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PAGEPAGE3高级生物化学课件总结核酸部分第二章核酸的化学组分糖环的折叠:折叠。核酸组分的分离方法:纸电泳、胶电泳、离子交换层析、薄层层析,反相层析等核酸组分的鉴定方法:紫外吸收法、紫外光谱法、第三章核酸的化学结构与性质DNA:DNA性,又称为简单序列DNA,又因为其不同寻常的核苷酸组成,经常在浮力密度梯度离心中从整个基因DNADNA。多态性:脱氧核糖和磷酸组成的骨架上的许多键都可以全动,随着热力学的变化,可以使链弯曲、伸DNADNA为多态性。DNA结构变异的三个方面:a.脱氧核糖的五元环能折叠成多种构象;b.组成磷酸脱氧核糖骨架的连续的键可以转动;c.C-N1发夹结构,茎环结构:具有不完善的两侧对称结构的区域形成的二级结构。两端互补的序列可配对形内特殊的减价配对及碱基堆积力,三到四个碱基形成的环特别稳定。在许多生物系统中,发家结构及tRNArRNARNA-蛋白的相互作用位点。DNAa.沟(特别是大沟)的特征在遗传信息表达过程中其关键作用;bDNADNADNA回文结构:又称反向重复序列,是一段能自我互补的序列,即同其互补链一样的序列(5’-3’).能形成发夹结构或十字形结构。HoogsteenDNADNADNAWatson-Crick配对,从而形成DNA的三级结构,这种非Watson-CrickHoogsteen能进一步形成一些氢键。特别是大沟中一些功能基因的重排。DNA(双螺旋)体三维形状有影响的相互作用,包括不同二级结构元件的相互作用、单链与二级结构元件间的相互作用以及核酸的拓扑特征。DNADNA松弛态。DNA如果DNADNA张力不能释放掉,DNA分子就会发生扭曲,用以抵消这种张力,这种扭曲成为超螺旋,这种状态成为紧张态。(1)水解磷酸二酯键的酶。a.磷酸二酯酶:非特异水解磷酸二酯键的酶;b.核酸酶:专一水解核酸的磷酸二酯键的酶。按第五专一性分为核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶;按对底物的作用方式分为核酸内切酶和核酸外切酶(2)NN-糖苷酶。30-40DNA260nmPH碱基间的碱基堆集力受到了破坏,有规则的双螺旋结构变为无规则的单链线团状,这个变形过程称为熔解(Tm)。变性不涉及共价键的断裂。变性的因素:热力、强碱、强酸(甲酸等、有机溶液、变性剂(尿素、甲酰胺、射线、机械力等。Tm(全变性)一半(双螺旋结构失去一半)DNATm与下列因素有关:a.核酸的均一程度,均一性愈高的样品,变性过程的温度范围愈小。B.TmG-Cc.Tm复性DNA(PHpH合成为双螺旋结构,此过程称为复性(慢慢降温复性又称退火。复性的条件0.150.50mol/LNaClbTm20-25℃的温度。复性的机理(1)DNA(2)DNA一步又叫成核作用,反应较慢,第二步又叫拉拉链作用,反应很快。复性反应的影响因素(1)DNA片段的大小(大的线性单链,扩散速度受到妨碍,减少互补链的碰撞(2)DNA(浓度高增加互补链的相碰机会(3)DNA(原核为单一顺序,所以复DNA(4(Tm25℃为最佳(5)盐浓度(NaCl0.15-0.50mol/L。但太高会导致低严禁型杂交分子。Cot:分子杂交技术依据(1)2)有标记探针。分子杂交的应用(1)DNA(2)DNA(3)DNADNADNARNA(基因定位、克隆含量很少的但拷贝基因等(4)基因芯片与生物计算机。突变:能够产生永久(可遗传)的遗传密码改变的DNA突变的来源:DNADNA甲基化酶(据活性:DNADNA(DNA)上。外遗传信息(epigeneticinformation):DNADNA可遗传的性质(即最终将影响器官的表现型。染色质的结构、分子的构象和拓扑特征等也是外遗传信息的形式。第四章核酸的种类与分布基因:将遗传信息由亲代传递给子代;二是经转录对表现型有一定的效应;可突变形成各种等位基因。RNAa.控制蛋白质合成;b.作用于RNAc节;d.生物催化与其他细胞持家功能;e.遗传信息的加工与进化;f.染色体、核糖体、核酶等的骨架构成成分;g.信号识别与传导。ribozyme(核酶):RNAPtRNA5’-端多余的核苷酸使tRNA第五章核酸的分离与纯化1.分离纯化核酸时的注意事项(1)防止物理因素的降解。a.尽量简化操作步骤,缩短提取时间,以减少变性机会;b.防止热变性,避免高温,一般0-4℃;c(2)防止化学因素的降解。A.避(3)防止核酸酶的降解(4)防止DNAADNARnaseDNA(5)RNAA.带一次性手套、口罩;bDEPCtrisDEPC尽早出去蛋白质(RNase),并加抑制剂。第六章DNA科学基本工具与技术(核酸工具酶)DNARNA-DNADNADNA;c.具有核糖核酸酶HRNA-DNARNA。DNA按限制性内切酶的作用位点在DNA物理图谱构建原则:后再以切点较多的酶,逐步构建成包括多种限制性内切酶切点相对排列位置的物质图谱。第七章核酸一级结构的序列分析及全基因组分析1.DNADNA(2)Maxam-GilbertDNA,b,c,d(3)DNASBHDNAaDNAbc第九章DNA重组技术-重要基因的鉴别与表达DNA(1)DNA2)选择合适的克隆载体(3)DNA(4)DNA(5)DNA产生特定的DNA片段。A.限制性内切酶降解(全部降解,部分降解;b.机械剪刀;ccDNA;d.人cDNA3.基因组文库:整套基因组片段插入克隆载体所获得的所有的分子克隆的汇集。基因组文库的构建:aDNAbDNA;c.体外连接与包装;d.染大肠杆菌;e.基因组文库的鉴定与扩增。cDNA是由细胞全部mRNAcDNAcDNAa.mRNA;bcDNA;cDNA;d.cDNAecDNA克隆载体:DNA的起点,可以自主复制,是一个复制子。理想载体具备的条件:a.具有自主复制的能力;bDNA;c内切酶的单一识别序列;d.携带易于筛选的选择性标记;e.使用安全。shuttlevectors(穿梭载体):通常是指那些既能在真核细胞中繁殖又能在原核细胞中繁殖的载体。DNA(1)(2)点穿孔/3)(4)微注射。transformation(转化):细菌或细胞质吸收质粒DNA细菌或细胞吸收噬菌体DNA基因不能随着靶细胞基因组的复制而复制。基因的稳定表达:外源基因以某种形式整合在靶细胞的基因组中,随着靶细胞基因组的复制而复制。13利用核酸链间互补的性质,选择适当的探针与重组体中的DNA进行DNA-DNADNA-RNADNA基本步骤:a膜或尼龙膜上;b.用NaOHDN

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