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文档简介
蛋白质的分离、纯化 和表征 顾 黎 Y 山东大学生命科学学院 1 以蛋白质的结构与功能为基础,从分子水 平上认识生命现象,已经成为现代生物学 发展的主要方向,研究蛋白质,首先要得 到高度纯化并具有生物活性的目的物质。 2 蛋白质的相关性质 3 蛋白质的两性电离 一、蛋白质的酸碱性质 蛋白质的等电点: 当溶液在某一pH环境中,使蛋白质所带正、负电荷 相等,净电荷为零,在电场中不向阳极也不向阴极 移动,这一pH称为该蛋白质的等电点(pI)。 4 蛋白质pI与所含氨基酸种类和数量有关,若 蛋白质中碱性aa较多,其pI偏碱,如从雄性鱼 类精子中提取的鱼精蛋白含Arg多,其pI 约为 12 ;若含酸性aa较多,则pI偏酸。 蛋白质在等电点时其溶解度、导电性、粘度 、渗透压最小。 5 蛋白质的等离子点: 没有其他盐类干扰时,蛋白质质子供体基团解 离出来的质子数与质子受体基团结合的质子数 相等时的pH称为蛋白质的等离子点. 6 蛋白质相对分子量在10000 - 1000000之间。 测定分子量的主要方法有: 渗透压法、超离心法、凝胶过滤法、聚丙烯酰 胺凝胶电泳等。 二、蛋白质的分子大小与形状 7 1、根据化学组成测定最低相对分子质量 肌红蛋白含铁0.335%,其最低相对分子质量为: 铁的原子量 铁的百分含量 100 55.8 0.335 10016700 真实的分子量是最低相对分子质量的n倍,n为每 个蛋白质分子中某原子的数目。 8 2、渗透压法测定相对分子质量 渗透:溶剂分子由纯溶剂(或稀 溶液)向溶液(或浓溶液)单方向 的净移动现象。 渗透压: 渗透压是溶液的依数性质之一。 在一种溶质的理想溶液中渗透压 是浓度的线性函数。 9 在理想溶液中,溶液的渗透压与溶质浓度的关系可用 vant Hoff公式表示: 实际情况下,渗透压与浓度之间不是 简单的线性关系,用以下公式: =cRT/Mr r 10 优点: 1、装置简单 2、精确度不亚于其他方法 用该法应注意的问题: 渗透压受pH的影响- 唐南平衡造成半透膜两侧 可渗透的无机离子的不均衡分布,从而增加蛋白 质溶液的渗透压。 缺点: 易受蛋白质样品纯度的影响 11 3、蛋白质的扩散和扩散系数 蛋白质的扩散系数与分子大小和形状以及溶剂的 粘度有关。 平移扩散或扩散:由于浓度差引起的溶质分子的 净迁移。扩散的热力学驱动力是熵的增加。 12 扩散系数一般不单独用来决定分子量,而是与沉降系 数结合起来,可以给出蛋白质的精确相对分子质量。 扩散系数D =浓度梯 度为一个单位时, 1s内通过1cm2面积 所扩散的溶质的量 。 D与分子量立方根成反比,因此D对分子量的变化 并不敏感。 13 4、沉降分析法测定相对分子质量 沉降速率与蛋白质的分子大小、形状和密度有关 ,还与溶剂的密度和粘度有关。 沉降分析不仅可以提供关于蛋白质相对分子质量 的数据,还可以作为鉴定蛋白质分子均一性的一 种方法。 14 s = v 2x v =沉降速度(dx/dt) =离心机转子角速度(弧度/s) x =蛋白质界面中点与转子中心的距离cm) 沉降系数的单位常用S,1S=110-13(s) 1)沉降速度法 沉降界面移动的速度代表蛋白质分子的沉降速度。 