全国细菌耐药监测网信息系统-数据上报标准V5

全国细菌耐药监测网信息系统

数据上报标准V5.2

全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统”收集所

有成员单位的耐药监测数据，系统具备完善的数据筛选和容错处理功能,

系统所支持上传的数据文件格式为WHONET5.6软件所导出的通用数据

文件格式，但后缀必需为“.dbf”。除此以外，系统还支持Excel表格，包

括Excel2003以下版本生成的（*.xls）以及Excel2007^010所生成的*.xlsx。

一、科室代码设置

监测网成员单位首次登录时须先使用【本院科室管理】功能，登记

注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上，该映射

关系可随着本院的科室变化随时进行调整（增加、删除、修改），调整之

后不影响曾经上传过的文件，仅影响在调整时间点后上传的数据。而各

医院临床科室对应上报数据文件中的WARD字段保存的值，可以是本院

临床科室名称也可以是本院的临床科室代码，取决于各院在WHONET中

是如何管理的，或者是如何从LIS系统导出的。完成医院科室设置后，在

上传本院数据时一,系统会自动将已经设置好的本院科室信息与系统标准

的科室分类进行映射，并将映射结果直接写入DEPARTMENT字段，不影

响WARD字段中上传的原始值，也就是说，DEPARTMENT字段实际上可

以不填写，甚至是整列都不存在。其实，更好的做法是在上报的数据文

件中直接将DEPARTMENT字段设置成系统内置的标准科室代码（3位字

符）。

1

二、数据文件各字段要求

1、来源ORIGIN

非必填字段，最长1个字符。若填写，则其必须为“h”，若不填写,

数据上传后系统会自动补充，若填写值不为“h”，系统将自动替换成“h”。

2、国家COUNTRY_A

非必填字段，最长3个字符。若填写，则其必须为“CHN”，若未填

写，数据上传后系统会自动补充。

3、医院INSTITUT

非必填字段，为卫生部统一分配的标准代码，标准6字符，前两位

为国家标准省级代码（如北京为11,福建为35等），后4位为各省编码

（从0001开始），例如福建省立医院为350001,若未填写，数据上传后

系统自动补充已注册的医院标准代码，若填写则必须与本院的代码一致,

否则系统会自动替换为正确代码，在数据上传时此字段不建议填值。

4、实验室LABORATORY

非必填字段，最长3个字符。系统不再将此作为医院标识，无具体

格式要求，只要不超长，系统均可接受。

5、病历号PATIENTJD

对于门诊病历不要求必须填写，对于住院病历要求必须填写，并且

填写总量至少占住院病历数据量的95%,否则会导致整个数据文件系统

无法接收，该字段最长16个字符。

6、姓氏LAST_NAME、名字FIRST_NAME、姓名FULL_NAME

2

系统原则上要求FULL_NAME必填，如果未填写系统可根据

LAST_NAME和FIRST_NAME自动推算FULL_NAME的值。因此请根据本院

实际情况填写如上三个字段中的任意一个字段即可，如果考虑到本院病

人隐私问题，可将病人姓名加密，只要不超长，系统依然可以正常接收。

以上三个字段的长度要求分别为：LAST_NAME（30字）、FIRST_NAME（20

字）、FULL_NAME（50字）。

7、性别SEX

此字段要求必填，最长1个字，WHONET要求只能填写“f”或者“m”,

系统提供了相关的容错处理机制，允许填写“男”和“女”，系统会自动

将“男”替换成“m”，将“女”替换成“f”。

8、年龄字段AGE

此字段要求必填，最长3个字符。

（1）不带任何后缀的1~3位整数或者2位数字+"y"后缀，代表年龄

是按岁计算。

（2）2位数字+"d"即代表年龄按天计算。

（3）2位数字+"w"即代表年龄按周计算。

（4）2位数字+"m"即代表年龄按月计算。

（5）空值或其它字符，系统会认为是非法值，需补充修改后才能上

报。

9、年龄类别PATJYPE

非必填字段，系统会根据年龄AGE自动生成，即使是数据中已经填

写了该值系统也会强制替换，因此，该字段可以不填，若要填写，长度

3

必须为3位字符，且要符合系统的计算规则，具体计算规则如下：

1）当AGE后缀为“d”代表“天”时：

A.<=28d,生成“new”代表“新生儿”；

B.>28d,生成“ped”代表“儿童”;

