PubMed使用攻略培训课件

PubMed使用攻略PubMed使用攻略一、PubMed简介二、检索途径和方法三、检索结果处理四、其他辅助检索主要内容五、免费获取全文2PubMed使用攻略一、PubMed简介1.PubMed基本情况2.PubMed的由来3.PubMed的数据范围4.PubMed的特点5.PubMed主页3PubMed使用攻略一、PubMed简介1.PubMed基本情况PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息中心（NCBI）开发的一个以Web方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统，是继MEDLINE数据库国际联机检索和光盘检索之后推出的一种网络免费检索方式。4PubMed使用攻略

包括2,100多万篇来自MEDLINE和其他生命科学期刊的生物医学文献最早可回溯到1948年提供部分全文和其他相关资源的链接一、PubMed简介5PubMed使用攻略一、PubMed简介2.PubMed的由来

创刊:最早可以追溯到1879年美国NLM编译出版的医学文献检索刊物《医学索引》（IndexMedicus,IM）。6PubMed使用攻略1964年:为了实现IM的自动化编辑出版，NLM开发了“医学文献分析与检索系统”（MedicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystem,简称MEDLARS）.目前MEDLARS已拥有40多个数据库，其中最重要、最大、且发展最早的为MEDLINE(MEDLARS

ONLINE)

生物医学数据库

7PubMed使用攻略1971年:MEDLINE正式建成联机数据库，并通过MEDLARS开展国际联机检索服务。自MEDLINE投入联机检索服务以来，一直成为MEDLARS最大的使用频率最高的数据库。8PubMed使用攻略

1983年：随着光盘技术的发展，MEDLINE光盘数据库建成，并得到了广泛的应用。

1997年9月26日，MEDLINE网络版开通，取名PubMed，并向全球免费开放。

9PubMed使用攻略

很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间，却不愿花上几个小时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事，必先利其器"，PubMed就好像一把功能强大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹，更重要的是，你要知道如何利用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。一、PubMed简介10PubMed使用攻略一、PubMed简介出版商提供的书目信息

PreMedlineMEDLINE与NCBI其它数据库的链接3.PubMed的数据范围11PubMed使用攻略

3.1MEDLINE基本情况出版：美国国家医学图书馆（NationalLibraryofMedicine,NLM）。印刷版1879联机版1971光盘版1983网络版1997MEDLINE数据库简介12PubMed使用攻略MEDLINE数据库简介收录范围：收录7538种（2009.10.11）权威期刊，包含50种语言，涉及70多个国家（其中中国48种），约40万篇/年，已经累计2100余万篇。内容涉及生物医学各个领域；85%原文为英语。回溯年代：1948年至今每条记录标有[indexedforMEDLIEN]标记13PubMed使用攻略14PubMed使用攻略内容涵盖三种重要的纸本医学文献检索工具：

IndexMedicusIndextodentalLiteratureInternationalNursingIndex15PubMed使用攻略学科范围：基础生命科学 临床生命科学生物科学解剖学 组织学 化学与药物心理学 社会医学 农业医技设备学医技工业学 医学信息学使用词表：MeSH（医学主题词表）16PubMed使用攻略

3.2PreMEDLINE

是一种由正在加工处理中的文献记录组成的数据库，这些新记录还未被标引，暂时存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新，经过标引（增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段）以后转入Medline，一旦记录被转入到Medline数据库，就被从PreMEDLINE数据库中删除。每条记录标有[inProcess]标记。17PubMed使用攻略Pre-Medline最新信息MedlineNewDataCollectPubMedProcessPubMed一周以后18PubMed使用攻略（Publisher-SuppliedCitation）出版商直接向PubMed提供的非Medline收录的电子刊物，每条记录标有[assuppliedbypublishers]标记。（如：Science或Nature中的地质学文献等）。

3.3出版商提供的书目信息19PubMed使用攻略标记不同，其数据来源亦不同20PubMed使用攻略

3.4与NCBI其它数据库的链接Nucleotide：DNA序列数据库Protein：蛋白质序列数据库Genome：基因组序列数据库Structure：分子结构模型数据库OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库PMC:PubMed中心，免费全文期刊检索21PubMed使用攻略

