Tw 5比对好的文件须保存,选Data中的save session,提示保存命名另蒂为曲?在 d>- | »riair Qt )j tCrTBfcMKM 5, OMBKWT jIisL.1j Lwavu qjtntr k FilU lir-ata-ix fia*t iitjiciens

6、5M 如E丈*洛聊后二iZ118疗'X'l|AJb 419144. C* &al)可燃串性KM6到MEGA主界面,点击 data,打开刚才保存的文件,会有如下提示,选 Analyze即导入数据如右。?JHow Mould ;rixi liue- ta Dpen this MAS Hb?| AndpzE | .ign |7选中带有TA的方框,如上图,点击主界面上的进化树选项,如下图中间,可选择不同的 进化树类型,一般用 NJ树。D 神e痴iyPtjdggi Uw Tree8出现提示参数,默认即可,点compute执行。会完成进化树e Analysis Pccference

7、 51J牝 FeEK1!I EdSlake .''Optionxrsmr51*如anwuiast:$MleOxriudrej hteimifin(为e 甘志l恁®2EAnfrpf Qni>441 Fl 11Jmi|nci . ptqridjin LMinttnMfcaiSc<4» <LL 氾K“d tui.SlanaLLcal MahlwilB«i ibvr-jE-iamcT-ii I.Twl «C EHgnr lnUrlHr-lr«4h t*jtf- *1lpLLU.ZU HttbSabElltalm ludi-1 * H-* I . .F.iCOHB W jw_E_l_Hi*_iv_Hn_HiM_»P& IB _HMj:WJRMA_r|BjxMKta-«w_*祐网_-Jw-gMIHI* I>aNi_l:PHt_I j0wanjpbkum jw;f * «»_»_ * K#TJ1-r<4tl _

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