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第七章酶促反应动力学

化学反应动力学基础一.化学反应动力学基础1.酶催化作用的本质:降低反应活化能2.酶催化作用的中间产(络合)物学说在酶催化的反应中,第一步是酶与底物形成酶-底物中间复合物。当底物分子在酶作用下发生化学变化后,中间复合物再分解成产物和酶。

E+SE-S

P+E许多实验事实证明了E-S复合物的存在。E-S复合物形成的速率与酶和底物的性质有关。酶作用的机制一.底物浓度对酶促反应速度影响在酶浓度,pH,温度等条件不变的情况下研究底物浓度和反应速度的关系。如右图所示:在低底物浓度时,反应速度与底物浓度成正比,表现为一级反应特征。当底物浓度达到一定值,几乎所有的酶都与底物结合后,反应速度达到最大值(Vmax),此时再增加底物浓度,反应速度不再增加,表现为零级反应。酶促反应的速度及其影响因素酶促反应过程中各种浓度与时间关系曲线底物浓度与反应速率

米氏方程1913年,德国化学家Michaelis和Menten根据中间产物学说对酶促反应的动力学进行研究,推导出了表示整个反应中底物浓度和反应速度关系的著名公式,称为米氏方程。Km—米氏常数Vmax

—最大反应速度

根据中间产物学说,酶促反应分两步进行米氏方程的推导:底物浓度与反应速率

米氏常数Km的意义:由米氏方程可知,当反应速度等于最大反应速度一半时,即V=1/2Vmax,Km=[S]

上式表示,米氏常数是反应速度为最大值的一半时的底物浓度。因此,米氏常数的单位为mol/L。不同的酶具有不同Km值,它是酶的一个重要的特征物理常数。Km值只是在固定的底物,一定的温度和pH条件下,一定的缓冲体系中测定的,不同条件下具有不同的Km值。Km值表示酶与底物之间的亲和程度:Km值大表示亲和程度小,酶的催化活性低;Km值小表示亲和程度大,酶的催化活性高。

米氏常数Km的意义:测定Km和V的方法很多,最常用的是Lineweaver–Burk的作图法—

双倒数作图法。

1Km11

=

+

V

Vmax[S]Vmax取米氏方程式的倒数形式:1/Vmax斜率=Km/Vmax-1/Km米氏常数Km的测定:双倒数作图法双底物反应双底物反应乒乓反应氨基酸的氨基转移反应序列反应与乒乓反应的区别二.抑制剂对酶反应的影响有些物质能与酶分子上某些必须基团结合(作用),使酶的活性中心的化学性质发生改变,导致酶活力下降或丧失,这种现象称为酶的抑制作用。能够引起酶的抑制作用的化合物则称为抑制剂(inhibitor酶的抑制剂一般具备两个方面的特点:a.在化学结构上与被抑制的底物分子或底物的过渡状态相似。b.能够与酶的活性中心以非共价或共价的方式形成比较稳定的复合体或结合物。酶的抑制作用可逆抑制与不可逆抑制的区别抑制作用的类型:(1)不可逆抑制作用:

(irreversibleinhibition)抑制剂与酶反应中心的活性基团以共价形式结合,引起酶的永久性失活。如有机磷毒剂二异丙基氟磷酸酯。有机磷化合物路易士气失活的酶羟基酶失活的酶酸巯基酶失活的酶酸BAL巯基酶BAL与砷剂结合物(2)可逆抑制作用(reversibleinhibition):抑制剂与酶蛋白以非共价方式结合,引起酶活性暂时性丧失。抑制剂可以通过透析等方法被除去,并且能部分或全部恢复酶的活性。根椐抑制剂与酶结合的情况,又可以分为三类:竞争性抑制:某些抑制剂的化学结构与底物相似,因而能与底物竟争与酶活性中心结合。当抑制剂与活性中心结合后,底物被排斥在反应中心之外,其结果是酶促反应被抑制了。竟争性抑制通常可以通过增大底物浓度,即提高底物的竞争能力来消除。竞争性抑制可用下式表示:竟争性抑制1.竞争性抑制竞争性抑制作用的Lineweaver–Burk图

加入竞争性抑制剂后,Km变大,酶促反应速度减小。可逆抑制作用的动力学特征竞争性抑制剂无抑制剂1/Vmax竞争性抑制作用的双倒数图有竞争性抑制剂存在时,Km值增大(1+[I]/Ki)倍,且Km值随[I]的增高而增大;在[E]固定时,当[S]﹥﹥Km(1+[I]/Ki),Km(1+[I]/Ki)项可忽略不计,则v=Vmax,即最大反应速度不变。竞争性抑制作用的速度方程琥珀酸脱氢酶催化琥珀酸脱氢形成延胡索酸竞争性抑制2.非竞争性抑制:酶可同时与底物及抑制剂结合,引起酶分子构象变化,并导致酶活性下降。由于这类物质并不是与底物竞争与活性中心的结合,所以称为非竞争性抑制剂。如某些金属离子(Cu2+、Ag+、Hg2+)以及EDTA等,通常能与酶分子的调控部位中的-SH基团作用,改变酶的空间构象,引起非竞争性抑制。非竟争性抑制不能通过增大底物浓度的方法来消除。非竞争性抑制可用下式表示:非竟争性抑制2.非竞争性抑制作用非竞争性抑制作用非竞争性抑制作用的Lineweaver–Burk图:加入非竞争性抑制剂后,Km虽然不变,但由于Vmax减小,所以酶促反应速度也下降了。非竞争性抑制剂无抑制剂-1/km有非竞争性抑制剂存在时,V值减小(1+[I]/Ki)倍,且V值随[I]的增高而降低;Km值不变。非竞争性抑制作用的速度方程:3.反竞争性抑制

酶反竞争性抑制有反竞争性抑制剂存在时,Km和V值均减小(1+[I]/Ki)倍,且都随[I]的增高而降低。反竞争性抑制:酶只有在与底物结合后,才能与抑制剂结合,引起酶活性下降。反竞争性抑制可用下式表示:反竞争性抑制作用的速度方程:二.抑制剂对酶反应的影响抑制作用的类型:不可逆抑制作用可逆抑制作用竞争性抑制非竞争性抑制反竞争性抑制abc三种可逆抑制的区别三种可逆抑制的区别酶的不可逆抑制作用汞三.激活剂对酶反应的影响凡是能提高酶活力的简单化合物都称为激活剂(activator)。其中大部分是一些无机离子和小分子简单有机物。如:Na+、K+、Ca2+、Mg2+、Cu2+、Zn2+、Co2+、Cr2+、Fe2+、Cl-、Br-、I-、CN-、NO3-、PO4-等;这些离子可与酶分子上的氨基酸侧链基团结合,可能是酶活性部位的组成部分,也可能作为辅酶或辅基的一个组成部分起作用;一般情况下,一种激活剂对某种酶是激活剂,而对另一种酶则起抑制作用;对于同一种酶,不同激活剂浓度会产生不同的作用。四.酶浓度对酶反应的影响在底物足够过量而其它条件固定的情况下,并且反应系统中不含有抑制酶活性的物质及其他不利于酶发挥作用的因素时,酶促反应的速度和酶浓度成正比。EV五.温度对酶反应的影响一方面是温度升高,酶促反应速度加快。另一方面,温度升高,酶的高级结构将发生变化或变性,导致酶活性降低甚至丧失。

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