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文档简介

1、2021/7/241第四章第四章 病毒的分类与命名病毒的分类与命名 一、病毒的分类一、病毒的分类(一)病毒分类的发展历程(一)病毒分类的发展历程n1937年:年:Levadifi&Leptin根据病毒对组织的亲和性根据病毒对组织的亲和性进行分类;进行分类;n1948年:年:Holmes 提出根据病毒感染引起的症状来分提出根据病毒感染引起的症状来分类;类;n1950年:国际微生物学会提出分类的八项原则;年:国际微生物学会提出分类的八项原则;n1953年:年:Andremes提出按病毒的理化特性来分;提出按病毒的理化特性来分;2021/7/242n1963年:国际微生物命名委员会病毒学分会

2、提出年:国际微生物命名委员会病毒学分会提出新的八项分类原则;新的八项分类原则;n1966年成立国际病毒命名委员会(年成立国际病毒命名委员会(international committee on nomenclature of virus, ICNV););1971年发表第一份报告:年发表第一份报告:500多种病毒分成多种病毒分成43个个病毒属(组);病毒属(组);n1 9 7 3 年 更 名 为 国 际 病 毒 分 类 委 员 会年 更 名 为 国 际 病 毒 分 类 委 员 会(international committee on taxonomy of virus, ICTV););202

3、1/7/243n最新的病毒分类报告:第六次报告(最新的病毒分类报告:第六次报告( 1995年)年)n现在已知的病毒有现在已知的病毒有3600多种,它们分别属于多种,它们分别属于71个病毒科个病毒科;n其中动物病毒(包括脊椎动物病毒和无椎脊其中动物病毒(包括脊椎动物病毒和无椎脊动物病毒)有动物病毒)有2000余种,分属余种,分属27个病毒科个病毒科;2021/7/244(二)分类依据(二)分类依据1 1病毒的形态学特征病毒的形态学特征病毒粒子的大小和形状;病毒粒子的大小和形状;有无表面纤突和纤突的特征;有无表面纤突和纤突的特征;有无囊膜;有无囊膜;衣壳对称型和结构;衣壳对称型和结构;2021/7

4、/2452 2理化学特性理化学特性n病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系数;病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系数;n对酸碱的稳定性;对酸碱的稳定性;n对热的稳定性;对热的稳定性;n对两价阳离子的稳定性;对两价阳离子的稳定性;n对去污剂的稳定性;对去污剂的稳定性;n对脂溶剂的稳定性;对辐射的稳定性。对脂溶剂的稳定性;对辐射的稳定性。2021/7/2463 3基因组基因组n核酸类型:核酸类型:DNADNA或或RNARNAn基因组大小;线状还是环状;基因组大小;线状还是环状;n单股还是双股单股还是双股n是整个的还是分节段的,节段的大小和是整个的还是分节段的,节段的大小和数目数目4.4.基因组的复制策略、开

5、放阅读框架基因组的复制策略、开放阅读框架的数目和位置、转录特征、翻译特征、的数目和位置、转录特征、翻译特征、翻译后加工特征。翻译后加工特征。 2021/7/2475 5蛋白质蛋白质 结构蛋白的数目、大小和功能活性,非结结构蛋白的数目、大小和功能活性,非结构蛋白的数目、大小和功能活性,蛋白质的特构蛋白的数目、大小和功能活性,蛋白质的特殊功能活性(转录酶、反转录酶、血凝素、神殊功能活性(转录酶、反转录酶、血凝素、神经氨酸酶)经氨酸酶)6 6脂质、糖类含量和特性脂质、糖类含量和特性 2021/7/2487 7在细胞培养中的生长特性在细胞培养中的生长特性n对细胞种类的特异性;对细胞种类的特异性;n病毒

6、蛋白的聚集场所;病毒蛋白的聚集场所;n病毒粒子的装配场所;病毒粒子的装配场所;n病毒粒子成熟和释放的部位和性质。病毒粒子成熟和释放的部位和性质。2021/7/2498 8抗原性抗原性n与其他相关病毒的血清学关系与其他相关病毒的血清学关系9 9生物学特性生物学特性n自然宿主范围、传播方式、传播介体,地理自然宿主范围、传播方式、传播介体,地理分布、致病性及与疾病的关系;分布、致病性及与疾病的关系;n组织嗜性和组织病理学。组织嗜性和组织病理学。2021/7/2410二病毒的命名规则二病毒的命名规则(一)一般规则:(一)一般规则:1病毒的分类和命名应是国际性的,应普遍病毒的分类和命名应是国际性的,应普