沉降系数s:单位离心场的沉降速度 15 蛋白质分子量(M)与沉降系数(s)的关系 M = RTs D(1V) R气体常数(8.314107ergsmol -1 度-1 ) T绝对温度 D扩散系数(蛋白质分子量很大,离心 机转速很快,则忽略不计) V蛋白质的微分比容(m3g-1) 溶剂密度(20,gml-1) s沉降系数 斯维得贝格方程 16 在较低速度离心场中进行。 当净离心力与扩散力平衡时,在离心池内从液面 到液底形成一个由低到高的恒定浓度梯度。 r 2)沉降平衡法 17 沉降分析法的优点: 不仅可以测分子质量,而且可以鉴定 蛋白质分子的均一性。 18 1) 凝胶过滤的原理 不同大小的分子由于所经过的路径不同而被分离。 5、凝胶过滤法测定相对分子质量 19 2)凝胶过滤的介质 凝胶珠(凝胶颗粒),凝胶珠的内部是多孔的网状 结构。 排阻极限 常用:交联葡聚糖、聚丙烯酰胺凝胶和琼脂糖等。 Sephadex-葡聚糖凝胶G10-G200 Sepharose-琼脂糖凝胶2B,4B,6B Sephacryl-丙烯酰胺葡聚糖凝胶S100、S200、S300 20 Vo Vt-Vo = Vi+Vm Vt lgMr =a/b-1/b(Ve/Vo) 21 蛋白质分子通过凝胶柱的 速度(洗脱体积的大小)并 不直接取决于分子的质量 ,而是它的斯托克半径。 优点: 1)比较简便 2)待测样品可以不纯 22 6、SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定相对分子质量 SDS: CH3-(CH2)10-CH2-OSO3Na 1)使多肽链覆盖上相同密度的负电荷。 2)改变了蛋白质单体分子的构象。 不同蛋白质的SDS复合体具有几乎相同的 荷质比和相同的构象,因而它们的净电荷 量与摩擦系数之比都接近一个定值(具有相 近的自由迁移率)。 23 电泳法测分子量 24 7、蛋白质分子形状 溶液中蛋白质: 借助间接方法。 晶体状态蛋白质: 最精确的方法是X射线晶体结构分析。 25 摩擦比(蛋白质的不对称常数): 蛋白质分子形状偏离真正球体的程度的一种衡量。 26 三、蛋白质的胶体性质与蛋白质的沉淀 1、蛋白质的胶体性质 蛋白质在溶液中保持稳定的2个条件: 质点的电荷 质点与溶剂形成溶剂化层 分散系统分为3类: 真溶液:小于1nm 胶体溶液:1100nm 悬浊液:大于100nm 布郎运动、丁道尔现象、 电泳现象,不能透过半透 膜,具有吸附能力 + + + + + + 27 2、蛋白质的沉淀 蛋白质在溶液中靠水膜和电荷保持其稳定性,水 膜和电荷一旦除去,蛋白质溶液的稳定性就被破 坏,蛋白质就会从溶液中沉淀下来,此现象即为 蛋白质的沉淀作用。 蛋白质胶体溶液的稳定性与它的分子量大小 、所带的电荷和水化作用有关。改变溶液的 条件,将影响蛋白质的溶解性质 28 5、加热变性沉淀法:天然结构解体,疏水基团外露,破 坏水化层。 2、有机溶剂沉淀法:脱水化层及降低介电常数加强带电 质点的相互作用。 1、盐析法:脱水化层。 沉淀蛋白质的方法有以下几种: 4、生物碱试剂和某些酸类沉淀法:与生物碱试剂或酸性 负离子生成不溶性盐。 3、重金属沉淀法:与重金属离子生成不溶性盐。 29 蛋白质分离纯化的 一般原则 总目标:增加制品的纯度或比活。 30 分离和纯化的过程中,必须注意保存生物大 分子的完整性,防止酸、碱、高温,剧烈机 械作用导致所提物质生物活性的丧失。 31 根据蛋白质的特性,选择不同的溶剂进行抽提。 水溶性蛋白用中性缓冲溶液抽提,酸性蛋白用稀碱 性溶液抽提,脂溶性蛋白用表面活性剂抽提等。 