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文档简介
英文医学数据库检索1英文医学数据库检索12概述外文文摘数据库检索Medline与Pubmed,EMBASE,SciFinderScholar,BioSISPreviews,EngineeringVillage,Dialog外文全文数据库检索OVIDFullText,EBSCOhost,ElsevierSDOS,SpringLink,ProQuestMedicalLibrary,KluwerOnlineJournalsOCLCFirstSearch2概述外文文摘数据库检索3中南大学图书馆()
3中南大学图书馆()
4校园网外文数据库()
4校园网外文数据库()
5一、Medline概述1.书目数据库:NLM,最重要2.来源:5200+期刊(80+国家,(LSTRC),
)
90%英文,涉及医学各领域3.获取:印刷、联机、光盘、网络Medline与PubMed5一、Medline概述Medline与PubMed6印刷型检索工具n
IndexMedicus《医学索引》(IM)(CumulatedIndexMedicus,CIM)n
IndextoDentalLiteraturen
InternationalNursingIndex6印刷型检索工具n
IndexMedicus《医学索引7IndexMedicus图片7IndexMedicus图片8印刷型检索工具n
SubjectSection:主题词入手n
AuthorSection:作者入手n
BibliographyofMedicalReviews查找综述8印刷型检索工具n
SubjectSection:主题9联机检索
1964年开发MEDLARS,MEDLINE成为使用频率最高的数据库9联机检索
1964年开发MEDLARS,MEDLINE成为10光盘检索
1980s至今
SilverPlatterMedlineonCD(银盘)10光盘检索
1980s至今11光盘11光盘12二、PubMed概述(P.67)检索系统:
NCBI免费:检索:最强、查全率高12二、PubMed概述(P.67)检索系统:NCBI13主页PubMedcomprisesmorethan20millioncitationsforbiomedicalliteraturefromMEDLINE,lifesciencejournals,andonlinebooks.Citationsmayincludelinkstofull-textcontentfromPubMedCentralandpublisherwebsites
13主页PubMedcomprisesmorethan14获取全文214获取全文215PubMedCentral
(/pmc/)15PubMedCentral
(http://www.n16查找的文章提供两种格式16查找的文章提供两种格式17可在主页选择其他数据库检索17可在主页选择其他数据库检索181.Pubmed的文献来源MedlineIn-processcitationsPublisher-SuppliedCitations181.Pubmed的文献来源Medline19记录标识(1)[PubMed-inprocess]
[PubMed-assuppliedbypublisher]
[PubMed–indexedforMedline]
19记录标识(1)[PubMed-inprocess]202.PubMed记录的字段可供检索和显示的字段共60多个(表4-1-1)202.PubMed记录的字段可供检索和显示的字段共60多21MEDLINE格式21MEDLINE格式22TI-Lymphedemaaftertreatmentofbreastcancer.MH-AxillaMH-BreastNeoplasms/*surgeryMH-LymphNodeExcision/*adverseeffectsMH-Lymphedema/*epidemiologySO
-AmJSurg2004Jan;187(1):69-72.
