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肺癌中PVT1的表达及调控机制
ExpressionandregulationmechanismofPVT1inlungcancer报告人:何山川篇名摘要背景实验总结个人观点背景肺癌是常见的恶性肿瘤之一,2017年美国癌症协会资料统计,肺癌在所有新发恶性肿瘤中发生率排第二位,死亡率排第一位。对人们的生命健康是一种巨大的威胁。肺癌的发生因素是多方面的,主要包括易感基因的遗传、环境污染以及吸烟饮食等生活方式等。手术、化疗和放疗为现阶段肺癌的主要治疗方法,但对肺癌患者机体本身存在较大的杀伤性。分子靶向治疗已经被证明具有高效性’高度选择性等优良特点,但由于缺乏可靠靶点在临床运用中并不广泛,因此寻找肺癌治疗的新靶点对于分子靶向治疗十分重要。背景LncRNA(Longnon-codingRNA)是人体内一大类复杂的RNA分子,其长度大于200nt,不编码任何蛋白质。早期的研究认为lncRNA属于“噪声”,现有许多研究表明,lncRNA可通过多种机制在转录水平以及转录后水平调控细胞生命活动,而且与多种癌症的发生发展有密切关系,这为肺癌的诊断和治疗提供新的理论依据。lncRNA定义:
长度在200-100000nt之间的RNA分子不编码蛋白
lncRNA参与细胞内多种过程调控种类、数量、功能都不明确分类:lncRNA功能背景PVT1(Plasmacytomavarianttranslocation1)是一段长度为1957nt重要lncRNA分子,目前已有较多研究证实PVT1在癌症的发生过程中充当促癌因子,PVT1在乳腺癌、卵巢癌及宫颈癌等许多癌症细胞中都呈现高表达趋势,因频繁出现变异位点导致原癌基因的激活,与肿瘤发展密切相关。MTT法检测分析得出结论,PVT1可增强乳腺癌细胞的增殖能力,干扰PVT1后可使乳腺癌细胞的增殖和侵袭能力均下降,因此PVT1可以作为一种新型分子标记物。目前关于PVT1影响肿瘤发生的作用机制研究侧重PVT1与其邻居基因MYC的互相影响,加上其自身能编码miRNA,PVT1与其编码的miRNA(如miR-1204、miR-1207)也是当前研究的热点。Yang等发现,PVT1在非小细胞肺癌组织中的表达明显高于邻近的正常组织和正常支气管上皮细胞,但PVT1具体如何调控肺癌的发生发展,其如何促进肺癌肿瘤的恶化,在肺癌中与哪些基因进行相互作用,其内源竞争ceRNA(CompetingendogenousRNAs)作用机制是否在肺癌中扮演重要角色,这些都尚未可知。因此,深入的研究PVT1在肺癌中的调控机制具有重要意义,且根据调控机制可能获得潜在的诊断或预后指标及基因治疗的靶点。目的本文通过TCGA数据库筛选出差异表达显著lncRNA,以PVT1为研究对象,分析其在肺癌中分子调控机制,探讨PVT1与miRNAs、mRNAs以及蛋白质之间的关系,为更深层次地研究肺癌发生发展中分子调控机制提供数据支撑和理论参考。方法收集肺癌患者组织样本TCGA数据库筛选肺癌中差异表达的lncRNA实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测肺癌组织中lncRNA的表达水平利用软件和数据库分析和预测PVT1在肺癌lncRNA-miRNA-mRNA中可能的相互作用网络结果和分析收集到来自浙江省肿瘤医院的单原发性肺腺癌组织及癌旁组织(共7例)同时实验开展过程中收集到1例肺部陈旧性病灶患者与1例健康血浆样本样本质量分析显示样本RNA的提取质量与完整性符合后续qRT-PCR实验要求结果和分析结果和分析结果和分析qRT-PCR结果显示:肺癌患者相比肺部陈旧性病灶患者EXOC3-AS1、PVT1表达出现了明显差异结果和分析软件分析预测出PVT1在肺癌中lncRNA-miRNA-mRNA的相互作用网络结果和分析为更进一步了解PVT1在肺癌发生发展中的影响,利用分析工具对所预测的靶mRNAs可能参与的生物学功能进行富集分析,富集结果如图6,其中富集相关性与颜色深浅成正比,由生物学过程到细胞过程相关性越来越强。深色较集中在细胞信号的传递以及黏附作用过程中。结果表明mRNAs靶基因PCDHA家族基因以及NOVA1等高度富集到细胞与胞间信号传递、细胞间黏附作用和系统的发育过程等生物学进程,与癌症相通路相关。讨论PVT1在恶性肿瘤调控机制中可能发挥的作用:讨论PVT1在恶性肿瘤调控机制中可能发挥的作用:讨论局限但本研究存在一些不足:1.样本数量较少,实验结果存在一定局限性。2.主要是对肺腺癌患者进行的研究3.PVT1预测的互作因子在细胞中能否相互作用,可否直接影响肿瘤细胞的增殖迁移,还需要进一步深入实验和探讨。个人观点在前期研究发现,PVT1作为lncRNA(以RNA形式发挥作用)发挥促癌功能Cell报道:lncRNA
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