肿瘤登记软件使用介绍

肿瘤登记软件使用介绍主要内容全国肿瘤登记中心推荐使用国际癌症研究中心(IARC)/国际癌症登记协会(IACR)编制的两款软件：肿瘤登记软件CanReg4：用于登记资料的收集与简单分析肿瘤登记工具软件IARCcrgTools：用于编码的转换与数据审核软件的获得两个软件均可从如下网址下载：

http://.fr/iarccrgtools.htm肿瘤登记软件CanReg4使用需要授权，国际肿瘤登记协会（IARC）会员可以免费使用肿瘤登记工具软件（IARC/IACRCancerRegistriesTools)可以免费使用CanReg概述CanReg是由国际癌症研究中心描述流行病学室开发的肿瘤登记软件，目前第4版，即将推出第5版CanReg4是由AndyCooke、MaxParkin、JacquesFerlay等人开发的1.CanReg特点CanReg用于基于人群肿瘤登记的软件CanReg3最早在1996年发布，是DOS下使用的；CanReg4运行于Windows操作系统下目前全世界已经有100多个肿瘤登记处在使用CanReg软件CanReg特点CanReg4的解剖学部位及形态学编码使用国际疾病分类肿瘤学专辑第三版（ICD-O-3）CanReg4的数据录入模块中的检查程序，可以很方便的检查出不合格的、罕见的，以及重卡和多原发肿瘤病例记录简单易用的分析选项，包括按年的频数分析表、发病频数和发病率表等CanReg特点CanReg4可扩充登记项目和数据质量检查项目CanReg4目前已有：英语、法语、西班牙语、意大利语，阿拉伯语、泰国语和简体中文版等版本。各语言版本之间，可以方便地进行转换2.CanReg4主要模块数据录入数据分析数据管理

数据录入浏览/编辑记录字典导入数据分析频数分布（按年）发病率表导出/报告频数/表格Epi-Info6数据管理查看工作文件备份名字/性别检查（中文版不适用）重卡搜寻用户/密码选项CanReg4的安装一、软件的获得与使用授权CanReg4可以免费获得，IACR不定期的对软件进行更新，可从以下网址获得最新的版本:.fr/canreg4.htm使用CanReg4必须得到授权，需要有由IACR/IARC统一定义的、带有三位字符编码的系统备份文件，且每个登记处使用唯一的编码一、软件的获得与使用授权肿瘤登记处为国际肿瘤登记协会（IACR）成为会员,才可以获得免费CanReg4使用的授权全国肿瘤登记中心负责定义中国肿瘤登记处三位编码，并授权使用CanReg4全国肿瘤登记中心以团体会员的形式，加入了IACR，因此各登记处可以得到授权使用CanReg4

使用现有系统登录用户名ANDY密码

cookeCanReg4的功能介绍登陆CanReg4用户名：

andy密码：

cooke数据录入模块浏览/编辑记录字典导入浏览与编辑记录CanReg4的这个页面用于浏览和编辑数据库记录浏览记录：可利用筛选、排序和范围等工具，对已有记录进行查看。编辑记录：可建立新记录，或对原有记录进行编辑、修改。使用筛选工具利用筛选可以找出所需要的记录:性别=1（男性）年龄>=60性别=2和年龄<60名字=‘李*'诊断级别=7或诊断级别=5部位=‘50*’(全部的乳腺癌病例)日期='199904*'(1999年4月)Sex=1Age>=60Sex=2andAge<60Names=‘李*'Basi=7orBasi=5Topo='50*'Date='199904*‘利用快速筛选例如：选择60岁以上的女性，先点击….筛选工具右侧的“笑脸”按钮，然后选取

变量-"性别"

运算符-"="

值-“女性”(从字典中选择)"和"变量-"年龄"

运算符-">"

值-键入"60""完成"利用快速筛选例如：选择60岁以上的女性，先点击….筛选工具右侧的“笑脸”按钮，然后选取排序CanReg4一共有7条索引：

RegistryNo.:登记号/Updatedate:更新日期/MultiplePrimary:多原发肿瘤/发病日期/Incidencedate:发病日期/ICD-10:ICD-10/性别/Names:姓名/Pinyin:姓名拼音/使用排序/范围先将记录根据选定索引进行排序然后为已排序变量指定开始和结束范围例如:按发病日期排序,仅显示1991年和1992的记录:

