第1章 核酸的分子结构、性质和功能课件

第一章核酸的分子结构、性质和功能第一节DNA的结构与功能第二节RNA的结构与功能第三节核酸的分子杂交第四节反义核酸及药物第五节RNA干扰第1章核酸的分子结构、性质和功能1869年，F.Miescher从脓细胞中提取到一种富含磷元素的酸性化合物。称核素(nuclein)第1章核酸的分子结构、性质和功能一、核酸的种类和分布核酸有两大类：DNA和RNADNA分布的主要场所：细胞核，线粒体，叶绿体RNA分布的主要场所：细胞核，细胞质细胞生物中DNA和RNA均有病毒体内则只含有DNA或RNA二、核酸是主要的遗传物质历史经典实验证明遗传物质是DNA而不是蛋白质1928年Griffith肺炎球菌转化实验1943年Avery离体条件下完成转化1952年HersheyChase噬菌体转导实验第1章核酸的分子结构、性质和功能一、DNA的一级结构DNA的一级结构是由4种脱氧核糖核苷酸即：腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶脱氧核苷酸，通过3’，5’，—磷酸二酯键连接起来的直线形或环形多聚体。第一节DNA的结构与功能第1章核酸的分子结构、性质和功能DNA的一级结构5’3’5’5’---------------------------3’第1章核酸的分子结构、性质和功能DNA的相对分子质量非常大，通常一个染色体就是一个DNA分子，最大的染色体DNA可超过108bp。bp,basepairb,base那么一种生物基因组有多大呢？DNA分子量的表示方法第1章核酸的分子结构、性质和功能C值：一个物种单倍体的染色体所含的DNA的量。第1章核酸的分子结构、性质和功能C值矛盾：DNA含量与其结构和功能并不一致，可能有的基因种类远大于实际所需的DNA含量。第1章核酸的分子结构、性质和功能为了阐明生物的遗传信息，首先要测定生物基因组的序列。迄今已经测定基因组序列的生物数以百计，其中包括病毒、大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇和拟南芥菜、玉米、水稻和人类基因组。GenomesizeGenenumber基因组大小实际上就是它的C值第1章核酸的分子结构、性质和功能DNA的二级结构就是指两条脱氧核苷酸链反向平行排列所形成的双螺旋结构右手螺旋，A-DNA、B-DNA、C-DNA、D-DNA左手螺旋，Z-DNA双螺旋碱基倾角/o碱基间距/nm大沟和小沟每轮碱基数螺旋方向A-DNA200.26大沟窄，很深小沟很宽，浅11右B-DNA60.34大沟宽，深小沟窄，很深10右Z-DNA70.37大沟平坦小沟很窄，深12左不同螺旋形式DNA分子主要参数比较：二、DNA的二级结构第1章核酸的分子结构、性质和功能关于DNA双螺旋的小沟和大沟大沟宽小沟窄蛋白质的alpha螺旋第1章核酸的分子结构、性质和功能1.B-DNA是活性最高的DNA构象，B变成A仍有活性，但变成Z，活性明显降低。

2.双螺旋是动态的平衡，结构改变以适应行使不同的功能。说明：第1章核酸的分子结构、性质和功能三、DNA的三级结构

DNA三级结构是指DNA分子通过扭曲和折叠所形成的特定构象。包括不同二级结构单元间的相互作用、单链与二级结构单元间的相互作用及DNA的拓扑特征。超螺旋是三级结构的一种形式。第1章核酸的分子结构、性质和功能拓扑结构见p9就是指在DNA双螺旋的结构基础上，DNA进异步扭曲形成的特定的空间结构。超螺旋是其主要的形式。超螺旋又有正和负之分。负超螺DNA易于解链。DNA的复制、重组和转录等过程都需将两条链解开，因此负超螺旋有利于这些功能的进行，但这些过程需要的需要的负超螺旋程度是各不相同的，可以通过DNA的拓扑结构来调节其功能拓扑异构酶DNA的拓扑异构体之间的转变是通过拓扑异构酶(topoisomerase)来实现的。第1章核酸的分子结构、性质和功能四、Triplex（三股螺旋）Hoogsteen于1963年描述了三股螺旋结构。第三股碱基可与Watson-Crick碱基对中的嘌呤碱形成Hoogsteen配对；第三股与寡嘌呤核苷酸之间同向平行；第三股可来自分子间也可来自分子内。第1章核酸的分子结构、性质和功能RNA的一级结构RNA的二级结构分子内的局部双链图tRNARNA的三级结构tRNA三叶草倒LrRNA的高级结构其他RNA高级结构核酶：锤头型、发夹型等第二节RNA的结构与功能一、RNA的结构第1章核酸的分子结构、性质和功能RNA的一级结构RNA的二级结构RNA的二级结构第1章核酸的分子结构、性质和功能二、RNA的功能mRNAtRNArRNA细菌rRNA有5S、16S、23S三种；哺乳动物rRNA有5S、5.8S、18S、28S四种sRNAsnRNA核小RNAscRNA胞浆RNA通常与蛋白质结合形成核糖核蛋白颗粒（RNP），U-snRNP对基因表达和细胞功能有调节功能的RNAmiRNARNAiRNA干扰

