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文档简介
《生物化学》(张洪渊)讲义-川大
上册
第一章绪论(L2节)
一.如何学好生化课
1.生物化学的特点
.内容分布:生物化学这门课,从教材上看,通常都分为上下两集,
上集谈的是生物分子的结构、性质、功能,很少涉及它们的变化,这
些生物分子包括糖、脂、蛋白质、核酸、酶、激素、维生素以及抗生
素等,叫做静态生化,以DNA结构为例。而下集则讲的是这些生物
分子的来龙去脉,即合成与分解,叫动态生化,以DNA的复制为例。
.特点:概念性描述性的内容居多,很少有推导性或计算性的内容,
因此,它不同于理科而更近似于文科,记忆的东西多,女生常常比男
生学得好,巧妙记忆成为学好生化的一个重要方法,学完生化课后,
你们应该有一种意外的惊喜,阿,我的脑子咋变得这样好使呢?2.
师生合作
.老师备课:由于生物化学是我院最重要的课程(课时多以及研考跑
不掉),所以我得竭尽全力准备,既要完成大纲规定的内容又不能照
本宣科,注意理论和实践、经典与前沿的融合,使生化课变得兴趣盎
然而不是枯燥无味,要做到这些,备课是相当辛苦的,且听我来表一
表,我在四川大学上了320节生化课(200节理论,120节实验),上
课笔记成了现在的讲课笔记的一部分,后来临时抱佛脚,又到南大进
修了200学时的生化理论课(生化专业用)以及120学时的理论课(非
生化专业用),讲课教师叫杨荣武,是个教书天才(合作文章(在我
儿十篇文章中,这是最得意的一篇)、同学的师弟、上海生化所),听
课笔记真是一摞一摞,从中精炼出我们现在的6-70学时理论课(难
呐),还要增补一些名人趣闻、科学前沿之类的味精,总的算来,我
给你们讲一节课,自己要听7节课,再准备三小时一,代价不菲,所以
我常挂在嘴边的一句话就是,你们一定要学好这门课,学不好很对不
起人,在你最对不起的人里面,我应该列在前三名。
.学生学习:看小说似的预习儿遍,尤其上课要用心听讲(省时省力),
当场或课后整理笔记(重要性),择重记忆(注意方法),儿个小窍门:
早上多吃糖(原因,脑血糖),站立听课(肾上腺,恐怖电影,我讲
课)。业远远落后于日本和欧美列强,给毕业生就业带来了困难。喜
者是许多有识之士已经看到了生化的光辉前景,纷纷抢滩这块宝地,
生化工业也在艰难的条件下起步并有蓬勃发展之势,以我们身边的人
物为例,欧阳老师和我们的专业发展。
第二章糖类
§1.糖的概念
一.糖的种类和功能
1.糖的定义
2.糖的功能:能源结构信息传递
3.糖的种类:
单糖:定义醛糖酮糖丙、丁、戊、己、庚糖及其两者的组合,重
要单糖的举例
寡糖:定义举例
多糖:定义同多糖杂多糖举例
结合糖:定义举例
4.碳水化合物:carbohydrate
二.糖的构型
1.儿个概念:
同分异构体
结构异构
立体异构
儿何异构
旋光异构
差向异构
2.糖的构型
不对称碳原子旋光异构体的性质
甘油醛的构型(D\L)意义
葡萄糖的构型
§2.单糖的结构和性质
单糖举例
一.葡萄糖的结构
1.链式结构:条件结构式构型旋光异构体和自然选择简化结构式
2.环状结构:条件毗喃型和吠喃型及自然选择a型和B型异头物
3.投影式(Haworth式)链式与环式的互变规则
4.变旋现象:现象本质
5.葡萄糖的构象:船式和椅式
6.儿种重要单糖的结构式(默认为D-型):甘油醛二羟丙酮核糖!脱
氧核糖!葡萄糖甘露糖半乳糖果糖!链式和环式都要,请大家自
己在书上将其找到。
二.单糖的性质
1.物理性质:
旋光性(特例)
甜度:标准以及顺序(果糖〉蔗糖〉葡萄糖)
溶解性
2.化学性质
.与强酸的作用:形成糠醛及其衍生物
反应式及其原理:书P16
糖的鉴定:
Molish反应:糠醛及其衍生物与a-蔡酚反应作用生成紫色的化合物,
原理是好基于酚类进行了缩合,这样,将糖与浓酸作用后再与a-蔡酚
反应作用就能生成紫色的化合物,可鉴别糖。(多羟、醛基)
Seliwanoff反应:同样的原理,将糖与浓酸作用后再与间苯二酚反应,
若是酮糖就显鲜红色,若是醛糖就显淡红色,由此可鉴别酮糖和醛糖。
.形成糖甘:糖的半缩醛羟基与其它物质的羟基或氨基脱水缩合形成
的化合物。
举例:麦芽糖的结构式:见书P22
葡萄糖a-1,4-葡萄糖昔,a-葡萄糖出半缩醛羟基,另一葡萄糖(a、P
可互变)出4位上的羟基。
反应部位
主体、配体、糖昔键的键型(半缩醛羟基的构型-半缩醛羟基的位置,
另一羟基的位置)
全名:配体半缩醛羟基的构型-半缩醛羟基的位置,另一羟基的位置-
主体昔
.糖的还原性
费林反应(Fehling):见P15费林试剂反应式定量法
与铁氟化钾的反应:
将葡萄糖与铁氟化钾(K3Fe(CN)6)溶液共热时,铁氧化钾被还原
成亚铁氟化钾(K4Fe(CN)6)。
反应式:K3Fe(CN)6+葡萄糖-K4Fe(CN)6+葡萄
糖酸
.形成糖豚
糖与三分子苯明的反应
反应式:见P17
用途:鉴定单糖的种类:糖月杀为黄色的不溶于水的晶体,不同的糖豚
其晶型和熔点均不同,由此可鉴别单糖的种类。
思考题:葡萄糖、果糖、半乳糖、甘露糖哪儿种可被糖豚反应所鉴别,
哪些不能?