索引=发病日期（IncidenceDate）开始=1991

结束=19929999导航按钮下页上页第一个记录最后一个记录显示变量点击变量“单选按钮”可以选择显示如下变量:

全部变量(Allvariables)

指定(强制性)变量(Mandatoryvariables)登记处定义为必须填写的项目关键变量(Keyvariables)姓名,年龄,发病日期,肿瘤部位等不可空缺的项目7.编辑记录使用右侧3个按钮可以编辑记录:建立新记录:

使用这个选项可建立一个新的空白记录表，当保存这个记录的时候，会自动赋予一个登记号编辑表中记录:这个选项可编辑在数据表中的被蓝色条标记的当前记录编辑记录号:在按这个按钮之前，先填写你想编辑的记录的登记号。如果记录已经存在，将打开这个记录进行编辑；如果不存在，则打开一个空白记录且将登记号赋予这个空白记录使用这个选项可重新设置登记号。8.刷新表格如果数据库中的记录数改变了，使用这个按钮可以刷新显示的列表新录入的数据不会马上显示，刷新之后会显示编辑页面组成“系统变量”面板数据录入“多原发肿瘤”面板

数据录入表数据录入表由4部分组成：病人信息肿瘤信息医院信息随访信息变量名称对于每个变量，有三个变量名：中文变量名LongVariablenames短的变量名ShortVariablenames英文变量名EnglishVariablenames例如：出生日期BirthdaBirthDate病人信息变量11个肿瘤信息变量11个theInternationalClassificationofChildhoodCancer(ICCC).国际儿童肿瘤分类医院信息变量4个

随访信息变量6个新病例控制变量8个数据录入

点“建立新记录”在数据录入过程中使用下列方法移动光标:-向上或向下键可移动到下一个或上一个变量;-"回车"键可到下个变量;-PgDown,PgUp键可移动到下一个,上一个组;-"Home,"End"键可移动到第一个,最后一个变量。

