微生物学检验技术 课件 15项目十五：细菌分类与命名

项目十五细菌分类与命名思维导图项目十五细菌分类与命名学习目标1．掌握基本概念。2．熟悉细菌的分类等级和命名。3．了解细菌分类方法。4．具有分析细菌分级、命名的能力。5．能正确读懂、看懂细菌的分类等级、会书写细菌命名的格式。项目十五细菌分类与命名一、概述项目十五细菌分类与命名一、概述1.细菌分类

是根据每种细菌各自的特征，并按照它们的亲缘关系分门别类，以不同等级编排成系统。分类有两种：①以细菌的形态和生理生化特性为依据的表型特征分类法②用化学分析和核酸分析一、概述2.细菌命名

是在分类基础上，给予每种细菌一个科学名称，使之在生产实践、临床实践和科学研究工作中相互交流成为可能。按照细菌命名的法规，能保证所有的科研工作者以同样方式给予细菌命名。

是将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置和已知细菌比较其相似性，用对比分析方法确定细菌的分类地位。若与已知细菌相同即采用已知菌的名称，不同者则按命名原则确定一个新名称。一、概述3.细菌鉴定二、细菌的分类项目十五细菌分类与命名

细菌的分类等级和其他生物相同，依次为界（kingdom）门（division）纲（class）目（order）科（family）属（genus）种（species）。二、细菌的分类（一）分类等级

种是细菌分类的基本单位，将生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属，相近的属归为一科；由不同来源分离的同一种、同一亚种或同一型的细菌，称为株（strain），在细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌为依据，也可作为质量控制的标准。二、细菌的分类（二）分类方法1.生理学与生物化学分类法细菌的形态，染色以及细菌的特殊结构是最早和最基本的分类依据；而细菌的生理生化特征一直作为分类的主要依据。（1）传统分类法：传统分类的原则是将生物的基本性质分为主要的和次要的（主次原则），然后将主次顺序一级一级地往下分，直至最小区分。按细胞形态、革兰染色性、鞭毛及代谢特点作为较高一级分类依据。科、属、种水平的分类主要依靠生化特性和抗原结构。

（2）数值分类法：数值分类法集数字、电子、信息及自动化分析技术于一体，将细菌的一些基本性质视为同等重要（等重要原则），采用标准化、成品化和配套生化反应试剂条，检测细菌的数十个生理生化特性。每个细菌都能产生一套阴阳性结果，然后转换成数字，通过电子计算机进行复杂计算，比较每一株与其他类同株，测定其相似度。根据相似度，区分细菌的种群，并确定各种细菌的亲缘关系。2.遗传学分类法 遗传学分类是以细菌的核酸、蛋白质等在组成的同源程度分类。该分类法具有下述的优点：①对细菌的“种”有一个较为一致的概念；②使分类不会出现经常性或根本性的变化；③可制定可靠的细菌鉴定方案；④有利于了解细菌的进化和原始亲缘关系。目前较为稳定的应用遗传学的细菌分类方法有下列几种：a.DNAG+Cmol％测定;b.核酸同源值测定;c.核糖体RNA碱基序列测定。二、细菌的分类（二）分类方法三、细菌的命名项目十五细菌分类与命名三、细菌的命名细菌的命名

自1998年1月以来,所有微生物科学名称列于英特网在线数据库中,细菌名录每月更新。20世纪后期,细菌学家开始用DNA-RNA杂交技术和测定细菌G+C含量,对细菌进行分类和命名。进入21世纪,则将表型特征与16SrRNA测序相结合来分类和命名细菌。

由于测序的普及,可将微生物第一时间正确分类到合适的科和属。随着国际微生物系统分类学技术水平的不断提高,一些微生物菌种的分类学地位发生了变迁,名称也随之发生变化。

细菌的命名依据《国际细菌命名法典》(TheInternationalCodeofNomenclatureofBacteria）的规定，学名用拉丁文，遵循“双名法”。所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成，属名在前，是名词，第一个字母必须大写，其余均应小写，即使种名是以人名或地名命名的，种名头一个字母也用小写。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。三、细菌的命名细菌的命名(1）出现在分类学文献中的细菌拉丁文学名，在属名和种名之后，往往还要加上首次定名人（加括号）、现名定名人和现名定名年份，这些均用正体排字。但在一般兽医学及医学微生物学文献中，属名和种名之后的部分均予省略。例如大肠埃希菌的学名全名是Escherichiacoli(Migula1895)CastellanietChalmers1919，指的是Migula于1895年命名此菌为Bacilluscoil,Castellani及Chalmers于1919年改为现名的。三、细菌的命名

命名的注意事项(2)拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规则读念，但由于受英语的影响，不少人是按英语的读法来读细菌拉丁文名的，这在国际学术交流中常常遇到。(3)只确定属名、未确定种名的某一株细菌，其拉丁文学名可在属名之后加sp.（正体字）；如果同属未定种名的若干菌株，则用spp．取代、p.,spp．为species复数的简写。(4)如果是新种，在新种的拉丁文学名之后还要加上“sp.nov.”,nov是novel的缩写。三、细菌的命名

命名的注意事项(5）亚种用subsp.（正体字）表示，这是subspecies的缩写，例如Pasteurellamultocidasubsp.septic，中译名为多杀性巴氏杆菌败血亚种。(6)少数拉丁文学名会因研究的进展等原因而改变，比如Clostridiumwelchii（魏氏梭菌）、Aeromonaspunctata（斑点气单胞菌）等是曾用名，现今的国外文献已不再沿用，分别改为Clostridiuniperfringens（产气荚膜梭菌）和Aeromonascaviae（豚鼠气单胞菌）。(7)细菌的拉丁文学名在翻译为中文时，由于译者不同，往往同物异名，可造成不必要的混乱，为此应尽可能采用公认的译名。三、细菌的命名

命名的注意事项(8)译名应尽可能准确，例如Edwardsiellatarda，应译为迟缓爱德华菌，tarda有迟缓或迟钝之意，该菌有动力，并不迟钝，但生长缓慢。(9)按照国家出版局的规定，细菌名称中涉及外国人名译为汉语时，除极少数特别著名、沿用已久者外，均省略“氏”字，除非取词头字母发音。例如Brucella译为布氏杆菌属，Yersinia译为耶尔森菌属；Pasteurella译为巴氏杆菌属，Listeria译为李氏杆菌属。三、细菌的命名

命名的注意事项(