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文档简介
计算流程求解的氢迁移反应如下。图1.氢迁移反应首先，在GaussView上画出丙二醛的结构。从苯环开始画再删掉一些多余的原子会比较省力。图2把要转移的氢原子挪到设想的中间体中的位置。放的位置越接近真实中间体里转移氢的位置计算结果越准确。首先在环的内侧放置一个氢原子，之后加上氢氧键。图3接下来建立inputfile。JobType设定为Optimization+Frequency。Optimization表示结构优化，Frequency表示振动分析。“Optimizetoa”选择TS(Berny)，向软件发出求解中间体的指示。“CalculateForceConstants”选择Once，计算方法选择Hartree-Fock。以上设置完毕，开始计算。先打开log文件内result的vibrations，确认振动数（Freq）为负值，只有为负值，所画的分子有局部稳定的结构，才可能有中间体。选择振动数为负，之后进入下一步。图4JobType中选择IRC。这是用来确认中间体是不是反应物到生成物中间的状态(本次计算指氢原子移动前和移动后)。选择Computemorepoints可以改变计算范围。默认设定为10。这次初始设定为30。Guess和Solvation设为默认，AdditionalKeywords这里暂不需要填写。计算结果如下图所示。图5图6图5展示了整个分子的能量变化，能量越高结构越不稳定，能量越低结构越稳定。中间体时能量最高。中间体时的丙二醛分子的转移氢位于两个氧原子的正中间。图7是图5的微分形式（微分能量的平均值），纵轴的0表示能量的最高值。图7应用联想以下丙二醛分子内氢转移的反应过程，不难理解能量变化图的曲线是对称的。如果将丙二醛碳链上的一个氢原子替换成其他原子，会发生什么有趣的现象呢？图8.将一个氢原子替换成氟原子后如图如果将其中一个醛基的氢换成氟，曲线图就不对称了。后记我用Gaussian的时候经常需要请教老师。量子化学不同于常用的电子计算器，计算过程可谓是充满了弯弯绕绕。本篇记事虽然谈不上什么深入挖掘﹑手把手教学，只是一个备忘录性质的记
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