科研公开课文献精读（二）

科研公开课：文献精读（第二节）医盟讲师：魏晓为南京医科大学附属南京医院（南京市第一医院）上节回顾文献精读的目的意义文献精读的必要基础文献精读的目标化阅读模式本节内容文献的分类、管理文献精读的要素化阅读文献精读的目标化阅读模式良好的科研习惯：文献分类节约时间、复习方便、参考效率无序的下载+盲目的标记=混乱的思维前车之鉴、后事之师下载后分类、标记（事半功倍）分类：按文章类型、按时间、按内容、按关键 词标记：精读前：title

or

running

title、杂志名时间精读后：加付必要关键词及权重（*）无有效信息灵活运用running

title信息不足过于冗长、易含非法字符精读后加（*）文献编辑管理工具Endnote（国外软件）：英文文献兼容性好，可直接从Pubmed检索后保存到数据库中。根据投稿要求随时调整参考文献格式查阅便利文章内引用文献自动排序WORD兼容性好中文处理差NoteExpress（国内软件）：中文数据库推荐文献精读三步走阅读：要素化阅读/需求性阅读精读≠全读记录：历史、重要数据、关键功能、关键机制 优美句式、多义用词等等书写：综述、文献解析整体性阅读与要素化阅读整体性阅读（高水平阅读）基本点:一、辨清概念,明确方向; 二、阐明意图,弄清思路 三、结合语境,解惑化难 四、知晓背景,加深理解要素化阅读/需求性阅读（新手）知识面的扩充：综述性文章、论著的abstract实验技术学习：论著的methods、results和figures学术背景学习：综述性文章、论著的introduction科学思维辩证学习：论著的discussion文章句式书写：随读随记以上均为针对性强化阅读，非抛弃性阅读精读的目标这篇文献所做工作的领域？这篇文献的科学问题？转化医学意义？你是否感兴趣？这篇文献具体的研究目标是什么？这篇文献中主要研究方法是什么？这个方法和技术细节 是否我是否弄明白了？如何借鉴？研究的主要结果？图表是否明晰？结论是什么，是否回答了前言中的科学问题和研究目标？ 如果没有，存在什么疑问？这篇文献的启发性及创新性？综述的精读从读中文综述到读英文综述从读综述到写综述领会自己和他人实验工作的思路、线索和意义， 督促自己看更多的文献培养、锻炼自己的文献阅读能力、归纳能力、思 考能力和写作能力综述的基本框架题目、摘要、关键词：研究的主题引文/前言：研究的原因、背景正文：排列式、对比式、阶梯式的分段描述， 锦上添花的图表小结：总结及展望综述的阅读要点阅读题目、摘要、关键词浏览正文分段标题阅读正文分段内容，标注关键内容浏览小结题目、摘要、关键词简洁明了的题目（中、英文推荐）关键词揭示翻译后修饰的具体类型意境化的题目（学习欣赏、谨慎使用）关键词揭示维生素C的多种表达方式，便于读者理解浏览标题作者习惯、主题内容决定了正文的模式排列式：内容无主次之分对比式：内容相反，辨证式论述阶梯式：层层引出，环环相扣排列式正文对比式正文阶梯式正文流程式阶梯：常用于临床综述化疗认知功能损伤易感人群临床症状病因机理诊断与干预常见模式：背景、症状、诊断、治疗阶梯式正文故事式阶梯：综述阅读后注意重要数据的参考文献，标记并下载阅读注意作者举证文献的证据等级重视归纳性图表的采集重要内容尝试翻译注重翻译的重要性在语言转化的过程中加深对知识的消化、理解避免阅读时信息的丢失、遗漏英语语言的学习争取全文翻译加强科研思维的锻炼研究性论著的精读第一阶段：读懂他人实验工作第二阶段：模仿他人实验工作第三阶段：结合他人实验工作基础创新研究性论著的基本框架题目、摘要、关键词（title，abstract，key

words）引文/前言：研究的原因、背景（introduction）实验材料及方法（materials

and

methods）实验结果（resuts）讨论（discussion）论著的常见阅读模式根据目的合理选择阅读顺序抓住主题、分解细节提出问题、交流讨论注意阅读的深度和广度，避免思维定势根据目的合理选择阅读顺序一般情况下，建议先abstract、introduction，然后discussion，最后results

、figures和methods。摘要的阅读摘要又称概要、内容提要。摘要是以提供文献内容梗概 为目的，不加评论和补充解释，简明、确切地记述文献 重要内容的短文。基本要素包括研究目的、方法、结果和结论。重点是结

果和结论，有时也包括具有情报价值的其它重要的信息。多数文章看摘要，少数文章看全文摘要需要充分展示前沿性、创新性，这是你、审稿人、 评审专家读下去的主要动力引文的阅读引文是科学对话的一种方法，是作者认为对自己的研究

“有用”的资料，但同时也表明，引文的含义不是简单 的，它并不是许多人认为的那样只是“定量”的、“客 观”的。首先它是作者的“主观”判断，但有多少个作 者有这样的“主观”判断，其引文的“数据”则是“客 观”的。它既是定性的，又是定量的。引文阅读的要点学习作者为提出科学问题（论述或证明该项研究的重要 意义）做出的铺垫****引文内容与同主题综述的横向比较注意重要背景数据的记录、收集写作模板注意归纳、总结性语句的使用、记录、收集举例说明：重要背景数据举例说明：归纳、总结性语句讨论(Discussion)的阅读讨论是文献精读的重要部分，这一部分考验的是作者以 及读者的逻辑辩证思维能力。宋曾巩《祭孔长源文》：