与NCBI其它数据库的链接22PubMed使用攻略3.特点收录生物医学权威期刊最多世界上70多个国家的7000多种权威期刊多种检索方法，多条检索途径时效性极强(每周更新)回溯年代久远（1948年至今）利用MeSH作为转换词表，标引质量高部分文献可以免费获取全文检全率、检准率高BACKPubMed简介23PubMed使用攻略4、PubMed主页网址：http://www.24PubMed使用攻略25PubMed使用攻略高级检索简介基本检索26PubMed使用攻略

PubMed简介

PubMedcomprisesmorethan21millioncitationsforbiomedicalliteraturefromMEDLINE,lifesciencejournals,andonlinebooks.Citationsmayincludelinkstofull-textcontentfromPubMedCentralandpublisherwebsites.27PubMed使用攻略一、PubMed简介二、检索途径和方法三、检索结果处理四、其他辅助检索主要内容五、免费获取全文28PubMed使用攻略

1、基本检索

2、高级检索

3、主题词检索

二、检索途径和方法29PubMed使用攻略

1.基本检索MeSH转换表（词语检索及自动词语匹配）期刊转换表短语表作者姓名索引逻辑运算符检索30PubMed使用攻略31PubMed使用攻略

Pubmed基本检索实例

例一

“肝癌和肝炎的关系”

“livercancer”

和“hepatitis”第一步选择关键词输入检索框livercancerhepatitis32PubMed使用攻略1.基本检索检索前，选择需查询数据库。下拉菜单中显示Entrez系统提供的所有数据库，可任意选择进行检索。33PubMed使用攻略34PubMed使用攻略可看到该检索词下命中的所有文章、综述及免费全文35PubMed使用攻略

CombinedFunctionalGenomeSurveyofTherapeuticTargetsforHepatocellularCarcinoma.SatowR,ShitashigeM,KanaiY,TakeshitaF,OjimaH,JigamiT,HondaK,KosugeT,OchiyaT,HirohashiS,YamadaT.ClinCancerRes.2010Apr13.[Epubaheadofprint]PMID:20388846[PubMed-assuppliedbypublisher]Relatedcitations这条记录包含几个字段?36PubMed使用攻略文摘格式37PubMed使用攻略注意检索词的使用截词检索当检索词结尾不确定时,可用*替代精确检索用双引号“

”将要检索的多个词限定为一个词进行检索

看下面的例子!38PubMed使用攻略截词检索和字段限定检索例如：输入cell*[ti]可以查出标题中含cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等词的文献。39PubMed使用攻略“”将短语做为不可分割的整体进行检索。如：“oxygenfreeradicals”注意：“”必须为英文半角状态下输入40PubMed使用攻略

1、基本检索

2、高级检索

3、主题词检索

二、检索途径和方法41PubMed使用攻略2.高级检索42PubMed使用攻略高级检索界面下可进行多种检索条件的限定。同时可显示检索历史，允许使用检索史序号进行组配检索。43PubMed使用攻略检索框预览检索史限定检索30个字段可选择作者、刊名、出版日期等多个项目进行任意组合检索。如果输入框不够，可点击“AddMoreFields”添加44PubMed使用攻略限定检索字段限定检索45PubMed使用攻略高级检索—限定检索设定只搜索包含摘要、全文或免费全文的文献在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围内搜索只搜索某语种出版的文献或特定的文章类型只搜索PubMed数据库的某一子数据库只在某一特定的字段中搜索，缺省是所有字段46PubMed使用攻略

Eg.检索2002年以来发表在Nature杂志上关于糖尿病（diabetes）的英文文献，要求能获得免费全文限制检索案例47PubMed使用攻略检索框输入检索词对应字段名称填写期刊名称和时间范围限定只链接到可免费获取的全文48PubMed使用攻略限定语种为英文最后点击检索输入框后的Search49PubMed使用攻略13篇。大大减少了文献数量50PubMed使用攻略高级检索——检索史（SearchHistory）当至少运行一次检索后，即可使用History检索史中显示的是你前面所做的查询方案和查询结果（检索序号、检索式、检索时间和检索结果数量）