MESH字段(MEDLINE格式)22TI-Lymphedemaaftertrea23《医学主题词表》(医学主题注释词顺表)(MedicalSubjectHeadings)(MESH表)23《医学主题词表》(医学主题注释词顺表)24MESH特性(优势):规范10例AIDS病人死亡因素分析1例艾滋病患者的诊断爱滋病患者常见之口腔表征治疗获得性免疫缺陷综合征病人的健康教育主题词:获得性免疫缺陷综合征24MESH特性(优势):规范10例AIDS病人死亡因素分析25MESH特性:
支持副主题词限定形式:MeSH词/
Qualifiers作用:限定;扩大词量举例:白血病的发病机制研究
白血病/病因学副主题词:83个25MESH特性:支持副主题词限定形式:MeSH词/Q26MESH特性:扩展检索功能MESH树状结构体系:主题词概念等级分类体系,它将MeSH表中的所有主题词,按照其词义范畴和学科属性,分门别类地归入15个大类,每个大类又逐级划分(主要类目见附录).每个主题词都在这种体系中至少有一个位置,用来描述这种位置的号码称为树状结构号。26MESH特性:扩展检索功能MESH树状结构体系:主题词概27MESH特性:两种形式自然语言顺序:心理学试验
倒装形式:心理学,临床心理学,比较心理学,教育心理学,实验心理学,医学27MESH特性:两种形式心理学,临床28三、检索途径与方法基本检索高级检索:AdvancedSearch其他:PubmedTools,PubmedResources28三、检索途径与方法基本检索29主页29主页30Q:遇到一个课题时,该选择何种检索方式?30Q:遇到一个课题时,该选择何种检索方式?31基本检索:检索方法(规则)不区分大小写逻辑组配检索
(1)NOT,AND,OR(2)不输入默认为AND
vitaminccommoncoldvitamincANDcommoncold31基本检索:检索方法(规则)不区分大小写vitamin32PMID-14706589TI-Lymphedemaaftertreatmentofbreastcancer.AU-OzaslanCLA-engPT-JournalArticleMH-AxillaMH-BreastNeoplasms/*surgeryMH-LymphNodeExcision/*adverseeffectsMH-Lymphedema/*epidemiologySO
-AmJSurg2004Jan;187(1):69-72.
格式:检索词[字段标识]Lymphedema[TI]1832篇OzaslanC[AU]11篇Axilla[MH]7073篇字段检索(教材P.86)32PMID-14706589TI-Lymphe33
举例(PUBMED):
检索式检出数量
BreastNeoplasms[MH]141536篇
BreastNeoplasms[MAJR]114513篇
灵活地扩大或缩小检索33
举例(PUBMED):灵活地扩大或缩小检索34检索举例查找入学前儿童的哮喘治疗的文献(综述文献/全文)child,preschool[mh]ANDasthma/therapy[mh]
5348篇(756篇/920篇)34检索举例查找入学前儿童的哮喘治疗的child,pres35检索结果child,preschool[mh]ANDasthma/therapy[mh]35检索结果child,preschool[mh]AN36获取全文136获取全文137获取全文237获取全文238日期检索格式:YYYY/MM/DD[datefield]2009/10/06[edat]2008[dp]2008:2010[dp]2009/01:2010/03[edat]38日期检索格式:YYYY/MM/DD[datefiel39词语检索自动词语匹配功能:输入未加任何限定的检索词时,系统依次进行匹配、转换和检索:MeSH转换表刊名转换表著者索引39词语检索自动词语匹配功能:输入未加任何限定的检索词时,系40livercancerANDgenetherapy2744篇
("liverneoplasms"[MeSHTerms]OR("liver"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"liverneoplasms"[AllFields]OR("liver"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"livercancer"[AllFields])AND
("genetherapy"[MeSHTerms]OR("gene"[AllFields]AND"therapy"[AllFields])OR"genetherapy"[AllFields])40livercancerANDgenetherap41精确短语检索使用引号“livercancer”6987篇livercancer146836篇41精确短语检索使用引号42截词检索:加*(截取前600个截词)
检索:Immun*Immun[AllFields]ORimmun21[AllFields]ORimmun68[AllFields]ORimmun70[AllFields]ORimmuna[AllFields]ORimmunabeled[AllFields]ORimmunablation[AllFields]ORimmunabsorbant[AllFields]ORimmunabsorbent[AllFields]ORimmunabsorption[AllFields]ORimmunabwehr[AllFields]ORimmunabwehrreaktionen[AllFields]……42截词检索:加*(截取前600个截词)