其余的反应如酯化作用、对碱的作用、糖的氧化性等,请大家自己看
看O
§3.寡糖
定义
结构单位:环状的糖
糖昔键
主体和配体
寡糖(以及淀粉)中的单糖叫残基
一.儿种重要的二糖
1.麦芽糖:见P22葡萄糖a-1,4-葡萄糖昔:是直链淀粉的形成方式
2.异麦芽糖:葡萄糖a-1,6-葡萄糖昔:是枝链淀粉分支处的的形成方
式
3.蔗糖:a-葡萄糖p-2,1果糖普般-果糖a-1,2葡萄糖昔
4.乳糖:见P22葡萄糖-1,4-半乳糖昔
5.纤维二糖:见P22葡萄糖B-1,4-葡萄糖昔:是纤维素的形成方式。
§4.多糖
定义
一.同多糖
即均一多糖:定义
1.淀粉
结构单位:a-D-葡萄糖(在淀粉和寡糖中叫做葡萄糖残基)
连接方式(即糖背键型):直链淀粉:a-1,4糖昔键,枝链淀粉a-1,6
糖昔键(仅出现在分支处)和a-1,4糖背键(除了分支处以外的地方)
直链淀粉的结构:见P24还原端和非还原端各一
枝链淀粉的结构:见P25还原端一个,非还原端多个
淀粉的二级结构(空间结构):见P24右手螺旋(像个弹簧),每一
圈含有6个葡萄糖残基
碘显色机理:钻圈,圈越多(分子量越大即葡萄糖残基越多)色越深
淀粉水解碘显色的变化:淀粉(蓝色或紫色)一红色糊精一无色糊精
一寡糖一葡萄糖
性质:与葡萄糖相比,它没有还原性、有旋光性但无变旋现象、溶解
度降低
2.糖原:结构上完全同枝链淀粉,只是分子量要大得多
3.纤维素:见P27
结构单位:0-D-葡萄糖
连接方式:P-1,4糖昔键
分子量:上万个葡萄糖残基
二级结构:锯齿带状,交织在一起,强度很大。
4,其余多糖:半纤维素和儿丁质等,请大家自己回去看看。
二级结构:锯齿的链状,由于它们互相缠绕和交织,因此,强度很大。
性质:不溶于水,仅能被高温的强酸和少数儿种纤维素酶所水解
二.杂多糖
通常与蛋白质形成具有粘性的物质,故称粘多糖,在体内起润滑作用
(胃部以及关节处的粘夜,鼻涕等)
例如:透明质酸、硫酸软骨素和肝素等
三.结合糖:糖脂、糖蛋白、蛋白多糖等,自己看。
布置作业:重要单糖的结构,糖月杀反应的思考题。抽查
第三章脂类
§1.概述
定义:由脂肪酸和醇作用生成的酯及其衍生物统称为脂类,这是一类
一般不溶于水而溶于脂溶性溶剂的化合物。
一.脂类的类别
1.单纯脂:定义:脂肪酸与醇脱水缩合形成的化合物
蜡:高级脂肪酸与高级一元醇,幼植物体表覆盖物,叶面,动物体表
覆盖物,蜂蜡。
甘油脂:高级脂肪酸与甘油,最多的脂类。
2.复合脂:定义:单纯脂加上磷酸等基团产生的衍生物
磷脂:甘油磷脂(卵、脑磷脂)、鞘磷脂(神经细胞丰富)
3.脂的前体及衍生物
高级脂肪酸
甘油
固醇
菇类
前列腺素
4.结合脂:定义:脂与其它生物分子形成的复合物
糖脂:糖与脂类以糖背键连接起来的化合物(共价键),如霍乱毒素
脂蛋白:脂类与蛋白质非共价结合的产物如血中的儿种脂蛋白,
VLDL、LDL、HDL、VHDL是脂类的运输方式。
二.脂类的功能
1.最佳的能量储存方式
体内的两种能源物质比较
单位重量的供能:糖4.1千卡/克,脂9.3千卡/克。
储存体积:1糖元或淀粉:2水,脂则是纯的,体积小得多。
动用先后:糖优先,关于减肥和辟谷
2.生物膜的骨架:细胞膜的液态镶嵌模型:磷脂双酯层,胆固醇,蛋
白质。见HP34
3.电与热的绝缘体
电绝缘:神经细胞的鞘细胞,电线的包皮,神经短路
热绝缘:冬天保暖,企鹅、北极熊
4.信号传递:固醇类激素
5.酶的激活剂:卵磷脂激活隹羟丁酸脱氢酶
6.糖基载体:合成糖蛋白时,磷酸多菇醇作为埃基的载体
§2.甘油脂
定义:高级脂肪酸与甘油,其中甘油三脂就是油脂。
一.脂肪酸:结合态、游离态(FFA)
1.性质
偶数
顺式
双键的位置9、12、15
溶点与结构的关系:链长(长-高),饱不饱和(饱-高)
2.简单表达式:
简单结构式:波浪形,注意双键的构型
简单表达式:链长:双键数△双键位置
举例:油酸18:1A9
3.常见脂肪酸和必需脂肪酸
常见:
软脂酸16:0,
硬脂酸18:0
必须脂肪酸:(Vf):人和哺乳动物不可缺少但又不能合成的脂肪酸,
必须从食物(尤其是植物)中摄取。包括:
亚油酸18:2A9,12
a-亚麻酸18:3A9,12,15
y-亚麻酸18:3A6,9,12
素油比荤油营养价值大
二.甘油脂(脂酰甘油)
甘油的写法和性质:P33
甘油脂的通式:MG、DG、TG:P33
油脂:油(植物)+脂肪(动物),脂肪酸的饱和性决定了它们的状态
1.油脂的物理性质
.溶解度:不溶于水,而溶于乙醇、乙酸、氯仿、表面活性剂(双亲
性物质)等,对比MG和DG
.溶点:植物的油与动物的脂肪的溶点,由脂肪酸的饱和性决定
.旋光性:前题,书写方式(L)与构型无关,这是规定,P33。
2.化学性质
.皂化与皂化值
定义:油脂与碱共热时,产生甘油和脂肪酸盐(肥皂),实际上是碱
催化的水解反应
反应式:P36
皂化值:加热,KOH(mg)/油脂(g),可以反映油脂的量(摩尔数)
.酸败与酸值
油脂长期搁置时会产生酸臭味就是酸败
原因是油脂受空气和光照作用,部分发生分解,不饱和脂肪酸被氧化
成为醛或酮以及竣酸,产生酸臭味。P37
桐油的应用
酸值:不加热,KOH(mg)/油脂(g),可以反映油脂的新鲜程度。
.加成反应与碘值
油脂中的不饱和双键可以与H2、12、HC1、C12等发生加成反应
卤化作用:P36
碘值:12(g)/油脂(百克)
反映油脂的不饱和程度
§3.磷脂
复合脂中最重要的一族
组成基团:脂肪酸、醇(甘油、鞘氨醇等)、磷酸根、X(醇类)
一.甘油磷脂(磷脂酰甘油)
1.结构通式:P39
命名:磷脂酰X
X为其它的醇类,通过磷酸二酯键与甘油连接。
天然磷脂均为L型构型
2.儿种重要的磷脂
X胆碱乙醇胺(胆胺)丝氨酸肌醇H
结构式P40P40P41P41
名称磷脂酰胆碱(卵磷脂)生物膜、卵黄中的重要成分,良性的脂
溶性溶剂,常用于治疗心脑血管疾病P40磷脂酰乙醇胺(脑磷脂)
P40磷脂酰丝氨酸P41磷脂酰肌醇P41磷脂酸
3.儿种重要的磷脂酶及其作用特点:PLA1、PLA2(PLB)、PLC、PLD
作用位点:P397或P39+