“维我与公，绸缪平昔，诗书讨论，相求以益。”讨论(Discussion)的阅读这一部分把实验结果提高到理论认识的部分，作者在讨

论中着重阐述整篇论文中有创造性的内容和独到的见解， 并根据本文结果，归纳其内在联系，并将全部资料加以综 合分析，然后构成几个观念或提出自己的论点。讨论中的最精彩的是作者的思维创新性以及如何辩证地与他人实验结果比较 逻辑思维能力的训练文献的讨论是一种潜在的辩论，是用一定的理由来说明自己对事物或问题的见解，化解对方的疑问，以便最后得到共同的认识和意见。读者、审稿专家、作者自己讨论的常见框架本研究工作的依据与意义：即选择本研究课题的背景材料，国内外对于类似问题的研究进展，本研究的重点是要解决什么问题。本研究方法的机理、特点与优劣:应说明研究方法的科学性,研究材料与对象的客观真实性,以及研究数量的充分性等。应交代研

究方法的机理，指出其明显特点,评价其较过去方法的优越之处。此外，对本实验方法的不足之处，尤其是某些实验条件未能控制之处，以及明显的缺点也应一一说明。讨论的常见框架研究结果的新发现、新效果及与过去文献的比较：应着重指出本研究结果的新发现、新效果，并应对研究结果进行分析和解释。根据本研究的理论或国内外的新学说、新见解，以及自己的实验依 据进行阐述。根据本研究结果的理论意义和实践意义两方面讨论。也可以将本研究的结果与过去的文献进行比较，或用别人的资料补 充和说明自己的结论和观点，从而进一步证实本研究结果的先进性 和可靠性。讨论的常见框架从本研究结果得出的新观点、新结论、新理论：这部分通常

是对本研究工作的升华，是论文先进性与创造性的重要体现。作者在此基础上，提出自己的新见解，探求其本质和规律，并上升到理论的水平。今后将进一步研究的课题与设想：讨论部分也可在肯定已取得的成绩的基础上提出目前研究的不足、今后努力的方向及有待进一步解决的问题。你读懂讨论了吗？作者研究的意义是什么？作者的结论是什么？作者的研究思路是如何开展的？实验结果的关联 是什么？作者实验的缺陷或局限是什么？作者实验的争议是什么？实验方法（Methods）抓住主题后的细节分解学习重要的实验方案、材料来源（重要）、实验 条件（重要、参考价值高）、生物学信息如引物 序列等（重要、参考价值高）理清结果与图表中的特殊名词与缩写参考学习统计学方案实验方法特别关注点实验技术的先进性实验方法的严谨性和认可度实验方法的互补性与自己课题的关联性学习先进的实验技术十分重要拓展自己的知识面为课题、文章提升技术层次比如：H2O2检测，一般试剂盒，如amplex等，新型检 测技术：HyPer

fluorescence（实时动态监测）比如细胞内能量代谢，传统方法ATP、乳酸测定 目前国际多采用新技术，如Seahorse细胞能量代谢检测系统实验的严谨性和认可度很多实验方法的本身存在非特异性，需要阳性对照、阴 性对照去排除相关干扰因素，阅读文献时需敏锐观察到 作者实验的严谨性，学以致用。研究者的专业角度优于试剂盒说明书实验方法的互补性注意文献中对同一问题采用不同实验技术验证的 方法，这种互补性体现的是实验严谨度，值得我 们学习。最为典型的就是体内实验与体外实验的互补性与自己课题的关联性详细记录与自己课题密切相关的任何信息细胞株实验参数（密度、温度、培养方式、给药浓度等）目标蛋白的亚型、抗体目标基因的序列、引物设计信号通路的上游及下游等等。。。结果与图表方法、结果、图表相结合阅读，减少理解的困难注意阅读图表注释一般情况下，作者会根据思路将results分成几块，并设 置子标题，引导读者阅读理解每一个子标题就是一个新的发现或者一个结论注意文献的supplement

data临床研究文献的阅读与评价临床研究的目的和假说临床研究的设计（参考性）、样本量结果的真实性和实用性文献中所采用的观测指标文献中所采用的统计学方法对“阴性”结果要有辩证的认识一些阅读技巧：注意特殊句式表达观点的，比如”which

indicates/suggests/demonstrates that……”，之后的内容才是重点。表达统计学差异的单词，“significant”or

“non-significant”， “statistical”……总结式的单词，“In

brief/In

conclusion/above

all……”学会抓住主题词句善于发现每一段的主题词句，往往在段落的第一句或最 后部分，理解主题词句后可以更好的理解作者罗列的证 据。理解主题词句，标注暂时不能理解的证据及数据Ascorbic

acid

(AA),

commonly

known

as

vitamin

C,

has

a

somewhatcontroversial

history

as

a

therapeutic

drug

for

cancer

treatment

(9,10).

Emerging

studies

suggest

that

only

intraperitoneal

orintravenous

AA,

and

not

orally

administered

AA,

can

reachpharmacological

concentrations

that

can

kill

cancer

(10,

11).

However,although

clinical

trials

of

AA

have

demonstrated

the

differencesbetween

administration

routes

and

the

safety

of

intravenous

AA

(12,13),

there

is

still

a

lack

of

understanding

of

the

mechanisms

by

whichAA

kills

cancer

cells.

In

general,the

cytotoxicity

induced

by

AA

seemsto

be

primarily

mediated

by

hydrogen

peroxide

(H2O2)

generated

inextracellular

fluids

(14).

A

recent

elegant

study

demonstrated

thatpharmacologic

ascorbate

enhances

the

cytotoxic

effects

of

ionizingradiation

in

pancreatic

cancer

cell

lines,

but

not

in

non-tumorigenicpancreatic

ductal

epithelial

cells