7、遍适用于所有病毒适用于所有病毒;2. 通用的病毒分类系统采用通用的病毒分类系统采用目、科、亚科、目、科、亚科、属和种的等级制度属和种的等级制度,在种的命名尚不完善,在种的命名尚不完善的情况下,许多病毒可用国际通用的俗名。的情况下,许多病毒可用国际通用的俗名。2021/7/24113ICTV不统一规定病毒种以下的分类和命不统一规定病毒种以下的分类和命名。关于血清型、基因型、病毒株、变异名。关于血清型、基因型、病毒株、变异株等的命名由公认的国际专家组决定。株等的命名由公认的国际专家组决定。4对人工产生的病毒和实验室杂交株不予分对人工产生的病毒和实验室杂交株不予分类考虑,这些病毒的命名也同样由公认的

8、类考虑,这些病毒的命名也同样由公认的国际专家组决定。国际专家组决定。2021/7/2412n5当代表成员病毒经过充分鉴定并在发表当代表成员病毒经过充分鉴定并在发表的文献上描述后,才能建立一个类,以便的文献上描述后,才能建立一个类,以便与相似的类区别。同样,命名一个病毒时,与相似的类区别。同样,命名一个病毒时,该病毒必须经过充分鉴定并在文献上发表该病毒必须经过充分鉴定并在文献上发表以明确区别于相似的病毒以明确区别于相似的病毒 2021/7/2413(二)关于类和病毒的命名原则(二)关于类和病毒的命名原则6现有的类和病毒的名称无论是否适用均应现有的类和病毒的名称无论是否适用均应予保留。予保留。7在

9、类和病毒的命名中不遵守优先率。在类和病毒的命名中不遵守优先率。8不使用人名。不使用人名。9类和病毒的名称应便于使用,容易记忆,类和病毒的名称应便于使用,容易记忆,最好使用听起来悦耳的名称。最好使用听起来悦耳的名称。2021/7/241410不使用上标、下标、连字符、斜杠和希腊字不使用上标、下标、连字符、斜杠和希腊字母。母。11新名称不应与已通过的名称有重复,应选用新名称不应与已通过的名称有重复,应选用与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称。与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称。12如果缩拼词对病毒学家有意义,且得到公认如果缩拼词对病毒学家有意义,且得到公认的国际专家组的推荐,可以接受作为

10、类的名称。的国际专家组的推荐,可以接受作为类的名称。2021/7/2415关于类和病毒的命名原则关于类和病毒的命名原则13由一个类或病毒的名称所由一个类或病毒的名称所隐含的任何意隐含的任何意义义都会因在名称中涉及不是所有成员或潜都会因在名称中涉及不是所有成员或潜在成员所具有的特征,以及不是均等地适在成员所具有的特征,以及不是均等地适用于不同类的特征而排斥该类中的合适成用于不同类的特征而排斥该类中的合适成员病毒,员病毒,这种情况应当避免。这种情况应当避免。 2021/7/241614新名的选用应考虑国家或民族敏感性问题。新名的选用应考虑国家或民族敏感性问题。应采用那些被病毒学家在科学杂志上发表的

11、工应采用那些被病毒学家在科学杂志上发表的工作中常用的名称及衍生名称作为命名的基础,作中常用的名称及衍生名称作为命名的基础,此时可不必考虑国家来源;在有一个以上的候此时可不必考虑国家来源;在有一个以上的候选名称时,相应的研究组或分委员会向选名称时,相应的研究组或分委员会向ICTV执执行委员会提出建议,由执行委员会决定取哪一行委员会提出建议,由执行委员会决定取哪一个名称。个名称。 15新的名称和名称的变更应以分类建议格式提新的名称和名称的变更应以分类建议格式提交交ICTV。2021/7/241716病毒种是组成一个复制系并占有一个特定生病毒种是组成一个复制系并占有一个特定生态环境的一类多原则病毒。

