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文档简介
1、PubMed检索与利用,文献情报源研究,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,总结,检索结果的处理,一、简介,由美国国立医学图书馆(NLM)所属国家生物技术信息中心(NCBI) 建立;,http:/,收录范围,MEDLINE 记录标注PubMed - indexed for MEDLINE PreMedline 是临时性医学文献数据库,每天接收新数据,经MeSH词表标引后,每周向medline移加一次。 记录标注PubMed - in process Publisher supplied citations 出版商直接向PubM
2、ed递送的电子记录中不被Medline收录的部分。 记录标注PubMed - as supplied by publisher,MEDLINE数据库由美国国家医学图书馆(National Library of Medicine,简称NLM)编制,是印刷刊Index Medicus(医学索引)、Index to Dental Literature(牙科文献索引)和Internationgal Nursing Index(国际护理索引)的光盘版,数据摘自3700种期刊,是生物医学的主要数据库。时间跨度1966年至今。,简介,PubMed的特点,二、PubMed的特点,免费提供题录和文摘 可与提供原
3、文的网址链接 (部分免费获取) 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷,自动转换匹配: PubMed对输入检索框中的检索词进行智能化地校对,将其逐步地与其数据库中的各类术语匹配的原则。,MeSH Translation Table 主题词注释表,Journals Translation Table 期刊注释表,Common Phrase List 常用词组表,Author Index 作者索引表,No Mapping,检索词拆分AND,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,基本检索输入框,特征栏提供辅助 检索功能,侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索、特定文献检索,执行
4、检索按钮,Journals DatabaseMeSH DatabaseSingle Citation MatcherBatch Citation MatcherClinical QueriesSpecial QueriesLinkOutMy NCBI,三、PubMed检索界面,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,(一)单词、短语、词组检索,(二)作者姓名检索,(三)期刊名称检索,(四)截词检索,(五)带逻辑运算符的复合检索,在PubMed基本检索里面的前面四项其实也就是告诉我们在基本检索输入框中,可以输入任何具有实质性意义的词语,比如说:自由词、主题词、人
5、名或者刊名,系统都会智能化地同系统中词表的进行匹配后完成检索。,在基本检索里面,PubMed能够完成:,1、单词、短语、词组检索,2、作者检索,3、期刊名称检索,4、截词检索,5、带逻辑运算符的复合检索式,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,(一)单词、短语、词组检索,检索出文章总篇数,综述类文献总篇数,单词检索,系统自动进行转换匹配后生成的检索式,Liver cancer,固定搭配 词组检索,可以保证查全率,自动转换匹配后,进行逻辑或的运算,短语检索,自动转换匹配后的结果,强制短语/词组检索,针对特定的短语和词组的检索,需要在短语或者词组上加上双引号。,
6、简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,(一)单词、短语、词组检索,(二)作者姓名检索,作者姓名检索,格式:姓+名缩写(不用标点),如要查找王智彪教授发表的文章,输入格式为:wang zb,系统会自动在作者字段内进行检索。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,(一)单词、短语、词组检索,(二)作者姓名检索,(三)期刊名称检索,建议期刊检索使用期刊名称检索字段标识ta或者是so,这是因为: 如果期刊名称正好是一个MeSH中的词,系统会将其作MeSH词进行检索。 如果期刊名称是一个单词,系统会在所有字段中进行检索。,简介,Pu
7、bMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,(一)单词、短语、词组检索,(二)作者姓名检索,(三)期刊名称检索,(四)截词检索,在词的末尾加“*”号,PubMed就会检索出以该词为词根的所有的词。截词检索将关闭自动词语匹配功能。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,(一)单词、短语、词组检索,(二)作者姓名检索,(三)期刊名称检索,(四)截词检索,(五)带逻辑运算符的复合检索,如我们要检索肿瘤的诊断和治疗方面的文献,我们可以在基本检索输入框中输入:cancer AND (diagnosis OR therapy),点击“Go”进行检索。
8、,复合检索式检索,布尔逻辑运算符有: AND,OR或NOT,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索,检索史管理,预检索及浏览索引检索,详细匹配过程,剪贴板,界面介绍,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索(Limits),输入检索词,系统默认空格为AND关系,子文档,检索词字段,出版类型 选择限制,文献发表日期,只要有文摘的文献,语种,研究对象年龄,限制字段和条件检索(Limits),性别,数据输入时间,研究对象,将检索词限制在一个特定范围,简介,PubM