检索:Immun43Q:检索免疫方面的文献,用immun*检索文献多,还是immunology检索文献多Immun*341839篇Immunology
1115106篇43Q:检索免疫方面的文献,用immun*检索文献多,还是i44Immun*44Immun*454546著者检索姓在前用全称,名在后用首字母Smithj[au]14819篇
“smithJ”[au]2240篇(2002年起可以采用全称)46著者检索姓在前用全称,名在后用首字母47Q:如何查询著者Yang发表的论文?YangYin-Yang[mh]ORYang[TW]用:Yang[AU]
47Q:如何查询著者Yang发表的论文?48Q:利用基本检索时,如果要作一些限定,如何实现?(举例:检索“颅脑外伤对青少年及儿童生长激素的影响”)48Q:利用基本检索时,如果要作一些限定,如何实现?(举例:49利用limits49利用limits50limits时间文献类型研究类别子集文本选项语种性别年龄字段50limits时间文献类型研究类别子集文本选项语种性别年龄51craniocerebraltraumaANDgrowthhormone选择allchild:0-18years51craniocerebraltraumaAND选择a52检索结果52检索结果53高级检索SearchbuilderSearchhistoryMoreresoures53高级检索SearchbuilderSearchhis54其他JournalsDatabase(查询期刊信息并检索)MeSHDatabase(获取主题词信息并检索)
SingleCitationMatcher(从文献外表特征查找单篇或一组论文)BatchCitationMatcherClinicalQueries(临床文献查询)Topic-SpecificQueriesLinkout(外部链接)ClinicalTrials54其他JournalsDatabase(查询期刊信息并检55主页55主页56JournalsDatabase56JournalsDatabase57SingleCitationMatcher57SingleCitationMatcher58举例查找夏家辉教授发表在“NatGenet,1998;20(4):370-3”的关于神经性耳聋基因的论文及相关信息58举例查找夏家辉教授发表在“NatGenet,1998;59(1)输入已知条件59(1)输入已知条件60(2)显示结果Natgenet[ta]AND1998[dp]AND20[vi]AND4[is]AND370[pg]ANDxiaj[au]60(2)显示结果Natgenet[ta]AND199861BatchCitationMatcher61BatchCitationMatcher62ClinicalQueriesSearchbyClinicalStudyCategoryFindSystematicReviewsMedicalGeneticsSearches62ClinicalQueriesSearchbyCl63过滤检索结果63过滤检索结果64ClinicalQueries:ClinicalStudyCategories
按临床问题分类检索可以根据需要选择检索文献更多一些或更少一些64ClinicalQueries:ClinicalSt65Therapysensitive/broad((clinical[Title/Abstract]ANDtrial[Title/Abstract])ORclinicaltrials[MeSHTerms]ORclinicaltrial[PublicationType]ORrandom*[Title/Abstract]ORrandomallocation[MeSHTerms]ORtherapeuticuse[MeSHSubheading])specific/narrow(randomizedcontrolledtrial[PublicationType]OR(randomized[Title/Abstract]ANDcontrolled[Title/Abstract]ANDtrial[Title/Abstract]))65Therapysensitive/((clinical[66Topic-SpecificQueries:特定文献查询
Topic-SpecificQueries66Topic-SpecificQueries:特定文献676768MedlinePlus()68MedlinePlus(http://medlinepl69Topic:高血压69Topic:高血压70Topic:高血压70Topic:高血压71印刷版:MeSH表MeSH,SupplementtoIndexMedicus®MeSH-AnnotatedAlphabeticListMeSHTreeStructuresPermutedMeSH电子版(1)---单独
电子版(2)---检索系统/meshMeSHDatabase71印刷版:MeSH表MeSH,Supplementt72电子版(1)72电子版(1)73主题词信息73主题词信息74提供MESH主要系统PubMed:MeSHDatabaseCBMDisc:MESH词表特点:(1)提供MESH信息:含义,所能组配的副主题词信息,树状结构(2)提供MESH检索途径:选择MESH,副主题词,是否扩展或加权74提供MESH主要系统PubMed:MeSHDatab75MeSHDatabase75MeSHDatabase76树状结构表AllMeSHCategories
DiseasesCategory
HemicandLymphaticDiseases
HematologicDiseases
Anemia
Anemia,Aplastic
Anemia,Hypoplastic,Congenital
Anemia,Diamond-Blackfan