注:1、检索史中最多可保留100个检索式，超过100个时将自动删除最早的检索式。

2、系统在休止状态对检索式的保留时间为8小时，8小时后检索式自动消失。51PubMed使用攻略52PubMed使用攻略详细检索策略（Details）主要用于描述所输入检索式的详细检索过程，即系统将用户所输入的检索词自动转换为哪些词（如MeSH词等），并使用什么样的句法（检索规则）来进行检索。同时也包含了任何的错误信息。53PubMed使用攻略54PubMed使用攻略系统将输入的检索词与MeSH转换表进行对照,自动按照转换后的检索式进行组配和检索.55PubMed使用攻略

1、基本检索

2、高级检索

3、主题词检索

二、PubMed的检索途径和方法56PubMed使用攻略3、主题检索主题词检索

57PubMed使用攻略3、主题检索单篇/多篇引文匹配临床咨询专题咨询主题词检索期刊检索临床实验外部链接58PubMed使用攻略3、主题词检索（MeSHDatabase）主题词数据库（MeSHDatabase）在“MeSHDatabase”]检索提问框内输入检索词后系统将自动主题词表进行匹配检索，有的非主题词将转换为主题词，可浏览主题词的定义、浏览树状结构并进行选择，并能提供可供组配的副主题词进行检索，还提供是否只针对主要主题词检索及是否进行扩展检索等功能59PubMed使用攻略MeSHDatabase：例：从主题途径查找FK506副作用和肾移植的文献60PubMed使用攻略61PubMed使用攻略FK50662PubMed使用攻略主题词轮排提示相关词主题词轮排表63PubMed使用攻略主题词细节屏主题词词义注释主题词细节屏副主题词选择主题词词义注释不扩展检索加权检索64PubMed使用攻略曾用词药理作用树状结构曾用词入口词树状结构药理作用65PubMed使用攻略

选择发送方式SearchBoxwithANDSearchBoxwithORSearchBoxwithNOT

66PubMed使用攻略searchbox67PubMed使用攻略题录格式界面68PubMed使用攻略逻辑组配（#4and#6）69PubMed使用攻略70PubMed使用攻略一、PubMed简介二、检索途径和方法三、检索结果处理四、其他辅助检索主要内容五、免费获取全文71PubMed使用攻略三、检索结果处理

1、检索结果的显示与标记

2、检索结果的保存及定购

72PubMed使用攻略检索结果显示默认为题录格式每页显示20条记录结果显示格式每页显示记录数结果排序方式73PubMed使用攻略纯文本方式显示74PubMed使用攻略纯文本显示记录75PubMed使用攻略文摘显示格式76PubMed使用攻略MEDLINE格式77PubMed使用攻略可链接到SpringerLink数据库获取全文，但是是收费的可链接到PubMed中心获取免费全文

全文链接图标78PubMed使用攻略选择“File”，可完成将记录保存为文件；选择“clipboard”，可将记录保存在剪贴板；选择“E-mail”,可以通过邮件发送记录79PubMed使用攻略剪切板静止状态下最长保存8小时，最多可以保存500条记录80PubMed使用攻略以邮件方式发送记录填写邮箱地址81PubMed使用攻略一、PubMed简介二、检索途径和方法三、检索结果处理四、其他辅助检索主要内容五、免费获取全文82PubMed使用攻略四、其他辅助检索PubMedService期刊数据库(JournalDatabase)单篇引文匹配器（SingleCitationMatcher）多篇引文匹配器（BatchCitationMatcher）临床咨询（ClinicalQueries）我的NCBI（MyNCBI）83PubMed使用攻略JournalDatabase(期刊数据库)

84PubMed使用攻略JournalDatabase(期刊数据库)

JournalDatabase(期刊数据库)

可输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号（ISSN)检索特定期刊的编目信息；可通过linkstofull-textwebsites链接进入所有与PubMed建立链接的生物医学期刊列表；

85PubMed使用攻略检索：PubMed中收录关于高血压(hypertension)的期刊有哪些？86PubMed使用攻略单篇引文匹配器87PubMed使用攻略单篇引文匹配器输入刊名、日期、卷、期、页码、作者、题目中的一项或多项内容进行检索，系统返回文献记录结果88PubMed使用攻略单篇引文匹配器例：引文匹配器（SingleCitationMat