-键入“?”可看见字典弹出。使用鼠标，可以直接点击想编辑的变量，并可在弹出的字典框中去选择正确的编码。数据录入或修改后，必须完成以下步骤：录入检查当数据录入完成后执行各种的一致性检查。重卡检查搜寻任何的可能属于同一个病例的记录。记录状态改变记录状态是确认、挂起、或删除。保存/退出如果更改过记录内容，将出现一个红色的星号在”保存”按钮旁边。如果不保存，修改无效。“系统变量”面板检查状态：是否做过，结果是什么。重卡检查：是否做过，结果是什么。记录状态：在成功的完成“检查”和“重卡搜寻”程序以前，所有新的记录都被设置成“未确定的”。只有被“确认”的病例记录才可用于本软件的分析。保存/退出：保存或不保存退出。更新日期：方框显示的是这条记录最后的编辑日期检查内容编辑检查地方检查（LocalChecks）各登记处自定义项目的检查强制性变量检查（MandatoryVariables）登记处规定必须填写的变量检查名和性别（中文版不适用）交叉检查（Cross-Checks）检查项目发病日期检查出生日期检查年龄检查死亡日期检查性别检查部位检查形态学检查行为检查分期检查诊断级别检查发病日期/出生日期年龄=发病-出生发病日期/死亡日期部位/形态形态/行为性别/部位性别/形态年龄/部位年龄/形态年龄/部位/形态部位/行为重卡检查搜寻可能属于同一个病例的记录，既查重在查重过程中使用如下有关的变量：日期出生、居住地址、身份证号码、姓名、拼音等，每个变量的权重不同如果没有发现匹配的记录,系统将会出一个提示信息。IARC有关多原发肿瘤的定义识别存在着两个或两个以上的原发肿瘤不取决于时间。一个原发肿瘤是一个起源于一个原发部位或组织的肿瘤。因此既不是扩散也不是复发和转移。某一发生在一个或多个器官或组织（由ICD-O解剖学所限定的）肿瘤，除组织学不同外应认识是单一肿瘤。字典CanReg4允许登记处编辑字典内容，并可添加或删除代码；编辑字典代码注意事项及步骤：确定没有用户在使用输出字典到文本文件根据需要对文本文件进行编辑输入文本文件到字典CanReg4中文版共有字典18个1.Recordstatus记录状态10.Grade分级2.Checkstatus检查状态11.Tribe民族3.Personsearch人工搜索12.Maritalstatus婚姻状况4.Topography解剖学部位13.Status最后接触状态5.Morphology形态14.CauseDeath死亡原因6.Behaviour行为15.Address地址代码7.Sex性别16.Doctors医师8.BasisDiagnosis诊断依据17.PlaceofDeath死亡地点9.Hospital医院18.Occupation职业CanReg4中文版共有字典18个1.Recordstatus记录状态10.Grade分级2.Checkstatus检查状态11.Tribe民族3.Personsearch人工搜索12.Maritalstatus婚姻状况4.Topography解剖学部位13.Status最后接触状态5.Morphology形态14.CauseDeath死亡原因6.Behaviour行为15.Address地址代码7.Sex性别16.Doctors医师8.BasisDiagnosis诊断依据17.PlaceofDeath死亡地点9.Hospital医院18.Occupation职业新病例控制部分字典3个1.Recordstatus记录状态10.Grade分级2.Checkstatus检查状态11.Tribe民族3.Personsearch人工搜索12.Maritalstatus婚姻状况4.Topography解剖学部位13.Status最后接触状态5.Morphology形态14.CauseDeath死亡原因6.Behaviour行为15.Address地址代码7.Sex性别16.Doctors医师8.BasisDiagnosis诊断依据17.PlaceofDeath死亡地点9.Hospital医院18.Occupation职业病人信息部分字典5个Sex 性别Tribe 民族Maritalstatus 婚姻状况Occupation 职业Address 地址代码肿瘤信息部分字典5个1.Recordstatus记录状态10.Grade分级2.Checkstatus检查状态11.Tribe民族3.Personsearch人工搜索12.Maritalstatus婚姻状况4.Topography解剖学部位13.Status最后接触状态5.Morphology形态14.CauseDeath死亡原因6.Behaviour行为15.Address地址代码7.Sex性别16.Doctors医师8.BasisDiagnosis诊断依据17.PlaceofDeath死亡地点9.Hospital医院18.Occupation职业医院信息部分字典2个Hospital 医院Doctors 医师随访信息部分字典3个Status 最后接触状态CauseDeath 死亡原因PlaceofDeath 死亡地点

软件安装完毕后

需要根据实际情况修改字典修改字典修改字典点击数据录入点击字典修改字典点击：输出字典到文本文件找到

#9-------------<Hospital#15-----------<Addcode#16------------<Doctors修改这三个地方的字典修改字典

#9---------------<Hospital

报告医院#15------------<Addcode地区代码#16---------------<Doctors报告医师根据实际情况修改这三个地方的字典注意：其他字典内容请勿修改修改字典#15-<Addcode地区代码增加“区”代码和“街道”的代码。请注意，区的代码4位，街道的代码6位，且区的前四位代码和街道的前四位代码应该相同，否则区和街道不能对应。相应的，区可以改为”县”,街道可以改为乡镇的代码，这样方便农村登记地修改完毕之后请点击输入来自文本的字典否则修改的字典不保存修改字典点击OK后关闭字典即修改成功修改字典#15-<Addcode地区代码在字典中定义之后，录入软件中用到地区代码的地方，需要定义“区”代码和“街道”的代码，且区代码的4位数和街道代码应该对应

修改字典#9-<Hospital#16--<Doctors在字典中定义之后，录入软件中用到报告医师和报告医院的地方，这可以根据实际情况进行修改数据导入如果多台电脑录入，则存在数据录入后合并的问题导入外部数据文件中的记录可通过导入添加到CanReg4数据库中外部数据文件必须是文本格式，并以下列格式分隔字段：Tab键、逗号或竖线|数据文件每栏（列）的顶端最好有变量名，并且与CanReg4定义的变量名一致导入步骤主要有以下4步：选择文件识别变量选择不同选项导入文件导入时的不同选项有差异时最大行数CanReg4数据有差异时差异是指当导入时发现在同一个数据库中相同的登记号的记录有差异当一些数据有差异时，选择:

