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文档简介
65.020.20CCS
B
054415 DB4415/T
24—2023甘薯病毒分子检测技术规程Technical
for
detection
of
potato
2023-09-14
发布 2023-10-08
实施汕尾市市场监督管理局 发布DB4415/T
-2023 本文件按照
GB/T
—2020《标准化工作导则
第
1
部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定编写。本文件由汕尾市市场监督管理局提出并归口。本文件起草单位:
汕尾市农业科学院。本文件主要起草人:
林少钦。DB4415/T
-2023甘薯病毒分子检测技术规程1 范围及记录和归档。本文件适用于汕尾市区域内甘薯脱毒组培苗、原原种、原种以及生产用种的病毒分子检测。2 规范性引用文件文件。GB/T
6682
分析实验室用水规格和试验方法NY/T
脱毒甘薯种薯(苗)病毒检测技术规程SN/T
2122
进出境植物及植物产品检疫抽样方法SN/T
2964
植物病毒检测规范3 术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1分子检测
molecular
detection以功能基因、核糖体、等区域为标靶,采用分子生物学的方法在基因水平上对物种进行鉴定。3.2引物
板DNA互补的序列。3.3聚合酶链式反应
chain
reaction在DNA体外复制出与母链互补的子链DNA的过程,是一项能快速特异性的在体外扩增目的DNA片段的技术。3.4逆转录聚合酶链式反应
reverse
transcription
chain
reaction以RNADNADNA为模板进行PCR性的检测目的的技术。DB4415/T
-20234检测对象4.1
a)甘薯类花椰菜花叶病毒(SPCV)b)
甘薯曲叶病(SPLCV)4.2
a)
甘薯褪绿矮化病毒()b)
甘薯羽状斑驳病毒()c)
G
病毒(SPVG)d)
甘薯潜隐病毒(SPLV)e)
甘薯褪绿斑病毒()f)
甘薯脉花叶病毒()g)
黄瓜花叶病毒()5 抽样方法抽样方法应符合
SN/T
2122
和
SN/T
2964
中的规定,遵循随机的原则,根据样品的特性和样品中可能存在的病毒表现出的症状特点,确定取样方法、取样数量、取样工具、保存方法等。合适的取样计划,进行再次取样。6
6.1
聚合酶链式反应()检测用于检测甘薯
病毒。6.1.1
试剂及缓冲液的配置试剂及缓冲液用水应符合
GB/T
6682
的规定,配置按
NY/T
执行。6.1.2
DNA
的提取样品
的提取按
NY/T
执行。6.1.3
对照组以
ddH2O
作为检测的阴性对照。6.1.4
引物a)甘薯类花椰菜花叶病毒(SPCV):F-AGGAAATCCCAGTATTATTCAAC,,扩增产物
922
;b)甘薯曲叶病(SPLCVF-CCYTAGGGTTCGAGCTVTGTTCGG,R-TTTATTAATTDTTRTGCGAATC,扩增产物
。6.1.5
PCR
扩增采用
病毒特异引物进行
PCR
扩增;反应体系(
μL):样品总
DNA(约
ng/
μL)2
μL,2×Taq
Master
Mix
12.5
μL,上、下游引物(10
μmol/L
1
μL,ddH2O
补齐至
μL;扩增条件:DB4415/T
-202394℃
2
min;94℃
s,退火
s,68℃
1
,30
次循环;68℃
10
min;4℃
保存;扩增产物用于后续凝胶电泳检测。6.1.6
PCR
产物的电泳检测取
10
μL
PCR
扩增产物与
1
μL
10×loading
混合后,1%琼脂糖凝胶恒压(120
V~150
V)下电泳
20
min~30
min,EB
染色后,凝胶成像仪拍照观察。6.2
反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测用于检测甘薯
病毒。6.2.1
试剂及缓冲液的配置试剂及缓冲液用水应符合
GB/T
6682
的规定,配置按
NY/T
执行。6.2.2
RNA
的提取样品
的提取按
NY/T
执行。6.2.3
对照组以
ddH2O
作为检测的阴性对照。6.2.4
引物a)甘薯褪绿矮化病毒(F-CGGTCARATTGGAAGGT,,扩增产物
;b)甘薯羽状斑驳病毒(F-GCATGGTATGARGGAGTYAA,R-TCTTCTTCTTGCGTGGAG,扩增产物
589
bp;c)甘薯
G
病毒(SPVGF-GTATGAAGACTCTCTGACAAATTTTG,,扩增产物
1191
bp;d)甘薯潜隐病毒(SPLVF-GCCGAYGAAACCATCMTCGAT,R-GTCTCYGGTATAAGACAAAAAG,扩增产物
1076
bp;e)甘薯褪绿斑病毒():F-CTATGCTGCTCACTCAAGC,R-TTGATTGGCCACAAGCGAAG,扩增产物
600
bp;f)甘薯脉花叶病毒():F-GCGAATTCTCAAGCACTGAAGAAAC,R-CTCTCGAGTTACTGCACACCTCTCATT
1015
;g)黄瓜花叶病毒():F-ATGGACAAATCTRAATCAACCAG,,扩增产物
657
;6.2.5
反转录反转录过程按
NY/T
D.3.2
执行。6.2.6
PCR
扩增采用
病毒特异引物进行
PCR
扩增;反应体系(
μL):合成的
cDNA
2
μL,2×Taq
Master
12.5
μL,上、下游引物(10
μmol/L)各
1
μL,2O
补齐至
25
μL;扩增条件:94℃
2
min;94℃
s,退火
45
s,68℃
1
,30
次循环;68℃
10
;4℃
保存;扩增产物用于后续凝胶电泳检测。6.2.7
PCR
产物的电泳检测取
10
μL
PCR
扩增产物与
1
μL
10×loading
混合后,1%琼脂糖凝胶恒压(120
V~150
V)下电泳
20
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