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文档简介
1、嗜水气单胞菌 cpha 酶与碳青霉烯类抗生素之间的分子识别和相互作用金属 -内酰胺酶(metallo-beta lactamase,m ls)通过水解 -内酰胺抗生素的 -内酰胺环而阻止抗生素对抗细菌感染的有益行为。来自于嗜水气单胞菌的 cpha 酶是 m ls 亚群的一员,其在活性位点只有一个 zn2+,并只特异性水解 碳青霉烯类抗生素。然而对于 cpha 酶与碳青霉烯类抗生素之间的分子识别和相互作用知之甚少。本研究将在重组菌中表达并分离纯化得到 cpha 酶的基础上,采用荧光光谱法和分子对接模拟法相结合,以亚胺培南(imipenem,imp)和比阿培南(biapenem,bia)为研究对象
2、,研究它们在结合过程中,酶的构象变化、抗生素分子的空间分布取向、 形成络合物的本质以及它们之间的作用力类型和作用位点数等。(1)将含有 pet28b-cpha 的大肠杆菌 bl21(de3)进行诱导表达,通过阳离子交换层析分离纯化,然后用 sds-page 鉴定和 bradford 测蛋白含量,最后对其进行荧光表征。结果表明:得到有活性的纯度较高的样品,其分子量约为 28 kda,纯化后产量约为 0.180.21 mg/ml,当激发波长为 278 nm 时,发现在 336.2 nm 处荧光 明显。(2)在 277 k、ph 7.4 pbs 中,测得 cpha 酶对 imp 与 bia 的 km
3、 分别为356 m 和 286 m;通过荧光发射光谱测得 cpha 酶与 imp 和 bia 的分子饱和比分别为 0.95 和 0.98;同步荧光光谱结果表明:它们相互作用且 tyr 残基附近的微环境发生微弱的变化;测定 277 k、281 k 和 285 k 三个温度下 cpha 酶分别对 imp和 bia 结合过程的猝灭光谱,结果表明:它们之间发生的猝灭均为静态猝灭;它们之间是依靠单一的结合位点结合,且均为自发的放热过程。(3)分子对接结果显示cpha 酶与 imp 和 bia 在结合过程中存在一些相同之处:两种抗生素-内酰胺环的 c3 羧基氧直接与 zn2+形成金属配位键,促进相互作用,且均使 cpha 酶 loop 环 发生局部的构象变化。不同之处为:imp 因侧链空间位阻较小,使其全部进入口袋,在相互作用过程中,共有 3 组静电力和 5 组氢键形成;bia 因侧链双环三唑的位阻比较大,留部分侧链位于口袋外侧,在相互作用过程中,共有 4 组静电力和 2 组氢键,进而使得cpha 酶对 bia 的亲和力大于对 imp 的,以及形成 cpha-bia 复合物的稳定性也大于 cpha-imp 复合物的稳定性。荧光光谱结果中 cpha-bia 复合物体系的 ksv 和 ka 高于 cpha-imp 复合物体系的,
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