分子生物学国家重点实验室课件

分子生物学国家重点实验室工作报告〔2001.01－2005.12〕金由辛中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、开展规划与设想报告内容历史沿革论证1984验收1986生物口第一个论证开放的国家重点实验室第二届第三届第四届第一届1987-19902001-20051996-20001991-1995基因组织特异、细胞分化、形态、胆固醇等基因组学1987年研究方向生物大分子的结构与功能分子遗传学生物膜的结构与功能HUGO计划结束后的现状预计的10万基因降到24500，只占总基因组的2％以下基因的表达、调控与功能

研究方向一、研究工作与成果编码RNA非编码RNA3’非翻译区（抑癌）RNA

组学与合成酶识别，调控染色体染色体开放DNA甲基化表观遗传学端粒（长寿与癌症）紧密结合“人口与健康〞这一国家重大需求,为防治人类重要疾病、培养生物新品种提供理论依据，建成一个在分子生物学领域从事根底性研究的实验室，跻身国际前列，并为我国国民经济建设作出奉献。总体定位一、研究工作与成果承担任务类别课题数主持经费(万元)97310713918631410995863攻关11689基金委重大331716基金委4141上海市23231168中科院14141891小计106997850姓名合作项目经费年度合作方式张永莲美国NIHFogarty项目基金9.6万USD2002-2004合作研究徐国良中科院与德国马普学会20万EU2002-2007联合资助管理周金秋中科院与德国马普学会20万EU2002-2007联合资助管理徐国良欧盟国际合作项目5万EU2005-2008合作研究承担国外研究工程

一、研究工作与成果研究总经费2001-2005年，共11618万科研经费：7850万管理费：750万依托单位投入：2718万设备更新费：300万组均经费800余万

一、研究工作与成果2001-2005年，共发表论文220篇，其中SCI论文206篇，联系作者/第一作者197篇。SCI论文总影响因子646。论文中有152篇被引用，总引用频次1041次，其中他引820次。合计发表IF>4论文57篇〔上届12篇〕。论文发表情况一、研究工作与成果期刊IF篇数Science31.81Cell28.41NatCellBiol20.61MolCell16.81EMBOJ10.51合计5期刊IF篇数CellDeathDiffer8.21CancerRes7.72NucleicAcidsRes

7.39Development7.11JBiolChem

6.413Oncogene6.32合计28期刊IF篇数MolMicrbiol6.02MolEndocrinol5.92Leukemia5.81Endocrinology5.23GeneTher5.01BiochemJ4.37Biochemistry4.08合计24论文发表情况比较122.6206468201992205913372455280一、研究工作与成果获奖情况王恩多〔2001〕刘望夷〔2005〕一、研究工作与成果上海市科技进步奖戚正武〔2003〕戚正武〔2005〕刘望夷〔2003〕一等奖二等奖三等奖国家自然科学二等奖专利已申请创造专利39项已获批准授权创造专利20项〔1项国际〕一、研究工作与成果一、研究工作与成果代表性研究成果成果2成果5成果3成果1成果4基因的表达、调控与功能基因组学RNA

组学表观遗传学人类生殖系统发育与疾病研究

真核生物的生殖与发育是当今生物学研究热点之一，生殖细胞的分化发育与形态发生在人口与健康问题的研究中占有重要的地位。主要完成人：张永莲、陈江野、金由辛等代表性研究成果〔一〕附睾自身免疫系统天然抗菌肽起始精子运动Science

March1,2001使21世纪追求的既能避孕，又能防止性传播感染的双功能药物的出现成为可能NatureCellBiology

May1,2004迄今为止，被发现的第一个附睾蛋白质与精子作用后刺激其功能Bin1b基因代表性研究成果〔一〕<Science>EditorialComments:“ACondominPillForm?〞NewfindingsmayofferaleadfordevelopingadrugthatoffersbothcontraceptionandSTDprevention.Chineseresearchershaveidentifiedapeptide,calledBin1b,thatisexpressedinthemalerat'sreproductivetract,andseemstohaveequivalentsinhumansandchimpanzees.Thepeptideisrelatedtoagroupofotheranti-microbialmoleculescalledß-defensins,andisexpressedonlyinthesexorgancalledtheepididymus,whichmaybeareservoirforsexuallytransmittedbacteriaandviruses,includingHIV.Inadditiontoshowingantimicrobialactivity,Bin1bisalsoresponsibleforspermmaturation,storage,andprotection,suggestingthatthepeptidemaybeausefultargetfordrugsthatwouldbothstopspermproductionandprotectagainstSTDs.<科学>编辑短评：药片型的避孕套中国研究者的这一新发现可能提供引导一种既可避孕又能防止性传播感染的双功能药物的出现......代表性研究成果〔一〕成果一小结代表性研究成果〔一〕氨基酰-tRNA合成酶与相关tRNA的相互作用在维持正常生命活动中的功能

催化蛋白质生物合成关键酶主要完成人：王恩多、金由辛等代表性研究成果〔二〕代表性研究成果〔二〕为说明蛋白质生物合成精确性的机理作出了奉献，为药物设计提供潜在的靶点。NucleicAcidsRes,JBiolChem,BiochemJ各4篇，Biochem.