溶血磷脂
蛇毒与磷脂酶
二.神经鞘磷脂:神经鞘氨醇P42、脂肪酸、磷酸、胆碱
神经鞘氨醇P42(+脂肪酸)-神经酰胺P42(+磷酸+胆碱)-神经鞘磷
脂P42
三.磷脂的特性
1.溶解性:表面活性剂,双亲化合物(亲油亲水)
氯仿+甲醇是提取磷脂的有效溶剂
2.解离:两性电解质,解离后磷酸基团带负电,X基团带正电(见X
的结构)
3.水解反应:碱解(皂化)、酶解
§4.其它脂类
一.结合脂
1.糖脂
.甘油糖脂:甘油磷脂的磷酸X被糖所取代的产物,即第三个羟基与
糖的半缩醛羟基脱水缩合的产物(P39),因此,也属于糖昔。
.糖鞘脂:鞘磷脂的磷酸+胆碱被糖所取代的产物,糖也是出的半缩醛
羟基,也属于糖昔。例如:脑背脂和神经节背脂P47(霍乱毒素受体
GMI)等。
2.脂蛋白:血液中的四种脂蛋白。
二.固醇类:环戊烷多氢菲的衍生物P42。编号
功过是非:癌症(黄曲霉素),心血管疾病(高血压),结石;脑细胞、
胆汁酸、激素、VDo
固醇(留醇):环戊烷多氢菲上3位接-OH,10、13位上接-CH3,17
位上接一烷链P42o
.胆固醇:固醇上的17位上接一异辛烷P43。游离胆固醇和胆固醇脂
均不溶于水。
胆固醇在紫外线的作用下可以转化成VD,VD的作用,婴儿晒太阳。
.胆汁酸:胆固醵衍生的一类固醇酸。
胆酸:P43略
三.菇类:异戊二烯的衍生物P45,衍生方式为异戊二烯首尾相连或尾
尾相连P45+O
单菇(2个异戊二烯单位)、倍半葩(3个异戊二烯单位),胡罗卜
素为4菇,天然橡胶为上千拓。
霍乱病:
病征:上吐下泻,全是水,若不补充水,一天之内即死亡
病理:肠内大量失水,水压过高,排泄物中有大量的霍乱弧菌。
分子基础:小肠上皮细胞的外表面结构如图(讲义稿P5),具有霍乱
毒素的受体,霍乱毒素的结构是个七聚体蛋白,与受体结合后解离,
穿过细胞膜,刺激腺普酸环化酶,提高cAMP,使钠/水泵失调,向肠
内排水,又向周围组织以及血管中抽水
第四章蛋白质
一.蛋白质是生命的表征,哪里有生命活动哪里就有蛋白质
1.酶:作为酶的化学本质,温和、快速、专一,任何生命活动之必须,
酶的另一化学本质是RNA,不过它比蛋白质差远了,种类、速度、
数量。
2.免疫系统:防御系统,抗原(进入“体内”的生物大分子和有机体),
发炎。
细胞免疫:T细胞本身,分化,脓细胞。
体液免疫:B细胞,释放抗体,导弹,免疫球蛋白(1g)。
3.肌肉:肌肉的伸张和收缩靠的是肌动蛋白和肌球蛋白互动的结果,
体育生化。
4.运输和储存氧气:Hb和Mbo
5.激素:含氮类激素,固醇类激素。
6.基因表达调节:操纵子学说,阻遏蛋白。
7.生长因子:EGF(表皮生长因子),NGF(神经生长因子),促使细
胞分裂。
8.信息接收:激素的受体,糖蛋白,G蛋白。
9.结构成分:胶原蛋白(肌腱、筋),角蛋白(头发、指甲),膜蛋白
等。生物体就是蛋白质堆积而成,人的长相也是由蛋白质决定的。
10.精神、意识方面:记忆、痛苦、感情靠的是蛋白质的构象变化,
蛋白质的构象分类是目前热门课题。
11.蛋白质是遗传物质?只有不确切的少量证据。如库鲁病毒,怕蛋
白酶而不怕核酸酶。
二.构成蛋白质的元素
1.共有的元素有C、H、O、N,其次S、稀有P等
2.其中N元素的含量很稳定,16%,因此,测N量就能算出蛋白质
的量(实验四,修改预定表)。
三.结构层次
1.一级结构:AA顺序
2.二级结构:主干的空间走向
3.三级结构:肽链在空间的折叠和卷曲形成的形状,所有原子在空
间的排布。
4.四级结构:多条肽链之间的作用。
§1.氨基酸蛋白质的结构单位、水解产物
一.氨基酸的结构通式:P50
a-碳原子,a-竣基,a-氨基
氨基酸的构型:自然选择L型,D型氨基酸没有营养价值,仅存在
于缴氨霉素、短杆菌肽等极少数寡肽之中,没有在蛋白质中发现。
二.氨基酸的表示法
生物体中有20种基本氨基酸(合成蛋白质的原料),还有其它非基本
氨基酸,20种基本氨基酸的表示方法有下列儿种:
1.中文名:X(X)氨酸,如甘氨酸、半胱氨酸。20种要会背。
2.英文名:3字名,如Gly、Cys等,20种要会背。
3.按顺序演示,记忆技巧。
AlaArgAspAsnCysGluGinGlyHislie
丙精天天冬酰氨半谷谷氨酰氨甘组异亮
LeuLysMetPheProSerThrTrpTyrVai
亮赖甲硫苯丙膈丝苏色酪缴
三.氨基酸的具体结构:20种全部记住,仅注意R。
P51〜53
讲解顺序:
甘Gly(最特殊,唯一无旋光性)、丙Ala(顾名思义)、苯丙Phe(顾
名思义)。
酪Tyr(有供苯酚基)、半胱Cys(0-毓基)、丝Ser(彷羟基)、苏Thr
(B-羟基)、天冬Asp(酸性氨基酸,供竣基)、天冬酰氨Asn(隹酰
氨)、色Trp(中口引蛛基P66)、组His(隹咪哇基P66)。
谷Glu(酸性氨基酸,y-竣基)、谷氨酰氨Gin(y-酰氨)、甲硫Met
(「甲硫基)。
金Arg(3理I基P66)o
赖Lys(碱性氨基酸,。氨基)。
缀Vai、亮Leu、异亮lie:都是烷煌链。
脯Pro(亚氨基)。
四.氨基酸的分类
1.结构上
脂肪族氨基酸:酸性氨基酸(2竣基1氨基:Glu、Asp),碱性氨基
酸(2氨基1竣基:Arg、Lys),中性氨基酸(氨基酸基各一:很多)
芳香族氨基酸:含苯环:Phe>Tyr
杂环氨基酸:His(也是碱性氨基酸)、Pro、Trp
2.R基的极性
极性氨基酸:亲水氨基酸:溶解性较好,酸性氨基酸、碱性氨基酸、
含筑基、羟基、酰胺基的氨基酸,Glu、Asp、Arg、Lys、His、Cys、
Ser、Thr、Tyr、Gln>Asn
非极性氨基酸:疏水氨基酸:溶解性较差,具有烷煌链、甲硫基、蚓I
喙基等的氨基酸,Gly、Ala、Leu>lie、Val>Pro>Met、Trp
3.营养价值
必需氨基酸:人和哺乳动物不可缺少但又不能合成的氨基酸,只能从
食物中补充,共有8种:Leu、Lys、Met、Phe>lie、Trp、Thr、Vai
半必需氨基酸:人和哺乳动物虽然能够合成,但数量远远达不到机体
