MS中各种操作共3

1、X Y平面内平移选定的对象 XY平面内平移选定的对象 相对屏幕水平移动选定对象 相对屏幕竖直移动选定对象 相对屏幕垂直移动选定对象 相对屏幕水平移动选定对象 相对屏幕竖直移动选定对象 相对屏幕垂直移动选定对象 沿着XY轴旋转选定对象 沿着Z轴旋转选定对象 绕X轴旋转选定对象Rotate selected objects about Y Rotate selected objects about ZSHIFT + 鼠标中间拖动开始添加原子 在已有原子上再加原子 创建化学键XY 方向平移原子 合并两个原子 移动已画原子 前后移动已画的原子 改变已画化学键的长度 添加原子并停止草画 停止草画停止草画

2、 改变化学键的数目 在化学键中插入原子 替换元素画原子团片断 功能 建立独立原子团 向原子上添加原子团 添加原子团并旋转 结合两个原子团片断 改变原子团结合点在窗口的右边SHIFT + ALT + 鼠标右键拖动SHIFT + X + 鼠标中间拖动SHIFT + Y + 鼠标中间拖动SHIFT + Z + 鼠标中间拖动SHIFT + ALT- 鼠标水平移动SHIFT + ALT- 鼠标竖直移动SHIFT + ALT- Z 鼠标移动SHIFT + 鼠标右键在靠近窗口中央拖动SHIFT + 鼠标右键窗口边缘拖动SHIFT + X + 鼠标右键拖动SHIFT + Y + 鼠标右键拖动SHIFT + Z

3、 + 鼠标右键拖动空白处单击鼠标 在原子上单击 先后单击这两个原子 单击原子并拖动。 把一个拖到另一个上 鼠标拖动它ALT + 鼠标左键拖动SHIFT + ALT + 鼠标左键拖动 左键双击ESC单击活动窗口以外地方 单击化学键ALT + 单击化学键ALT + 单击原子按键空白处单击 单击头上的原子 在头上原子单击并拖动ALT + 分别单击两个原子团头上的原子 双击原子团头上的原子建模时加入杂原子的方法方法一： 用鼠标点上将要被取代得原子（点上后原子颜色将变成黄色）属性栏中，将会显示这个原子的相关属性，并告诉你这个原子的元素种类（比方是Al吧），然后点这个元素种类 Al，将出现一个元素周期表，

4、选择你要掺杂得原子，确定就可以了！方法二： 建立完没有掺杂的晶胞后 ,选 supercell, 然后再选择要替换的原子 ,进行掺杂 .如 果不把晶胞的对称性改为 supercell 就不能改变其中的一个原子 , 而是由于对称性把同一元 素的所以原子改变了采用DM0L3建模的基本步骤第一种情况 :从程序自带的各种晶体及有机模型中导入体系的晶胞打开MS ，由fileimportstructuresmetalspure-metalsFe 导入 Fe 的晶胞。由 build Surfaces cleave Surfaces 打开对话框。在对话框中输入要建立的晶面（ hkl ），选择 position

5、，其 中depth控制晶面层数。进入 buildSupercell，输入A、B、C的值，得到想要的超晶胞。到该步骤，我们已经建立了一个周期性的超晶胞。如果要做周期性计算，则应选择buildCrystalsbuild vaccum slab ，其中真空层通常选择 10埃以上。如果建立团簇模型 则选择 buildSymmetryNon-periodicStructure ，去掉模型的周期性，并跟据自己的实际 需要删除部分原子，得到想要的团簇模型。在表面插入分子时通过菜单栏上的几个小图标 添加即可。第二种情况 :手动建模，优点是可控制晶格常数。首先从文献中查到晶体的晶格常数的 实验值。打开 buil

6、dCrystalsbuildcrystals ，可见到对话框。在对话框中选择空间群与 点群，然后在 Lattice Parameter 中设置晶胞基矢的长度及夹角。然后打开 buildAdd atom ，从对话框中输入坐标。这里只需输入几个有代表性的原子的坐标，不必全部输入。 在坐标输入前首先在 option 页面中选择 coordinate system ，或者分数坐标或者卡迪尔坐标。以下步骤重复 2-5 步。需要注意的是，采取什么样的团簇并不是任意的。原因是很多模型构 造出来后在优化过程中往往不收敛。要避免这个问题的办法是查阅文献，参考文献上模型 进行选取，因为它们的模型通常是经过试验证实收敛的。关于计算参数设置1. 主要有几个参数需要注意，对于Electronic 页面，需要注意的是 Coretreatment, 对于过渡金属原子通常需要考虑相对论效应，因此一般不使用 AllElectron 方法。其他几种方法 任选。Basis set应为DNP， Setup下的Quality 一般选fine。为了提高计算速度，一个较好 的办法是先用粗糙的 Basis set 和 Quality 进行优化，然后再提高精度。2. 还有一