2）当AGE后缀为“w”代表“周”时：

A.<=4w,生成“new”代表“新生儿”；

B.>4w,生成“ped”代表“儿童”；

3）当AGE后缀为“m”代表“月”时：

A.0m,系统无法识别，需修正后才能上报；

A.>=lm,生成“ped”代表“儿童”；

4）当AGE为纯数字，代表“岁”时:

B.。或者Oy,系统无法识别，需修正后才能上报；

C.>=1或者>=ly并且<=14或者<=14y,生成“ped”代表“儿童”；

D.>=15或者>=15y并且<=65或者<=65y,生成“adu”代表“成人”;

E.>65或者>65y,生成“ger”代表“老年”。

10、科室（送检科室）WARD

为必填项，最大长度为15字，中英文不限，此字段所填写的值应该

对应为本院科室维护模块中所录入的信息，可以是本院科室代码也可以

是本院科室名称，而填写的值不在本院科室列表中时一，系统会认为该值

为非法值，需要修改之后再上传。

11、科室类别WARD_TYPE

为非必填项，最大长度为3个字。如果不填写，系统不进行校验，

4

如果填写，则必须与WHONET内置的代码要求一致，见附表1。

12、专业类别DEPARTMENT

为100%必填项，最大长度为3个英文字符，此字段所填写的值，必

须为系统所规定的标准专业类别代码，见附表2。未在该附表中的值为非

法值，无法通过系统校验。系统提供了容错处理，可直接通过WARD字

段自动推算此列的值。因此，此字段其实可以不填写。

13、标本类型英文代码SPECJYPE

本字段为必填项，最低校验通过率为100%,要求100%必填，不能

为空白，否则将导致整个文件校验失败，系统拒绝接收！系统只接受

WHONET标准【标本字典】中的英文代码，见附表3。

意外情况：如果本字段所填写值，与从【SPEC/ODE】字段所推算出

来的值不匹配，则同样会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收,

必须改正之后才可以重新上传，且不仅仅是影响单列通过率的问题！

例如：痰标本的英文代码为“sp"，数字代码应该对应为“3”，如果

填写了其它数字代码，会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收,

必须改正之后才可以重新上传！

14、数字代码SPEC_CODE

本字段为必填项，最低校验通过率为100%,要求100%必填，不能

空，否则将导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收！

校验规则如下：

系统只接WHONET标准【标本字典】中的数字代码，具体请参照或者

下载《全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准》文档中的《附表3：

5

SPECJTYPE与SPEC_CODE对照字典》中的【SPEC_CODE】歹限

除此以外的值，均为非法值，如果有一项填写错误，将导致整个文

件校验失败，并且被系统拒绝接收！

意外情况：

如果本字段所填写值，与从【SPECJYPE】字段所推算出来的值不匹

配，则同样会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正

之后才可以重新上传！

例如：痰标本的英文代码为“sp"，数字代码应该对应为“3”，如果

填写了其它数字代码，会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收,

必须改正之后才可以重新上传！

容错处理：

如果本字段未填写值，则系统会自动从［SPEC_TYPE］字段推算出本

列的值，并且会给出警告提示，这不影响通过率，但这会影响高质量数

据占比。

15、关于标本字段的其它规则

如果标本代码的确没有在系统所给出的字典库中列中，可以将

SPEC_TYPE填写为“ot”将SPEC_CODE填写为“89”,代表“其它”。如果

出现了SPEC_TYPE与SPEC_CODE两者都填写了值，但两值并不匹配的情

况，例如：痰标本的英文代码为“sp"，数字代码应该对应为“3”，如果