第1章核酸的分子结构、性质和功能一、核酸的变性和复性

核酸的变性（denaturation）是指核酸双螺旋氢键的断裂，变成单键并不涉及共价键的断裂。共价键的断裂是核酸的降解.

将DNA双螺旋失去一半时的温度称为该DNA的Tm（meltingtemperature）

第三节核酸的分子杂交p15第1章核酸的分子结构、性质和功能复性（renaturation）

变性DNA在适当的条件下又可使两条彼此分开的链自发重新缔合成为双螺旋结构的过程称为复性。

变性DNA在缓慢冷却时可以复性，称为退火

核酸的变性和复性在基因工程中有何应用？第1章核酸的分子结构、性质和功能已经复性的DNA分子如果两条链来源不同，就叫杂交分子核酸的杂交（hybridization）序列互补的单链RNA和DNA，或DNA和DNA，或RNA和RNA，根据碱基互补的原则，借助氢键相连而形成双链杂交分子的过程二、核酸分子杂交的基本原理第1章核酸的分子结构、性质和功能探针probe:

是一段可以与靶核酸序列特异结合发生相互作用的核酸序列，经过标记后可以用来检测出靶核酸序列探针的性质：DNA，RNA，双链或单链均可探针的长度：从20bp到几kb都可以探针的标记：同位素或非同位素三、核酸探针及标记第1章核酸的分子结构、性质和功能1.Southernblot

1975英国分子生物学家E.M.Southern发明的DNA印迹方法检测DNA2.Northernblot

1977年Alwine建立Thonas改进的RNA印迹方法检测RNA3.Westernblot以亲和或免疫反应检测蛋白的蛋白质印迹方法四、核酸分子杂交的应用第1章核酸的分子结构、性质和功能SouthernBlot第1章核酸的分子结构、性质和功能4.hybridizationinsitu

原位杂交在组织或细胞水平上使用标记探针与细胞内DNA或RNA杂交的方法5.其他形式的杂交如斑点杂交,狭缝杂交,菌落杂交,噬菌斑杂交,本质还是SouthernorNorthernblot第1章核酸的分子结构、性质和功能6.

Biochip生物芯片

来源于微阵列技术(Microarray)生物芯片：将数以万计的生物大分子探针分别固定在微小载体表面而制成的芯片。目前有蛋白质芯片和核酸芯片两类。原理:核酸或蛋白质之间的杂交1998年世界十大科技进展之一第1章核酸的分子结构、性质和功能第四节反义核酸及药物p18（1）概念：反义核酸是根据碱基互补的原理,利用人工合成或细胞中天然存在的DNA或RNA片段(或其化学修饰的衍生物)与目的靶序列核酸结合，通过空间位阻作用或诱导RNAase活性的降解作用，在复制、转录、剪接、mRNA转运及翻译等水平上，抑制或封闭目的靶基因的表达。反义核酸的功能主要取决于其稳定性、生物利用度以及与靶基因结合或反应的特性。1.反义核酸(antisensenucleicacid)第1章核酸的分子结构、性质和功能（2）.反义核酸作用的靶区域mRNA5’非翻译区mRNA5’编码区mRNA5’帽子形成位点区域前体mRNA外显子与内含子结合部位mRNApolyA形成位点区域阻止mRNA的成熟及其向胞浆中的转运第1章核酸的分子结构、性质和功能