的需求,尤其是在胚胎发育以及婴幼儿期间,基本上也是由食物中补
充,只有2种:Arg、Hiso有时也不分必需和半必需,统称必需氨基
酸,这样就共有10种。记法:TipMTVHall
非必需氨基酸:人和哺乳动物能够合成,能满足机体需求的氨基酸,
其余10种
从营养价值上看,必需〉半必需,非必需
五.非基本氨基酸
1.氨基酸的衍生物:蛋白质化学修饰造成的,有P-Ser、P-Thr、P-Tyr、
OH-Pro.OH-Lys,最为重要的是Cyss胱氨酸,是由2分子Cys通过
二硫建连接起来的,P54
2.非蛋白氨基酸:仅游离存在,瓜氨酸、鸟氨酸、隹丙氨酸
3.D-氨基酸:缀氨霉素、短杆菌肽中含有。
六.氨基酸的性质
1.物理性质
紫外吸收:有共甄双键的物质都具有紫外吸收,在20种基本aa中,
有4种是具有共甄双键的,Trp、Tyr、Phe、His,其中His只有2个
双键共飘,紫外吸收比较弱,Trp、Tyr、Phe均有3个双键共加,紫
外吸收较强,其中Trp的紫外吸收最厉害,是蛋白质紫外吸收特性的
最大贡献者,此3种氨基酸的紫外吸收特点如下:
Aa(氨基酸)Am(最大吸收波长:nM)E(消光系数:A/Mol/L)
Phe2572*102
Tyr2751.4*103
Trp2805.6*103
旋光性:仅Gly不具旋光性,其它19种都有,且自然选择为L-型。
溶解性:溶解于水,特别是稀酸稀碱溶液,不溶于乙酸、氯仿等有机
溶剂。
熔点:均大于200C,也就是说氨基酸都是固态,而同等分子量的其
它有机物则是液态,这说明了氨基酸与氨基酸之间的结合力很强,是
离子键,即氨基酸是以离子状态存在的,而不是以中性分子存在的。
2.化学性质
解离和等电点:
氨基酸是个两性电解质,既可进行酸解离也可进行碱解离,用解离方
程式表示就是:见P57,这样,氨基酸在水溶液中就可能带电,+或
以及呈电中性,到底是什么情况,完全由溶液的PH值来决定。
等电点:如果调节溶液的PH值使得其中的氨基酸呈电中性,我们把
这个PH值称为氨基酸的等电点:PLPI是氨基酸的重要常数之一,
它的意义在于,物质在P1处的溶解度最小,是分离纯化物质的重要
手段。
思考题:
当溶液的PH值〉PI时,aa带电为+/-?
当溶液的PH值=<8?
等电点的计算:对于所有的R基团不解离的氨基酸而言(即解离只
发生在a-竣基和a-氨基上),计算起来非常简单:
PI=(PKF+PK2,)/2
若是碰到R基团也解离的,氨基酸就有了多级解离,这个公式就不
好用了,比如Lys、Glu、Cys等。
aaCysAspGluLysHisArg
PK'a-竣基1.712.692.192.181.822.19
PKb-氨基8.339.829.678.959.179.04
PIC-R-基团10.78(-SH)3.86(B-COOH)4.25(y-COOH)10.53
(E-NH2)6(咪哇基)12.48(肌;基)
在这种情况下可以按下面的步骤来计算:
由PK?值判断解离顺序,总是PKiyPK2yPK3,PI时,aa带-电;
PH值
氨基酸的重要化学反应
反应基团试剂主要产物应
用P
a-NH2年三酮紫色、红色物对氨
基酸显色63
a=NH2玮三酮黄色物
Pro的鉴定
a-NH2HNO2N2等游离aa定量,
蛋白质水解程度59
a-NH2DNFB二硝基氟苯Sanger试剂DNP-aa二硝基苯黄色物蛋
白质N端测定一级结构分析标准图谱
6181
a-NH2PITC苯异硫氟酸酯Edman试剂PTC-aa在无水的酸中环化
成PTH-aa蛋白质N端测定一级结构分析aa顺序自动分析仪标准图
谱82
a-NH2甲醛羟甲基-aa和二羟甲基-aa甲醛滴定aa含量(封闭氨基)
60
Arg的肌;基a-蔡酚次澳酸钠坂口试剂桃红色物鉴定Arg
Met的-S-CH3H202过氧化物吸烟有害,烟中的过氧化物,弹性蛋
白酶,抑制剂Met,肺气肿。
Cys的-SH碘代乙酸ICH2coOH过甲酸HCOOOH乙酸硫基
H00C-CH2-S-磺基HS3O-肽链拆分,作用与CYSS上的二硫键65
His的咪唾基重氮苯磺酸Pauly试剂樱红色物(IHis连2重)鉴定
His65-66
Tyr的酚基重氮苯磺酸Pauly试剂桔黄色物鉴定Tyr
Tyr的酚基磷锯酸、磷鸨酸Folin试剂兰色物质定量测定蛋白质、
Tyr
Trp的U引喙基对二甲基氨基苯甲醛兰色物质鉴定Trp
-OHSer.Thr、Tyr激酶、ATPP-aa调节酶的活性,测定酶的活性中
心65
§2.肽
一.肽与肽键
氨基酸的竣基与另一氨基酸氨基脱水缩合形成的化合物就是肽,其实
就是一种酰胺化合物,其酰胺键就是肽键,它的特点是刚性平面、反
式构型。见补页。
肽中的氨基酸叫氨基酸残基,儿个氨基酸残基就叫儿肽。
二.肽的种类
寡肽:2-10,无构象,谷胱甘肽是3肽
多肽:10-50,介于之间,胰高血糖素是29肽
蛋白质:50以上,有特定的构象,胰岛素是51肽
三.肽的表示法
LN端、C端的概念:肽链的两个端点,N端的氨基酸残基的a-氨基
未参与肽键的形成,C端的氨基酸残基的a-竣基未参与肽键的形成。
2.写法和读法:规定书写方法为N端一C端,例如:Ala-Gly-Phe,
读作:丙氨酰甘氨酰苯丙氨酸。
注意有时会看到一些奇怪的写法,比如:NH2-Ala-Gly-Phe-COOH,
或H-Ala-Gly-Phe-OH,均属于画蛇添足,但Ala-Gly-Phe-NH2则表
示C端被酰胺化了。
若有必要从C端一N端写,则必须标明,如(C)Phe-Gly-Ala(N)
四.肽的性质
1.酸碱性:肽至少有一个游离的氨基和游离的竣基,也是两性化合物,
至少有2级解离,通常都有多级解离。因此,肽在水溶液中也能够带
电,也有自己的等电点PI,其计算与测定完全同氨基酸的。
例如:谷胱甘肽,Glu-Cys-Gly,其结构见P72,注意Glu-Cys之间的
肽键(Y-,而不是正常的a-),各解离基团的PK,值见P72,PI=
(2.13+2.34)/2=2.235,很酸。
2.双缩服反应:见笔记P33,双缩胭(相似于三肽,即2个肽键)、碱
