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文档简介
1、蛋白质修饰位点预测详解This model paper was revised by LINDA on December 15, 2012.蛋白质修饰位点分析目录实验目的实验平台实验过程错误!未定义书签。、“人类connexin43蛋白质磷酸化位点修饰1、“人类connexin43”蛋白质序列下载2、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点53、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点(1)DISPHOS预测未知蛋白磷酸化位点(2)PhosphoSitePlus预测指定蛋白磷酸化位点4、人类connexin43”蛋白质磷酸修饰结论二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰1、N型糖基化位点预测2、0型糖基化位点预
2、测(1)哺乳动物0型糖基化位点预测(2)真核生物0型糖基化位点预测3、uniprot数据库查看蛋白质糖基化修饰位点4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论实验结论(特别提示:ctrl+单击H录下的标题链接,可以跟踪标题;ctrl+单击标题后的图标矽 可以返回H录)实验目的矽找出“人类connexin43w蛋白质上面的所有可能磷酸化位点,并说明为什么(注释)找出“人类血红蛋白”上面的糖基化位点,注释结果实验平台搦uniprot数据库:(査看蛋白的修饰情况)预测未知蛋白磷酸化位点DISPHOS:PhosphoSitePlus:预测未知蛋白的糖基化修饰位点型糖基化位点预测:0型糖基化位点预测:实验过程
3、报一、人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰厘卩1、“人类connexin43”蛋白质序列下載孩蛋白序列:-J2、uniprot数据库査看蛋白磷酸化位点少网站链接:3、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点矽-J(1) DISPHOS预测未知蛋白磷酸化位点少网站链接:开始预测矽DISPHOS III蛋口序列预测蛋口磷酸修饰位点,总共有37个丝氨酸修饰位点,13个苏氨酸修饰位点,16个酪氨酸修饰位点。但是根据打分,只有8个丝氨酸修饰位点可能存在。(2)网站链接:开始预测矽结果矽筛选参考文献来源多于5篇的磷酸化修饰位点,丙氨酸磷酸化修饰位点数LJ为1、丝 氨酸为17、苏氨酸数LI为1、酪氨酸数LI
4、为7。4、人类 connexin43在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致,“人类connexin43蛋口质磷酸位 点数量相对一般蛋口质较多,且丝氨酸磷酸修饰位点最多。“人类connexin43”蛋口质 极有可能是一种活性较高的蛋口质,与机体的生物活性显着相关。通过各种文献阅读和网络筛选发现connexin43蛋口质是一种哺乳动物连接蛋口,是 主要的细胞缝隙连接蛋口,其表达的异常与多种疾病的发生有关。二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰矽Ncbi下载人类血红蛋白的蛋口序列保存为:1、N型糖基化位点预测矽网站链接:开始预测矽2、0型糖基化位点预测矽(1) 哺乳动物o型糖基化位点预测矽网站链接:开始预测结(2) 真核生物0型糖基化位点预测矽网站链接:开始预测矽结3、uniprot数据库査看蛋白质糖基化修饰位点矽4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论矽在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致,人类血红蛋口基本没有0型糖基化修饰位点,但是存在N型糖基化修饰位点。血红蛋口是高等生物体内负责运载氧的一种蛋口 质,糖基化修饰可能和血红蛋口的信号传导功能有关。实验结论戈 人类con
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