反义技术是利用人工合成或细胞中天然存在的DNA或RNA片段(或其衍生物)与特定的基因相互作用,从而抑制基因的表达。目前发展到第三代。第一代硫代修饰寡聚核苷酸第二代甲氧/乙氧基反义寡核苷酸第三代肽核酸（PNA）

2.反义技术与药物第1章核酸的分子结构、性质和功能20年来,反义核酸药物的发展非常缓慢,仅有一个反义药物进入市场,惟一获得批准的RNA反义药物是1998年8月27日得到美国FDA正式批准的诺华、Isis制药的福米韦生（fomivirsen、Vitravene），该药主要用来治疗艾滋病人的巨细胞病毒性视网膜炎。

其他大部分都在Ⅲ期临床试验中遭遇失败,有关反义新药的申请也很快被FDA驳回。人们开始把目光投向竞争RNA技术平台尤其是小干扰RNA(siRNA)。这是否意味着反义核酸药物没有发展前途了呢?第1章核酸的分子结构、性质和功能第五节RNA干扰（RNAinterference，RNAi

）

2002年度Science评选的10大科学成就中RNAi名列榜首1998年诺贝尔奖从反向的角度为基因表达调控的研究，基因的功能分析提供了更好、更有效的手段第1章核酸的分子结构、性质和功能

概念一：正义链和反义链RNA组成的双链RNA可有效抑制靶基因的表达，这种现象称为RNA干扰。

概念二：RNA干扰是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA（double-strandedRNA，dsRNA）诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。（来自于网络）

1.概念第1章核酸的分子结构、性质和功能2.RNA干扰作用原理RNAi抑制基因表达方式：（1）与mRNA形成双链，阻止蛋白与靶mRNA的结合；（2）促使目标mRNA的降解。第1章核酸的分子结构、性质和功能3种不同的survivinsiRNA对EJ28细胞增殖和凋亡的影响第三军医大学学报2007/22目的观察靶向survivin的不同siRNA对EJ28细胞增殖和凋亡的影响。方法通过化学合成方法合成3对siRNA和1对荧光标记的阴性对照siRNA。转染荧光标记的siRNA后,在荧光显微镜下观察转染效率。实验分为siRNA164、siRNA167、siRNA389、阴性对照组、脂质体对照组和细胞对照组。转染后24h、48h和72h,MTT法检测siRNA对EJ28细胞增殖的影响,流式细胞术检测凋亡率。结果靶向survivin的序列特异性siRNA均能抑制EJ28细胞的增殖,其中以siRNA164抑制细胞的增殖能力最强(P<0.05),转染48h后的抑制率最高[(41.32±2.54)%];转染48h后,siRNA164组凋亡率最高[(13.20±0.25)%]。结论靶向survivin的RNAi技术在膀胱癌的基因治疗中可能具有一定的价值文献选读第1章核酸的分子结构、性质和功能3.microRNA或miRNA，小RNAMicroRNAs(miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA，是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成。最早被发现的两个miRNAs——lin-4andlet-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA3’非编码区端，以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制，进而抑制蛋白质合成。多个果蝇miRNA也被发现和他们的目标靶mRNAs的3’非编码区有部分同源。由于miRNA和其潜在的目标靶之间并非完全互补，这使得通过信息学的方法鉴定miRNA的目标靶位点变得困难。MiRNA的作用目标靶和活性机制一直是各地的研究人员的关注热点。

第1章核酸的分子结构、性质和功能MicroRNA-21targetstumorsuppressorgenesininvasionandmetastasis.CellResearch(2008)18:350-359.MicroRNAs(miRNAs)areaclassofnaturallyoccurringsmallnon-codingRNAsthattargetprotein-codingmRNAsbyrepressingtranslationorcausingmRNAdegradation.MaturemiRNAscompriseabout22nucleotides,derivedfromlongtranscriptspri-miRNAsandpre-miRNAs.AlthoughmiRNAsoperateinasimilarfashionasshortinterferingRNAs(siRNAs)theytypicallytargetaclusterofgenesinsteadofonespecificgene.ItispredictedthatanaveragemiRNAcanhavemorethan100targets].EmergingevidencedemonstratesanimportantroleofmiRNAsinregulatingdiversecellularprocessesincludingdifferentiation,proliferationandapoptosis.第1章核酸的分子结构、性质和功能DeregulationofmiRNAsaffectsnormalcellgrowthanddevelopment,leadingtoavarietyofdisordersincludinghumanmalignancies.Ofparticularinterest,theove