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肠杆菌种属鉴定靶点的选择江苏嘉语生物医药技术股份有限公司陈颖曦肠杆菌种属鉴定靶点的选择1内容简介肠杆菌简介肠杆菌检测常用靶点比对种属缩写与比对菌株数特异性靶点的选择及序列比对文献内容简介2肠杆菌属简介肠杆菌属拉丁学名(EnterobacterHormaecheandEdwards,1960)直杆状,宽0.6~10μm×12~3.0μm,符合肠杆菌科的一般定义。革兰氏阴性,周生鞭毛(通常4~6根)运动。兼性厌氧,容易在普通培养基上生长。发酵葡萄糖,产酸产气(通常co2:H2=2:1)。在44.5℃时不能由葡萄糖产气。大多数菌株vP试验阳性,MR试验阴性。一般可利用柠檬酸盐和丙二酸盐作为惟的碳源和能源。不从硫代硫酸盐产生H2S。多数菌株可将明胶缓慢液化,不产生脱氧核糖核酸酶。最适生长温度为30℃,多数临床菌株在37℃生长,有些环境菌株37℃时生化反应不稳定。广泛分布于自然界,普遍存在于人和动物中。DNA的G+Cmol%为5260(Bd)。种间和相近属的鉴别见表3-11。模式种;阴沟肠杆菌(Enterobactercloacea),临床致病种为阪崎肠杆菌,阴沟肠杆菌和产气肠杆菌肠杆菌属简介3肠杆菌分类肠杆菌科沟肠杆菌(Enterobactercloacea埃希氏属爱德华氏菌属产气肠杆菌柠檬酸杆菌属Enterobacteraerogenes沙门氏菌属志贺氏菌属克雷伯氏菌属肠杆茵属肠杆菌属阪崎肠杆菌Enterobactersakazakii)哈夫尼菌属Cronobactersakazakii)沙雷氏菌属变形杆菌属耶尔森氏菌属其他6个种欧文氏菌属克罗诺杆菌属其他种肠杆菌分类4肠杆菌科cloacae肠杆菌属克罗诺杆菌属其他属aeroagglomeransasburlaecancerogenoussakazakiicowanmalonaticusgergoviaemuytjensIdublinensisintermediusuniversalisludwigiigenospeciesprints肠杆菌科5阪崎肠杆菌(ES)简介阪崎肠杆菌(又称阪崎氏肠杆菌)是肠杆菌科的一种,1980年由黄色阴沟肠杆菌更名为阪崎肠杆菌。阪崎肠杆菌能引起严重的新生儿脑膜炎、小肠结肠炎和菌血症死亡率高达50%以上。目前,微生物学家尚不清楚阪崎肠杄菌的污染来源,但许多「病例报告表明婴儿配方粉是目前发现的主要感染渠道阪崎肠杆菌(ES)简介6阴沟肠杆菌(EC)简介阴沟肠杆菌(Enterobactercloacae)广泛存在于自然界中,在人和动物的粪便水、泥土、植物中均可检出,它是肠道正常菌种之一,但可作为条件致病菌随着头孢菌素的广泛使用阴沟肠杆菌已成为医院感染越来越重要的病原菌,其引起的疾病,常累及多个器官系统,包括皮肤软组织感染、泌尿道感染、呼吸道感染以及败血症等,由于阴沟肠杆菌能产生超广谱β内酰胺酶(extended-spectrumβ-1actamases,ESBLS)和AmpC,耐药情况严重,给临床治疗带来了新的挑战。阴沟肠杆菌(EC)简介7产气肠杆菌(EA)简介产气肠杆菌(Enterobacteraerogenes),属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae),肠产气杆菌属(Enterobacter)。革兰氏阴性菌,兼性厌氧生物。曾在1963年和一些现属于Enterobacter的菌类被归类为Paracolobactrumaerogenoides。在希腊字中,aer代表“空气”,gennin代表“产生”,所以其种名aerogenes代表着“产气”的意,产气肠杆菌呈棒状菌体大小约为长1.2-3.0μm、宽0.6-1.0μm,为革氏阴性的兼性厌氧杆菌。不产孢子且具有小的荚膜。其有周鞭毛,可以活动。主要生存于人类和动物的肠道,为人体内的正常菌相,只有在人体虚弱的特殊情况下才偶尔引起疾病。亦生存于水、土壤及腐败物中产气肠杆菌(EA)简介8肠杆菌种属鉴定常用靶点基因名生理扩增片段大靶微功能小(bp)生物特异性敏感性2.3cfu/assay16S[1-7,28核糖体RNA100.950100%100fg/assay[]ES\EC102to10ITS[8-12核糖体RNA500-600假阳性[9]22cfu/mLI8InpA[9,11,13100-50015,29外膜蛋白A假阳性[9]103CFU/mL[15guA[9,16,17,18]葡萄糖苷酶600100100%0-cfu/mL[17DNA引发酶dnaG(MMs)(大分子合63×103<100100%7,18,19]成系统操纵fu/mL[7IaE20]α-葡萄糖苷114100%400cfu/mL[201atpD[211ATP合成酶180EC100%unknow亚基肠杆菌种属鉴定常用靶点9基因名生理扩增片段靶微功能小(bp)生物特异性敏感性RNA区分rpobi23241Polymerase00各种Cssp100%subunitbeta分DNA促旋酶151l00%unknow亚基B各种(ES)锌金属Zpx26,27]350蛋白酶100%180fg/PCRI27I基因名10微生物之肠杆菌课件11微生物之肠杆菌课件12微生物之肠杆菌课件13微生物之肠杆菌课件14微生物之肠杆菌课件15微生物之肠杆菌课件16微生物之肠杆菌课件17微生物之肠杆菌课件18微生物之肠杆菌课件19微生物之肠杆菌课件20微生物之肠杆菌课件21微生物之肠杆菌课件22微生物之肠杆菌课件23微生物之肠杆菌课件24微生物之肠杆菌课件25微生物之肠杆菌课件26微生物之肠杆菌课件27微生物之肠杆菌
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