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isCytoscape?易生信,毕生缘;培训版权所有。易生信2易生信3易生信,毕生缘;培训版权所有。网络的要素和类型BCEF节点(Node)网络中的基本单元,基因、蛋白、药物分子等边(Edge)节点之间的相互作用A

D无向网络有向网络易生信4易生信,毕生缘;培训版权所有。主要内容Cytoscape安装界面介绍网络和本地数据的导入与作图App的安装和应用易生信Cytoscape的下载与安装/5易生信,毕生缘;培训版权所有。易生信选择合适的版本下载易生信,毕生缘;培训版权所有。6https://www./en/

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wnloads/jre8-downloads-2133155.htmlCytoscape的安装易生信,毕生缘;培训版权所有。7易生信V3.6.0 Starter

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Panel易生信,毕生缘;培训版权所有。9易生信V3.2.1易生信,毕生缘;培训版权所有。10易生信易生信界面介绍易生信,毕生缘;培训版权所有。11菜单栏工具栏控制面板数据板块图形的风格和整体布局易生信,毕生缘;培训版权所有。12易生信节点和边的参数设置易生信,毕生缘;培训版权所有。13易生信节点边颜色节点边宽度节点颜色填充节点高度节点上添加图片或图表节点名称节点字体颜色节点字体大小节点展示形状节点大小边缘显示透明度节点宽度边颜色边的注释文字边注释文字颜色边注释文字大小边线型指向源节点的箭头类型源节点箭头颜色边的颜色指向靶节点的箭头类型靶节点箭头颜色边缘显示透明度边宽度App插件易生信,毕生缘;培训版权所有。14易生信直接从网络数据库导入数据易生信,毕生缘;培训版权所有。易生信15初步形成的网络图易生信,毕生缘;培训版权所有。16易生信选中非目的基因,点击右键删掉非目的物种的分子易生信,毕生缘;培训版权所有。17易生信易生信18易生信,毕生缘;培训版权所有。美化加工Style和layout整体布局节点和边的参数设置Sample1

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picture易生信21易生信,毕生缘;培训版权所有。本地数据导入作图-数据格式Cytoscape支持并识别多种格式的文件:txt、excel互作网络数据文件中至少包括两列:源节点和靶节点。建议加上互作关系的类型(边的类型)易生信22易生信,毕生缘;培训版权所有。本地数据导入作图-数据格式属性数据文件,用来设置节点的显示方式。节点名称要和构建网络数据中的一致易生信23易生信,毕生缘;培训版权所有。本地数据导入用于构建网络的分子互作数据导入本地数据导入易生信,毕生缘;培训版权所有。易生信24易生信25易生信,毕生缘;培训版权所有。本地数据导入不导入源节点互作类型靶节点边的属性源节点属性靶节点属性易生信26易生信,毕生缘;培训版权所有。本地数据导入用于设置节点属性的数据导入,如基因类型、基因表达量…选择匹配的Keycolumn易生信,毕生缘;培训版权所有。易生信27易生信美化加工28Target

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Charts易生信,毕生缘;培训版权所有。31易生信App的安装和使用易生信,毕生缘;培训版权所有。32易生信网络数据导入易生信,毕生缘;培训版权所有。33易生信网络数据导入易生信,毕生缘;培训版权所有。34易生信网络数据导入易生信,毕生缘;培训版权所有。35易生信本地数据与网络数据的整合易生信,毕生缘;培训版权所有。易生信36基因表达量的映射易生信,毕生缘;培训版权所有。37易生信基因表达量的映射易生信,毕生缘

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