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文档简介

1、动物肝脏中DNA的提取及检测一、前言脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸(DNA ,为英文 Deoxyribonucleic acid的缩写),又称去氧核糖核酸, 是脱氧核糖核酸染色体的主要化学成分, 同时也是组成基因的材料。 有时也被称为“遗传微粒”, 原因是在繁殖过程中,父代会把它们自己 DNA 的一部分复制传递到子代中,从而完成性状的传播。DNA 是高分子聚合物, DNA 溶液为高分子溶液,具有很高的粘度,可被甲基绿染成绿色。 DNA 对紫外线( 260nm )有吸收作用,利用这一特性,可以对 DNA 进行含量测定。当核酸变性时,吸光度升高,称为增色效应;当变性核酸重新复性时,吸光度又会恢复到原来的

2、水平。较高温度、有机溶剂、酸碱试剂、尿素、酰胺等都可以引起 DNA 分子变性,即 DNA 双链碱基间的氢键断裂,双螺旋结构解开也称为 DNA 的解螺旋。在细胞内, DNA 能与蛋白质结合形成染色体,整组染色体则统称为染色体组。对于人类而言,正常的体细中含有46 条染色体。染色体在细胞分裂之前会先在分裂间期完成复制,细胞分裂间期又可划分为: G1 期-DNA 合成前期、 S 期-DNA 合成期、 G2-DNA合成后期。对于真核生物,如动物、植物及真菌而言,染色体主要存在于细胞核内;而对于原核生物, 如细菌而言,则主要存在于细胞质中的拟核内。染色体上的染色质蛋白,如组织蛋白,能够将 DNA 进行组

3、织并压缩,以帮助 DNA 与其他蛋白质进行交互作用,进而调节基因的转录。脱氧核糖核酸的结构DNA 的结构:DNA 的结构一般可划分为一级结构、二级结构、三级结构和四级结构四个水平。DNA 是一种长链聚合物,组成单位为四种脱氧核苷酸,即腺嘌呤脱氧核苷酸(dAMP脱氧腺苷)、胸腺嘧啶脱氧核苷酸 (dTMP脱氧胸苷)、胞嘧啶脱氧核苷酸(dCMP脱氧胞苷)、鸟嘌呤脱氧核苷酸( dGMP脱氧鸟苷)。而脱氧核糖(五碳糖)与磷酸分子借由酯键相连,组成其长链骨架,排列在外侧,四种碱基排列在内侧。每个糖分子都与四种碱基里的其中一种相连,这些碱基沿着DNA 长链所排列而成的序列,可组成遗传密码,指导蛋白质的合成。

4、读取密码的过程称为转录,是以DNA 双链中的一条单链为模板转录出一段称为 mRNA (信使 RNA )的核酸分子。DNA 是由许多脱氧核苷酸按一定碱基顺序彼此用3 , 5 - 磷酸二酯键相连构成的长链。大多数DNA 含有两条这样的长链,也有的 DNA 为单链,如大肠杆菌噬菌体 X174 、G4、M13 等。 DNA 有环形 DNA 和链状 DNA 之分。在某些类型的 DNA 中, 5- 甲基胞嘧啶可在一定限度内取代胞嘧啶, 其中小麦胚 DNA 的 5- 甲基胞嘧啶特别丰富。在某些噬菌体中,5- 羟甲基胞嘧啶取代了胞嘧啶。40 年代后期,查加夫(E.Chargaff )发现不同物种 DNA 的碱

5、基组成不同,但其中的腺嘌呤数等于其胸腺嘧啶数(A=T ),鸟嘌呤数等于胞嘧啶数(G=C ),因而嘌呤数之和等于嘧啶数之和,一般用几个层次描绘DNA 的结构。浓盐法从动物组织中提取DNA核酸和蛋白质在生物体中常以核蛋白 (DNP/RNP )的形式存在,其中 DNP 能溶于水及高浓度盐溶液,但在 0.14 M 的盐溶液中溶解度很低,而 RNP 则可溶于低盐溶液,因此可利用不同浓度的 NaCl 溶液将其从样品中分别抽提出来。 将抽提得到的 DNP 用 SDS 处理可将其分离 DNA 和蛋白质,用氯仿 - 异戊醇将蛋白质沉淀除去可得 DNA 上清,加入冷乙醇即可将其呈纤维状析出。肝脏细胞肝脏是由肝细胞