拒绝：数据将不会被输入更新：所有新的数据将会覆盖数据库记录重写：所有变量将会被覆盖,包括空项最大行数/仅测试为了能成功导入数据，可先进行导入测试，“最大行数”可用于指定先导入的记录数当“仅测试”被勾定时，数据实际上没有被导入到数据库中；只生成一个报告去展现将要发生的导入结果。（需要真正导入时，要把这个勾去掉）CanReg数据运行检查如果导入的数据不是由CanReg4建立的，或者是一个未确定的病例,则必须运行检查程序如果新导入病例已经通过检查,则可去除这个选项的勾定，检查程序将不会运行运行重卡搜索在导入CanReg4数据时，即使已经做过重卡搜索，查重仍需要运行如果这个选择项不被勾定，则查重不会运行有疑问的名字（中文版不适用）四、数据分析

数据分析模块的介绍频数分布（按年）发病率表导出/报告频数/表格Epi-Info6四、数据分析

数据分析模块简介频数分布(按年)建立文本文件，显示按年各选定变量的病例频数分布建立的文本文件自动保存在下列文件夹中：

\CR4SHARE\CANREG4\CR4-WORK\使用“数据管理”中的“查看工作文件”选项，可查看文件频数分布(按年)默认产生以下3个文件：

-性别/记录状况

-月

-ICD-10组其他变量的频数分布，可从“选择变量”的滚动条中选择。对具有复合字典的变量，可选择是对其分类还是对全部字典编码进行病例计数发病率表计算发病率，需要知道人口数（分母）。因此需要建立“人口数据集”（P.D.S.)“人口数据集”由以下部分组成：人口数据，按性别和年龄分组数据来源(例如：人口普查或人口估算)该人口数据所对应的时间“筛选器”或选择标准，选择对应于该人口的发病记录(分子）

“人口数据集”P.D.S.有两个选项：使用一个已经存在的人口数据集P.D.S.建立一个新的人口数据集P.D.S.计算发病率时，须定义一个计算发病率的时间段“年龄标化率”用于比较不同地区人群的发病率，通常使用“世界标准人口”，也可改为“中国标准人口”（如2000年普查人口）等导出/报告导出全部或部分CanReg4数据库记录到一个外部文件有两个主要的作用：将数据文件转入到另一个程序如“EXCEL”或“ACCESS”

，以便做进一步分析。产生一个报告或一个病例清单，以便能在“WORD”等文件中浏览并打印。导出/报告的步骤：

选择想导出的记录：可使用筛选、排序/范围工具选择想导出的变量：选择标题或变量名：标题、变量名选项导出文件的格式：一般都生成文本文件，默认扩展名为“.TXT”，若指定为“逗号”的文件其扩展名为：“.CSV”“Tab键”

-将每个变量以TAB符（制表符）分割“逗号”

-“逗号分割变量”将每个变量用引号括起来，后用逗号分开“固定的宽度，无空格”

-根据变量的最大宽度，在其结尾填补空格“固定的宽度+1空格”

-与上同,但各栏间有一个空格，更易于浏览“固定的宽度+2空格”

-如上,但各栏间有两个空格“EpiInfo6”

-可将文件存成扩展名为“.REC”的Epi-Info6的文件格式频数/表格-频数从Excel（或一个文本文件）中剪切一列数据，然后粘贴到A栏点击“频数A”产生这列数据的频数分布选择“从最多的开始”把从原先以字母排序的显示转为以频数由多到少排序用相同的方法可对B栏也产生频数分布频数/表格-表格剪切并粘贴数据到A栏把数据库中相同的记录的第二栏数据粘贴到B栏点击“表格AxB”

产生以A为行、B为列的交叉表格点击“表格BxA”

