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Circos简介可视化自由软件://circos.ca中文简介Bynodexy@Gmail2011@ShenZhenOutline了解:Circos是什么?学习:如何开始?交流:还有谁在用?乱问:可以跟Martin或nodexy交流么?了解:Circos是什么?Circos是一个用于可视化数据和信息的软件包;它采用一种圆形风格的布局–这使得circos非常适合于挖掘数据对象或位置及其之间的关系。Circos是自由软件,采用GPL协议分发。Circos采用perl编写,所以可在装有perl的任何操作系统上运行。Circos输出PNG和SVG格式的、到达可发表质量的信息图片。官方网站:图例:了解:Circos是什么?典型的案例或场景:基因组,染色体,各种变异数据,基于位置的质量等数据…通用场合:不限于基因组数据---只要是有数据对象及其连接关系,就可以选择circos来表达;circos非常善于表达多个数据对象及其内部或相互之间的关系〔主要是连接关系〕学习:如何开始?在官方网站://circos.ca了解circos;学习circos网站的教程第1章,下载并安装circos;://circos.ca/tutorials/lessons/学习教程第2到5章,同时根据教程中的例如练习使用circos画图;准备你自己的数据,使用circos画图;学习教程第6到10章,设计你自己的可视化方案,准备数据并画图。学习:如何开始?Circos画图原理:数据对象排布:在极坐标中根据偏移角度计算数据对象之间的关系:二次贝塞尔曲线数据对象的排序:circostools中的order算法Circos画图过程:数据准备:按照circos需要准备数据,无特殊格式图形布局规划:画几个圈?每个圈画哪些数据?…图形样式规划:什么颜色?粗细?是否留间隙?…配置文件创立或修改:在配置文件中指定自己的数据和图形样式绘图:bin/circos–conf./circos.conf交流:还有谁在用?Circos官方的googlegroup:Circos在中国:文档翻译工程:/豆瓣小组::///QQ群:171307056新浪微博:://weibo/circos腾讯微博:乱问:可以跟Martin或nodexy交流么?Circos作者是MartinKrzywinski,他工作在加拿大MichaelSmith基因组科学中心;他的网站和email分别是:,在中国,nodexy(也就是我)较早并较热情地参与和推进circos的用户社区构建与交流;我是一个普通的程序猿,兴趣之一是可视化;我的Gmail是nodexy希望有更多中文资料?敬请关注尚未完成的circos文档翻译工程(已经Martin许可)参与奉献:分享你自己的经验和心得欢送交流Circ

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