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文档简介
基因重组和基因工程
GeneticbinationandGeneticEngineering第十四章目录目的和要求掌握基因重组与基因工程的基本原理及基本概念。理解细菌中的基因转移和重组熟悉工具酶,特别是限制性核酸内切酶及其特点,DNA克隆的一般步骤了解重组DNA技术与医学的关系。
本章主要内容一、DNA的重组二、DNA重组技术三、DNA重组技术与医学的关系第一节
DNA的重组
DNAbination
DNA重组的类型转座重组((transposition)同源重组(homologousbination)特异位点重组(site-specificbination)细菌的基因转移与重组一、同源重组(bination)
发生在同源序列间的重组称为同源重组,又称基本重组。是自然界最基本的DNA重组方式二、细菌的基因转移与重组(一)接合作用(二)转化作用(三)转导作用(一)接合作用(conjugation)。当细菌通过菌毛相互接触时,质粒DNA从一个细菌转移至另一细菌,这种类型的DNA转移称为接合作用。(二)转化作用通过自动获取或人为的供给外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型,称为转化作用
(transformation)。
λ噬菌体的生活史溶源生长途径(lysogenicpathway)溶菌生长途径(lysispathway)例目录(三)转导作用DNA的复制蛋白质外壳的合成溶菌、释放溶菌生长途径溶源生长途径溶源生长途径当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(受体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用(transduction)。三、位点特异重组(site-specificbination)
由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位点间发生的整合重组四、转座重组(transposition
bnition)由插入序列和转座子介导的基因移位或重排称为转座。第二节
重组DNA技术DNAbinationTechnique重组DNA技术的发展史年G.J.Mendel的豌豆杂交试验1944年O.T.Avery的肺炎球菌转化实验1972年美国斯坦福大学的科学家构建第一个重组DNA分子1976年美国南旧金山建立世界上第一家遗传工程公司,专门应用重组DNA技术制造医学上重要的药物。1980年开始建造第一家应用重组DNA技术生产胰岛素的工厂1997年英国罗林研究所成功的克隆了“多莉”一、重组DNA技术相关概念克隆(clone)来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。(一)DNA克隆获取同一拷贝的过程称为克隆化(cloning),即无性繁殖。技术水平:动物或植物(个体克隆)细胞克隆分子克隆(molecularclone)
即DNA克隆
DNA克隆将目的片段与载体连接并导入宿主细胞。使目的片段在宿主细胞中不断进行增殖。最后用适当的方法收集这些DNA片段,就获得了该DNA的克隆。又称基因克隆或重组DNA(binantDNA)。生物技术工程:
基因工程、蛋白质工程、酶工程、细胞工程等基因工程(geneticengineering)
——实现基因克隆所用的方法及相关的工作称基因工程,又称重组DNA工艺学。(二)工具酶
限制性核酸内切酶
T4DNA连接酶
DNA聚合酶Ⅰ
逆转录酶碱性磷酸酶末端转移酶
TaqDNA聚合酶
限制性核酸内切酶发现:来源:细菌定义:限制性核酸内切酶(restrictionendonuclease,RE)是识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCG+BamHⅠ作用与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰系统,限制外源DNA,保护自身DNA。分类Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(基因工程技术中常用Ⅱ型)第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。命名HindⅢ