性铜离子、紫红色化合物。凡大于三肽的肽都能发生此反应,2肽不
行。
3.水解反应:肽可以被酸、碱、酶所水解,其优劣性如下:
酸水解:浓酸(6N以上,解释一下N=M/价),高温(110℃以上),
长时(24-36小时),污染,Trp遭到破坏,不消旋,水解彻底
碱水解:浓碱(6N以上),高温(100℃以上),6小时、污染,含-OH
和-SH的氨基酸均遭到破坏,Ser、Thr、Tyr、Cys,消旋,水解彻底。
酶水解:胰酶,常温常压,常PH,不消旋、不破坏、不彻底。
常用的蛋白酶,即工具酶:
外切酶:氨肽酶:从N端开始一个个水解肽键
竣肽酶:从c端开始一个个水解肽键:
竣肽酶A:Arg、Lys>Pro除外的氨基酸残基
竣肽酶B:仅Arg、Lys
竣肽酶C:所有的氨基酸残基
内切酶:胰蛋白酶:仅作用于Arg、Lys的竣基与别的氨基酸的氨基
之间形成的肽键。产物为C端Arg、Lys的肽链。
糜蛋白酶:仅作用于含苯环的氨基酸的竣基与别的氨基酸的
氨基之间形成的肽键。Trp、Tyr、Phe,产物为C
端Trp、Tyr、Phe的肽链。
五.肽的实例
1.谷胱甘肽:其结构见P72,注意Gki与Cys的连接(y-,而不是正
常的a-),还原型GSH和氧化型GSSG,多种酶的激活剂,参与体内
多项代谢,主要作用是还原剂,消除体内的自由基(过氧化物,抽烟,
黑坳)。
2.催产素和加压素:9肽或环8肽,都是脑垂体后叶激素,结构见《生
化制药工艺》P?都有升血压、抗利尿、刺激子宫收缩、排乳的作用,
催产素促进遗忘,加压素增强记忆。
3.短杆菌肽和缴氨霉素
4.促甲状腺素释放因子:TRF,是个三肽,TRF一促甲状腺素一甲状
腺素
5.胰高血糖素:29肽,存在,见《生化制药工艺》P?,升高血糖,
作用同肾上腺素。
§3.蛋白质
一.种类和性质
1.种类
组成上分:简单蛋白:仅由aa构成
结合蛋白:简单蛋白与其它生物分子的结合物,糖蛋白(共价)、脂
蛋白(非共价)
形态上分:球蛋白:长/宽。〜4,血红蛋白
纤维蛋白:长/宽>10,血纤蛋白、丝蛋白
功能上分:酶、抗体、运输蛋白、激素等
理化性质上分:HDL、VHDL、LDL、VLDL
构象上分:国际上有蛋白质构象库。
2.性质
紫外吸收:280nm,贡献者是Trp、Tyr、Phe,最主要的是Trp,核酸
的紫外吸收峰在260nmo
两性解离:有PL不能计算,只能测定(等电聚焦)。
等电点沉淀法:PI处蛋白质的溶解度最低。
胶体性质:大分子,多于51个aa残基,最小平均分子量为5000D;
在水中能两性解离故而带电,又亲水,所以是胶体,分散好。有电泳、
布朗运动、丁达尔现象、不能通过半透膜等等典型的胶体性质。
沉淀反应:凡是能破坏水化膜以及能中和电荷的物质均可使蛋白质沉
淀
等电点沉淀:PH值,中和电荷
盐析:高浓度的盐溶液使蛋白质沉淀,离子中和电荷,如(NH4)2SO4
盐溶:低浓度的盐溶液使蛋白质溶解,蛋清的溶解。
有机溶剂沉淀:降低溶液的介电常数。
蛋白质变性:蛋白质在某些外界因素的影响下,理化性质改变、生物
活性丧失的现象。这些因素包括热、酸、碱、有机剂等。
蛋白质变性理论:吴宪,1931年提出。蛋白质的功能直接由蛋白质
的构象来决定,某些外界因素改变了蛋白质的独特构象,因而使生物
活性丧失。但不改变蛋白质的一级结构(即共价结构)。蛋白质的变
性与水解是不同的。
当环境条件恢复时,蛋白质的生物活性有可能也恢复,这就是蛋白质
的复性。
这一理论在实践中有很重要的指导意义,能够解释酶为什么有最适的
PH和最适的温度。
蛋白质的颜色反应:可以用来定量定性测定蛋白质
双缩版反应:红色,Xm=540nm
黄色反应:与HNO3的反应,生成硝基苯,呈黄色。皮肤遇到HNO3
的情况,白一黄一橙黄。
米伦氏反应:与HgNO3或HgNO2的反应,呈黄色,原理同上。
与乙醛酸的反应:红色,Trp的口引噪基的特定反应。
坂口反应:红色,Arg的®]I基的反应。
福林反应:蓝色,是Tyr的酚基与磷铝酸和磷鸨酸的反应。
印三酮反应:紫红色
Pauly反应:樱红色,His的咪哇基。
二.蛋白质的一级结构及其测定
1.蛋白质的结构层次:1、2、超2、结构域、3、4
2.一级结构:即蛋白质的共价结构或平面结构,核心内容就是aa的排
列顺序,它的改变涉及到蛋白质共价键的破坏和重建。
一级结构的全部内容包括:肽链的个数、aa的顺序、二硫键的位置、
非aa成分。
3.蛋白质一级结构的测定
间接法:通过测定蛋白质之基因的核甘酸顺序,用遗传密码来推断
aa的顺序。这是因为核甘酸的测序比蛋白质的测序工作要更方便、更
准确。
直接法:用酶和特异性试剂直接作用于蛋白质而测定出aa顺序。
第一步:前期准备
分离纯化蛋白质:纯度要达到97%以上才能分析准确。
蛋白质分子量的测定:渗透压法、凝胶电泳法(聚丙烯酰胺、SDS)、
凝胶过滤法、超离心法等
aa组成的测定:氨基酸自动分析仪
肽链拆分:非共价键的如氢键、离子键、疏水键、范德华力4种,可
用尿素或盐酸服等有机溶液来拆分。共价键的仅二硫键1种,可用筑
基乙醇、碘代乙酸、过甲酸来拆分。
第二步:肽链的端点测定
N端测定:Sanger法,DNFB—DNP-肽一水解一乙醛萃取一层析鉴定
Edman法,PITC-PTC-肽―PTH-aa一层析鉴定
C端测定:明解法,P83,唯有C端aa与众不同,酰肿化合物与游离
aa,再通过Sanger法来鉴定。Asn>Gin、Cys、Arg将被朋破坏,不
能分析。
竣肽酶法:配合动力学控制。
竣肽酶A:Arg、Lys>Pro除外的氨基酸残基
竣肽酶B:仅Arg、Lys
竣肽酶C:所有的氨基酸残基
每条肽链aa顺序的测定:aa顺序自动分析仪只能准确测定50aa以下
的肽链,而一般的蛋白质都含有100以上的aa残基,所以,事先要
将蛋白质打断成多肽甚至寡肽,再上机分析,而且要2套以上,便于
以后拼接。
常用的工具酶和特异性试剂有:
胰蛋白酶:仅作用于Arg、Lys的竣基与别的氨基酸的氨基之间形成
的肽键。
糜蛋白酶:仅作用于含苯环的氨基酸的竣基与别的氨基酸的氨基之间
形成的肽键。Trp、Tyr、Phe