9、ed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索(Limits),预检索/浏览索引检索(Preview/Index),检索式,预检索/索引加词检索,预检索按钮,索引检索按钮,预检索/浏览索引检索界面(Preview/Index),检索结果数量,therapy,预览检索结果,修改和增删检索词,步骤2 输入待选词,步骤1 点击预览/索引按钮,hepatitis b,步骤3 点击index按钮,步骤5 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系,步骤4 索引选词,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条
10、件检索(Limits),预检索/浏览检索(Preview/Index),检索史管理(History),检索历史回顾,检索式,检索时间,检出篇数,点击预检索按钮,#1 and therapy,用于查看检索记录和检索结果的数量,并进行各种逻辑运算。,检索史管理界面(History),检索号,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索(Limits),预检索/浏览检索(Preview/Index),检索史管理(History),剪贴板管理(Clipboard),剪贴板管理界面(Clipboard),暂存需下载或者是打印的记录,多项检索
11、后集中存盘或者打印。最多允许存储1000条。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索(Limits),预检索/浏览检索(Preview/Index),检索史管理(History),剪贴板管理(Clipboard),详细匹配过程(Details),详细匹配过程界面(Details),点击后,系统可以把我们真正执行了自动匹配转换功能的检索式显示出来,可以看见系统详细的转换过程。,数据库匹配过程,规范词转换,你输入的检索式,检索明细,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助
12、检索,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,临床查询,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,批引文匹配器,临床查询,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,(一)期刊浏览检索 (Journal database),cancer,点击,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,主题词浏览检索,(二)主题浏览检索 (Mesh Database),功能: 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词,主题词数
13、据库检索,1.输入检索词,3.点按此处可获详细注解,2.执行浏览,主题词注释,可选副主题词,限定作为主要主题词检索,不进行下位词扩检,该主题词所替代的非规范词形式,主题词树形结构表,发送至检索框,通过MeSH Database 检索的结果,其中32篇综述文献,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,(三)单个引文匹配检索 (Mesh Database),输入题录信息,查找特定文献。 刊名要准确,缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如查找:王智彪教授1997年发表在Ultrason Son
14、ochem期刊上的一篇文章的其他作者的名字,单个引文匹配检索,Ultrason Sonochem,1997,Wang zb,得出其他著者,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,临床查询,(四)临床查询 ( Clinical Queries ),检索临床研究方法学(循证医学)文献,主要涉及治疗、诊断、病因、和预后四个分类,并提供强调选择,即敏感度(强调查全)或专指度(强调查准)。,有三个方面的内容: 研究类别查询:治疗、诊断、病因学及预后 系统评价查询 医学遗传学查询 :诊断 、临床描
15、述、管理、基因、分子遗传学、基因测试等内容。,研究类别查询,系统评价查询,医学遗传学查询,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果(send to ),输出到文本(send to Text),输出到文件(send to File ),输出到E-mail(send to E-mail),简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),显示检索结果(Display),检索格
16、式选择,显示记录数,排序方式,有摘要,有free全文,无摘要,全文链接图标,点击下载PDF 格式的全文,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果(send to ),检索结果输出(send to ),Text:当前网页所显示记录的文本格式,用浏览器文件菜单中的保存文件的功能保存文件。 File:所有记录纯文本文件格式,用对话框保存。 Clipboad: 剪贴板,暂存需下载记录,多项检索后一起保存。 Email: 通过邮件发送文献,最多500篇文献。,简介,PubMed的特
17、点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果(send to ),输出到文本(send to Text),检索结果输出(send to Text):当前网页所显示记录的文本格式,用浏览器文件保存。,保存该文本文件,打印该文本文件,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果(send to ),输出到文本(send to Text),输出到文件(send to File ),检索结果输出(send to File ):以纯文本文件保存,注意的是,在display中的显示格式就是存盘的格式,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果(send to ),输出到文本(send to Text),输出到文件(send to File ),输出到E-mail(send to E-mail),检索结果输出(send to E-mail):
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