2篇现代的LeuRS可能是由双链进化而来。20氨基酸结构模体犹如LeuRS的进化遗迹。(人的阑尾?)LeuRS独立的CP1结构域可与tRNA的进化早期的小螺旋相互作用，从另一个角度证明了aaRS/tRNA共进化。EMBOJ四位审稿人的一致好评。认为该研究为合成酶与tRNA共进化理论提供了依据，将影响许多研究工程的提出。代表性研究成果〔二〕发表研究论文20篇，平均影响因子5.3；已被73篇研究论文引用。王恩多研究员2005年中选中科院院士。获国家自然科学奖二等奖〔王恩多等，2001〕获全国优秀博士论文〔李勇，2002〕成果二小结代表性研究成果〔二〕染色体和染色质结构的稳定与白血病发生的相关性主要完成人：徐国良、周金秋等Science2002,297:1824-1827核小体代表性研究成果〔三〕Cell121,167-178,2005

代表性研究成果〔三〕MedicalScienceNews中对该论文作出如下评论：“这项基于小鼠骨髓细胞的研究发现为开发AML急性白血病治疗新药提供了潜在靶点〞。

成果三小结代表性研究成果〔三〕脂类代谢的细胞和分子机制

主要完成人：廖侃、李伯良等代表性研究成果〔四〕代表性研究成果〔五〕核糖体失活蛋白及核糖体RNA结构与功能

主要完成人：刘望夷等核糖体失活蛋白〔RIP〕专一失活核糖体，导致细胞死亡。它可用作抗癌抗病毒感染药物或杀虫剂等，也可作为研究rRNA结构与功能的工具酶。SCI论文IF他引备注全室206646820－－代表性成果成果11187.5142Science文章，当选院士成果21589.536当选院士，国家自然科学奖二等奖成果3549.225Cell文章成果41041.975加入基金委创新群体成果51134.129国家自然科学二等奖25项成果22131.8315专著1部，发明专利2项上述成果占全室％37％67％76％－－代表性研究成果总结工作连续，系统性强成果影响力大，获奖多在顶尖杂志上发表论文创新文化成绩卓越科学编辑短评－药片型的避孕套第一次证明表观遗传学方面的改变引发了白血病他引173次证明了tRNA与合成酶的共进化一、研究工作与成果一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、开展规划与设想报告内容队伍建设二、队伍建设与人才培养现有科研人员43人本届期间先后有院士7人，另有研究员、博导11人。老中青各7、3、6人李伯良赵慕钧刘定干谢幼华周金秋徐国良陈江野胡赓熙廖侃李载平洪国藩林其谁王恩多张永莲敖世洲金由辛队伍建设二、队伍建设与人才培养本届期间4位中选院士队伍建设张永莲〔2001〕张友尚〔2001〕林其谁〔2003〕王恩多〔2005〕二、队伍建设与人才培养中青年优秀人才二、队伍建设与人才培养姓名获杰青时间获百人计划时间李伯良1995-1999廖侃1999-2002陈江野1997-2000徐国良2002-20052002-2004周金秋2002-20052002-2004王纲2005获资格宋保亮2005获资格人才培养出站博士后9名获博士学位70名在读硕－博士生100名二、队伍建设与人才培养学生获奖情况全国优秀博士学位论文奖2人次李勇〔2002，导师王恩多〕，李鹏〔2003，导师张永莲〕全国优秀博士学位论文提名奖2人次陈剑峰〔2004，导师王恩多〕，惠利健〔2005，导师胡赓熙〕中国科学院优秀博士学位论文奖1人次惠利健〔2004，导师胡赓熙〕中国科学院院长特别奖3人次李鹏〔2001，导师张永莲〕，任秀荣〔2001，导师敖世洲〕，赵明炜〔2005，导师王恩多〕二、队伍建设与人才培养各种冠名奖共63人次，很多老师也获得了优秀导师奖。很多毕业生在国内外成为PI等。报告内容一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、开展规划与设想国际学科前沿PNAS,2000,97:14035-37三、国内外地位与优势－－地位国际机构任职胡赓熙EnvironmentalHealthPerspective，