属种株序Haemophilusinfluenzaed株流感嗜血杆菌d株的第三种酶Ⅱ类酶识别序列特点——
回文结构(palindrome)
切割产生的末端:平端、粘端GGATCCCCTAGGBamHⅠGTCCAGG3'CCTAG55'GATCC'
'3G+GGATCCCCTAGGHindⅡGTCGACCAGCTGGACCTG+平端粘端同功异源酶来源不同的限制酶,但能识别和切割同一位点,这些酶称同功异源酶。GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCG+BamHⅠGGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCG+BstⅠ同尾酶有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,但切割DNA后,产生相同的粘性末端,称为同尾酶。这两个相同的粘性末端称为配伍末端(compatibleend)。BamHⅠBglⅡGGATCCCCTAGGAGATCTTCTAGAGCCTAGGATCCG++ATCTAG
GATCTA(三)目的基因
cDNA(complementaryDNA)
指反转录合成的、与RNA互补的单链DNA。定义:人们感兴趣的基因或DNA序列。RNAcDNA基因组DNA(genomicDNA)(四)基因载体定义:为携带目的基因,实现其无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。
质粒DNA
病毒DNA
噬菌体DNA
可充当载体的DNA:
克隆载体(cloningvector)为使插入的外源DNA序列被扩增而特意设计的载体称为克隆载体表达载体(expressionvector)为使插入的外源DNA序列可转录翻译成多肽链而特意设计的载体称为表达载体。载体的选择标准能自主复制;具有两个以上的遗传标记物,便于重组体的筛选和鉴定;有克隆位点(外源DNA插入点),常具有多个单一酶切位点,称为多克隆位点;分子量小,以容纳较大的外源DNA。1.质粒
(plasmid)特点能在宿主细胞内独立自主复制;带有某些遗传信息,会赋予宿主细胞一些遗传性状。pBR322的物理图谱能自主复制具有amprterr有克隆位点λ噬菌体DNA改造系统λgt系列(插入型,适用cDNA克隆)EMBL系列(置换型,适用基因组克隆)2.噬菌体(phage)
插入型置换型外源片断M13噬菌体DNA改造系统(含lacZ'基因)M13mp系列pUC系列酵母人工染色体
(yeastartificialchromosome,YAC)细菌人工染色体
(bacterialartificialchromosome,BAC)动物病毒DNA改造的载体(如腺病毒,腺病毒相关病毒,逆转录病毒)其他二、重组DNA技术基本原理基本原理目的基因的获取DNA导入受体菌外源基因与载体的连接克隆载体的选择和构建重组体的筛选克隆基因的表达
(一)目的基因的获取1.化学合成法要求:已知目的基因的核苷酸序列或其产物的氨基酸序列。2.基因组DNA文库(genomicDNAlibrary)3.cDNA文库(cDNAlibrary)4.聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)
(见第22章)*化学合成法获取目的基因由已知氨基酸序列推测可能的DNA序列组织或细胞染色体DNA基因片断克隆载体重组DNA分子含重组分子的转化菌限制性内切酶受体菌基因组DNA文库存在于转化细胞内由克隆载体所携带的所有基因组DNA的集合*从基因组DNA文库获取目的基因目录mRNAcDNA双链cDNA重组DNA分子cDNA文库反转录酶载体受体菌复制*从cDNA文库获取目的基因逆转录酶AAAA
TTTTAAAASI核酸酶
DNA聚合酶Ⅰ碱水解
TTTT目录(三)外源基因与载体的连接1.粘性末端连接方式:(1)同一限制酶切位点连接(2)不同限制酶切位点连接配伍末端连接(二)克隆载体的选择和构建BamHⅠ切割反应
GGATCCCCTAGGT4
