PubMed检索与利用(PPT课件)

1、李春英李春英北京大学医学图书馆北京大学医学图书馆20172017年年1010月月PubMed检索与利用检索与利用主要内容主要内容1. 1. 数据库概况数据库概况2. 2. 数据库检索机制数据库检索机制3.3. 数据库的组成结构数据库的组成结构4. 4. 检索界面检索界面5.5. 检索方法与技巧检索方法与技巧PubMedPubMed概况概况1.1.创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心技术信息中心(NCBI)(NCBI)2.2.类型：类型：WebWeb数据库数据库3.3.网址：网址：/p

2、ubmed/pubmed4.4.特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。免费获得全文。5.5. 学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、生物工程、化学等学科。生物工程、化学等学科。6.6.与与MedlineMedline光盘数据库的区别：检索机制、检索光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。界面、检索方法以及收录文献数量不同。PubMe

3、dPubMed数据来源数据来源1.MEDLINE：包括OLDMEDLINEOLDMEDLINE 2.In Process Citations：每天收录，尚未经规范处理的数据。3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有PubMed-as supplied by Publisher。PubMedPubMed检索机制检索机制1 1自动截词转换匹配功能自动截词转换匹配功能(Automatic Term Mapping)(Automatic Term Mapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词

4、表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSH table)、期刊刊名表(Journal table)、作者索引(Author Index)、调查者表(Investigator table) 、所有字段（All Fields）。如果在以上5个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。2 2短语检索短语检索(Phrase Searching)(Phrase Searching)也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“ ”将其引起来。如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自

5、动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。1.1.逻辑运算符：逻辑运算符： 逻辑与：逻辑与：ANDAND，逻辑或：，逻辑或：OROR，逻辑非：，逻辑非：NOTNOT。当一个检索表。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。以改变运算顺序。2.2.截词符：截词符：* *，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，符，chemchem* *表示用词根进行检索。表示用词根进行检索。Heart attackHeart attack* * 会关闭自动转换匹配检索词，会关闭自动

6、转换匹配检索词，myocardialmyocardial infarction,infarction, myocardial stunning,myocardial stunning, shockshock等词会匹配不到等词会匹配不到 3.3.双引号：双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行检索。，表示对引号中的短语进行检索。4.4.检索字段标识符：检索字段标识符：tagtag，tagtag为字段名称。为字段名称。 titi，auau，tata，soso，lala，ptpt。PubMedPubMed检索运算符检索运算符常用字段组成常用字段组成标识符标识符 字段名称字段名称TI TitleTI T

7、itleAU AuthorAU AuthorAD AffiliationAD AffiliationAB AbstractAB AbstractDP Publication DateDP Publication DateEDAT Entrez DateEDAT Entrez DateSO SourceSO SourceTA Journal Title TA Journal Title AbbreviationAbbreviationMH MeSH TermsMH MeSH TermsPT Publication TypePT Publication Type 检索界面检索界面基本检索基本检索高

8、级检索高级检索MeSHMeSH DatabaseDatabase检索检索限定检索限定检索期刊查询期刊查询(Journals Databases ) (Journals Databases ) 引文匹配器引文匹配器(Citation Matcher)(Citation Matcher)临床查询临床查询(Clinical Queries)(Clinical Queries)PubMed检索方法检索方法1.基本检索：在基本检索界面下完成的检索方法2.高级检索：高级检索界面下进行的检索方法3.MeSH Database检索：主题词检索基本检索基本检索基本检索基本检索1.1.关键词、词关键词、词( (词

9、组词组) )或短语：或短语：2.2.作者：作者：Smith JS Smith JS 或或 SmithauSmithau3.3.期刊刊名：期刊刊名：GENE THERAPYTAGENE THERAPYTA，JAMATAJAMATA4.4.截词：截词：CHEMOCHEMO* *5.5.复杂表达式：复杂表达式：CANCER AND THERAPYCANCER AND THERAPY6.#1 AND #26.#1 AND #2 肝癌的基因治疗肝癌的基因治疗Liver cancer gene therapySearch DetailsSearch Details检索过程检索过程Search detail

10、s检索过程检索过程(liver (liver neoplasmsneoplasmsMeSHMeSH Terms OR Terms OR (liverAll Fields AND (liverAll Fields AND neoplasmsneoplasmsAll Fields) OR liver All Fields) OR liver neoplasmsneoplasmsAll Fields OR (liverAll All Fields OR (liverAll Fields AND cancerAll Fields) OR Fields AND cancerAll Fields) OR

11、liver cancerAll Fields) AND liver cancerAll Fields) AND (genetic therapy(genetic therapyMeSHMeSH Terms OR Terms OR (geneticAll Fields AND (geneticAll Fields AND therapyAll Fields) OR genetic therapyAll Fields) OR genetic therapyAll Fields OR (geneAll therapyAll Fields OR (geneAll Fields AND therapyA