填写了其它数字代码，系统会给出提示，要求修正不匹配的数据后再次

上传。超出附表（3）内的标本类型系统视为非法值，需修正后才能上报

数据。另外，当标本类型为质控标本（即SPEC_TYPE为qc并且SPEC_CODE

6

为75或者SPEC_TYPE为ex并且SPEC_CODE为99）时系统会忽略这些数

据，并给出提示并自动忽略该条数据。

14、标本编号SPEC_NUM字段

100%必填字段，最大长度30字。

15、检验结果（细菌）ORGANISM

100%必填字段，标准3位英文字符代码，此代码为WHONET5.6标

准细菌代码；注意！系统仅接收革兰阳性菌与革兰阴性菌，见附表（4）,

不接受真菌，支原体，厌氧菌和分枝杆菌等。当发现在附表（4）所规定

的标准代码外的数据时，系统会给出提示并自动忽略该条数据。

16、细菌类别ORGJYPE

系统仅接受革兰阳性菌“+”和革兰阴性菌代码最大允许1字

符，此字段可不填写。当系统发现未填写时会自动根据ORGANISM字段

的值推导出来，当系统发现本字段中填写的值与系统所推导的合法值不

匹配的时候，会自动将其替换成合法值。

17、B-内酰胺酶BETA_LACT

非必填字段，1字符，且值仅能为“+”或若填写为“n”、“ne”、

“neg”、“negative”或者中文全角“一”，系统会自动将其修正为半角英

文”,若填写为文”、“p。”、“pos”、“positive”或者中文全角“+

系统会自动将其修正为半角英文“+”。

18、超广谱B-内酰胺酶ESBL

规则同上。

19、耐甲氧西林葡萄球菌检测试验MRSA_SCRN

7

规则同上。

20、诱导型克林霉素耐药试验INDUC_CLI

规则同上。

21、霍奇试验HODGE

非必需字段，规则同上。

22、碳青酶烯酶CARBAPENEM

规则同上。

23、送检日期（标本日期）SPEC_DATE

本字段为必填项，最低校验通过率为100%!

系统只接收特定的日期格式，例如2014年11月5日可以有如的表

示方式：

20141105（长度必须为8位）

20141105或者2014115

2014-11-05或者2014-11-5

2014/1W5或者2014/11/5

2014年11月05日或者2014年11月5日

Nov052014,其中Nov为英文的11月简写

Nov-05-2014,其中Nov为英文的11月简写

Nov/35/2014,其中Nov为英文的11月简写

05Nov2014,其中Nov为英文的11月简写

05-NOV-2014,其中Nov为英文的11月简写

0%Nov〃014,其中Nov为英文的11月简写

8

201405Nov,其中Nov为英文的11月简写

2014-05-Nov,其中Nov为英文的11月简写

2014/35/Nov,其中Nov为英文的11月简写

2014Nov05,其中Nov为英文的11月简写

2014-NOV-05,其中Nov为英文的11月简写

2014/NOV/35,其中Nov为英文的11月简写

错误的日期格式举例：

2014115中间没有任何分隔符，并且长度不为8位，系统将无法识

别。

英文月份的简写请参照下表:

月份英文代码月份英文代码

1Jan7Jul

2Feb8Aug

3Mar9Sep

4Apr10Oct

5May11Nov

6Jun12Dec

24、报告日期（数据录入日期）DATE_DATA

为非必填字段，规则同上。

9

25、抗生素

所有抗生素代码采用Whonet5.6标准代码。抗生素代码见附表（5）。

纸片法（K-b法）：

填写结果只能为6至80之间的整数，否则视为填写错误，系统会将

该值忽略，这会影响该列的通过率。对应的字段名应为：抗生素英文代

码++抗生素含量，例如：、切记：不能

“_ND”AMK_ND30AMX_ND25O

为（S、I、R）、不能有小数、不能带任何符号（.＞＜=等等）。

MIC法：

对于除高浓度庆大霉素和高浓度链霉素以外的MIC法字段，系统要求

只能为小数或者1、2、4、8、16、32、64、128、256、512,不在这些数

字范围内的，均为非法值。可以有前导【＞、＜、=】符号。合法情况举例:

