第十章微生物分类及鉴定帮助你理清基本概念规律

第十章微生物分类及鉴定一.分类学基础分类学(taxonomy)：生物分类的科学微生物分类学(microbialtaxonomy):研究微生物分类理论和技术方法的学科1.M分类学三个组成部分(既独立又相互关联的三个部分):分类(classification)鉴定(identification或determination)命名(nomenclature)分类(classification)：根据相似性或相关性(进化亲缘关系)将生物归属为类群或分类单元.鉴定(identification或determination)：决定某一特定分离物归属于某一已确定分类单元的过程。命名(nomenclature)：给予分类类群单元与公布规则相符的名称.2.分类单元及其等级分类单元(taxon,复数taxa)：是指具体的分类群，如：原核生物界(Procaryotae)、杆菌科(Enterobacteriaceae)、枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)等都分别代表一个分类单元。国际公认的7个生物分类单元:界(亚界),门(亚门),纲(亚纲),目(亚目),科(亚科),属(亚属),种(亚种).除此之外,在M的分类中,还常使用一些非正式的类群术语,亚种以下常用培养物、菌株、居群和型；种以上常使用群、组、系等类群名称；近年伍斯还在界之上使用域(domain)，他把全部生物分为古生菌域、细菌域和真核生物域，域下面再分界，把"域"作为分类单元的最高等级。(1).种(species):物种，生物分类中基本的分类单元和分类等级。峡高等软生物或中，蔑物种餐通常议被看唤作是需彼此避杂交下能繁窄殖的盏自然馋群体跪，这脂个群约体与乐其他飘群体哪在生是殖上杰是隔脏离的修。在呼这里益，卸“郊生殖演隔离拘”孟被看附作是威区分缴物种染的标傲准。演微生模物的邪种：物菌株涂的一凯个集题合，粘这批篇菌株市有许躁多共墓同稳樱定特峰征，某并与穗其他根类菌泛株有神显著盐区别愈。脉有相诸似漂G+溪C某组成虫，吗DN丰A馆杂交饼同源沈性在杯70炒%政以上局的菌遗株的定集合累。霜(2深).舌产亚种袄(s终ub好sp误ec抽ie渐s)烧:产是正丰式分滨类单读元中跃地位暗最低龟的分衣类等赤级。岭当某验一个军种内液的不谷同菌晓株存笼在少街数明关显而尽稳定冠的变接异特护征或建遗传盲性状而而又略不足温以区课分成鹿新种蜻时，墓可以赢将这降些菌火株细宏分成堡两个飘或更镜多的芝小的帮分类表单元召--格亚种吓。室变种俩是亚概种的劫同义们词。直在《抢国际某细菌垫命名芝法规店》银(1冤97完6竿年修纵订本束)劲发表元以前抓，变丽种是传种的熊亚等旱级，援因妹"帖变种斜"索一词租易引挤起词垄义上遣的混救淆，况19据76若年后拔，细顿菌种微的亚欢等级蔬一律职采用荷亚种封，不题再使扑用变狸种。阳(3剃).友夫属搬(g抛en涨us巾):立竿介于扮种透(挤或亚依种祖)析与科友之间叙分类夹等级舟，也拣是生樱物分自类中区的基蹈本分论类单马元。田通常沟是把感具有藏某些甜共同浇特征脊或密收切相问关的疲种归含为一效个高仪一级耻的分尿类单裳元，得称之刃属。这(4琴).拜竿科榨(f讲am艇il座y)陆:歼系统而分类醋中，泼把具燃有某慰些共怠同特燥征或姥相关阻的属属归为光更高幅一级鸦的分杏类单庸元称摔为科矩。壤(5层).货痰培养领物森(c停ul余tu旷re五)压：一漂定时芬间一允定空贞间内洪微生卷物的测细胞骆群或角生长炊物。财如微痛生物密的斜恋面培魔养物膝、摇板瓶培蛛养物陕等。忧纯培求养揭(p预ur献e既cu伍lt先ur贡e)蝇:鞭单一栗微生遵物细介胞繁做殖产帝生的常培养添物来.可(6讲).薪迈菌株吩(s叨tr悔ai踢n)它：在幕一个第特定叹分类睡学中蔑至少之与其两他一是些群旨体是骨可以授区别及的生蓝物群炮体。伙是来私自单总个或欣纯培粗养物犹的微问生物笔，一测个种产内菌我株间狼在许孩多方坐面有搞小差勿别。述(7论).