DB4415-T 24-2023 甘薯病毒分子检测技术规程_第1页
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文档简介

65.020.20CCS

B

054415 DB4415/T

24—2023甘薯病毒分子检测技术规程Technical

for

detection

of

potato

2023-09-14

发布 2023-10-08

实施汕尾市市场监督管理局 发布DB4415/T

-2023 本文件按照

GB/T

—2020《标准化工作导则

1

部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定编写。本文件由汕尾市市场监督管理局提出并归口。本文件起草单位:

汕尾市农业科学院。本文件主要起草人:

林少钦。DB4415/T

-2023甘薯病毒分子检测技术规程1 范围及记录和归档。本文件适用于汕尾市区域内甘薯脱毒组培苗、原原种、原种以及生产用种的病毒分子检测。2 规范性引用文件文件。GB/T

6682

分析实验室用水规格和试验方法NY/T

脱毒甘薯种薯(苗)病毒检测技术规程SN/T

2122

进出境植物及植物产品检疫抽样方法SN/T

2964

植物病毒检测规范3 术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1分子检测

molecular

detection以功能基因、核糖体、等区域为标靶,采用分子生物学的方法在基因水平上对物种进行鉴定。3.2引物

板DNA互补的序列。3.3聚合酶链式反应

chain

reaction在DNA体外复制出与母链互补的子链DNA的过程,是一项能快速特异性的在体外扩增目的DNA片段的技术。3.4逆转录聚合酶链式反应

reverse

transcription

chain

reaction以RNADNADNA为模板进行PCR性的检测目的的技术。DB4415/T

-20234检测对象4.1

a)甘薯类花椰菜花叶病毒(SPCV)b)

甘薯曲叶病(SPLCV)4.2

a)

甘薯褪绿矮化病毒()b)

甘薯羽状斑驳病毒()c)

G

病毒(SPVG)d)

甘薯潜隐病毒(SPLV)e)

甘薯褪绿斑病毒()f)

甘薯脉花叶病毒()g)

黄瓜花叶病毒()5 抽样方法抽样方法应符合

SN/T

2122

SN/T

2964

中的规定,遵循随机的原则,根据样品的特性和样品中可能存在的病毒表现出的症状特点,确定取样方法、取样数量、取样工具、保存方法等。合适的取样计划,进行再次取样。6

6.1

聚合酶链式反应()检测用于检测甘薯

病毒。6.1.1

试剂及缓冲液的配置试剂及缓冲液用水应符合

GB/T

6682

的规定,配置按

NY/T

执行。6.1.2

DNA

的提取样品

的提取按

NY/T

执行。6.1.3

对照组以

ddH2O

作为检测的阴性对照。6.1.4

引物a)甘薯类花椰菜花叶病毒(SPCV):F-AGGAAATCCCAGTATTATTCAAC,,扩增产物

922

;b)甘薯曲叶病(SPLCVF-CCYTAGGGTTCGAGCTVTGTTCGG,R-TTTATTAATTDTTRTGCGAATC,扩增产物

。6.1.5

PCR

扩增采用

病毒特异引物进行

PCR

扩增;反应体系(

μL):样品总

DNA(约

ng/

μL)2

μL,2×Taq

Master

Mix

12.5

μL,上、下游引物(10

μmol/L

1

μL,ddH2O

补齐至

μL;扩增条件:DB4415/T

-202394℃

2

min;94℃

s,退火

s,68℃

1

,30

次循环;68℃

10

min;4℃

保存;扩增产物用于后续凝胶电泳检测。6.1.6

PCR

产物的电泳检测取

10

μL

PCR

扩增产物与

1

μL

10×loading

混合后,1%琼脂糖凝胶恒压(120

V~150

V)下电泳

20

min~30

min,EB

染色后,凝胶成像仪拍照观察。6.2

反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测用于检测甘薯

病毒。6.2.1

试剂及缓冲液的配置试剂及缓冲液用水应符合

GB/T

6682

的规定,配置按

NY/T

执行。6.2.2

RNA

的提取样品

的提取按

NY/T

执行。6.2.3

对照组以

ddH2O

作为检测的阴性对照。6.2.4

引物a)甘薯褪绿矮化病毒(F-CGGTCARATTGGAAGGT,,扩增产物

;b)甘薯羽状斑驳病毒(F-GCATGGTATGARGGAGTYAA,R-TCTTCTTCTTGCGTGGAG,扩增产物

589

bp;c)甘薯

G

病毒(SPVGF-GTATGAAGACTCTCTGACAAATTTTG,,扩增产物

1191

bp;d)甘薯潜隐病毒(SPLVF-GCCGAYGAAACCATCMTCGAT,R-GTCTCYGGTATAAGACAAAAAG,扩增产物

1076

bp;e)甘薯褪绿斑病毒():F-CTATGCTGCTCACTCAAGC,R-TTGATTGGCCACAAGCGAAG,扩增产物

600

bp;f)甘薯脉花叶病毒():F-GCGAATTCTCAAGCACTGAAGAAAC,R-CTCTCGAGTTACTGCACACCTCTCATT

1015

;g)黄瓜花叶病毒():F-ATGGACAAATCTRAATCAACCAG,,扩增产物

657

;6.2.5

反转录反转录过程按

NY/T

D.3.2

执行。6.2.6

PCR

扩增采用

病毒特异引物进行

PCR

扩增;反应体系(

μL):合成的

cDNA

2

μL,2×Taq

Master

12.5

μL,上、下游引物(10

μmol/L)各

1

μL,2O

补齐至

25

μL;扩增条件:94℃

2

min;94℃

s,退火

45

s,68℃

1

,30

次循环;68℃

10

;4℃

保存;扩增产物用于后续凝胶电泳检测。6.2.7

PCR

产物的电泳检测取

10

μL

PCR

扩增产物与

1

μL

10×loading

混合后,1%琼脂糖凝胶恒压(120

V~150

V)下电泳

20

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