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文档简介
《微生物手册概览》微小世界中的无限可能课程概述1234微生物学基础知识基本概念和特性实验室技术和方法常用操作与检测微生物分类和鉴定系统分类体系应用领域第一部分:微生物学基础基础概念理解微生物本质结构特征各类微生物形态与构造生理功能微生物的定义和特征微生物的大小肉眼不可见的微小生物细菌:0.5-5μm病毒:20-300nm形态多样性球形、杆形、螺旋形微生物的分类原核生物无细胞核及膜性细胞器细菌和古菌真核生物具有细胞核及膜性细胞器真菌和原生动物非细胞微生物无细胞结构细菌的结构细胞壁维持形态和抵抗渗透压细胞膜选择性物质转运细胞质和核区病毒的结构核酸DNA或RNA,单链或双链1蛋白质外壳保护核酸并识别宿主包膜真菌的结构菌丝体由菌丝网络组成,是真菌的主体孢子繁殖结构,便于传播和生存细胞壁微生物的生长条件温度嗜热菌、嗜冷菌、中温菌pH值酸性、中性或碱性环境适应性营养需求碳源、氮源、矿物质、生长因子微生物的代谢能量代谢呼吸作用发酵作用光合作用物质代谢合成代谢分解代谢次级代谢产物微生物的遗传与变异DNA复制半保留复制方式基因突变自发或诱导突变基因重组转化、接合、转导第二部分:实验室技术和方法基础技术无菌操作和仪器使用培养方法培养基制备与微生物培养鉴定技术形态学、生理生化和分子生物学无菌操作技术无菌操作原则避免污染保持工作区清洁减少气流扰动常用设备酒精灯接种环生物安全柜操作流程器材灭菌创造无菌环境快速精确操作显微镜使用400x光学显微镜常规形态观察10,000x电子显微镜超微结构研究1000x荧光显微镜特定结构标记培养基制备1固体培养基添加琼脂,用于分离纯培养2液体培养基用于大量培养和发酵3选择性培养基含特定抑制剂或指示剂4差别培养基根据代谢特性区分不同微生物微生物培养技术平板划线法分离纯培养的基本方法倾注平板法适合定量分析液体培养法大规模培养微生物菌落计数方法平板计数法直接计数可见菌落30-300个菌落为宜结果以CFU/ml表示最大可能数(MPN)法基于概率统计适用于液体样品多管发酵技术微生物染色技术简单染色单一染料,显示基本形态革兰氏染色区分革兰阳性和阴性细菌抗酸染色鉴定结核杆菌等抗酸菌鞭毛染色观察细菌鞭毛结构微生物生理生化实验糖发酵试验鉴定微生物代谢特性酶活性测定检测特定酶的产生抗生素敏感性试验评估药物治疗效果分子生物学技术在微生物学中的应用PCR技术特定基因片段扩增基因测序DNA序列精确分析基因克隆目的基因重组表达第三部分:微生物分类和鉴定形态学分类传统基础方法生理生化分类代谢特性鉴定3分子生物学分类基因组信息分析微生物分类的基本原则1形态学特征显微观察细胞结构2生理生化特征代谢特性和酶活性3分子生物学特征核酸同源性和序列分析细菌的分类系统伯杰氏细菌鉴定手册:细菌学权威参考16SrRNA基因分析:细菌分类的分子标准真菌的分类系统形态学分类孢子结构菌丝特征繁殖方式ITS序列分析内部转录间隔区分子标记物物种鉴定标准病毒的分类系统第I类双链DNA病毒疱疹病毒、腺病毒第II类单链DNA病毒细小病毒第III类双链RNA病毒轮状病毒第IV类正链单链RNA病毒脊髓灰质炎病毒第V类负链单链RNA病毒流感病毒第VI类反转录RNA病毒HIV第VII类反转录DNA病毒乙肝病毒原生动物的分类系统鞭毛虫具有鞭毛运动例:锥虫、利什曼原虫肉足虫利用伪足运动例:阿米巴原虫纤毛虫体表覆盖纤毛例:草履虫孢子虫寄生性强例:疟原虫微生物鉴定的传统方法形态观察显微镜下观察细胞特征生理生化试验代谢特性和酶活性测定血清学试验抗原抗体特异性反应微生物鉴定的现代方法1分钟MALDI-TOF质谱分析蛋白质指纹图谱24小时全基因组测序完整遗传信息解析48小时宏基因组分析复杂样品微生物组成微生物菌种保藏技术冷冻干燥法脱水冻干长期保存适用多种微生物保存期可达数十年超低温保存法-80℃或液氮温度添加保护剂维持活力和稳定性活化技术复苏保存菌种逐步适应生长条件验证纯度和特性微生物资源中心和数据库国际微生物资源中心:保存和提供标准菌种微生物基因组数据库:GenBank