CNBr:仅作用于Met的竣基与别的氨基酸的氨基之间形成的肽键。
拼接:将2套多肽的aa顺序对照拼接,举例:
156987351256984523->156987351256984523
―156987351256984523
第四步:二硫键位置的确定:包括链内和链间二硫键的位置,用对角
线电泳来测。在肽链未拆分的情况下用胃蛋白酶水解之,可以得到被
二硫键连着的多肽产物。先进行第一向电泳,将产物分开。再用过甲
酸、碘代乙酸、筑基乙醇处理,将二硫键打断。最后进行第二向电泳,
条件与第一向电泳完全相同。选取偏离对角线的样品(多肽或寡肽),
它们就是含二硫键的片段,上机测aa顺序,根据已测出的蛋白质的
aa顺序,把这些片段进行定位,就能找到二硫键的位置。如下图:
4.蛋白质一级结构测定的意义
分子进化:将不同生物的同源蛋白质的一级结构进行比较,以人的为
最高级,从而确定其它物种的进化程度,也可以制成进化树,由于这
是由数据决定的,因此比形态上确定的进化更加科学和精确。
证明了一个理论,即蛋白质的一级结构决定高级结构,最终决定蛋白
质的功能。
疾病的分子生物学:镰刀型贫血症的内因是血红蛋白的B6VaL正常
的血红蛋白的P6G1U
三.蛋白质的二级结构
1.二级结构概论
二级结构的定义:肽链主干在空间的走向。主干指的是肽平面与a-C
构成的链子,见P95。
二级结构的内容:空间走向以及维持这种走向的力量:氢键和R基
团的影响(离子键、疏水键、空间障碍等)
二级结构的数学描述:小角:肽平面绕N-Ca单键旋转的角度
V角:肽平面绕Ca-C竣基单键旋转的角
度,见P95。
至于+-方向的规定,0度角的规定太复杂,不作要求。
这样,一个肽平面的空间位置可以被2个二面角来确定,如果每个肽
链的两个二面角(巾,<|/)都相同,则构成了规则的空间走向,所以可
以用(4),w)来描述肽链的二级结构。
2.二级结构的常见类型
Pauling的贡献,X光衍射法是研究蛋白质构象的最好技术,羊毛蛋
白和蚕丝蛋白,单调一致,诺贝尔化学奖。
a-右手螺旋
a-螺旋即像弹簧一样的螺旋,有右手与左手之分,自然选择蛋白质的
a-螺旋为右手螺旋。示范。
a-右手螺旋的数据:每一圈含有3.6个aa残基(或肽平面),见P96
的b,每一圈高5.4A,即每一个aa残基上升1.5A,旋转了100度,2
个二面角个,V)=(-570,-480)o
维持a-右手螺旋的力量是链内氢键,它产生于一个肽平面的C=O与
相邻一圈的在空间上邻近的另一个肽平面的N-H之间,见P96b,它
的方向平行于螺旋轴,因此,a-右手螺旋的外观是个筒状的帘子,见
P96co每个氢键串起的长度为3.6个肽平面或3.6个aa残基,被氢键
串起来的这个环上含有13个原子,故a-右手螺旋也被称为3.613螺
旋。
R基团对a-右手螺旋的影响:破坏者Pro,该处折断,因为亚氨基不
能形成氢键;不稳定者酸性、碱性、太大、太小:Glu、Asp、Arg、
Lys、Gly、lie。其它都是起稳定作用的。
分布:毛发中的a-角蛋白,例如头发中的a-角蛋白。见沈同P155。
供折叠:肽链在空间的走向为锯齿折叠状,见P97。跟纤维素的相似。
二面角(巾,w)=(-119℃,+113℃)o
维持折叠的力量:链间的氢键,它产生于一个肽平面的c=o与相
邻肽链的在空间上邻近的另一个肽平面的N-H之间,见P98,两条肽
链上的肽平面互相平行,形成片层结构。见P97。
隹折叠有平行式和反平行式两种见P98o
平行式:两条链的走向相同,N-C
N-C
反平行式:两条链的走向相反,N-C
C-N
反平行式的快折叠比平行式的更稳定
一条肽链回折后就可形成两条走向相反肽段,就可以形成反平行式的
折叠,隹折叠不限于两条肽链之间,多条肽链可以形成很宽的供折
叠片层,片层与片层之间以范德华力相互作用,形成厚厚的垫子。
a-右手螺旋与隹折叠相比更具弹性,不易拉断,供折叠易拉断,a-右
手螺旋经加热后可变成隹折叠,长度增加,毛衣越洗越长也是这种变
化。
左手螺旋:存在于胶原蛋白中,aa残基组成为(-Gly-Pro-Y-),Y为
HyPro或HyLys靠链间氢键和范德华力来维持。见沈同P158。
U型回折:也叫B-转角,肽链在某处回折1800所形成的结构。这个
结构包括的长度为4个aa残基,其中的第三个为Gly,稳定该结构的
力量是第一和第四个aa残基之间形成的氢键。在黑板上演示。
310螺旋:是a-右手螺旋的过渡形式,又瘦又长,每个氢键串起的长
度为3个肽平面或3.6个aa残基,被氢键串起来的这个环上含有10
原子。
无规卷曲:无固定的走向,但也不是任意变动的,它的2个二面角
有个变化范围。
从结构的稳定性上看a-右手螺旋邛-折叠〉U型回折〉无规卷曲,而从
功能上看正好相反,酶与蛋白质的活性中心通常由无规卷曲充当,a-
右手螺旋和折叠一般只起支持作用。
3.超二级结构:空间相邻的儿个2级结构形成的更复杂的结构,其类
型有
左手超螺旋:3根a-右手螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋,如头发
中的角蛋白,见沈同P155。
右手超螺旋:3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋,如胶原蛋
白,见沈同P158。本教材P103有误。
aa:相邻的2根a-右手螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋,见P98。
Pxp:一个连接链连着2个p折叠,平行式,这个连接链可以很长。
见P98。
Pap:3段0折叠和2段a螺旋相间形成,见P98。
W:以2段U-型回折连接着的3段p折叠,反平行式。见P98。
4.结构域:长肽链(多于150个aa),在二级结构的基础上通过多次
折叠,在空间上形成一些半独立的球状结构,叫结构域,它是三级结
构的一部分,结构域之间靠无规卷曲连接。也就是说将三级结构拆开
后首先看到的结构。草图显示。
四.蛋白质的三级结构和四级结构
1.三级结构:即蛋白质的三维结构、构象,指其中所有原子的空间排