12、ll Fields) OR Fields AND therapyAll Fields) OR gene therapyAll Fields)gene therapyAll Fields)修改为：修改为：“liver neoplasms”“liver neoplasms”MeSHMeSH Terms Terms ANDAND genetic therapygenetic therapyMeSHMeSH Terms Terms 修改后的检索结果修改后的检索结果高级检索高级检索高级检索高级检索MeSHMeSH Database Database检索检索输入查找的主题词主题词注释主题词注释树状结构表树

13、状结构表款目词款目词MeSHMeSH主题词主题词什么是什么是MeSH MeSH ？ 又称叙词，在标引和检索中用以表达文献又称叙词，在标引和检索中用以表达文献主题的规范化的词或词组。主题的规范化的词或词组。主题词如何形成？主题词如何形成？哪些词可以作为主题词？哪些词可以作为主题词？副主题词又有什么作用？它和主题词是什么关系？副主题词又有什么作用？它和主题词是什么关系？主题词和自由词的区别？主题词和自由词的区别？主题词与自由词区别主题词与自由词区别l主题词：又称叙词，在标引和检索中用以表达文献主主题词：又称叙词，在标引和检索中用以表达文献主题的规范化的词或词组。题的规范化的词或词组。 主题词表示的

14、是概念，概念由语词表达的，并不是所主题词表示的是概念，概念由语词表达的，并不是所有的词语都是主题词。有的词语都是主题词。l自由词：关键词、文本词、款目词。表示的字面。自由词：关键词、文本词、款目词。表示的字面。MeSHMeSH的特性的特性l动态性动态性l唯一性唯一性MeSHMeSH Database Database检索步骤检索步骤1.1.输入查找的主题词输入查找的主题词2.2.找到所需主题词，直接点击词的链接找到所需主题词，直接点击词的链接3.3.选择与主题词对应的副主题词表（检索范围，参选择与主题词对应的副主题词表（检索范围，参考树状结构表）考树状结构表） 4.4.添加到检索框中添加到检索

15、框中5.5.在在PubMedPubMed中检索中检索检索步骤限定检索限定检索Article typesArticle types（文献类型）（文献类型）Text availabilityText availability（文本利用，文摘和全文（文本利用，文摘和全文）Publication datesPublication dates（出版日期）（出版日期）SpeciesSpecies（研究对象）（研究对象）LanguagesLanguages（语种）（语种）SexSex（性别）（性别）SubjectsSubjects（主题范畴）（主题范畴）Journal categoriesJournal c

16、ategories（期刊类型）（期刊类型）AgesAges（年龄组）（年龄组）Search fieldsSearch fields（特定字段）（特定字段）限定检索限定检索限定检索限定检索点击取消PubMedPubMed几种检索方法的选择几种检索方法的选择l基本检索基本检索l高级检索高级检索lMeSHMeSH DatabaseDatabase检索检索举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献基本检索基本检索 1.1.检索表达式：检索表达式： children asthma drug children asthma drug therapytherapy2.2.直接输入检索框

17、中，进行检索直接输入检索框中，进行检索检索过程（检索过程（SearchSearch detailsdetails） (childMeSH Terms OR childAll (childMeSH Terms OR childAll Fields OR childrenAll Fields) Fields OR childrenAll Fields) AND AND (asthmaMeSH Terms OR asthmaAll (asthmaMeSH Terms OR asthmaAll Fields) ANDFields) AND (drug therapySubheading OR (dru

18、gAll (drug therapySubheading OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug Fields AND therapyAll Fields) OR drug therapyAll Fields OR drug therapyMeSH therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR (drugAll Fields AND Terms OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields)therapyAll Fields)修改检索式：修改检索式：

19、childMeSHchildMeSH Terms AND asthmaMeSHTerms AND asthmaMeSH Terms Terms AND drug therapySubheadingAND drug therapySubheading举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献MeSHMeSH DatabaseDatabase检索检索1.1.确定主题词：确定主题词：child asthma child asthma drug therapy(drug therapy(副主副主题词题词) ) 2.2.查找主题词查找主题词举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献高级检索高级检索1.1.确定检索词：确定检索词：child asthma drug therapychild asthma drug therapy2.2.选择检索字段选择检索字段3.3.输入检索词输入检索词Journals Databases主题、刊名全称或缩写、主题、刊名全称或缩写、ISSNISSN单篇文献匹配器单篇文献匹配器临床咨询临床咨询特殊专题咨询检索结果检索结果显示显示保存保存打印打印显示格式显示格式Summary(简要格式)Abstract（文摘格式）MEDLI