FanconiAnemia下位词上位词76树状结构表AllMeSHCategories下位词77Q:如何利用MeSHDatabase查询“颅脑外伤对青少年及儿童生长激素的影响”相关文献?77Q:如何利用MeSHDatabase查询“颅脑外伤对78选择SearchBoxwithAND78选择SearchBoxwithAND79进行检索79进行检索80C80C8181828283五、检索举例83五、检索举例84(1)
输入提问84(1)输入提问85检索结果:Summary85检索结果:Summary86Summary提供的信息:TI,AU,SO+链接(Relatedarticles+Fulltext)三个细节:Filteryourresults;FindrelatedData;Searchdetails86Summary提供的信息:TI,AU,SO+链接(R87RelatedArticles:获取相关文献87RelatedArticles:获取相关文献88SummaryDiabetes[ta]ANDxiangk[author]ANDsusceptibilitygenes[ti]88SummaryDiabetes[ta]ANDxian89如何转换显示格式?选择文献——Displaysettings直接点击文献标题89如何转换显示格式?选择文献——Displaysetti90Summary90Summary91(2)Displaysettings:Abstract91(2)Displaysettings:Abstrac92Abstract:MESH和Linkout92Abstract:MESH和Linkout93Abstract:全文链接+相关文献+引用+其他链接93Abstract:全文链接+相关文献+引用+其他链接94DisplaySettings:Abstract(text)94DisplaySettings:Abstract95Q:如何获取更详细的信息?95Q:如何获取更详细的信息?96DisplaySettings:MEDLINE格式96DisplaySettings:MEDLINE格式97(3)结果输出:sendto97(3)结果输出:sendto98(4)获取全文98(4)获取全文99PubMed检索相关问题Q1:如何显示系统转换后的详细检索策略?99PubMed检索相关问题Q1:如何显示系统转换后的详细检100Summary格式:searchdetails100Summary格式:searchdetails101高级检索:details101高级检索:details102Details:详细的检索策略("liverneoplasms"[MeSHTerms]OR("liver"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"liverneoplasms"[AllFields]OR("liver"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"livercancer"[AllFields])…….102Details:详细的检索策略("liverneop103Q2:如何一次检索多个数据库?103Q2:如何一次检索多个数据库?104选择:alldatabases104选择:alldatabases105统一检索界面105统一检索界面106NLMGateway(http:)106NLMGateway(http:gateway.nl107检索结果107检索结果108Q3:从我校医学图书馆检索PubMed有何差别?108Q3:从我校医学图书馆检索PubMed有何差别?109医学图书馆:pubmed109医学图书馆:pubmed110检索110检索111Q4:利用其他系统检索MEDLINE和PubMed检索MEDLINE有差别吗?111Q4:利用其他系统检索MEDLINE和PubMed检索112主要差别1.费用:
免费:PubMed,gateway收费:OVID、FirstSearch、WOK、EMBASE2.可检数据库3.检索界面112主要差别1.费用:113EMBASE主页113EMBASE主页1144.检索功能自动词语匹配(PubMed、Gateway、EMBASE)1144.检索功能自动词语匹配(PubMed、Gatewa1155.获取全文PubMedFirstsearchOVIDEMBASE1155.获取全文PubMed116Q:如何在PubMed中得到个性化服务?116Q:如何在PubMed中得到个性化服务?117117118MyNCBI118MyNCBI119如何一次检索多个数据库?119如何一次检索多个数据库?120选择:alldatabases120选择:alldatabases121统一检索界面121统一检索界面122NLMGateway122NLMGateway123检索结果123检索结果124医学图书馆:pubmed124医学图书馆:pubmed125检索125检索126MEDLINE网络检索1.费用:
免费:PubMed,gateway收费:OVID、FirstSearch、WOK、
EMBASE2.检索服务3.可检数据库4.检索界面126MEDLINE网络检索1.费用:1275.检索功能自动词语匹配(PubMed、Gateway、EMBASE)1275.检索功能自动词语匹配(PubMed、Gatewa1286.获取全文PubMedFirstsearchOVIDEMBASE1286.获取全文PubMed129六、如何有效地利用PubMed查找所需文献选择最准确的提问词选择最合适的检索功能调整检索策略129六、如何有效地利用PubMed查找所需文献选择最准确的1301.选择最准确的提问词例:如何查找IFN-γ的相关文献?