Reviewer

金由辛RNABiology，编委林其谁亚大生物化学家与分子生物学家联合会(FABMB)，主席国际细胞研究组织(ICRO)，副主席张永莲Androlodia(德国)，编委三、国内外地位与优势－－地位国际合作与交流欧盟美加俄三、国内外地位与优势－－地位国际合作工程三、国内外地位与优势－－地位姓名合作项目经费张永莲美国NIHFogarty项目基金9.6万USD徐国良中科院与德国马普学会20万EU周金秋中科院与德国马普学会20万EU徐国良欧盟国际合作项目5万EU陈江野国家自然科学基金委（海外杰青）40万元徐国良国家自然科学基金委（海外杰青）40万元王恩多国家基金委与加拿大魁北克医学基金会6.2万元金由辛国家基金委中俄合作项目4.75万元王恩多中科院与法国科学研究中心5.5万元汪垣中科院联合实验室-法国20万元汪垣上海市科委国际合作项目20万元谢幼华所与法国INSERM的合作项目9.5万元4次全球性会议三、国内外地位与优势－－地位序号会议名称主办单位名称会议主席召开时间参加人数

1International

trainingcourseonRNA&biotechnology

联合国教科文组织（UNESCO）国际细胞研究组织金由辛2001年9月10-21日

30人(外宾10人)

2

19thInternationaltRNAworkshop“tRNA2002”

国际生化与分子生物学联合会（IUBMB）

金由辛B.Clark

2002年4月6-11日

120人(外宾100人)

3EFBICWorkshoponCell-freeproteinfactory

EuropeanFocusonBiotechnnologyinChinaB.Clark金由辛2002年4月11-12日

85人(外宾27人)4EFBICForummeeting(Shanghai)EuropeanFocusonBiotechnnologyinChinaB.Clark金由辛

2002年4月12-13日46人(外宾9人)19thInternationaltRNAworkshop“tRNA2002〞三、国内外地位与优势－－地位中科院－马普青年科学家小组徐国良〔马普三组〕

周金秋〔马普四组〕胡赓熙〔马普二组〕三、国内外地位与优势－－地位国内合作与交流三、国内外地位与优势－－地位出国访问112

人次，接待来访87

人次。以通讯作者/第一作者身份发表论文：92/197开放交流实效显著三、国内外地位与优势－－优势Okada,etal.Cell,121:167(2005)Mao,etal.MolCell,7:801(2001)Zhengetal.

NucleicAcidsRes.32:3294(2004).Li,etal.Science,291:1783(2001)Zhang,etal.CancerRes,64:7579(2004)Liu,etal.NucleicAcidsRes,29:783(2001)Hao,etal.NucleicAcidsRes,33:3606(2005)Huo,etal.JBiolChem,278:11561(2003)Jia,etal.JBiolChem,279:41960(2004)与国内合作发表论文52篇与所内其它实验室合作发表论文13篇

与国外合作发表论文27篇金由辛敖世洲李伯良刘定干赵慕钧廖侃胡赓熙陈江野徐国良周金秋谢幼华宋保亮王纲以院士为核心的人才队伍李载平林其谁洪国藩张永莲王恩多三、国内外地位与优势－－优势类别课题数主持经费（万元）9736696286344669863攻关11689基金委重大22190基金委重点44330国家杰青22160上海市重大11326中科院方向33523百人计划22500小计25254349竞争力强类别课题数主持经费（万元）97310713918631410995863攻关11689基金委44441716基金委重大3，43，4上海市23231168中科院14141891小计106997850姓名合作项目经费年度合作方式张永莲美国NIHFogarty项目基金9.6万USD2002-2004合作研究徐国良中科院与德国马普学会20万EU2002-2007联合资助管理周金秋中科院与德国马普学会20万EU2002-2007联合资助管理徐国良欧盟国际合作项目5万EU2005-2008合作研究承担国外研究工程

三、国内外地位与优势－－优势

研究领域瞄准国际前沿与热点三、国内外地位与优势－－优势表观遗传学基因组学RNA组学所有课题组的工作均已延伸到细胞生物学方面很多课题组的工作向结构生物学和生物信息学延伸

向其它领域延伸三、国内外地位与优势－－优势成果累累国家自然科学二等奖2项MolMicrbiol2,MolEndocrinol2,Leukemia,Endocrinology3,GeneTher,BiochemJ7,Biochemistry8

CellDeathDiffer,CancerRes2,NAR9,Development,JBC13,Oncogene2NatCellBiol,MolCell,EMBOJScience,