矛况居群牢(p叮op现ul北at谜io傅n)丛：采"p笛op津ul屯at贪io跨n"帽一词昼也有隆人译焦为群苗体、肺种群溜或群舱丛等惰，是闯指一偶定空河间中肾同种狡个体浑的组希合。痛(8炒).之车型镰(f寻or棍m轰或神ty立pe炕)取：常桌指亚梢种以挺下的稠细分果。当浩同种慢或同谜亚种侧不同闲菌株议之间阶的性沟状存逆在差苹异，灯不足足以分旧为新道的亚哀种时打，可御以细赠分为吊不同渠的型厦。汪由于宣"t秆yp违e"活一词渗既代符表趟"孟型玻"坦又可药代表悬"羊模式每"染，为列避免闹混淆源，现洒在对猪表示加型的鹿词作扭了修这改，睁用幕"v织ar掠"吼代替呢"t慎yp川e"颠。现母将较雁常用芹的罚型的缠含义夺及其疾表达啦方式饺列于担表中忆。揭中文司译名绸推荐弯使用控的名惊称战以前岭使用培的同逃义词巴应用素于只见有下补列性浑状的跑菌株稠生物扣型敞bi荐ov鹅ar苦bi脂ot关yp输e斤特殊女的生奔理生亦化性挥状恰血清欢型探se启ro扶va债r释se熊ro缺ty键pe粥不同斤的抗绢原特悉征原致病河型搞pa饶th想ov伯ar茄pa伏th咸ot例yp胸e功对宿昌主致考病性校的差连异华噬菌格型作ph彻ag拐ov谁ar鸽ph蹈ag察ot狠yp色e蜂ly兽so叼ty需pe池对噬旋菌体护溶解构反应装的差圣异尊形态青型柏mo旧rp粪ho怜va价r亿ph绞ag医ot跨yp岗e绪ly市so斗ty路pe剧特殊团的形荷态学船特征舌常用虑型的忍术语嫩及其届含义括p浓32机2归(9蚁).致凡群旋(g畏ro灯up冲),远当组眠(s写ec揭ti喉on节),句拳系伸(s群er鉴ie砍s)年:剃这些辜类群奶名称的用在损不同肥场合邀，常趴常有总非常仅不同锣的含匪义，对可以促是种幕水平避上的禁类群齿，也勺可以绢代表献属以支上等狱级的氧分类懂单元专的集塌合。钢如《叠伯杰巾氏系历统细害菌学苍手册迅》第邀一版标中，蹲主要鸭根据就表型迅特征塌将全术部原爷核生出物分笛为着33馋组。赚将假株单胞娃菌属余(辣Ps洪eu萄do转mo胜na两s写)篮内的券90桂个种曾分为误5戚组。虾3.藏微生董物的宽命名套(1革).牵狭命名细法则蜓所有希正式念分类拴单元揉的学践名玩,姓必须绵用拉构丁词哨或其挣他词夹源经批拉丁略化的竿词命馅名贷.核属名扯:葵一般愿拉丁斥字名赔词，平字首凤字母关大写立,疾主要外特征欢.车种名凶:僵林奈信氏双烦名法碌，由缺二个庄拉丁虏字组啊成，些属名位(累字首血字母丛大写室)寸+禁种名替加词风(渣全部弱小写夺)律亏娃碎约Ps拍eu扯do志mo干na事s跪ae勿ru探gi征no仗sa蜜,纲M士yc肯ob始ac追te扔ri传um慌t搭ub盗er捡cu似lo俯si稿s,腔冰Ba圾ci循ll叛us父t注hu恋ri括ng误ie夜ns霉is洁若所钉分离樱的菌剂株只稻鉴定咬到属尿，而平未鉴存定到吊种，影可用皆sp势.政来表异示单摩数，草sp闷p.讨来表睛示复净数昂.熟例如惰Ba旱ci赌ll却us浸s垦p.青梦Ba罪ci汤ll统us迁s闷pp源.浙亚种抬名治:吧三元盛式组剑合联;决属名明+父种名另加词突+绸s扬ub男sp援.第亚种求名加丈词驰永阶Al畅ca趁li机ge晨ne舱s助de吵ni补tr刷if铸ic廊an眯s趋s焦ub扇sp泉.叨x伴yl售os槽ox哥yd促an就s崇反硝舅化产谣碱杆裙菌氧清化木国糖亚冒种依Ba射ci卧ll拔us盒s犯ub徒ti伤lu胞s耀su间bs宜p.肉n泉ig辅ar凯搞容枯草止芽孢杰杆菌法黑色口亚种昏属级贞以上办分类框单元闯的名孝称鸭:秋特定允的词丹尾须目突台al吨es艘蛾龟际Ri止ck画et嘉ts迁ia狸le仿s(堵立克私次氏饺体目窝)吼科咱赵ac不ea凡e赴丝充Ri脊ck书et恨ts状ia果ce胳ae桂(博立克罪次氏留体科谅)尚属炸Ri问ck葱e石tt配si三a沾(栽立克牵次氏要体属品)拉属名拿,裹种名丙,勉亚种胖名印鱼刷体业一律离斜体兰.优(2卵).瓜仔命名签模式瓦模式挨:励是一配定分口类单茂元命疮名的扰依据陪,窝即对在于一昨个分侦类单哲元的竹命名舰,费应指委定一亭个命鬼名模乌式片,室它是洽该分略类单久元的用基本捡单元贺,警但不博一定哄是该示分类买单元反中最双典型概或具琴有代施表性魂的基作本单蒸元慕.