1301.选择最准确的提问词例:如何查找IFN-γ的相关文131#1IFN-γ43345篇(转换:IFN-gamma[AllFields])#2IFNγ45884篇(转换IFN[AllFields]ANDgamma[AllFields])#3IFNgamma45884篇#4Interferongamma60965篇#5#1OR#2OR#472006篇131#1IFN-γ43345篇132Interferongamma转换
"interferon-gamma"[MeSHTerms]OR"interferon-gamma"[AllFields]OR("interferon"[AllFields]AND"gamma"[AllFields])OR"interferongamma"[AllFields]132Interferongamma转换"interfe1332.选择最合适的检索功能例1:查找近两年多发性骨髓瘤(multiplemyeloma)的临床试验方面的英文文献(需全文)
1332.选择最合适的检索功能例1:查找近两年多发性134Limits134Limits135检索结果135检索结果136原拟检索式:madcowdiseaseepidemicstudy20条最合适的检索服务:MeshDatabase“Encephalopathy,BovineSpongiform/epidemiology”[MeSH]435条例2:疯牛病的流行病学研究136原拟检索式:例2:疯牛病的流行病学研究137(1)MESHDatabase输词137(1)MESHDatabase输词138(2)获取主题词138(2)获取主题词139(3)组配副主题词139(3)组配副主题词140(4)Sendto“SearchBoxwithAND”140(4)Sendto“SearchB141(5)searchPubmed141(5)searchPubmed142(6)获取结果142(6)获取结果143例3:多奈哌齐(Donepezil)治疗阿尔茨海默病(AlzheimerDisease)的预后和系统评价的文献143例3:多奈哌齐(Donepezil)治疗阿尔茨海默144ClinicalQueries144ClinicalQueries145prognosisSensitive/broad(incidence[MeSH:noexp]ORmortality[MeSHTerms]OR
followupstudies[MeSH:noexp]ORprognos*[TextWord]ORpredict*[TextWord]ORcourse*[TextWord])Specific/narrow(prognos*[Title/Abstract]OR(first[Title/Abstract]ANDepisode[Title/Abstract])ORcohort[Title/Abstract])145prognosisSensitive(incidenc146#1(DonepezilAlzheimerDisease)AND(Prognosis/Broad[filter])181篇#2(DonepezilAlzheimerDisease)AND(Prognosis/narrow[filter])45篇#3(DonepezilAlzheimerDisease)ANDPrognosis278篇#4#1or#2or#3407篇146#1(DonepezilAlzheimerDis147系统评价(DonepezilAlzheimerDisease)ANDsystematic[sb]147系统评价(DonepezilAlzheimerDi148
例4:性腺淋巴瘤与Fas、Fasl的关系
选择检索词
Sexglandlymphoma;OvarianlymphomaTesticularlymphoma;Fas;Fasl构成检索式----高级检索的History148
例4:性腺淋巴瘤与Fas、Fasl的关系
选择检索149History构建检索式149History构建检索式1503.调整检索策略检出文献过少—扩大检索检出文献过多—缩小检索1503.调整检索策略检出文献过少—扩大检索151扩大检索利用“自动转换检索词”特性增加相关词(增加OR组配面)减少AND组配面扩展检索采用截词151扩大检索利用“自动转换检索词”特性152截词检索举例Transplantation335805Transplant*355265Stemcelltransplantation43575Stemcelltransplant*16055stemcelltransplantation("stemcelltransplantation"[MeSHTerms]ORstemcelltransplantation[TextWord])152截词检索举例Transplantation153stemcelltransplant[AllFields]ORstemcelltransplantation[AllFields]ORstemcelltransplantation/classification[AllFields]OR…
…ORstemcelltransplantations[AllFields])ORstemcelltransplanted[AllFields])ORstemcelltransplants[AllFields])Stemcelltransplant*153stemcelltransplant[AllFi154例:白血病患者锌、铁、铜等微量元素的变化Leukemia[mh]ANDZinc[mh]ANDiron[mh]ANDcopper[MH]12篇Leukemia[mh]ANDZincANDironANDcopper
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