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文档简介
如何分析基因序列中的启动子、外显子和内含子
DNA启动子、终止子•启动子:RNA聚合酶特异性和结合的DNA序列。启动子是基因的一个组成部分,控制基因表达的起始时间和表达的程度。•外显子:断裂基因中的编码序列。外显子是真核生物基因的一部分,它在剪接后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。•内含子:断裂基因的非编码区,可被转录,但在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。DNA启动子、终止子怎样利用互联网中的网站或软件分析该序列中的外显子、内含子和启动子呢?现有人基因组中的一段序列GGTATGGGGCCAAGAGATATATCTT………..DNA启动子、终止子一、根据一段碱基序列找到其对应的基因名或其序列号DNA启动子、终止子任选浏览器——搜索“NCBI”——找到后点击进入,出现如上界面——点击“BLAST”(BasicLocalAlignmentSearchTool,BLAST)DNA启动子、终止子当出现如上界面时,点击“nucleotideblast”DNA启动子、终止子
打开页面后,在检索框中输入需要查找的序列,如图所示DNA启动子、终止子根据索要查询的基因来源,选定需要查询的基因(人类基因)——点击“BLAST”打开DNA启动子、终止子出现页面后向下滑动直至出现图1寻找Ident(一致性)最高的一项点击进入DNA启动子、终止子点击进入后见所查序列名称以及序列号据此进行操作DNA启动子、终止子二、已知基因的基因名或序列号找到其启动子、外显子和内含子DNA启动子、终止子1、输入网址进入UCSC网站DNA启动子、终止子2、点击GenomeBrowserDNA启动子、终止子3、点击进入后可看到以下页面(1)选择是何种生物的基因(如人类,老鼠等)(2)输入你所需要查询的基因名称输入完毕,点击SUBMITDNA启动子、终止子4、可看到以下页面(1)将EnsemblGenes设置为dense(显示)(2)点击refreshDNA启动子、终止子5、可看到以下页面找到EnsemblGenes点击所对应的序列图形DNA启动子、终止子6、可看到以下页面继续点击所对应的序列图形DNA启动子、终止子7、可看到以下页面选择GenomicSequenceDNA启动子、终止子8、可看到以下页面(2)选择表现形式(如外显子大写,其余都小写)(1)根据需要选择所要展现的内容(如外显子、内含子)(3)点击submitDNA启动子、终止子9、可看到以下页面此为HBB基因的全部序列第一段大写部分为第一个外显子。第一个外显子前面的所有小写部分为该序列的启动子。大写部分之间夹杂的小写部分为该序列的内含子。DNA启动子、终止子三、检验所得序列是目的序列DNA启动子、终止子1、验证利用word输入我们所得到序列的第一个外显子的部分序列进行验证,看是否与原题序列匹配DNA启动子、终止子验证完成后,确认匹配
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