产生以B为行、A为列的交叉表格点击“短标题”按钮截取列的标题频数/表格-一般情况如果列的第一行包含了标量名称，选择“变量名在第一行”可将结果剪切并粘贴回Excel对数据进行作图点击“清除”按钮清除所有格子中的数据通过调整视窗的大小改变格子的大小五、CanReg4数据管理

数据管理模块查看工作文件备份名字/性别检查（中文版不适用）重卡搜寻用户/密码选项查看工作文件工作文件存放的默认文件夹：\CR4SHARE\CANREG4\CR4-WORK\可以打开的最大文件个数：10备份备份程序将压缩并加密所有的数据,且复制字典、人口数据以及登记处CanReg4系统定义等。可复制备份到软盘、光盘、移动磁盘等计算机以外的地方。默认的备份文件存放的文件夹：\CR4SHARE\CANREG4\CR4-BACK\备份文件备份文件至少有三个：Cr4-xxx.db(字典等)Cr4-xxx.mb0,Cr4-xxx.mb1….(记录数据库)Cr4-xxx.ob(登记处定义等)以上数据文件全部为加密后的文件。注：“xxx”为登记处编码重卡搜寻本选项可以查找数据库记录中可能的重卡和多原发肿瘤卡。用于查重的变量及所占权重：姓名:20

姓名拼音:12

省（市、区、县）:6

身份证号:20

出生日期:9默认的最小匹配量为：65%运行重卡搜索可改变最小匹配量可根据登记号选择搜索范围显示多原发肿瘤一对卡选项：将在报告中显示多原发肿瘤病例记录仅检验以前的病例选项：仅检查早先的病例用户/密码可以改变用户密码可以为数据库添加密码可以增加和删除用户可以管理网络用户用户管理这个选项允许管理员管理程序的其它用户每个使用者有自己的登录名字、密码和权限管理员：可以使用全部选项的权限登记员：除确定罕见的病例或可能的重卡外，可以完成大多数的数据录入。没有改变字典和用户管理权限分析员：不能对数据库做任何改变。仅能使用浏览或分析选项选项选择程序语言选择屏幕显示字体大小小结----常用功能或反馈问题软件安装字典修改登记号修改录入信息删除记录备份数据恢复数据导出数据合并（导入）核查病例修改个案

格式（txt、excel）网络版问题

审核软件的使用(IARCcrgTools)肿瘤登记资料审核的主要流程不合格不合格合格肿瘤登记处全国肿瘤登记中心

《中国肿瘤登记年报》生成报表结果的分析、评价IARCcrgTools审核IARCCHECK程序IARCCHECK程序最早是为了审核《五大洲发病率》第六卷数据，由Dr.Parkin等人编写的先前的版本对解剖学部位和形态学编码的审核是基于ICD-O-1和ICD-O-2，当前版本是基于ICCD-O-3.fr/iarccrgtools.htm

目前最新版本为2.05:iarccrgtools_205.zip，下载压缩文件后解压，点击setup安装软件的下载软件的安装运行开始运行点击安装注意：ICD-10不能直接转成ICD-O-3，需通过中间编码ICD-O-2转换即：ICD10=>ICD-O-2=>ICD-O-3Check审核：一是检查变量是否完整并在编码范围内的有效性检查；二是对不同变量之间是否合乎逻辑的一致性进行检查；Check程序—变量的一致性审核Age/Incidenceandbirthdates年龄/出生日期与发病日期Age/Site/Histology(ICD-O-3)年龄/部位/组织学Site/Histology(ICD-O-3)部位/组织学Sex/Site性别/部位Check

程序—变量的一致性审核Sex/Histology(ICD-O-3)性别/组织学Behaviour/Site(ICD-O-3)行为/部位Behaviour/Histology(ICD-O-3)行为/组织学Grade/Histology(ICD-O-3)分级/组织学Basisofdiagnosis/Histology(ICD-O-3)诊断依据/组织学变量的一致性审核发病/出生日期：发病日期>出生日期年龄/发病/出生日期：年龄=发病日期-出生日期在Excel中用公式：=DATEDIF(出生日期,发病日期,“Y”)计算年龄一致性审核:年龄/部位/组织学在一般情况下，某些肿瘤的部位和形态学，在某些特定年龄中是非常罕见的年龄在15岁以下的不太可能出现的肿瘤： 肿瘤诊断 不太可能出现的年龄Hodgkinlymphoma（霍其金淋巴瘤） 0-2Neuroblastoma（神经细胞瘤） 10-14Retinoblastoma（视网膜母细胞瘤） 6-14Wilms’tumour（维尔姆斯瘤） 9-14Renalcarcinoma（肾癌） 0-8Hepatoblastoma（肝母细胞瘤） 6-14

