一株高效降解菜籽饼粕中硫苷的枯草芽孢杆菌基因组鉴定及功能分析_第1页
一株高效降解菜籽饼粕中硫苷的枯草芽孢杆菌基因组鉴定及功能分析_第2页
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文档简介

有较高含量的硫苷,对饲料的利用率较低,甚至会引起饲料中毒。因此,降解菜籽饼粕中的硫苷已成为一个热点问题。枯草芽孢杆菌是一种常见Materialsand4℃下保IlluminaHiSeqXTen高通量测序MetaGeneMark软件对其进行开放阅读框预测。同时,使用MorphologicalandPhylogeneticAnalyzer(MPA)对菌株进行形态学和遗KEGG数据库对该菌株进行基因注释和代谢通路预测,并利用BLAST工具对其基因组序列进行同源性比对。同时,通过反转录实时荧PCR(qRT-PCR)RNA杂交技术,对其特异性基因和23株枯草芽孢杆菌。通过基因测序BacillussubtilisCSBJ-1。依据MorphologicalandPhylogeneticAnalyzer(MPA)的分析结果,该菌株属于枯草芽孢杆菌属,菌株的线粒体基因为cox1、cox2和cob,核糖体RNA基因为16S、23S和5S。菌株基因组大小为4,720,057bp,GC含量为37.8%。clustlsCSBJ-1基因组进行生物信息学分析,发现该菌株含有多个与硫苷降解和营养转化有关的特异性基因和适应基因,例如硫abyB,NAntKqT-RNA杂交实验,发现此菌株在菜籽饼粕样品中表达了诸多适应性dlAfd等。进一步分析表明,BacillussubtilisCSBJ-1有着较高的硫苷降解能力,可以将菜籽饼粕Bacilluss

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