前处理:生物组织的机械破碎 动物材料:除结缔、脂肪组织- 电动捣碎机、匀 浆器、超声波 植物组织:去种皮- 石英砂、玻璃粉 细菌细胞:超声波震荡、砂研磨、高压、溶菌酶 32 3、细分级分离:凝胶过滤、离子交换层析、吸附层析、 亲和层析、电泳 2、粗分级分离:盐析、等电点沉淀、有机溶剂分级分离 4、结晶 粗提目的蛋白质 纯化目的蛋白质、规模较小、分辨率很高 进一步纯化、准备结构分析 33 依据蛋白质的性质不同: 分子大小、溶解度、电荷、吸附性质、 特异的生物学亲和力 蛋白质的分离纯 化方法 34 透析( Dialysis) :根据分子量的大小,用透析袋将 大、小分子物质分开。 一、根据分子大小不同的分离方法 常用的半透膜有玻璃纸 或高分子合成材料,截 止分子量一般为一万。 1、透析和超过滤 通透动力为半透膜两侧的物质浓度差。 35 超(过)滤:利用压力或离心力,强行使 水和其他小分子通过半透膜,蛋白质被 截流在膜上,以达浓缩和脱盐的目的。 切向流过滤(交叉流过滤): 包括有:中空纤维超滤器、圆筒式超滤 器、板式超滤器。 超滤膜的截止分子量有100万、50万、 30万、10万、5万、1万、5千和1千。 36 2、 密度梯度离心 (沉降取决于大小和密度) 常用的密度梯度:蔗糖、聚蔗糖和其他 合成材料的密度梯度。37 3、 凝胶过滤(分子筛层析) 38 影响蛋白质溶解度的外部因素: 1)溶液的pH 2)离子强度 3)介电常数 4)温度 二、 利用溶解度差异的分离方法 溶解度归根结底取决于它们本身的分子结构 蛋白质所形成的亲水胶体颗粒具有两种稳定因素,即 颗粒表面的水化层和电荷。 若无外加条件,蛋白质不致互相凝集; 除掉这两个稳定 因素,蛋白质便容易凝集析出。 39 1、 等电点沉淀和pH控制 pH和离子强度对 -乳球蛋白溶解度 的影响 40 2、蛋白质的盐溶和盐析 盐溶:低浓度的中性盐可增加蛋白质的溶解度。 蛋白质分子吸附某种盐类离子,带电层使其互相排斥。 盐析:蛋白质在高浓度的中性盐溶液中,如 (NH4)2SO4、Na2SO4、NaCl,由于水化层被破坏和 表面电荷被中和,容易发生沉淀。 不同的蛋白质由于所带的电荷和水化程度不同,盐析 时所需的盐的浓度也不相同,因而可以将不同的蛋白 质加以分离。 41 半饱和硫酸铵 离心 球蛋白沉淀血清 血清 离心 饱和硫酸铵 白蛋白沉淀 42 3、有机溶剂分级法 在蛋白质溶液中,加入一定量的与水互溶的有机 溶剂,由于这些溶剂与水的亲和力强,能够破坏 蛋白质的水化层,降低介电常数使蛋白质的溶解 度降低而沉淀。 有机溶剂浓度不能太高(30%-50%),低温下或缩 短处理时间可防止或减缓变性。 常用的有机溶剂有乙醇、甲醇和丙酮等。 聚乙二醇:脱去蛋白质的水化层。 4、温度对蛋白质溶解度的影响 43 1、电泳 三、根据电荷不同的分离方法 在外电场的作用下,带电颗粒将向着与其电性 相反的电极移动,这种现象称为电泳。 蛋白质溶液的pH值不等于等电点时,蛋白质颗 粒均带有不同的电荷。 在外加电场作用下,带电的蛋白质颗粒在电场中移动 的速度(v)取决于电场强度(E)、所带的净电荷(q)以 及与介质的摩擦系数(f) 44 界面移动电泳图解 45 46 1)聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE) 圆盘电泳过程中的3种物理效应: a、 样品的浓度效应 b、 凝胶对被分离分子的筛选效应 c、 一般电泳分离的电荷效应 亦称圆盘凝胶电泳或圆盘电泳 “圆盘(disc)” discontinuity 和 discoid shape 不连续胶 47 2)毛细管电泳 优点:减少了由于热效应产生的许多问题。 