一致性审核:部位/组织学部位/组织学通过两种方式进行审核：一是通过审核某些形态学编码仅用于特定部位的肿瘤编码，如：8170/3肝细胞癌（C22.0)，8586/3胸腺癌（C37.9)二是通过审核“不常见的”或“不可能的”部位与形态学编码组合一致性审核:性别/部位男性，不应出现如下部位的肿瘤：C51._(外阴),C52._(阴道),C53._(宫颈),C54._(宫体),C55._(子宫),C56._(卵巢),C57._(其它和未特指的女性生殖器官),C58._(胎盘)女性，不应出现如下部位的肿瘤：C60._(阴茎),C61._(前列腺),C62._(睾丸),C63._( 其它和未特指的男性生殖器官),Check

程序—变量的有效性审核日期变量：格式2000-01-12或2007/01/09发病年龄：必须是数字格式，不大于105岁；如果出生日期和发病日期完整，年龄可以通过计算获得；如果出生日期不详，则年龄字段必须是空白或是999（年龄不详）性别：必须是有效编码，如1、2或9(不详)Check

程序—变量的有效性审核解剖学部位编码：必须是有效的ICD-O-3编码,如气管编码为C33,或C33.9,不能编码为C33.0、C33.8 形态学编码：必须是有效的ICD-O-3编码，如没有8006/3这个编码行为编码：必须是0,1,2,3(或特殊编码6或9) 分级编码：必须是有效的ICD-O-3编码IARC/IACRCancerRegistriesTools使用对数据格式的要求数据库文件必须以文本格式存放,变量以间固定格式分隔每一病例用一行,要求必须包括以下变量:(1)登记号； (2)性别；(3)年龄； (4)出生日期；(5)发病日期； (6)解剖学部位编码(ICD-O-3)(7)组织学编码(ICD-O-3)；(8)肿瘤行为编码(ICD-O-3)；(9)肿瘤分级编码(ICD-O-3)；(10)诊断依据编码；数据格式20070100127519321022200704052007072270C20C209801039C20980103920070100214419630911200702052007081120C22.9C220800039C22080003920070100316819380413200701062007070820C34.9C349800039C34980003920070100424919590530200710022008052570C66C669801039C66980103920070100526919380714200707232008020520C20C209800039C20980003920070100618019261025200705092008012420C34.0C340800039C34080003920070100715919431003200704102007052120C22.9C220800039C22080003920070100827819241125200701222007080520C22.9C220800039C22080003920070100918319191119200705062007080720C16.9C169800039C16980003920070101017219310209200710052009081870C22.9C220801039C22080103920070101928419180511200702252008020870C53.9C539807039C53980703920070102017419290116200708192008041970C16.1C161801039C161801039…Filespecification:1-9YearandID 11-11Sex 13-15Age17-24Dateofbirth 26-33Dateofdiagnosis 35-42Dateofdeath44-44Basis 46-46DCO 48-52ICD-1054-57ICD-O2 59-62ICD-O2-morphology 64-65ICD-O2Behaviorandgrade67-70ICD-O3 72-75ICD-O3-morphology 77-78ICD-O3Behaviorandgrade使用crgTools——格式转换当审核格式使用txt格式时，可能出现这样提示使用crgTools——格式转换打开IARCcrgTools—Tools—FileTransfer点击InputFile栏下的Browse…按钮，选取Input文件

在OutputFile栏中键入输出文件名下一步使用crgTools——格式转换选中全部变量完成使用crgTools——编码转换打开IARCcrgTools—Conversions—ICD-0-3->ICD10点击Inpu