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DB12RT-PCRassayfordetectionofporcinedeltacoronavirus天津市市场监督管理委员会发布I本标准按照GB/T1.1-2009给1猪德尔塔冠状病毒RT-PCR检测方法本标准规定了猪德尔塔冠状病毒(porcinedeltacoro仪器设备与试剂、样品对照、方法步骤和结果判定等技本标准适用于猪肠内容物、粪便以及细胞培养物中PDCoV核PDCoV:猪德尔塔冠状病毒(porcinePCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreactRT-PCR:反转录聚合酶链式反应(reversetranscription-polymerRNA:核糖核酸(ribonucleicTaq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribM-MLV:莫洛尼氏鼠白血病病毒(moloneymurinelPBS:磷酸缓冲液(phosphatebuffersolution)TAE:Tris-乙酸电泳缓冲液(trisacetate-EDTAbuffPDCoV是一种RNA病毒。RNA反转录产生的cDNA可作为PCR模板进行扩增。根据PDCoVM基因保守基因伸,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA。依据PCR试验结果,判断样品中是否含有PD4主要仪器设备2聚合酶、dNTP、DL2000DNAMarker、核酸染料、磷酸盐缓冲液(PBS,0.01mol/L,pH7.2)、TAE电PDCoVM基因PCR扩增方法所用引物见表1.5mL离心管、剪刀、镊子和棉拭子,经121(±2)℃,15min高压灭菌,50℃~60℃烘干备用。将采集的样品放入保温箱中,加入干冰,密封,24h内送至实肠组织及肠内容物:剪碎,用组织研磨机充分研磨,并按照质量体积比1:5加入PBS,冻融3次,转细胞培养物:冻融3次,转入1.5mL离心管中,4000rpm/m37.2.2向各管中加入200μL2℃~8℃预冷的氯仿,剧烈震荡15s,室温静置5min。dNTP2μL,随机引物1μL,M-MLV反转录酶0.5μL条件为:30℃10min,42℃1h,99℃5min。得到的cDNA溶液直接用于下面的PCR扩增或者-20℃冻dNTP2μL,上游引物P11μL,下游引物P21μL,cDNA4μL将PCR扩增产物8μL与2μL上样缓冲液混合,点样于1%琼脂糖凝胶板加样孔中,琼脂糖凝胶板一),45A.1PBS缓冲液A.1.10.2mol/L磷酸氢二钠溶液:称取磷酸氢二钠71.6g,加适量灭菌去离子水溶解,定容至1000A.1.20.2mol/L磷酸二氢钠溶液:称取磷酸二氢钠27.6g,加适量灭菌去离子水溶解,定容至1000A.1.3量取0.2mol/L磷酸氢二钠溶液36用灭菌去离子水溶解稀释至1000mLA.250×TAE电泳缓冲液A.2.10.5mol/L乙二铵四乙酸二钠(EDTA)溶液(pH8.0)A.2.2TAE电泳缓冲液(50×)0.5mol/L乙二铵四乙酸二钠溶液(
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