硕士开题报告 生物学公开课一等奖课件省课获奖课件

开题报告指导老师：谭钟扬专家学生：吴晓龙2023第1页研究课题：

简单反复序列在疱疹病毒基因组中分布及其对基因组进化影响第2页报告内容简单反复序列介绍研究内容已完成工作下一步展望第3页一、简单反复序列4第4页

SSRs5简单反复序列(SimpleSequenceRepeats，SSRs)也称微卫星序列(Microsatellites)或短串联反复序列(ShortTandemRepeats，STRs)，是由1-6个碱基对组成串联反复DNA片段。SSRs在真核和原核生物基因组中分布广泛、数量丰富,并具有较高突变频率。

如:(A)n、(ACG)n、(ATCG)n、(ACCCTT)n

第5页ImportantcharacteristicsofSSRs6第6页

SSRs突变机制

SSRs普遍存在于基因序列中，且曾经一度被以为是基因中“junk”，不具有生物功能。然而，伴随近几十年研究发觉，简单反复序列在序列中分布不是随机，且有主要生物功能。同步发觉许多神经方面疾病发生与简单反复序列突变有关，但对于简单反复序列在序列中突变机制，研究者们还不是很清楚。在近来几十年中，伴随对简单反复序列结识不停深入，研究者提出了下列多种主要用于揭示SSRs突变机制假设：1、滑动突变机制;2、重组机制；3、不对等交换机制；3、逆转录机制；。在这四种突变理论中，滑动突变理论被以为是简单反复序列突变最主要机制。7第7页ReplicationslippageEllegrenH.2023.Microsatellites:simplesequenceswithcomplexevolution.NATREVGENET.5:435-445.8第8页RecombinationGemayel,R.,Vinces,M.,Legendre,M.,Verstrepen,J.2023.VariableTandemRepeatsAccelerateEvolutionofCodingandRegulatorySequences.Annu.Rev.Genet.44:445–77.第9页ThedistributionofSSRsinagene10第10页ThefunctionofSSRsLi,Y.,Korol,A.B.,Fahima,T.,Nevo,E.2023.MicrosatellitesWithinGenes:Structure,Function,andEvolution.Mol.Biol.Evol.21,991–1007.11第11页TherelationshipbetweenSSRsandhumandisease12第12页第13页SSRs作用常用一种分子标识。在多数情况下，微卫星标识没有任何表型效应，因而不存在对个体有害或次级效应。

遗传图谱构建。微卫星标识还可应用于疾病基因诊断、性别控制、保护遗传学等方面。相信伴随人们对微卫星标识结识不停深入与完善，它必将成为遗传育种研究领域一种强有力工具,发挥其独特优势。第14页一、背景介绍及选材OrderFamilySubfamily

SpeciesHerpesviralesAlloherpesviridae

7/12HerpesviridaeAlphaherpesvirinae22/37Betaherpesvirinae14/18Gammaherpesvirinae12/32Malacoherpesviridae

1/2第15页形态学特性G：genome或core，是一条线状双链DNA。C：capsid，衣壳是病毒粒主要支架构造和抗原成份，有保护核酸等作用。T：tegument，内膜是出目前疱疹病毒衣壳和包膜之间无特定形态蛋白质。E：envelope，关键壳外还被一层含蛋白质或糖蛋白类脂双层膜覆盖着，这层膜称为包膜。包膜中类脂来自宿主细胞膜。与该病毒宿主专一性和侵入等功能有关。第16页基因组基因组大小：

125~295kbp.G+C含量：32~75%.由于基因组中存在很多反复序列（正向反复、反向反复，存在于基因组末端或中间）

，因而有很多不一样基因组构造。

第17页第18页在疱疹病毒科里，大约有40个编码蛋白基因是保守，他们存在6个基因区。这6个保守基因区在不一样亚科中有不一样次序和方向。保守基因一般编码：capsidproteins,componentsoftheDNAreplicationandpackagingmachinery,nucleotidemodifyingenzymes,