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1、分子生物学实验作业用分子生物学方法鉴定菌株专业:姓名:学号:生物化工王晓娜1043111039鉴定一株乳酸菌菌株一、实验目的和方法采用RAPD指纹图谱方法鉴定一株乳酸菌菌株二、实验材料2.1 菌株实验给定的菌株2.2 试剂Taq DNA聚合酶、DNA电泳buffer、弓I物、dNTR模板DNA2.3 仪器台式离心机,PCR仪,稳压稳流电泳仪,紫外检测仪,凝胶成像 系统三、实验步骤3.1制备细菌DNA羊品收集菌悬液于1.5mlepp管中,5 OOOr/min 离心5min。去上清, 在沉淀中加入567微升TE缓冲液、30微升10%的SDS5微升10mg/ml 的溶菌酶后,37C水浴3h。再加入3
2、微升20mg/ml的蛋白酶K, 37C 水浴 lh。加入 100 微升 5mol/l NaCl, 80 微升 CTAB/NaC溶液,65C 水浴10min。加入等体积的氯仿/异戊醇,12 000r/min离心5min。 取上清,加入等体积酚氯仿异戊醇,12 000rmin 离心 5min。取上清,加入 2 倍体积的冰乙醇, 12 000r/min 离心 10rnin ,沉降 DNA去上清,将沉淀吹干,用100微升TE缓冲液(pH8. 0)溶解。取 l微升DNA样品,稀释200倍后,紫外测定0D260和0D280。选取浓度1.8 < 0D& /0C280<2. 0的样品。然后,将DNA浓度稀释至48ng/ 4作为 模板备用。3.2 PCR 反应扩增体积为 25 4 (含 TapDNA聚合酶 2u,10x PCRreaction buffer 24, dNTP 24,弓I物l 4,模板DNA 14。扩增程序为:94C预变 性 5min, 94C变性 1min, 38 C复性 lmin , 72C延伸 2min,进行 40 个循环后72C延伸10min。取12 4扩增产物进行电泳,电压为100V, 琼脂糖凝胶为l %(0 . 5XTBE)电泳30 40min,用凝
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