静息态处理全过程

静息态处理全过程第一页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Outline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理第二页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第三页，共八十三页，编辑于2023年，星期二数据整理被试信息整理第四页，共八十三页，编辑于2023年，星期二数据整理被试信息整理第五页，共八十三页，编辑于2023年，星期二数据整理被试信息整理原始数据整理静息功能数据结构数据DTI数据第六页，共八十三页，编辑于2023年，星期二数据整理被试信息整理原始数据整理静息功能数据结构数据DTI数据第七页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第八页，共八十三页，编辑于2023年，星期二DICOM->NIFTIMRIcroN’sdcm2niiguiSPM5’sDICOMImport第九页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第十页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第十一页，共八十三页，编辑于2023年，星期二SliceTimingWhy?第十二页，共八十三页，编辑于2023年，星期二SliceTimingWhy?Huetteletal.,2004第十三页，共八十三页，编辑于2023年，星期二SliceTiming1:2:33,2:2:323322-(2/33)33第十四页，共八十三页，编辑于2023年，星期二SliceTiming第十五页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第十六页，共八十三页，编辑于2023年，星期二RealignWhy?第十七页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Realign第十八页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Realign检查头动?b=load(‘rp_name.txt’);c=max(abs(b));c(4:6)=c(4:6)*180/pi;第十九页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第二十页，共八十三页，编辑于2023年，星期二NormalizeWhy?Huetteletal.,2004第二十一页，共八十三页，编辑于2023年，星期二mean_name.imgr*.imgEPI.nii-90-126-72;9090108333第二十二页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Normalize第二十三页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第二十四页，共八十三页，编辑于2023年，星期二SmoothWhy?减少被试间的空间结构差异；有利统计检验的有效性;第二十五页，共八十三页，编辑于2023年，星期二w*.img平滑核Smooth第二十六页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第二十七页，共八十三页，编辑于2023年，星期二去线性漂移第二十八页，共八十三页，编辑于2023年，星期二预处理

数据整理

DICOM->NIFTI

去前10个时间点

SliceTimingRealignNormalizeSmooth

去线性漂移

Filter:0.01-0.08第二十九页，共八十三页，编辑于2023年，星期二滤波Why?关心低频的活动第三十页，共八十三页，编辑于2023年，星期二滤波第三十一页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Outline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理第三十二页，共八十三页，编辑于2023年，星期二ALFFZangetal.,2007第三十三页，共八十三页，编辑于2023年，星期二ALFF第三十四页，共八十三页，编辑于2023年，星期二ReHo注意：预处理时不做平滑，计算完ReHo后再进行平滑。Zangetal.,2004第三十五页，共八十三页，编辑于2023年，星期二ReHo第三十六页，共八十三页，编辑于2023年，星期二功能连接提取协变量

头动参数:rp_name.txt

全脑信号、脑脊液、白质信号第三十七页，共八十三页，编辑于2023年，星期二提取协变量第三十八页，共八十三页，编辑于2023年，星期二提取协变量第三十九页，共八十三页，编辑于2023年，星期二提取协变量第四十页，共八十三页，编辑于2023年，星期二提取协变量第四十一页，共八十三页，编辑于2023年，星期二提取协变量第四十二页，共八十三页，编辑于2023年，星期二提取协变量第四十三页，共八十三页，编辑于2023年，星期二提取协变量第四十四页，共八十三页，编辑于2023年，星期二功能连接提取协变量

头动参数:rp_name.txt

全脑信号、脑脊液、白质信号协变量组合：RPCov=load('rp_name.txt');BCWCov=load('ROI_FCMap_name.txt');Cov=[RPCov,BCWCov];save('Cov.txt','Cov','-ASCII','-DOUBLE','-TABS');第四十五页，共八十三页，编辑于2023年，星期二功能连接Voxel-wiseROI-wiser=0.36第四十六页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Voxel-wise第四十七页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Voxel-wise第四十八页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Voxel-wise第四十九页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Voxel-wise第五十页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Voxel-wise第五十一页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Voxel-wise第五十二页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Voxel-wise1by1Cov.txt第五十三页，共八十三页，编辑于2023年，星期二ROI-wise第五十四页，共八十三页，编辑于2023年，星期二ROI-wise第五十五页，共八十三页，编辑于2023年，星期二ROI-wise1by1Cov.txt第五十六页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Outline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理第五十七页，共八十三页，编辑于2023年，星期二统计单样本T检验双样本T检验第五十八页，共八十三页，编辑于2023年，星期二单样本T检验统计准备

ALFF:mALFFReHo:smReHoFC:zFC第五十九页，共八十三页，编辑于2023年，星期二单样本T检验mALFF-1,smReHo-1m图像1by1i1-1第六十页，共八十三页，编辑于2023年，星期二单样本T检验m*-1图像;zFC图像存放SPM.mat的目录第六十一页，共八十三页，编辑于2023年，星期二单样本T检验上一步生成的spm.mat第六十二页，共八十三页，编辑于2023年，星期二单样本T检验上一步生成的spm.mat1第六十三页，共八十三页，编辑于2023年，星期二单样本T检验HeightthresholdT=2.687659{p<0.05(FDR)}Extentthresholdk=10voxelsspmT_0001.imgPD_1T.img准备制作双样本T检验的MASK第六十四页，共八十三页，编辑于2023年，星期二双样本T检验统计准备

ALFF：mALFFReHo:smReHoFC:zFCMask第六十五页，共八十三页，编辑于2023年，星期二双样本T检验MaskMask=PD_1T.img+CON_1T.img>0PD_1T.imgCON_1T.imgMask_2T.imgi1+i2>0第六十六页，共八十三页，编辑于2023年，星期二双样本T检验两组的m*图像;zFC图像存放SPM.mat的目录Mask_2T.img第六十七页，共八十三页，编辑于2023年，星期二双样本T检验上一步生成的spm.mat第六十八页，共八十三页，编辑于2023年，星期二双样本T检验上一步生成的spm.mat1-1第六十九页，共八十三页，编辑于2023年，星期二双样本T检验HeightthresholdT=Inf{p<0.05(FDR)}Extentthresholdk=0voxelsspmT_0001.img第七十页，共八十三页，编辑于2023年，星期二Outline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理第七十一页，共八十三页，编辑于2023年，星期二结果呈现SPM5xjviewrest_sliceviewerMRIcroN第七十二页，共八十三页，编辑于2023年，星期二结果呈现—SPM5第七十三页，共八十三页，编辑于2023年，星期二结果呈现—SPM5第七十四页，共八十三页，编辑于2023年，星期二结果呈现—xjview第七十五页，共八十三页，编辑于2023年，星期二结果呈现—xjview第七十六页，共八十三页，编辑于2023年，星期二结果呈现—rest_sliceviewer第七十七页，