12、态环境的一类多原则病毒。17种名应由少而实用的字组成种名应由少而实用的字组成 18种名,通常与株名一起,必须表示明确的特种名,通常与株名一起,必须表示明确的特征,不涉及属名或科名。征,不涉及属名或科名。19已经广泛应用的数字、字母及其组合可用作已经广泛应用的数字、字母及其组合可用作种名性质形容词。但新提出的连续数字、字母种名性质形容词。但新提出的连续数字、字母或其组合不单独接受作为种名性质形容词。或其组合不单独接受作为种名性质形容词。 2021/7/2418n20ICTV通过新提议的种、种名和型名的通过新提议的种、种名和型名的程序分两步:首先,给予暂时性通过,这程序分两步:首先,给予暂时性通过

13、,这样的建议将发表在样的建议将发表在ICTV报告中;然后,经报告中;然后,经过三年的等候期,如果不撤销或修正,该过三年的等候期,如果不撤销或修正,该建议将得到最后通过。建议将得到最后通过。 2021/7/2419(三)关于属的规则(三)关于属的规则n21属是一组具有某些共同特性的种。属是一组具有某些共同特性的种。n22属名应是一个以属名应是一个以“Virus”结尾的单词。结尾的单词。n23通过一个属名的同时需通过一个代表种。通过一个属名的同时需通过一个代表种。n瘟病毒属:瘟病毒属:Pestivirusn冠状病毒属:冠状病毒属:Coronavirus2021/7/2420(四)关于亚科的规则(四

14、)关于亚科的规则n24亚科是一组具有某些共同特性的属。只有亚科是一组具有某些共同特性的属。只有当需要处理复杂等级结构问题时才使用亚科。当需要处理复杂等级结构问题时才使用亚科。n25亚科名应是一个以亚科名应是一个以“Virinae”结尾的单词。结尾的单词。 E.g. Retrovirinae :反转录病毒亚科反转录病毒亚科 Spumavirinae:泡沫病毒亚科泡沫病毒亚科2021/7/2421(五)关于科的规则(五)关于科的规则 n26科是一组具有某些共同特性的属(不科是一组具有某些共同特性的属(不管这些属是否组成了亚科)。管这些属是否组成了亚科)。n27科名应是一个以科名应是一个以“Viri

15、dae”结尾的单结尾的单词。词。n28通过一个科名的同时需通过一个属名。通过一个科名的同时需通过一个属名。疱疹病毒科:疱疹病毒科:Herpesviridae腺病毒科:腺病毒科:Adenoviridae2021/7/2422(六)关于目的规则(六)关于目的规则 n29目是一组具有某些共同特性的科。目是一组具有某些共同特性的科。n30目名应是一个以目名应是一个以“Virales”结尾的单结尾的单词。词。2021/7/2423动物病毒的命名现状:动物病毒的命名现状:1 1、种的命名、种的命名1 1)大多用其所引起疾病的名称,后加)大多用其所引起疾病的名称,后加“病毒病毒”两字两字 脊髓灰质炎病毒、猪

16、瘟病毒、流脊髓灰质炎病毒、猪瘟病毒、流感病毒感病毒2 2)在病名前加上最初发现该病毒的地名)在病名前加上最初发现该病毒的地名日本乙型脑炎病毒、东方型马脑炎病毒日本乙型脑炎病毒、东方型马脑炎病毒2021/7/24243 3)直接用地名称呼病毒)直接用地名称呼病毒新城疫病毒新城疫病毒(Newcastle disease virus)Newcastle disease virus)4 4)用人名称呼)用人名称呼马立克氏病病毒马立克氏病病毒( (Mareks disease virus)Mareks disease virus)2 2、科、属的命名科、属的命名1 1)依据病毒粒子的形态和理化学特性)依

17、据病毒粒子的形态和理化学特性小小RNARNA病毒科、反转录病毒科、轮状病毒属病毒科、反转录病毒科、轮状病毒属2021/7/24252 2)依据病毒所引起的病变的性质)依据病毒所引起的病变的性质疱疹病毒科、痘病毒科疱疹病毒科、痘病毒科3 3)以病毒酶作用的基质)以病毒酶作用的基质正粘病毒科、副粘病毒科正粘病毒科、副粘病毒科4 4)以病毒的最初分离部位)以病毒的最初分离部位腺病毒科腺病毒科2021/7/24265 5)感染宿主的部位)感染宿主的部位鼻病毒属、肠道病毒属鼻病毒属、肠道病毒属6 6)以几个属的缩拼词作为科名)以几个属的缩拼词作为科名乳多空病毒科乳多空病毒科2021/7/2427流感病毒

