【生物医学研究性课题报告：新型冠状病毒的基因组变异研究2000字】

生物医学研究性课题报告：新型冠状病毒的基因组变异研究目录TOC\o"1-2"\h\u21110生物医学研究性课题报告：新型冠状病毒的基因组变异研究 111493摘要 1245640引言 1225651实验 1292241.1材料与试剂 2144111.2实验仪器 255161.3实验方法 2271992结果与讨论 2298073结论 3摘要快速和准确的分子诊断是防治传染病和疫情的一个关键工具。随着新型冠状病毒（SARS-CoV-2）引起的肺炎患者的迅速增加和疫情的蔓延，SARS-CoV-2基因组测序和核酸检测的诊断试剂和方法应运而生，深度全基因组测序和RT-PCR是目前检测SARS-CoV-2的重要方法。然而，越来越多的冠状病毒（COVID-19）肺炎新病例的核酸检测结果为阴性，而影像学检查结果为阳性，因此有必要提高分子核酸诊断的效率和敏感性。关键词：新型冠状病毒；序列变异；比较基因组0引言2019年12月感染肺炎新型冠状病毒（COVID-19）对全球公众健康构成严重威胁，根据《中华人民共和国传染病防治法》，COVID-19属于乙类传染病，按甲类传染病管理。感染源主要是感染了SARS-CoV-2的人，但无症状的携带者也是一个感染源。临床数据表明，危重病人感染SARSCoV-2主要发生在老年人、糖尿病患者、高血压患者和有其他基础疾病的人身上，但也有因密切接触而感染的家族性病例。流行病学COVID-19在普通人群中具有普遍的易感性，潜伏期为1-14天，最常见的为3-7天。主要的临床症状是发热、乏力和干咳，危重病人会出现急性呼吸窘迫综合征、脓毒性休克和DIC，与感染SARS的病人类似。它已经引起了全世界的关注，许多国家已经采取积极措施防止该疾病的传播。在分子水平上对传染病进行快速和准确的诊断，以及对其起源机制的了解，是控制流行病的关键工具。1实验1.1材料与试剂新冠病毒基因重组蛋白S-RBD；标记用S-RBD蛋白；过氧化物酶新型冠状病毒中和抗体检测试剂盒（ELISA）；SM-3检测系统全自动酶标仪1.2实验仪器快检仪器和采样管1.3实验方法在这个研究组中使用了一种控制方法。根据分析，发现SARS-CoV-2与SARS和蝙蝠冠状病毒的关系最为密切。SARS与蝙蝠冠状病毒有共同的祖先序列，整个基因组的序列相似度很高。SARS-CoV-2基因组与蝙蝠冠状病毒全序列的同源性为87.99%，SARS-CoV-2基因组与SARS基因组全序列的同源性为79.5%。2结果与讨论NCBI公布了SARS-2全基因组序列，全长29.9kb。基因组结构和注释表明，SARS-2中有11个功能基因，3个与SARS-2同源，7个与蝙蝠冠状病毒同源，1个功能未知。在基因组中发现22个单核苷酸多态性位点。在SARS-2基因组22个SNP位点中，17个位于编码区，5个位于非编码区。对SARS-2的ORF3A和ORF8基因的单核苷酸多态性（SNP）位点进行了检测。基因组中未发现STR基因变异。基于SARS-CoV-2的标准参考序列，全基因组序列比对表明，这两个菌株都有缺失序列。第一个在序列的开头有15个碱基的删除，第二个删除序列结束时的11个碱基。在SARS-2病毒复制过程的基础上，有许多检测SARS-2病毒的技术或方法，如定量PCR、多重PCR、反转录等。许多实验室和企业已经根据这些原则研制出SARS-2诊断试剂。然而，目前还没有关于第三方评估不同工具包公司业绩的数据。目前还没有关于不同企业集团第三方绩效评价的数据。对假阴性结果的报告可以评估试剂盒的敏感性、特异性和性能。评价试剂盒的敏感性、特异性和准确性已成为当务之急。目的研究病毒RNA序列的多态性，设计一对基于全基因组序列的引物，包括病毒基因组序列。本研究的目的是设计一对包含RNA序列和基因组变异的全基因组序列引物。本研究的目的是设计一对包含RNA序列和基因组变异的全基因组序列引物，以鉴定SARS病毒，包括SARS-CoV2、SARS-CoV和SARS-Mars。所述引物对被设计用于将RNA序列中的变体包括在基因组中，所述RNA序列包括SARS-CoV、SARS-CoV和Mers。第三代纳米孔序列可以直接捕获RNA，检测SARS病毒基因组变异。无需RNAi，无需反转录和RNA扩增，可以直接检测病毒RNA中的SNPs。可以直接检测病毒RNA中的SNP位点，而无需逆转录和RNA扩增。因此，通过提高COVID-19患者样本中RNA亚型的可行性，可以为基于亚型的病毒鉴定和毒力分析建立一个基础。这将使基于亚型的病毒确认和毒株变异分析成为可能。3结论SARS-2已经在基因组测序和临床试验的基础上得到了广泛的研究，但目前仍缺乏准确、快速的检测技术，以及针对SARS-2的抗病毒药物和预防性疫苗。随着环境的变化，人类住区动物病原菌数量不断增加，从2011年到2018年，世界卫生组织在172个国家监测了1483起传染病爆发，新出现的不可预测的传染病仍在继续存在于此。从遗传学、基因组学、病毒学和进化生物学等方面理解SARS-2，追踪病毒传播的源头，根据基因组变异信息了解新的冠状病毒在动物、人类和环境中的传播为疫情的源头控制和预警提供有力的依据。将病毒的进化机制、基因变异、临床表型、医学影像学和分子病理学相结合，可将COVD-19患者的基因型与临床表型相结合。SARS-2亚型的临床表现和诊断标准，对有效防治传染病具有重要的指导意义。参考文献[1]白静.新冠病毒变异株的特点和防控[J].中国科技产业,2021(9):22-23.[2]徐莉,郭胜楠,郭占东,等.国外新型冠状病毒变异株疫苗研发与评价技术要求的比较与分析[J].中国生物制品学杂志,2021,34(9):5.[3]任胜勇,王兴伟,赵霞飞,等.德尔塔新冠病毒变异株的特点及防控对策[J].中华危重病急救医学,2021,33(9):4.[4]张珂,沈洁综述,胡丽华审校.新型冠状病毒变异株对新型冠状病毒疾病诊治及防疫的影