等于纯整数数字或者小数数字：4、4.0；大于或者大于等于上述两类数

字：＞4、＞=4、＞4.0、＞=4.0；小于或者小于等于上述两类数字：＜4、＜=4、

＜4.0＞＜=4.0；对应的字段名应为：抗生素英文代码+“_NM”；例如：

AMK_NM、AMX_NM；切记：不能为（S、I、R）不能为非2的平方数如

6、7、99、100等等。

MIC法特殊字段-【GEH_NM】高浓度庆大霉素的填写规则：

以下特殊规则将直接替代普通MIC法的校验规则，具体如下：

1、仅允许出现如下值：250,256,500,512,513,1000,1024,1025,

不在这些数字范围内的，均为非法值，影响通过率。

10

2、可以有前导【>、<、=】符号

3、如果填写了[SYN-S],系统将自动替换为【<=500】

4、如果填写了[SYN-R],则将自动替换为[>=1000]

MIC法特殊字段-【STH_NM】，高浓度链霉素的填写规则：

以下特殊规则直接替代普通MIC法的校验规则，具体如下：

1、仅允许出现如下值：500,512,1000,1024,2000,2048,2049,

不在这些数字范围内的，均视为非法值

2、可以有前导【>、<、=1符号

3、如果填写了[SYN-S],系统将自动替换为[<=10001

4、如果填写了[SYN-R]则将自动替换为[>=2000]

MIC法特殊字段-【SXT_NM】复方新诺明的填写规则：

该结果上传后系统自动将数据为320的字符替换为16,160替换

为8,80替换4,40替换为2,20替换为1,10替换为0.5,其余字

符保持原始数据。

A.系统会将数据中出现的一些特殊字符替换为合法字符，具体如下:

a）全角"“或"2”将替换为半角“>=”

b）全角“皂”、y将替换为半角“<="

c）全角“>”将替换为半角“>”

d）全角“V”将替换为半角“<”

e）全角“=”将替换为半角“=”

11

f）全角与“。”将替换为半角

在数据中若出现未在附表（5）中的其它抗生素字段，系统会自动忽略该

字段的数据，不予保存。

本系统目前抗菌药物敏感性执行标准为CLSIM100-S23,上传数据如

果有未达到该折点标准的数据，系统会将该组数据中的未达到CLSI

M100-S23标准的抗生素结果忽略。如某一抗生素，CLSIM100-S23折点为

S:<=2,1:4-8,R:>=16,测定结果为<=8,这样的数据系统无法判断是敏感

还是中介，系统在统计的时候会自动将该组数据中的这个抗生素结果给

忽略掉，不予统计。

2014新版细菌耐药监测信息系统具备了强大的数据容错处理功能，

能将上传的不合格数据自动修正或删除，处理为合格的数据文件，同时

具备一定的学习功能，用户可以下载经容错处理后的数据发现并纠正错

误，不断改进，提高数据质量，同时可将修正后数据用于本机构细菌耐

药监测统计分析。

12

附表1:

WARD_TYPE字典

代码含义

out门诊病人

in住院病人

inx住院病人（非TCD）

icu重症监护病房

int过度监护病房

eme急诊

nur家庭护理

com社区

hos其它医院

lab实验室

abaAbattoir（屠宰场）

vetVeterinaryclinic（兽医诊所）

farFarm（农场）

fieField（野外）

stoStore/Market（商店/超市）

resRestaurant（饭店）

zooZoo（动物园）

mix混合

unk未知（不明来源）

oth其他

13

附表2：

系统内置标准科室分类字典

代码名称代码名称

neu神经内科obg妇产科

car心内科ped儿科

res呼吸内科pes小儿外科

dis消化内科neo新生儿科

end内分泌内科oph眼科

hem血液内科oto耳鼻咽喉科

nep肾脏内科sto口腔科

ger老年病内科der皮肤性病科

rhe风湿免疫科inf感染疾病科

med（大）内科chi中医科

oim其它内科rad放射治疗科

sur外科one肿瘤科

ort骨科eme急诊科

urs泌尿外科out门诊科

ces胸外科icu重症医学科

cas心脏外科rcu呼吸监护室

bus整形烧伤外科ccu心脏监护室

nes神经外科ecu急诊监护室

vas介入血管外科reh康复医学科

ots其它外科oth其它

14

附表3：

SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照字典

SPEC_CODESPEC_TYPESPEC/ODESPEC_TYPE

名称名称

数字代码英文代码数字代码英文代码

鼻腔拭子1no水96wa

咽拭子2th食物97fo

痰3sp不明标本98un

支气管分泌物4br质控99qc

耳部标本5ea头发100hr

眼分泌物6ey指甲101nl

口腔拭子7mo鼻咽拭子102np

皮肤拭子8sk足拭子103ft

关节拭子9jt尸检标本104au

导尿管尿1()uc异物105fb

尿液11ur胎粪106me

血液12bl子宫内避孕器107iu

脑脊液13前段尿10Sfv

肺穿刺液11In脐部拭子109us

腹水15*)隔离标本110is

胃液16ga腹部脓肿111ad

排泄物17dr烧伤标本112bs

液体18fl永久导管113cp

胆汁19bi角膜标本114cr

伤口拭子21wd脓胸115ee

外科手术伤口拭子22sw胸膜脓肿116ep

脓肿23as硬膜下脓肿117es

脓液21PS人工心脏瓣膜118hp

羊水25am小支气管肺泡灌洗液119mb

气管插管26n-起博器120pm

窦道拭子27si胰腺标本121pn

棉签28sb心包积液122Pd

吸气管29at导管尖端123cs

无菌体液30fn人工骨124Pb

器官31og人工分流管125sh

宫颈拭子32ex人工血管126pv

脐带标本33urn保护性导管刷127pc

阴道拭子34va扁桃体穿刺液128tn

活检组织35bx褥疮溃疡129ud

组织36ti非导管尿130uz

脑部组织37bn肾穿刺尿131uo

心脏标本38in?未知来源尿132uu

心脏瓣膜39hv扁桃体脓肿133Pt

肝脏穿刺液40li牙龈脓肿134de

粪便41st肛周脓肿135ac

直肠拭子42re皮肤脓肿136ak

肌肉标本43mu阑尾137ap

手部拭子44ha外周导管138ch

手臂拭子45ar培养基140cm

腋窝拭子46ax前庭大腺囊肿111cb

结膜拭子47co引流液142dr

中耳拭子18em心内膜143ec

外耳拭子49eo附睾标本114ed

疹管50fi会厌拭子145eg

生殖器拭子51gn食管拭子146eh

男性外生殖器拭子52gm输卵管147fa

女性外生殖器拭子53gf疳148fu

胎盘组织54pl胆囊标本149gb

乳房穿刺液55bt髅关节标本150hi

乳汁56mi髅关节液151hf

15

精液57sm昆虫152i1

尿道拭子58ue关节腔积液153Jf

清洁中段尿59cv膝盖拭子154kn

分泌物60se膝关节液155kf

骨组织61bo喉拭子156lx

骨髓62bm唇拭子157lp

支气管肺泡灌洗液63ba恶露158lo

胸水64Pf卵巢组织159ov

下呼吸道标本65rl阴茎拭子160pe

上呼吸道标本66ru阴茎分泌物161pg

气管抽出液67ta会阴拭子162Pi

外部溃疡标本68ux血浆163Pa

内部溃疡标本69ui前列腺组织164PO

筛选标本70sc前列腺液165PU

筛选MRSA标本71mr直肠子宫陷凹穿刺液166rc

筛选VRE标本72vr检测寄生虫用透明胶带167lp

科研标本73rs血清168sr

实验室标本741H分流液169SU

外部质控75ex脾组织170si

呼吸道标本76rp抗酸染色痰171sa

溃疡标本77ul诱导痰172in

膀胱尿78•dl)吞线试验检测寄生虫173sg

肾脏尿79uk睾丸穿刺液174te

耻骨弓上穿刺尿80ua牙齿175to

肾脏标本81ki蠕虫176wo

子宫拭子82ut胸部伤口拭子177WI

十：指肠液83du腹部拭子178an

纵膈拭子84me血管179bv