6、组成,肝细胞极小,肉眼看不到,必须通过显微镜才能看到。人肝约有 25 亿个肝细胞, 5000 个肝细胞组成一个肝小叶,因此人肝的肝小叶总数约有 50 万个。肝细胞为多角形,直径约为 20-30/ 加(微米 ),有 6-8 个面,不同的生理条件下大小有差异,如饥饿时肝细胞体积变大。 每个肝细胞表面可分为窦状隙面、 肝细胞面和胆小管面三种。肝细胞里面含有许许多多复杂的细微结构 :如肝细胞核、肝细胞质、线粒体、内质网、溶酶体、高尔基氏体、微粒体及饮液泡等组成。二、实验目的1. 掌握浓盐法从动物组织中提取 DNA 的原理与技术三、实验原理核酸和蛋白质在生物体中常以核蛋白(DNP/RNP )的形式存在,

7、其中 DNP 能溶于水及高浓度盐溶液,但在 0.14 M 的盐溶液中溶解度很低,而 RNP 则可溶于低盐溶液,因此可利用不同浓度的 NaCl 溶液将其从样品中分别抽提出来。将抽提得到的DNP 用 SDS 处理可将其分离DNA 和蛋白质,用氯仿 - 异戊醇将蛋白质沉淀除去可得DNA上清,加入冷乙醇即可将其呈纤维状析出。四、实验器材和材料试剂实验器材:匀浆器量筒离心机离心管试管吸管恒温水浴锅实验材料:猪肝实验试剂:0.1mol/L NaCl-0.05mol/L柠檬酸钠溶液(pH6.8)95% 乙醇( A.R.)NaCl 固体( A.R.)5%SDS 溶液( 5g SDS定容至 100ml)V(氯仿

8、 ):V(异戊醇) 20 :1 的混合液五、实验操作1. 称量 称 取 一 定 质 量 的 猪 肝 , 加 入 2 倍 肝 重 的 0.1mol/L NaCl-0.05mol/L 柠檬酸钠缓冲液并用匀浆器磨碎(已完成)。2. 提取DNA量取肝糜4 ml于10毫升离心管,在4000r/min下离心10min,沉淀中再加入8 ml缓冲液于4000r/min离心5 min;弃上清,取沉淀;将沉淀用10 ml 柠檬酸钠缓冲液完全洗入干净的小烧杯、加入 5 ml 氯仿 - 异戊醇混合液、1 ml SDS ,振荡 30min(保鲜膜封口);缓慢加入固体 NaCl (约 0.9g ),使其最终浓度为 1mo

9、l/L ;将溶液分装到 2 个 10 毫升离心管中,在 4000r/min 离心 5min ,取上清水相;在上述水相溶液中分别加等体积冷95% 乙醇,边加边用玻棒慢慢朝一个方向搅动, 将缠绕在玻棒上的凝胶状物用滤纸吸去多余的乙醇,即得 DNA 粗品;用 8ml 蒸馏水溶解 DNA 粗品于 10ml 离心管中。3. 标准曲线的绘制按下表加入各种 试剂,混匀,于 60 恒温水浴锅 45min ,冷却后,在 595nm 波长下于分光光度计比色测定,以吸光度对 DNA 浓度作图,制作标准曲线。012345标准 DNA溶0.00.40.81.21.62.0液/ml蒸馏水 /ml2.01.61.20.80

10、.40二苯胺试剂4.04.04.04.04.04.0/mlA595nm4. 样品的测定将 DNA 粗品定容至 25ml容量瓶,再取 DNA 样液 1.0ml ,加入蒸馏水 1.0ml ,混匀。然后准确加入二苯胺试剂4.0ml ,混匀,于60 恒温水浴锅 45min ,冷却后,595nm波长下于分光光度计比色测定,根据所测的吸光度对照标准曲线求得DNA 的质量( ug )。5. 计算 100g 猪肝中 DNA 含量 w=m1/m2 100%w :DNA 的质量分数( %)m1 :样液中测得的DNA 的质量( ug )m2 :样液中所含样品的质量(ug )六、实验数据处理1. 标准曲线012345

