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文档简介

1、研究生科研实验教学基地建设基本实验技能培训,首都医科大学附属北京朝阳医院 基础医学研究中心 梁燕 85231624, ,主要内容,1.DNA的提取 DNA提取原理 DNA提取方法 操作注意事项,2.PCR PCR体系和循环条件 PCR操作步骤 操作注意事项,3.琼脂糖凝胶电泳 凝胶电泳原理 电泳方法步骤 操作注意事项,1.DNA的提取 DNA提取原理 DNA提取方法 操作注意事项,1.1 基因组DNA提取原理,既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离, 又要保持DNA分子的完整。,仪器准备: 台式离心机、恒温水浴锅、紫外分光光度计、移液器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌)、镊子(灭菌)、离心管架 试

2、剂准备: 试剂盒、无水乙醇等,1.2 基因组DNA提取,试剂盒,试剂盒内容,操作步骤(重点),向52ml的缓冲液GD中加入68ml无水乙醇,并标记;向50ml的缓冲液PW中加入200ml无水乙醇,并标记; 取200ul全血,加入20ul的蛋白酶K溶液,混匀; 加入200ul缓冲液GB,充分颠倒混匀,56放置10分钟,期间颠倒混匀数次,溶液应变清亮。 加入200ul无水乙醇,充分颠倒混匀,此时可能会出现絮状沉淀。 将吸附柱CB3放入收集管中准备好,将上述溶液移到吸附柱CB3中,12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管;如果步骤5的溶液不能一次加完,可以再次重复步骤6;

3、向吸附柱中加500ul的缓冲液GD, 12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管;,操作步骤(重点),7. 向吸附柱中加入700ul漂洗液PW, 12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管; 向吸附柱中加入500ul漂洗液PW, 12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管; 将吸附柱和收集管再次离心, 12000rpm离心2分钟,将吸附柱至于室温放置数分钟; 将吸附柱转入一个干净的离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加50-200ul洗脱缓冲液TB,室温放置2-5分钟, 12000rpm离心2分钟,将溶液收集到离心管中; 测O

4、D值,计算DNA浓度和纯度;或电泳估计DNA浓度。,计算公式: OD260/OD280=1.7-1.9 DNA浓度(ug/ul)=OD26050稀释倍数/1000 OD260=0.1 稀释倍数=250 DNA浓度=0.150 250/1000=1.25 ug/ul,操作注意事项,避免样品反复冻融,56水浴摇匀可消除GB中的沉淀,使用台式离心机,室温离心,2.PCR PCR体系和循环条件 PCR操作步骤 操作注意事项,仪器准备: PCR仪,微型离心机、移液器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌)、镊子(灭菌)、离心管架 试剂准备: ddH2O, PCR Buffer,dNTP,引物,PCR聚合酶,DNA

5、模板,2.1 PCR体系和循环条件(重点),95,30s (预变性),72 ,30s (后延伸),30cycles,2.2 PCR操作步骤(重点),计算好所需扩增的PCR体系; 打开PCR仪预热,设置PCR循环条件; 准备试剂,融化,离心,置于冰上,备用; 按顺序加样,混匀,离心,分装; 加入模板DNA,混匀,离心; 放入PCR仪,Start。,2.3 PCR操作注意事项,避免试剂反复冻融,计算总量,顺序加样,更换吸头,避免污染,3.琼脂糖凝胶电泳 凝胶电泳原理 电泳方法步骤 操作注意事项,3.1 琼脂糖凝胶电泳原理,DNA分子带负电荷,在直流电场中由负极移向正极; 其移动速度与线性DNA片段

6、长度成反比。,配置1%的胶:称1g琼脂糖于适当大小三角瓶中,倒入100ml的1*TAE,微波炉加热至完全融化; 待凝胶温度降至50-60度时,加入1ul的EB(10mg/ml),摇匀,将胶倒入放好梳子的电泳板中,自然冷却30-60分钟; 轻轻拔掉梳子,将胶放入电泳槽中,倒入1*TAE,没过加样孔; 按照1ul上样Buffer+5ul的DNA混合后,点样;每排留一个孔加DNA marker; 100V电泳30分钟,凝胶成像仪照相。,3.2 琼脂糖凝胶电泳方法(重点),3.3 电泳操作注意事项,带手套操作EB,凝胶冷却时间至少30分钟,凝胶完全融化,M II-3 II-2 II-1 I-2 I-1 0,应用BclI/RFLP 多态位点进行基因连锁分析,374,211,163,小 结,1.DNA的提取 DNA提取原理 DNA提取方法 操作注意事项,2.PCR PCR体系和循环条件

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