囊液85bu头部拭子181hd

囊肿穿刺液86cy唾液腺穿刺液182SV

淋巴结穿刺液87In腿部拭子1831g

腺体穿刺液88gl颈部拭子184nk

其它89（）1神经185nv

导管91ca盆腔积液186Iv

透析液92di筛选艰难梭菌187cd

环境标本93en腹股沟拭子188gr

假体94pr腹股沟三角区拭子189ig

中央导管95cc脐带导管190cu

16

附表4：

细菌字典

代码中文名称类型

saj毗邻颗粒链菌(Abiotrophiaadiacens)+

saj毗邻颗粒链菌(Streptococcusadjacens)+

Ibo博兹曼荧光杆菌(Fluoribacterbozemanii)-

Ibo博兹曼荧光杆菌(Legionellabozemanii)-

bsaA群B-溶血链球菌(Streptococcus,beta-haem.GroupA)+

grdSalmonellaGroupD(DI,D2,D3)-

greSalmonellaGroupE(E1-E2-E3)-

grgSalmonellaGroupG(0:13)(G1-G2)-

leg军团菌属(Legionellasp.)-

gglSalmonellaGroupG1(0:13,22)-

gg2SalmonellaGroupG2(0:13,23)-

bhm霍氏鲍特菌(Bordetellaholmesii)-

bhmCDCNO-2-

haf哈夫尼亚菌属(Hafniasp.)-

grcSalmonellaGroupC(C1-C4,C2-C3)-

grbSalmonellaGroupB(0:4)-

sunSalmonellasp.,unnamed-

sun未命名沙门菌(Salmonellaunnamed)-

spc变形斑沙雷菌(Serratiaproteamaculans)-

spcSerratiaproteamaculansss.proteamaculans(-

sen凝固酶阴性葡萄球菌(Staphylococcus,coagulasenegative)+

ral罗尔斯顿菌属(Ralstoniasp.)-

buk伯克霍尔德菌属(Burkholderiasp.)-

gelSalmonellaGroupCl(0:7)-

Ima麦凯克伦埃特洛克菌(Legionellamaceachernii)-

Ima麦凯克伦埃特洛克菌(Tatlockiamaceachernii)-

Ime麦克达德埃特洛克菌(Legionellamiedadei)-

Ime麦克达德埃特洛克菌(Tatlockiamiedadei)-

tai埃特洛克菌属(Tatlockiasp.)-

apl胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacilluspleuropneumoniae)-

apl胸膜肺炎放线杆菌(Haemophilusp1europneumoniae)-

acb放线杆菌属(Actinobacillussp.)-

clr红嘴鸥弯曲菌(Campylobacterlari)-

clr海鸟弯曲菌(Campylobacterlaridis)-

cap二氧化碳嗜纤维菌属(Capnocytophagasp.)-

capCDCDF-1-

chb金黄杆菌属(Chryseobacteriumsp.)-

sid产口引口朵萨顿菌(Kingellaindologenes)-

17

sid产口引口朵萨顿菌(Suttonellaindologenes)-

sut萨顿菌属(Suttonellasp.)-

eet肠产毒型大肠埃希菌(Escherichiacoli,enterotoxigenic(ETEC))-

eei肠侵袭型大肠埃希菌(Escherichiacoli,enteroinvasive(EIEC))-

PPm假鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderiapseudomallei)-

PPm类鼻疽伯克霍尔德菌(Pseudomonaspseudomallei)-

ste窄食单胞菌属(Stenotrophomonassp.)-

ef4CDCEF-4-

ef4类巴斯德菌(PasteurellaTike(CDCEF-4))-

e4aCDCEF-4a-

e4bCDCEF-4b-

oen酒球菌属(Oenococcussp.)+

dei异常球菌属(Deinococcussp.)+

cam弯曲菌属(Campylobactersp.)-

chm色杆菌属(Chromobacteriumsp.)-

cor棒杆菌属(Corynebacteriumsp.)+

ha-嗜血杆菌属(Haemophilussp.)-

meb甲基杆菌属(Methylobacteriumsp.)-

mic微球菌属(Micrococcussp.)+

och苍白杆菌属(Ochrobactrumsp.)-

oanCDCVd-1-

oanCDCVd-2-

oan人苍白杆菌(Ochrobactrumanthropi)-

ps-假单胞菌属(Pseudomonassp.)-

se-沙雷菌属(Serratiasp.)-

shi志贺菌属(Shigellasp.)-

snd志贺菌，非痢疾(Shigella,non-dysen