3)等电聚焦(属于自由界面电泳) *凝胶等电聚焦:用聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖或葡 聚糖凝胶代替蔗糖溶液进行电泳。固体、量大。 蛋白质混合物在具有pH梯度的介质(浓蔗糖溶 液)中进行。 48 2、聚焦层析 根据蛋白质的等电点差异分离蛋白质混合物 的柱层析方法。 用特种多缓冲液滴洗填充在柱中的特种多缓 冲交换剂,即可建立pH梯度。 49 3、离子交换层析 利用离子交换树脂 作为柱层析支持物 ,将带有不同电荷 的蛋白质进行分离 的方法。 50 1)纤维素离子交换剂 交换容量大于树脂、洗脱条件温和、品种较多。 2)交联葡聚糖离子交换剂 即可根据分子的净电荷数量又可根据分子的大小 进行分离。 51 四、利用选择性吸附的纯化方法 1) 羟磷灰石层析 Ca10(PO4)6(OH)2 2) *最重要的用途是将单链和双链DNA分开。 3) *从含RNA和蛋白质的细胞提取液中选择性除去DNA 。 吸附层析(薄层、柱): 利用待纯化的分子和杂质分子与吸附剂之间的吸附 能力和解吸性质不同而达到分离的目的。 吸附过程涉及范德华作用和氢键等非离子吸引力。 典型的吸附剂:硅胶、氧化铝和活性炭等。 52 2) 疏水作用层析 利用蛋白质表面存在的疏水区域的强度、大小不同, 而被吸附到连接有疏水基团的层析介质上。 疏水基团:正丁基-Sepharose、正辛基-Sepharose、 苯基-Sepharose - 连接到琼脂糖上。 离子强度增大(硫酸铵的存在)可增强吸附能力,因 此常在2mol/L或3mol/LNaCl溶解样品,洗脱时可通过 降低盐浓度、增加乙二醇浓度进行梯度洗脱。 53 这是一种高效分离纯化蛋白的方法。其原理是不 同的蛋白质分子对于固定化在载体上的特殊配基 具有不同的识别和结合能力。 五、利用对配体的特异生物学亲和力的纯化方法 54 常用的配基:抗体、抗原、激素或受体蛋白、酶 的底物和抑制剂等。 层析柱载体:琼脂糖凝胶等。 凝集素亲和层析、免疫亲和层析、金属螯合层析 、染料配体层析和共价层析。 55 56 六、高效液相层析和快速蛋白质液相层析 快速蛋白质液相层析(FPLC) 专用于蛋白质分离。没有自己的特有原理。 反相HPLC: 与其他层析的最大区别是固定相基本上是惰性的 ,固定相与被分离物只可能有疏水作用。 HPLC是离子交换、分子排阻、吸附和分配等层 析技术的发展新阶段。 更高的效率、更高的分辨率和更快的过柱速度。 57 蛋白质含量的测定与 纯度鉴定 58 一、蛋白质含量的测定 1) 凯氏定氮法:灵敏度较低 2) 双缩脲法:样品量0.2-1.7mg/L 3) Folin-Lowry法: 在碱性条件下磷钼酸、磷钨酸混合试剂与酪氨酸 上的酚发生反应,生成蓝色化合物,将其与双羧 脲法结合起来,蛋白质形成两种颜色的混合物呈 绿色,在650nm具有特定的吸收。灵敏度较高 25g-250g/ml。 BCA法 1、蛋白质总量的测量 59 4) 考马斯亮蓝法(Bradford法) 考马斯亮蓝G250是一种带有负电荷的染料,在酸性条 件下,可与蛋白质上的正电荷结合,形成蓝色化合物 ,在595nm具有特定吸收,反应简便、快速、
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