、EMBL等核酸序列库第四部分:微生物的应用领域医学疾病诊断与治疗环境生物修复与监测食品发酵与安全控制工业生物制品生产农业生物肥料与农药医学微生物学病原微生物致病机制和毒力因子研究感染性疾病传播途径和流行病学微生物诊断快速精确检测方法环境微生物学水质微生物学饮用水安全和污水处理土壤微生物学肥力维持和污染修复空气微生物学空气质量和传播疾病研究食品微生物学食品腐败微生物影响食品质量和保质期食品发酵微生物酸奶、奶酪、酒类生产食品安全控制HACCP系统和微生物标准工业微生物学发酵工业抗生素、氨基酸、有机酸生产生物制品生产酶制剂、疫苗、重组蛋白生物能源生物乙醇、沼气、生物柴油农业微生物学植物病原微生物真菌、细菌、病毒引起的植物病害病原学研究和防控生物肥料固氮菌和磷溶菌改善土壤肥力和作物产量生物农药微生物杀虫剂和除草剂环保型植物保护技术微生物生态学微生物群落多种微生物组成的生态系统微生物多样性物种丰富度和功能多样性微生物间相互作用共生、竞争、寄生关系生物地球化学循环碳氮循环中的微生物作用微生物基因工程重组DNA技术DNA切割、连接和转化基因编辑CRISPR-Cas系统定点修饰合成生物学设计构建人工生物系统微生物与生物技术代谢工程改造微生物代谢网络2蛋白质工程改进酶的特性和功能酶工程开发工业用酶制剂微生物与免疫学疫苗开发预防传染病的关键手段免疫调节剂微生物源免疫活性物质抗体工程单克隆抗体和重组抗体微生物与生物修复微生物降解不同污染物的能力各异石油烃类可实现高效生物降解微生物与纳米技术纳米材料合成微生物合成金属纳米颗粒生物传感器微生物与纳米材料结合靶向药物递送微生物运载纳米药物系统第五部分:微生物实验室安全风险评估识别潜在危害安全措施防护设备和操作规程应急处理事故响应和处置生物安全等级BSL-1无致病性或低致病性基础教学实验室BSL-2中等危害性临床诊断实验室BSL-3高度危害性结核菌、SARS研究BSL-4极高危害性埃博拉、天花病毒个人防护装备实验服:基本防护,避免污染手套:防止微生物和化学物质接触防护眼镜:保护眼睛免受飞溅物面罩:提供全面面部保护生物安全柜的使用原理和类型Ⅰ级:排气过滤保护环境Ⅱ级:双向过滤保护样品和人员Ⅲ级:完全密闭手套箱正确操作步骤开启预热15分钟从内到外擦拭消毒物品放置不阻碍气流缓慢移动避免气流扰动实验室废弃物处理1高压灭菌121℃、15-20分钟灭活微生物化学消毒氯制剂、过氧化物、醇类处理医疗废物处理专用容器收集并专业处置意外事故处理生物材料泄漏覆盖消毒液吸收由外向内清理废弃物专门处置人员暴露立即冲洗接触部位报告实验室主管进行医学观察或治疗应急预案制定详细流程定期演练紧急联系方式明示第六部分:微生物学新技术和发展趋势1组学技术多层次分子分析微流控技术微型化实验系统人工智能数据分析与预测基因编辑精准修饰微生物基因组单细胞测序技术原理分离单个细胞扩增基因组DNA高通量测序应用微生物异质性研究难培养微生物鉴定微生物组细胞水平分析微流控技术在微生物学中的应用100μm微生物培养单细胞培养和分析15分钟快速检测病原体即时诊断1000个高通量筛选并行微生物分析人工智能在微生物学中的应用微生物图像识别自动识别和分类微生物微生物组数据分析复杂数据挖掘与模式识别3预测性分析微生物演化和功能预测合成微生物学最小基因组确定生命必需基因人工细胞设计从头设计合成生命生物工厂构建定制化微生物生产平台微生物组学研究宏基因组学宏转录组学宏蛋白组学宏代谢组学其他技术宏基因组学占据微生物组研究主导地位多组学联合分析是发展趋势CRISPR技术在微生物学中的应用基因编辑精确修改微生物基因组功能基因组学研究基因功能高通量筛选基因表达调控精准控制目标基因活性微生物信息学数据库建设微生物基因组和功能信息资源生物信息分析工具序列比对、进化分析软件系统生物学建模微生物代谢网络模拟微生物学与其他学科的交叉前沿交叉研究突破学科界限创新微生物与材料科学生物材料与生物矿化微生物与能源科学微生物燃料电池和生物能源微生物与药学新型抗生素和生物制剂微
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