式种和寸亚种绿的命户名模奔式是坦模式鼻菌株画;速羡属和临亚属障的命连名模批式是则模式茅种隆;毯科盟(值以及率高于念科的电分类雅单元悼)节的命漆名模忌式是见模式指属江.尘(3闻).膊伸新名净称的棵合格务发表谊:悼国际忠细菌奥命名蛾法规企规定驴,欺对于搜一个尖新名孔称的查有效瘦发表振,飘必须猴在扯In弹te崭rn阔at蹲io营na棵l妇Jo胆ur拾na究l即of清S吸ys趁te初m蜜at庭ic睁a趟nd贷E津vo掏lu泉ti掏on鸭ar史y塌Mi辆cr慧ob碑io涂lo赴gy彻(帅IJ不SE营M)彩上发倒表侧,梳或其塘他杂畅志发耕表后恳，必嚷须向货IJ携SE耀M绩递交单论文蛛拷贝扭，同变时将仪该菌牢株培棵养物浅保存姨在美积国扔AT品CC心或德赖国千DS僵MZ诊。乡IJ狱SE形M毯每期忌公布判批准顺的菌纽种名反，并新为其专收录日在富Be掘rg班ey执’霞s颜Ma迫nu徐al丽o哪f桃Sy页st蹲em剧at拘ic魄B暂ac搞te圆ri昏ol节og泉y毒中做隶好准岸备。拣发表柄新名疯称时溜，应畜在新柿名称弓之后见加上煎所属肠新分润类等懂级的海缩写液词，凑如新楚目刚"o混rd彼.n钥ov库."年、新农属笑"g渠en剃.n喇ov爆."眉、新球种砍"s右p.箩no灯v.秆"升等。线例如贵：税Py崖ro钓co内cc宵us惜f搞ur还io乔su架s除s衰p.价no层v.饼表明染该菌祸(据猛烈段火球蔬菌往)枯是一伞个新金发表厉的种勇。遣4.屠胆细菌盈分类坚系统科--般--婶Be贺rg史ey响’s渡M赵an铅ua赶l碧Be漆rg嗓ey略’s滑M盗an句ua裤l简of枪D糖et饼er植mi设na诚ti踩ve洪B躬ac劲te捞ri拦ol扑og苹y杨19蠢23贪年宾练夕法拒尼亚毫大学茄的细努菌学伙教授夫Da企vi济d丑Be也rg价y酿和四询个同痒事发夹表了杠细菌笛分类酱法肠,腊至没19耗94眠年扶,潮发行希了第境9芬版谅.迈从根19吓74希年的纯第违8裙版开更始饲,蚁已经土成为咱世界俊通用座的压“殖官方涨的分乓类变”蠢。月(陵如循19当74涝年第着八版隶，撰换稿人栽多达袭13竞0扎多位涝，涉升及梢15吗个国槽家；捡现行恐版本芝撰稿列人多应达胁30梨0学多人星，涉犬及近霞20争个国葡家冤)电B振er缴ge斩y’躲s畏Ma眼nu寸al绢o校f凑Sy悔st走em右at浊ic恭B掘ac腰te骂ri揪ol往og洞y逼19辱84铜-1旷98草9诸年分尸4内卷出宪版第竟一版太（给苦出的脂系统壶基本忧上是狮表型拖性的藏），峡目前框正在杆分炸5岗卷出知版该摄手册闯的第悦二版狂（项rR蒜NA齿,D碎NA路和蛋窄白质汁，系腥统发丑育）存。构伯杰岂氏系科统细箩菌学树手册均第一明版分偏类大袜纲雀p3五26祝伯杰瓦氏系送统细晃菌学说手册等第二句版分兄类大券纲母p忠32志7的从怪19旁84罚年伯在杰氏饥系统屿细菌牧学手满册第歇一版揪开始秀发行缓以来港，细彻菌分亲类已誓取得借了巨给大进堆展，客新命绵名的敲种成欢倍增筝加、化新描礼述的馋属也迁在蹦17伶0糟个以血上，驶尤其果是莫80秧年代遭末以问来，急rR勒NA齐、页DN浙A普、蛋宋白质躺序列身分析奥方法罩日趋约实用清，因窄而为浮细菌钳的系馆统发蹲育积私累了炊不少责新的称资料慨。桑伯杰厦氏系乎统细肿菌学孝手册缝第二桂版中施更多环地采仔用了上核酸班序列飘资料口对分浆类群供进行偶新的拿调整星，无颗疑这传是细镰菌系鸽统发拒育分骂类的弱重大拜进展多.像二设.刮微生肺物分亭类鉴结定的若特征缠和技口术粥19仇87初年妨,艰Wa刊yn策e役等提霜出羽:扒一个吐种的广所有岁菌株现DN熔A式的相用似性故接近恶或大破于摆70包%,眉蚂D顽Tm吸≤尘5毫℃迷(迁一个当正式葵的微鼻生物能种的犹分子喇学定聋义夸)孔19良90恳年牢,葵Mu键rr孩y榆等提爬出胡,熄只根乞据核丑酸序利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