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文档简介
变应性鼻炎相关的长链非编码RNA表达谱分析的任务书任务书任务名称:变应性鼻炎相关的长链非编码RNA表达谱分析任务概述:本次任务旨在利用生物信息学技术,探究变应性鼻炎相关的长链非编码RNA(lncRNA)在变应性鼻炎发生过程中的表达谱,为该疾病的预防和治疗提供新的思路和方法。任务内容:1.了解变应性鼻炎的病理生理过程、病因和发病机制,明确需要分析的样本类型和样本量,包括正常对照组和变应性鼻炎患者组。2.收集公共数据库中的变应性鼻炎相关的lncRNA数据集,如GENCODE、Lncipedia和NONCODE等,利用生物信息学工具进行筛选和过滤,最终确定适合本次研究的候选基因。3.根据样本的RNA测序数据,利用基因差异表达分析工具(如DESeq、edgeR、limma等)进行差异表达分析,挑选出显著差异表达的变应性鼻炎相关lncRNA基因。4.利用生物信息学工具预测差异表达lncRNA的功能和调控机制,如基因本体论(GO)和通路分析,构建lncRNA-mRNA共表达网络,挖掘与变应性鼻炎相关的调控模式和通路。5.验证lncRNA表达差异和功能分析的结果,利用实时荧光定量PCR和RNA干扰技术,检测lncRNA的表达水平和调控效应,并进一步研究与变应性鼻炎发生和发展的关系。6.利用机器学习算法(如支持向量机,随机森林等)对lncRNA基因进行分类和预测,分析其在变应性鼻炎诊断与预测中的潜在作用。7.撰写研究论文,介绍实验设计、数据分析和结果解释,总结研究意义和启示,为变应性鼻炎的诊断、治疗和防控提供新思路和方法。任务要求:1.能够熟练运用生物信息学工具进行差异表达分析、功能分析和共表达网络构建等研究,具有一定的编程和数据处理能力。2.具备实验室分子生物学技术操作技能,如RNA提取、RT-qPCR、RNA干扰等,能够高效完成验证实验。3.具备较好的文献阅读和英文写作能力,能够撰写流畅、结构严谨的研究论文,并进行学术报告和口头交流。4.能够积极配合课题组其他成员开展合作研究,具有良好的团队协作能力和沟通能力。任务时间:任务周期为6个月,具体任务时间为2021年6月1日至2021年11月30日。任务预算:根据研究所需的RNA测序、实时荧光定量PCR、RNA干扰等实验所需的试剂和设备,以及文献检索和参考书籍等费用计算预算,预计费用为15万元人民币。其中,人员费用为10万元,试剂和设备费用为5万元。费用状况需及时向课题负责人汇报并按照实际情况进行调整。任务评估:任务完成后,将根据论文质量、实验进展情况、成果发表情况、团队合作等多方面进行综合评价。评估结果将作为任务完成的重要参考依据。任务指导:本课题由医学研究所某教授负责指导,对学员工作进行指导和评审,同时,课题组
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