布,是结构域再经过卷曲和折叠后形成的。如果蛋白质是单条肽链,
则三级结构就是它的最高级结构,三级结构由二硫键和次级键(氢键、
疏水键、离子键、范德华力)维持。P99是肌红蛋白的三级结构。
2.四级结构:多条肽链通过非共价键(氢键、疏水键、离子键、范德
华力)形成的聚合体的结构就是四级结构,注意,由二硫键连接的儿
条肽链不具有四级结构。每条肽链都有自己的三级结构,称为亚基或
亚单位,一般情况下,具有四级结构的蛋白质含有的肽链不会太多,
故称这类蛋白质为寡聚蛋白,如寡聚酶等。
五.蛋白质的结构与功能
1.蛋白质的结构与功能的关系
每一种蛋白质都具有特定的结构,也具有特定的功能。
蛋白质的结构决定了蛋白质的功能。
蛋白质的功能直接由其高级结构(构象)决定。例子,蛋白质的变性
现象。
蛋白质的一级结构决定高级结构(构象),因此,最终决定了蛋白质
的功能。例子,人工合成胰岛素,A、B链分别合成,等比例混合后
就有活性。而生物合成胰岛素则是先合成一条长肽链,形成正确的二
硫键,而后再剪去中间的c肽才形成胰岛素的。草图显示。
2.蛋白质结构与功能实例
免疫球蛋白G:即抗体G,IgG(Immunoglobe),由免疫细胞B分泌
出的蛋白质,可以特异的结合抗原并消灭之,这就是免疫反应。
IgG的一级结构:四条肽链,2重2轻(L2H2),对称排列,LHHL,
有12条链内二硫键,4条链间二硫键,见草图。对其aa的分析发现,
IgG分为V区(可变区)和C区(恒定区)。
二级结构:儿乎全是P折叠,由无规卷曲连接。
结构域:有12个球体,每个均被二硫键锁住。
三级结构:T型和Y型,属于球蛋白。
没有四级结构。
IgG的功能:V区负责结合抗原,像钳子一样夹住抗原,体现了IgG
的特异性,2价。C区负责结合补体(一种酶,可以水解抗原),也
是2价,结合部位在寡糖链处的钱链区。IgG的动态作用过程用人体
演示。
肌红蛋白:Mb(Myoglobin),哺乳动物的肌肉中储存氧气的蛋白质,
水生的哺乳动物体内尤为发达(如鲸鱼),因此,它们可以憋气很长
时间,研究用Mb一般由鲸鱼提供。
一级结构:单条肽链,153个aa,其中的83个aa为保守序列(即同
源蛋白质均相同,是决定功能的最重要序列),含有一分子血红素辅
基,见P104,其中保持Fe2+,血红素通过Fe2+以配位键吊在肽链的
His的咪唾基上,示意。02将结合在Fe2+上。
二级结构:儿乎全是a-右手螺旋,中间由无规卷曲和结来连接。
三级结构:扁平的菱形,见P99或沈同P172,属于球蛋白。
功能:储存氧气。其三级结构在分子表面形成一个疏水的空穴,血红
素即藏在其中,该空穴允许02进入而拒绝水的进入,保证了Fe2+
结合02而避免了Fe2+—Fe3+。
Mb结合氧气的特征可以由氧合曲线来描述,见P104,为双曲线形。
其中的氧饱和度(饱和百分数)为Mb02/(Mb02+Mb),P02为
氧的分压。从图中可以看出,Mb倾向于结合氧气而不愿意放出氧气,
所以它的功能是储存氧气,只有在P02极低的时候(体内缺氧的时
候)它才释放出氧气。另外,C0可以与02竞争性的结合Mb。
血红蛋白:Hb(Hemoglobin),在人体中有三种,HbA,HbA2,HbF
(仅存于胎儿中),三者的结构和功能大同小异,此处以HbA为例。
一级结构:4条链,a2p2oal41,13146,每条肽链都结合着一分子的
血红素,两条B链之间还夹着一分子DPG(二磷酸甘油酸),每条肽
链都有保守序列。
二级结构:4条链均同Mb,儿乎全是a-右手螺旋,中间由无规卷曲
和结来连接。
三级结构:4条链均同同Mb,扁平的菱形,见沈同P181,属于球蛋
白。
四级结构:4个亚基占据着4面体的4个角,链间以离子键结合,
条a链与一条P链形成二聚体,Hb可以看成是由2个二聚体组成的
(印)2,在二聚体内结合紧密,在二聚体之间结合疏松。
功能:运输氧气,4价。其三级结构在每个肽链的分子表面形成一个
疏水的空穴,血红素即藏在其中,该空穴允许02进入而拒绝水的进
入,保证了Fe2+结合02而避免了Fe2+一Fe3+。
其氧合曲线见P104,为S形曲线,只有在PO2很高的情况下(在肺
部)Hb才结合氧气,而P02一降低(在外周血管中),它就释放02,
而此时的Mb却纹丝不动。就结合02的能力而言,4价的Hb还不如
1价的Mbo
Hb的氧合曲线形状与Mb不同是因为它有着Mb所不具有的一些特
性,如:
协同效应:Hb分子中一条链结合02后,可以导致其构象的变化,
使其它儿条链结合02的结合能力突然增强,表现出其氧合曲线为S
形曲线。对Hb协同效应的解释为:在没有结合氧气时、Hb的四条
链之间结合紧密,这种构象称为T态,这种紧密是由离子键和DPG
(位于2条p链之间)造成的,屏蔽了分子表面疏水的空穴,使Hb
分子结合02的能力降低(游离的a链和0链结合氧气的能力与Mb
相同)。当一条链结合了氧气之后,铁吓琳把His的咪哇基向下一扯,
导致该肽链的三级结构发生变化(牵一发而动全局),肽链之间的离
子键被破坏,Hb的四级结构也随之改变,2个二聚体(ap)之间发
生错位,挤出DPG,四级结构进一步变化,每条链表面疏水的空穴
暴露在外,这种构象称为R态,结合氧气的能力得以增强。
别构效应:是某些寡聚蛋白质特有的现象。是指蛋白质与效应物结合
改变蛋白质的构象,进而改变蛋白质的生物活性。
Hb的活性中心:Hb每个亚基上血红素存在的那个疏水空穴是结合氧
气的地方,称之为活性中心,也叫活性部位。
别构中心:在Hb分子的其它地方还有结合效应物的部位,如结合
H+、CO2、DPG甚至02,这些部位结合了效应物之后,可以改变蛋
白质的构象,进而影响到活性中心与氧气的结合,这些部位就叫别构
中心。活性中心与别构中心可以重合也可以不重合,在Hb中是不重
合的。
因此,别构效应可以说成是别构中心结合了效应物之后影响了活性中
心与氧气的结合。协同效应实际上就是一种别构效应。Mb只有活性
中心没有别构中心,它的氧合曲线就是双曲线形的。
Hb的另一个别构效应是波尔效应:H+和CO2对Hb与氧气结合的影