11、标准 DNA溶0.00.40.81.21.62.0液/ml蒸馏水 /ml2.01.61.20.80.40二苯胺试剂4.04.04.04.04.04.0/mlA595nm00.0390.090.1460.1970.249DNA 含量080160240320400/ug2. 实验结果处理猪肝质量为 2.04gDNA 提取液体积为 12.53ml序号123A595nm0.1020.1020.101平均 A595nm0.102样液中 DNA 含量 /ug171.4样液中样品质量 /g0.1628根据公式w=m1/m2100%得: w=0.1053 则 100g 猪肝中 DNA 含量为: w 100=0

12、.1053g七、思考题1. 实验中的乙醇、 SDS、氯仿 - 异戊醇、 NaCl 、柠檬酸钠分别有什么作用?答:柠檬酸的钠盐在实验中既充当DNA酶的抑制剂,也是pH 缓冲溶液; SDS 是表面活性剂,可以让蛋白质与 DNA 分开;氯仿是有机溶剂,可以使蛋白质聚集沉淀, 便于分离出去;异戊醇是消泡剂,可以减少泡沫的发生;氯仿 - 异戊醇的作用是使蛋白质变性、膜溶解;NaCl 固体溶解使得试液成为高浓度的盐溶液,在这样的环境中 DNA核蛋白能溶解, RNA 核蛋白则溶解度很低,可以利用这一性质分离两种核酸。八、实验注意事项1.DNA主要集中在细胞核中,因此,通常选用细胞核含量比例大的生活组织作为提

13、取制备DNA 的材料,小牛胸腺组织中细胞核比例较大,因而 DNA 含量丰富,同时其脱氧核苷酸酶活性较低,制备过程中 DNA 被降解的可能性相对较低,所以是制备DNA 的良好材料,但其来源较困难,脾脏或肝脏易获得,也是实验室制备DNA 常用的材料,本实验用新鲜肝脏作为实验材料。2. 为了防止大分子核酸在提取过程中被降解,须采取以下措施:整个过程必须在低温下进行, 可加入某些物质抑制核酸酶的活性, 如柠檬酸钠、 EDTA、SDS 等, EDTA 是抑制核酸酶的活性最好的抑制剂。3. 从核蛋白中脱去蛋白质的方法很多,经常采用的有:氯仿 - 异丙醇法、苯酚法、去垢剂法等,他们均能使蛋白质变性和核蛋白解

14、聚,并释放出核酸。4. 使用离心机时,对称放置的离心管必须用天平调平衡。5. 避免剧烈振荡,如研磨过程、搅拌过程等。九、实验结果误差分析及讨论经过对本次实验结果进行分析,得出100g 猪肝中 DNA 含量大约为0.1053g 的结论,在上网查阅相关资料后发现:猪肝中 DNA 含量与本次试验实际操作测量得出的结果大致相互吻合。 由此可知,本次试验结果是相对比较成功的,较为粗略地测量出猪肝中 DNA 的含量,并且较为熟练地掌握了浓盐法从动物组织中提取 DNA 的原理与技术,基本达到了本次实验的目的。但是本次实验结果只是粗略测量,并未达到精确测量猪肝中DNA 的含量,且实验数据较理论值偏低,这是由于

15、某些误差导致,在实验过程中些许因素可能会导致实验结果数据有偏差,经分析得出以下几点:在称取猪肝后加入柠檬酸钠缓冲液进行研磨的过程中, 由于猪肝组织表面较滑不易磨碎, 且研磨至最后依旧有小部分猪肝组织块残留,因此可能导致猪肝中 DNA 提取不充分,致使实验数据较理论值偏低;研磨过程中, 可能由于操作不当,导致部分液体溅出,因此可能使得提取液中部分DNA 损失,导致实验数据偏低;在粗提取 DNA 操作中,频繁地将 DNA 提取液转移至各个仪器内,可能有极小部分 DNA 提取液未倒净,残留在仪器壁上损耗掉,导致实验误差;在使用移液枪的过程中, 可能因为操作不当或移液枪经常错误使用,出现仪器误差, 导致吸取的 DNA 样液不精确,出现实验误差;在水相中加入乙醇析出 DNA

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