18、的命名方法流感病毒的命名方法1.国际上通用的流感病毒命名方法国际上通用的流感病毒命名方法 型别型别/分离地点分离地点/分离序号分离序号/分离时间(年代)分离时间(年代)(血凝素和神经氨酸酶序号)(血凝素和神经氨酸酶序号) e.g A/Hongkong/1/68(H3N2) A/京科京科/1/56(H1N1)H:hemagglutinin 血凝素血凝素N:neuraminidase 神经氨酸酶神经氨酸酶2021/7/2428流感病毒的命名方法流感病毒的命名方法2. 动物流感病毒的命名则在型别与分离地点之动物流感病毒的命名则在型别与分离地点之间加上动物宿主名称间加上动物宿主名称 e.g 甲甲/马马

19、/布拉格布拉格/1/56(H1N1) 2021/7/2429三、三、Baltimore 的分类系统的分类系统n以以mRNA为核心:根据病毒的为核心:根据病毒的DNA或或RNA是是与与mRNA互补互补(-)和不互补)和不互补(+) 而将病毒分而将病毒分为为6类。类。II类(+DNA)I类(DNA) mRNAIII类(RNA)V类(-RNA)VI类IV类+RNA2021/7/2430一一 DNA病毒病毒 (一)单链(一)单链DNA病毒病毒 细小病毒科(细小病毒科(Parvoviridae):猪细小病毒(猪细小病毒(PPV) 圆环病毒科(圆环病毒科(Circoviridae) :猪圆环病毒(猪圆环病

20、毒(PCV)四、动物病毒的分类现状四、动物病毒的分类现状2021/7/2431(二)二) 双链双链DNA病毒病毒 痘病毒科(痘病毒科(Poxviridae):痘苗病毒、天花病毒痘苗病毒、天花病毒 疱疹病毒科(疱疹病毒科(Herpesviridae):伪狂犬病病毒伪狂犬病病毒(PRV)、)、马立克氏病病毒(马立克氏病病毒(MDV)、)、鸡传染性鸡传染性喉气管炎病毒(喉气管炎病毒(ILTV)、)、鸭瘟病毒(鸭瘟病毒(DPV)、)、牛牛传染性鼻气管炎病毒(传染性鼻气管炎病毒(IBRV) 腺病毒科(腺病毒科(Adenoviridae):减蛋综合症病毒减蛋综合症病毒(EDS76) 2021/7/2432

21、 乳多空病毒科(乳多空病毒科(Papovaviridae):猴空泡病猴空泡病毒毒40(SV40) 非洲猪瘟病毒科(非洲猪瘟病毒科(Asfarviridae):非洲猪瘟非洲猪瘟病毒病毒 嗜肝嗜肝DNA病毒科(病毒科(Hepadnaviridae):人乙人乙型肝炎病毒(型肝炎病毒(HBV) 虹彩病毒科(虹彩病毒科(Iridoviridae): 杆状病毒科(杆状病毒科(Baculoviridae):2021/7/2433二二 RNA反转录病毒反转录病毒 反转录病毒科(反转录病毒科(Retroviridae):马传马传染性贫血病毒(染性贫血病毒(EIAV)、)、人免疫缺陷病人免疫缺陷病病毒(病毒(HI

22、V)2021/7/2434三三 RNA病毒病毒 (一)双股(一)双股RNA病毒病毒 呼肠孤病毒科(呼肠孤病毒科(Reoviridae):蓝舌病病蓝舌病病毒(毒(BTV)、)、轮状病毒轮状病毒 双双RNA病毒科(病毒科(Birnaviridae):鸡传染鸡传染性法氏囊病病毒(性法氏囊病病毒(IBDV) 2021/7/2435(二)单股负链(二)单股负链RNA病毒(不分节段)病毒(不分节段) 副粘病毒科(副粘病毒科(Paramyxoviridae):新城疫病毒新城疫病毒(NDV) 弹状病毒科(弹状病毒科(Rhabdoviridae):狂犬病病毒狂犬病病毒(RV)、)、水疱性口炎病毒(水疱性口炎病毒(VSV) 丝状病毒科(丝状病毒科(Filoviridae):埃博拉病毒(埃博拉病毒(EBV)2021/7/

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