响。具体的影响见P105的方程式,叙述为H+和CO2促进Hb释放
02,这也解释了Hb为什么在肺中吸氧排CO2,而在肌肉中吸C02排
氧°
另外,DPG降低Hb与02的结合能力。
关于镰刀形细胞贫血症:红细胞减少,只有正常人的1/2,无力,剧
烈运动会导致死亡。Hbs与Hb在结合02的能力方面并没有区别,
区别在于Hbs造成红细胞溶血,溶血后的Hb不能像红细胞中的Hb
一样正常运输02。Hbs导致溶血的原因在于其B6Val,正常的血红蛋
白的B6Ghi,红细胞表面的Hbs由于疏水键而聚集,使细胞膜破裂。
镰刀形细胞贫血症在非洲某些地区居然是自然选择的结果,是与疟疾
抗争的产物。
Hbs纯合子:B6Val「6ValHbs杂合子:B6Glu「6Val正常人B6Glu|36Glu
童年死,抗疟疾死亡分布年龄广,抗疟疾长寿,一得疟疾立即死
疟疾杆菌只能利用正常人的Hb,不能利用Hbs,所以Hbs者是不感
染疟疾的。在该地,Hbs纯合子和正常人都经不起自然选择,只有
Hbs杂合子存活了下来。
六.多肽的固相合成
1.多肽的液相合成:aa1-aa2-aa3-aa4-aa5
aal+aa2—aal-aa2+aa2-aal+aal+aa2,得率很低而且分离出2肽aal-aa2
很烦,合成越到后面,分离工作越困难。
2.经过保护和活化处理的多肽的液相合成:
保护氨基aal活化竣基+aa2保护竣基一
保护氨基aal-aa2保护竣基+保护氨基aal活化竣基+aa2保护竣基
分离2肽“保护氨基aal-aa2保护竣基”,去掉氨基保护,再与“保护
氨基aa3活化竣基”反应。
得率提高,分离简化,但仍然很烦。
3.多肽的固相合成:主要就是解决了分离提取方面的难题。
整个过程见草图,其中□表示保护,△表示活化,合成的方向为C-N,
与生物合成多肽的方向相反。
多肽的固相合成思路诞生于洛克菲勒大学主教学楼的电梯中,该大学
的教授、诺贝尔奖金获得者与其老板洛克菲勒的一段对话。因此,现
在人们还能在电梯的内壁上看到“Solid-phasepeptidesynthesizewas
bomhere!”
布置本章作业:
1.用下列实验数据推导某肽链的一级结构:
完全酸水解后产生的aa组成为:Ala、Arg、2Ser、Lys、Phe、Met、
Pro
用DNFB处理并水解得到DNP-Ala和e-DNP-Lys
竣肽酶A和B都对此肽不作用
用CNBr处理获得2个片段,其中一个片段含有Pro、Trp、Ser
用糜蛋白酶作用产生3个片段,1个含有Pro、Ser;另1个含有Met、
Trp;最后一个含有Phe、Lys>Ser、Ala>Arg
用胰蛋白酶处理产生3个片段,1个含有Ala、Arg;另1个含有Lys、
Ser;最后一个含有Phe、Trp、Met、Ser、Pro
2.根据书上P59给出的PK,值,计算正常的二肽Glu-Lys以及Lys-Glu
的PI值。
若有时间就介绍一下参考书。见本讲义P2
第五章酶
§1.酶的概论
一.酶是生物催化剂
二.酶的特点
1.效率高:用转换数来衡量,即每个酶分子每秒钟催化底物的量(uM),
比其它催化剂高出107〜1013倍。
2.具有专一性:每一种酶只能作用与一种或一类相似的物质,称为底
物。专一性表现在对某一种键的催化上(如水解糖昔键、肽键),高
度专一性的酶不仅对化学键有要求,对该键两侧的基团也有要求(胰
蛋白酶),甚至对基团的构型也有严格要求(体内所有蛋白质合成或
分解的酶都只认L型AA)
3.条件温和:室温、常压、温和的PH,剧烈条件反而使酶失活。对
比蛋白质的酸碱水解。
三.酶的化学本质
1.是蛋白质:酶的性质符合蛋白质的特性,为主,80年代以前的书籍
都认为酶的本质就是蛋白质。
2.是RNA:新发现的某些酶的成分是RNA,称为核糖酶。
对比而言,蛋白质作为的酶种类多,数量大,效率高,是酶中的主力。
核糖酶仅限于水解酶类,且效率低。
四.酶的分类
1.按组成成分分:
简单蛋白质:只有蛋白质成分。
结合蛋白质:蛋白质+非蛋白成分=全酶,蛋白质部分称为酶蛋白。
非蛋白成分称为辅酶:与酶蛋白结合疏松
或辅基:与酶蛋白结合紧密
通过透析可以鉴别两者。
2.按分子结构分:
单体酶:酶蛋白只是一条单肽链,如胃蛋白酶、胰蛋白酶、溶菌酶等。
寡聚酶:酶蛋白是具有4级结构的蛋白质,有儿条〜儿十条彼此非共
价连接的肽链,如糖原磷酸化酶等。这种酶便于进行调节。
多酶体系:由儿种独立的酶彼此结合形成的聚合体,后一种酶的底物
正好是前一种酶的产物,多酶体系的效率极高,很像是流水作业。
3.按反应性质分:6大类,很重要。
氧化还原酶类:催化氧化还原反应的酶,以催化脱氢为主加氧为次(包
括其逆反应:就是加氢脱氧)。用方程式表示就是:A-2H+B<-->A+
B-2H
这类酶通常都需要辅酶帮忙,辅酶有下列儿种:NAD(尼克酰胺
腺喋吟二核甘酸)、NADP(尼克酰胺腺喋吟二核甘酸磷酸)、FAD(黄
素腺喋吟二核甘酸)、FMN(黄素腺喋吟单核甘酸),这些都是维生
素的衍生物。
具体例子:乳酸发酵的最后一步,见草图。
转移酶类(移换酶类):催化基团转移反应的,用方程式表示为:AB
+CD<-->AC+BD
具体例子:aa代谢中的转氨反应:见草图。
水解酶类:催化水解反应。用方程式表示为:AB+HOH-AOH+BH
例子太多。
裂解酶类:从底物中移去一个基团并形成双键的反应,无方程式可表
/hO
例子:见草图。
异构酶:催化同分异构反应。用方程式表示为:A<-->B例子:见
草图。
合成酶:催化2种物质合成一种物质,又必须由ATP水解提供能量
的反应,无方程式可表示。例子:见草图。
六大类酶的记忆诀窍:Z字诀:O2+H2<-->H2O氧转水,裂亦
入口。
思考题:催化ATP+G<-->G-6-P+ADP反应的酶是那一类酶。
五.酶的命名
1.习惯名:规律性不强,抢先原则,比较乱,会出现一酶多名或一名
多酶,优点是简单明了。
2.系统命名:酶与名一一对应,要求标名所有底物的名
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