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1、PCF设计引物时酶切位点的保护酶寡核苷酸序列切割率%2 hr20 hrAcc IGGTCGACo0CGGTCGACG00CCTCGACGG00Afl IIICACATGG00CCACATGGG9090CCCACATGGGG9090Asc IGGCGCGCC9090AGGCGCGCC9090TTGGCGCGCC9090Ava ICCCCGGG5090CCCCCGGGG9090TCCCCCGGGGA9090BamH ICGGATCG1025CGGGATCCG9090CGCGGATCGCG9090Bgl IICAGATCG00GAAGATCTC7590GGAGATCTCC2590BssH IIGGC
2、GCGC00AG3CGCGCT00TTGGCGCGCAA5090BstE IIGGGT(A/T)ACCC010BstX IAACTGCAGACCAATGCATTGG00AAAACTGCACAATGCATTGG2550CTGCAGAACAATGCATTGTGCAT2590Cla ICATCGAG00GATCGAC00CCATCGAGG9090CCCATCGAGGG5050EcoR IGGAATTC9090CGGAATTCG9090CCG5AATTCGG9090Hae IIIGCEGCCC9090AGG3GCGCT9090TTGCGGCCCAA9090Hi nd IIICAAGCTG00CCAAG
3、CTGG00CCCAGCTGGG1075Kpn IGGGTACC00GGGGTACCC9090CGGGTACCCG9090Mlu IGACGCGd00CGACGCGCG2550Neo ICCCATGG00CATCCCATGGATG5075Nde ICCATATG00CCCATATGG00CGCATATGCG00GGGTTCATATGAACCC00GGAATTCATATGAATTCC7590GGGAATTCATATGAATTCCC7590Nhe IGGCTAGC00CGGCTAGCG1025CTAGCTAGTAG1050Not ITTGCGGCCGC00ATTTGCGGCCGTTA1010AAA
4、TATSCGGCCGCTAAA1010ATAAGAAGCGGCCGCAACTAT2590AAGGAAAAAACGGCCGAAAGGAAAA2590Nsi ITGCATGCAGCA1090CCAATGCATGGTTCTGCAGTT90901Pae ITTAATTAA00GTTAATTA/C025CCTTAATTAGG090Pme IGTTTAAAC00GGTTTAAAC025GCETTTAAACC050AGCTTGTTTAAAGGCGCGCCGG7590Pst IGCTGCAG00TGCACTGCAGGCA1010AACTGCAAACCAATGCATTGG9090AAAACTGCAGCAATGC
5、ATTGGAA9090CTGCAAACCAATGCATTGGATGCAT00Pvu ICCGATCG00ATCGATCGT1025TCGCGATCGGA010Sac ICGAGCTG1010Sac IIGCCGCGG00TCGCCGCGGGA5090Sal IGTCGAGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC00GG3TCGAGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG1050ACG(GTCGAGTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA1075Sea IGAGTACC1025AAAAGTACTTT7575Sma ICCCGGG010CCCCGGG010C8CCGGGG1050TCCCCC
6、GGGGA9090Spe IGACTAGC1090GGACTAGCC1090CG(ACTAGCCG050CTAGACTAGCTAG050Sph IGGCATGC00CATGCATGATG025ACATGCATGATGT1050Stu IAAGGCCT9090GAAGGCCTC9090AAAAGGCCTTT9090Xba ICTCTAGG00GCTCTAGGC9090TGCTCTAGGCA7590CTAGTCTAGCTAG7590Xho ICCTCGAG00CCCTCGAGG1025CCCCTCGAGGG1075Xma ICCCCGGG00COCCCGGGG2575CCCCCGGGGG5090TCCGCCCGGGGGA9090注释:1. 如果要加在序列的5 端,就在酶切位点识别碱基序列(红色)的 5端加 上相应的碱基(黑色),相同如果要在 3 端加保护碱基,就在酶切位点识 别碱基序列(红色)
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