DNA连接酶15ºCGATCCGGCCTAG+目的基因用BamHⅠ切割载体DNA用BamHⅠ切割重组体载体自连目的基因自连同一限制酶切位点连接BamHⅠBglⅡGGATCCCCTAGGAGATCTTCTAGAGCCTAGGATCCG++ATCTAG
GATCTA+目的基因用BamHⅠ切割载体DNA用BglⅡ切割GATCTAGATCTAGATGATCGATCTAGATCTAGATGATC不同限制酶切位点连接2.平端连接适用于:限制性内切酶切割产生的平端粘端补齐或切平形成的平端目的基因载体限制性内切酶限制性内切酶T4DNA连接酶15ºC重组体载体自连目的基因自连目录3.同聚物加尾连接在末端转移酶(terminaltransferase)的作用下,在DNA片段末端加上同聚物序列、制造出粘性末端,再进行粘端连接。5´3´3´5´载体DNA5´3´3´5´目的基因5´3´T(T)nT
T(T)nT3´5´5´3´A(A)nA
A(A)nA3´5´末端转移酶+dATP末端转移酶+dTTPT(T)nTA(A)nAA(A)nAT(T)nTT4
DNA连接酶15ºC重组体目录4.人工接头(linker)连接由平端加上新的酶切位点,再用限制酶切除产生粘性末端,而进行粘端连接。
人工接头及其应用CCGAATTCGGGCTTAAGC5´-3´-EcoRⅠEcoRⅠEcoRⅠEcoRⅠ目录受体菌条件安全宿主菌限制酶和重组酶缺陷处于感受态(competent)
导入方式转化(transformation)转染(transfection)
:感染(infection):以噬菌体为载体,在体外将噬菌体DNA包装成病毒颗粒,使其感染受体菌。(四)重组DNA导入受体菌(五)重组体的筛选
1.直接选择法(1)
抗药性标记选择(2)标志补救(markerrescue)(3)分子杂交法Southern印迹
2.免疫学方法如免疫化学方法及酶免检测分析等(插入失活法)抗药性标记选择目录BamHI组氨酸缺陷型大肠杆菌无组氨酸的培养基酵母咪唑甘油磷酸脱水酶基因促进组氨酸合成λDNA重组体标志补救目录α互补的检测目录Southern印迹重组DNA技术操作过程可形象归纳为小结分分离目的基因切限制酶切目的基因与载体接拼接重组体转转入受体菌筛筛选重组体重组DNA技术动画表达体系的建立表达载体的构建受体细胞的建立表达产物的分离纯化(六)克隆基因的表达1.原核表达体系(E.coli表达体系最为常用)标准:选择标志 强启动子翻译调控序列多接头克隆位点E.coli表达体系的不足
不宜表达真核基因组DNA不能加工表达的真核蛋白质表达的蛋白质常形成不溶性包涵体(inclusionbody)
很难表达大量可溶性蛋白E.coli优点:可表达克隆的cDNA及真核基因组DNA可适当修饰表达的蛋白质表达产物分区域积累缺点:操作技术难、费时、不经济2.真核表达体系
酵母、昆虫、哺乳类动物细胞家蚕(一)疾病基因的发现与克隆根据基因定位克隆之并研究其性质,而认识疾病的分子机制。三、重组技术与医学的关系(二)生物制药
重组DNA医药产品产品功能组织胞浆素原激活剂抗凝血液因子VIII促进凝血颗粒细胞-巨噬细胞集落剌激因子剌激白细胞生成促红细胞生成素剌激白细胞生成生长因子(bFGF,EGF)刺激细胞生长与分化生长素治疗侏儒症胰岛素治疗糖尿病干扰素(
1b,
2a,
2b,
)抗病毒感染及某些肿瘤白细胞介素激活、剌激各类白细胞超氧化物歧化酶抗组织损伤单克隆抗体利用其结合特异性进行诊断试验、肿瘤导向治疗乙肝疫苗(CHO,酵母)预防乙肝口服重组B亚单位菌体霍乱菌苗预防霍乱目录基因诊断(geneticdiagnosis)是利用分子生物学及分子遗传的技术和原理,在DNA水平分析、鉴定遗传疾病所涉及基因的置换、缺失或插入等突变。(三)基因诊断基本过程区分或鉴定DNA的异常分离、扩增待测的DNA片断基因治疗(genetherapy)是向有功能缺陷的细胞补充相应功能的基因,以纠正或补偿其基因的缺陷,从而达到治疗的目的。方式:体细胞基因治疗性细胞基因治疗(四)基因治疗1.产前诊断2.携带者测试3.症候前诊断4.遗传病易感性(五)遗传疾病的预防生物新闻10月11日我国科学家11日对外宣布,他们已经成功绘制完成第一个完整中国人基因组图谱(又称“炎黄一号”),这也是第一个亚洲人全基因序列图谱。专家表示,这项在基因组科学领域里程碑式的科学成果,对于中国乃至亚洲人的DNA、隐形疾病基因
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